MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_010334	AGT	2	6	439547	439552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622312
8003	NC_010334	TTA	2	6	439633	439638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622313
8004	NC_010334	GCT	2	6	439673	439678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622313
8005	NC_010334	GCCA	2	8	439779	439786	25 %	0 %	25 %	50 %	167622313
8006	NC_010334	CTG	2	6	439848	439853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622313
8007	NC_010334	AGC	2	6	439882	439887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622313
8008	NC_010334	TGC	2	6	439903	439908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622313
8009	NC_010334	GCT	2	6	439913	439918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622313
8010	NC_010334	CTGAT	2	10	439966	439975	20 %	40 %	20 %	20 %	167622313
8011	NC_010334	CTAT	2	8	440023	440030	25 %	50 %	0 %	25 %	167622313
8012	NC_010334	GCT	2	6	440039	440044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622313
8013	NC_010334	CTG	2	6	440082	440087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622313
8014	NC_010334	CTG	2	6	440296	440301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622313
8015	NC_010334	CAG	2	6	440313	440318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622313
8016	NC_010334	ACT	2	6	440387	440392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622314
8017	NC_010334	TCT	2	6	440419	440424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622314
8018	NC_010334	CAAAG	2	10	440446	440455	60 %	0 %	20 %	20 %	167622314
8019	NC_010334	CCG	2	6	440476	440481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622314
8020	NC_010334	ACC	2	6	440529	440534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622314
8021	NC_010334	ATA	2	6	440586	440591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622314
8022	NC_010334	CAG	2	6	440696	440701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622314
8023	NC_010334	GTAG	2	8	440728	440735	25 %	25 %	50 %	0 %	167622314
8024	NC_010334	TGCCA	2	10	440737	440746	20 %	20 %	20 %	40 %	167622314
8025	NC_010334	ATGGA	2	10	440771	440780	40 %	20 %	40 %	0 %	167622314
8026	NC_010334	CTA	2	6	440916	440921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_010334	GTCT	2	8	441148	441155	0 %	50 %	25 %	25 %	167622315
8028	NC_010334	CTC	2	6	441233	441238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167622315
8029	NC_010334	GTA	2	6	441310	441315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622315
8030	NC_010334	CGCT	2	8	441394	441401	0 %	25 %	25 %	50 %	167622315
8031	NC_010334	CGAT	2	8	441558	441565	25 %	25 %	25 %	25 %	167622315
8032	NC_010334	ACC	2	6	441623	441628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622315
8033	NC_010334	GCC	2	6	441638	441643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622315
8034	NC_010334	GCA	2	6	441742	441747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622315
8035	NC_010334	G	6	6	441760	441765	0 %	0 %	100 %	0 %	167622315
8036	NC_010334	GTCT	2	8	441793	441800	0 %	50 %	25 %	25 %	167622315
8037	NC_010334	TGGA	2	8	441809	441816	25 %	25 %	50 %	0 %	167622315
8038	NC_010334	ATG	2	6	441818	441823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622315
8039	NC_010334	GGC	2	6	441878	441883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622315
8040	NC_010334	GC	3	6	441959	441964	0 %	0 %	50 %	50 %	167622315
8041	NC_010334	AT	3	6	441966	441971	50 %	50 %	0 %	0 %	167622315
8042	NC_010334	TCA	2	6	442024	442029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622315
8043	NC_010334	TA	3	6	442081	442086	50 %	50 %	0 %	0 %	167622315
8044	NC_010334	CTG	2	6	442144	442149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622315
8045	NC_010334	ACCG	2	8	442184	442191	25 %	0 %	25 %	50 %	167622315
8046	NC_010334	GTTGAG	2	12	442220	442231	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	167622315
8047	NC_010334	CG	3	6	442245	442250	0 %	0 %	50 %	50 %	167622315
8048	NC_010334	CTT	2	6	442462	442467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622315
8049	NC_010334	TAAG	2	8	442468	442475	50 %	25 %	25 %	0 %	167622315
8050	NC_010334	CCA	2	6	442561	442566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622315
8051	NC_010334	TGCT	2	8	442644	442651	0 %	50 %	25 %	25 %	167622316
8052	NC_010334	CTG	2	6	442661	442666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622316
8053	NC_010334	CTCA	2	8	442747	442754	25 %	25 %	0 %	50 %	167622316
8054	NC_010334	ACT	2	6	442774	442779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622316
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8056	NC_010334	GCAG	2	8	442884	442891	25 %	0 %	50 %	25 %	167622316
