MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_010334	GTTA	2	8	467694	467701	25 %	50 %	25 %	0 %	167622339
8502	NC_010334	TAC	2	6	467725	467730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622339
8503	NC_010334	GAA	2	6	467758	467763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622339
8504	NC_010334	GCA	2	6	467767	467772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622339
8505	NC_010334	ATGG	2	8	467775	467782	25 %	25 %	50 %	0 %	167622339
8506	NC_010334	GCT	2	6	467787	467792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622339
8507	NC_010334	CTA	2	6	467906	467911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622339
8508	NC_010334	GC	3	6	467924	467929	0 %	0 %	50 %	50 %	167622339
8509	NC_010334	GTGA	2	8	467947	467954	25 %	25 %	50 %	0 %	167622339
8510	NC_010334	GC	4	8	467976	467983	0 %	0 %	50 %	50 %	167622339
8511	NC_010334	GAG	2	6	468055	468060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622339
8512	NC_010334	CGA	2	6	468147	468152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622339
8513	NC_010334	GGC	2	6	468219	468224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622339
8514	NC_010334	GAGC	2	8	468262	468269	25 %	0 %	50 %	25 %	167622339
8515	NC_010334	CAC	2	6	468354	468359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622339
8516	NC_010334	GCG	2	6	468368	468373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622339
8517	NC_010334	ATG	2	6	468395	468400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622339
8518	NC_010334	CGC	2	6	468477	468482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622339
8519	NC_010334	CTG	2	6	468528	468533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622339
8520	NC_010334	GA	3	6	468564	468569	50 %	0 %	50 %	0 %	167622339
8521	NC_010334	ATG	2	6	468593	468598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622339
8522	NC_010334	GCA	2	6	468684	468689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622339
8523	NC_010334	GATATT	2	12	468778	468789	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167622339
8524	NC_010334	AG	3	6	468874	468879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_010334	GGA	2	6	468881	468886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_010334	TAGCC	2	10	468916	468925	20 %	20 %	20 %	40 %	167622340
8527	NC_010334	TTTA	2	8	468933	468940	25 %	75 %	0 %	0 %	167622340
8528	NC_010334	TTG	2	6	469005	469010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622340
8529	NC_010334	TTG	2	6	469022	469027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622340
8530	NC_010334	GCC	2	6	469067	469072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622340
8531	NC_010334	T	6	6	469073	469078	0 %	100 %	0 %	0 %	167622340
8532	NC_010334	TGG	2	6	469137	469142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622340
8533	NC_010334	GTC	2	6	469220	469225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622340
8534	NC_010334	CTTT	2	8	469227	469234	0 %	75 %	0 %	25 %	167622340
8535	NC_010334	TGC	2	6	469285	469290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622340
8536	NC_010334	TCA	2	6	469350	469355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8537	NC_010334	TAA	2	6	469469	469474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_010334	T	6	6	469515	469520	0 %	100 %	0 %	0 %	167622341
8539	NC_010334	AG	3	6	469542	469547	50 %	0 %	50 %	0 %	167622341
8540	NC_010334	CGC	2	6	469616	469621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622341
8541	NC_010334	TAT	2	6	469629	469634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622341
8542	NC_010334	ATC	2	6	469753	469758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622341
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8544	NC_010334	TGC	2	6	469827	469832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622341
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8546	NC_010334	AAGC	2	8	469865	469872	50 %	0 %	25 %	25 %	167622341
8547	NC_010334	GCCA	2	8	469958	469965	25 %	0 %	25 %	50 %	167622341
8548	NC_010334	GGA	2	6	469992	469997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622341
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8553	NC_010334	CTT	2	6	470255	470260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622341
8554	NC_010334	CTT	2	6	470297	470302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622341
8555	NC_010334	CTTT	2	8	470338	470345	0 %	75 %	0 %	25 %	167622341
8556	NC_010334	CTT	2	6	470381	470386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622341
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8558	NC_010334	TTG	2	6	470466	470471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622341
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8561	NC_010334	A	6	6	470653	470658	100 %	0 %	0 %	0 %	167622341
8562	NC_010334	T	8	8	470682	470689	0 %	100 %	0 %	0 %	167622341
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8567	NC_010334	TTG	2	6	471051	471056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8574	NC_010334	GTTT	2	8	471687	471694	0 %	75 %	25 %	0 %	167622342
8575	NC_010334	TGG	2	6	471752	471757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622342
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8579	NC_010334	AAT	2	6	471980	471985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8580	NC_010334	TAT	2	6	471992	471997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8581	NC_010334	TAA	2	6	472031	472036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622343
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8583	NC_010334	GT	3	6	472091	472096	0 %	50 %	50 %	0 %	167622343
8584	NC_010334	CA	5	10	472200	472209	50 %	0 %	0 %	50 %	167622343
8585	NC_010334	GCT	2	6	472216	472221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622343
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8588	NC_010334	CTGC	2	8	472527	472534	0 %	25 %	25 %	50 %	167622343
8589	NC_010334	CTC	2	6	472555	472560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167622343
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8591	NC_010334	TCA	2	6	472637	472642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622343
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8594	NC_010334	TTC	2	6	472714	472719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622343
8595	NC_010334	AATG	2	8	472724	472731	50 %	25 %	25 %	0 %	167622343
8596	NC_010334	TTA	2	6	472761	472766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_010334	GTCG	2	8	472827	472834	0 %	25 %	50 %	25 %	167622344
8598	NC_010334	GTT	2	6	472973	472978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622344
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8603	NC_010334	TGG	2	6	473393	473398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622344
8604	NC_010334	CTG	2	6	473474	473479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622344
8605	NC_010334	CATA	2	8	473536	473543	50 %	25 %	0 %	25 %	167622344
8606	NC_010334	GGTGA	2	10	473567	473576	20 %	20 %	60 %	0 %	167622344
8607	NC_010334	CTA	2	6	473587	473592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622344
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8610	NC_010334	CTG	2	6	474028	474033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622344
8611	NC_010334	CTTGG	2	10	474074	474083	0 %	40 %	40 %	20 %	167622344
8612	NC_010334	T	6	6	474154	474159	0 %	100 %	0 %	0 %	167622344
8613	NC_010334	CAT	2	6	474253	474258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622344
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8615	NC_010334	CTA	2	6	474331	474336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622344
8616	NC_010334	GCCA	2	8	474363	474370	25 %	0 %	25 %	50 %	167622344
8617	NC_010334	ATA	2	6	474414	474419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622344
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8619	NC_010334	CCA	2	6	474474	474479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622344
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8622	NC_010334	TGAG	2	8	474527	474534	25 %	25 %	50 %	0 %	167622344
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8995	NC_010334	TAA	2	6	495869	495874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8996	NC_010334	CAAA	2	8	496031	496038	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8997	NC_010334	CAT	2	6	496239	496244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622361
8998	NC_010334	GCG	2	6	496287	496292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622361
8999	NC_010334	CATC	2	8	496337	496344	25 %	25 %	0 %	50 %	167622361
9000	NC_010334	AAC	2	6	496585	496590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622361

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