MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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87002	NC_010334	TCC	2	6	4801511	4801516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167625843
87003	NC_010334	ACT	2	6	4801568	4801573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625843
87004	NC_010334	AGC	2	6	4801647	4801652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167625843
87005	NC_010334	ACA	2	6	4801889	4801894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87006	NC_010334	CCA	2	6	4802164	4802169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167625844
87007	NC_010334	ATGCA	2	10	4802279	4802288	40 %	20 %	20 %	20 %	167625844
87008	NC_010334	TGG	2	6	4802313	4802318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167625844
87009	NC_010334	GC	3	6	4802402	4802407	0 %	0 %	50 %	50 %	167625844
87010	NC_010334	GCC	2	6	4802424	4802429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167625844
87011	NC_010334	CA	3	6	4802459	4802464	50 %	0 %	0 %	50 %	167625844
87012	NC_010334	TCA	2	6	4802511	4802516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625844
87013	NC_010334	AGC	2	6	4802520	4802525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167625844
87014	NC_010334	CGC	2	6	4802530	4802535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167625844
87015	NC_010334	CGA	2	6	4802554	4802559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167625844
87016	NC_010334	GCC	2	6	4802670	4802675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167625844
87017	NC_010334	CCG	2	6	4802742	4802747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167625844
87018	NC_010334	CATC	2	8	4802929	4802936	25 %	25 %	0 %	50 %	167625844
87019	NC_010334	AGC	2	6	4802984	4802989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167625844
87020	NC_010334	GAC	2	6	4803123	4803128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87021	NC_010334	GTCT	2	8	4803175	4803182	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87022	NC_010334	ATT	2	6	4803193	4803198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87023	NC_010334	TAC	2	6	4803214	4803219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87024	NC_010334	AAAG	2	8	4803220	4803227	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87025	NC_010334	TGT	2	6	4803277	4803282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87026	NC_010334	GCA	2	6	4803300	4803305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87027	NC_010334	TA	3	6	4803333	4803338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87028	NC_010334	CTG	2	6	4803430	4803435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167625845
87029	NC_010334	GGT	2	6	4803544	4803549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167625845
87030	NC_010334	AAAC	2	8	4803595	4803602	75 %	0 %	0 %	25 %	167625845
87031	NC_010334	CTC	2	6	4803604	4803609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167625845
87032	NC_010334	TGG	2	6	4803619	4803624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167625845
87033	NC_010334	CCA	2	6	4803633	4803638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167625845
87034	NC_010334	GCT	2	6	4803784	4803789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167625845
87035	NC_010334	AC	3	6	4803849	4803854	50 %	0 %	0 %	50 %	167625845
87036	NC_010334	CAGCC	2	10	4804012	4804021	20 %	0 %	20 %	60 %	167625845
87037	NC_010334	CG	4	8	4804051	4804058	0 %	0 %	50 %	50 %	167625845
87038	NC_010334	GCAGA	2	10	4804082	4804091	40 %	0 %	40 %	20 %	167625845
87039	NC_010334	CAT	2	6	4804116	4804121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625845
87040	NC_010334	AAT	2	6	4804270	4804275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167625845
87041	NC_010334	GCC	2	6	4804327	4804332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167625845
87042	NC_010334	ACC	2	6	4804333	4804338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167625845
87043	NC_010334	GCT	3	9	4804368	4804376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167625845
87044	NC_010334	TCA	3	9	4804421	4804429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625845
87045	NC_010334	CAC	2	6	4804513	4804518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167625845
87046	NC_010334	GGT	2	6	4804561	4804566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167625845
87047	NC_010334	CGCACT	2	12	4804659	4804670	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	167625845
87048	NC_010334	TTA	2	6	4804784	4804789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167625845
87049	NC_010334	CAT	2	6	4804818	4804823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625845
87050	NC_010334	ATA	2	6	4804852	4804857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167625845
87051	NC_010334	GCG	2	6	4805069	4805074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167625846
87052	NC_010334	CGC	2	6	4805075	4805080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167625846
87053	NC_010334	TTGA	2	8	4805106	4805113	25 %	50 %	25 %	0 %	167625846
87054	NC_010334	CCA	2	6	4805169	4805174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167625846
87055	NC_010334	GCT	2	6	4805178	4805183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167625846
87056	NC_010334	CG	3	6	4805269	4805274	0 %	0 %	50 %	50 %	167625846
87057	NC_010334	ACA	2	6	4805296	4805301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167625846
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87059	NC_010334	CAT	2	6	4805395	4805400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625846
87060	NC_010334	C	7	7	4805513	4805519	0 %	0 %	0 %	100 %	167625846
87061	NC_010334	GTG	2	6	4805613	4805618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167625846
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87065	NC_010334	CGAT	2	8	4805868	4805875	25 %	25 %	25 %	25 %	167625846
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87068	NC_010334	GCA	2	6	4805926	4805931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167625846
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87071	NC_010334	GCGCT	2	10	4806213	4806222	0 %	20 %	40 %	40 %	167625846
87072	NC_010334	AC	3	6	4806422	4806427	50 %	0 %	0 %	50 %	167625846
87073	NC_010334	AT	3	6	4806456	4806461	50 %	50 %	0 %	0 %	167625846
87074	NC_010334	GCC	2	6	4806509	4806514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167625846
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87077	NC_010334	CTG	2	6	4807419	4807424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167625847
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87081	NC_010334	CCCG	2	8	4807791	4807798	0 %	0 %	25 %	75 %	167625847
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87089	NC_010334	CAAT	2	8	4808336	4808343	50 %	25 %	0 %	25 %	167625848
87090	NC_010334	TTAT	2	8	4808357	4808364	25 %	75 %	0 %	0 %	167625848
87091	NC_010334	TTA	2	6	4808426	4808431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167625848
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87100	NC_010334	A	6	6	4808875	4808880	100 %	0 %	0 %	0 %	167625849
87101	NC_010334	GCT	2	6	4808883	4808888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167625849
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87113	NC_010334	GCAAA	2	10	4810082	4810091	60 %	0 %	20 %	20 %	167625849
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