8057	NC_010334	AGC	2	6	442916	442921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622316
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8059	NC_010334	GTA	2	6	443058	443063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622316
8060	NC_010334	GCT	2	6	443127	443132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622316
8061	NC_010334	TGG	2	6	443198	443203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622316
8062	NC_010334	GCA	2	6	443270	443275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622316
8063	NC_010334	GCG	2	6	443474	443479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622316
8064	NC_010334	CGT	2	6	443485	443490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622316
8065	NC_010334	CG	3	6	443530	443535	0 %	0 %	50 %	50 %	167622316
8066	NC_010334	T	6	6	443659	443664	0 %	100 %	0 %	0 %	167622316
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8070	NC_010334	ATC	2	6	444062	444067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622316
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8074	NC_010334	TGA	2	6	444270	444275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622316
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8081	NC_010334	TGG	2	6	444731	444736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622317
8082	NC_010334	TATCGA	2	12	444769	444780	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167622318
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8092	NC_010334	CAG	2	6	445193	445198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622318
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8104	NC_010334	CA	3	6	445933	445938	50 %	0 %	0 %	50 %	167622318
8105	NC_010334	GCT	2	6	445958	445963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622318
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8109	NC_010334	GCT	2	6	446080	446085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622318
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8112	NC_010334	TCA	2	6	446327	446332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622319
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8120	NC_010334	GAC	2	6	446706	446711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622320
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8122	NC_010334	CTG	2	6	446769	446774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622320
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8158	NC_010334	TAA	2	6	448871	448876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8159	NC_010334	ACTC	2	8	448974	448981	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8218	NC_010334	TGA	2	6	452143	452148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8220	NC_010334	A	6	6	452167	452172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8221	NC_010334	CAAT	2	8	452282	452289	50 %	25 %	0 %	25 %	167622326
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8229	NC_010334	TAAG	2	8	452745	452752	50 %	25 %	25 %	0 %	167622326
8230	NC_010334	CCA	2	6	452797	452802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622326
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8232	NC_010334	GCA	2	6	452833	452838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622326
8233	NC_010334	CAA	2	6	453029	453034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622326
8234	NC_010334	CTAA	2	8	453094	453101	50 %	25 %	0 %	25 %	167622326
8235	NC_010334	A	6	6	453127	453132	100 %	0 %	0 %	0 %	167622326
8236	NC_010334	CCG	2	6	453133	453138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622326
8237	NC_010334	AATAA	2	10	453148	453157	80 %	20 %	0 %	0 %	167622326
8238	NC_010334	T	7	7	453208	453214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8239	NC_010334	CCA	2	6	453244	453249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8240	NC_010334	TAAA	2	8	453281	453288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8241	NC_010334	A	6	6	453286	453291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8243	NC_010334	CTT	2	6	453400	453405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622327
8244	NC_010334	GA	3	6	453544	453549	50 %	0 %	50 %	0 %	167622327
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8272	NC_010334	TAA	2	6	455066	455071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8273	NC_010334	TAAT	2	8	455078	455085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8343	NC_010334	A	7	7	459305	459311	100 %	0 %	0 %	0 %	167622332
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8353	NC_010334	ATTT	2	8	459930	459937	25 %	75 %	0 %	0 %	167622333
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8492	NC_010334	TGA	2	6	467316	467321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8493	NC_010334	TTTTG	2	10	467324	467333	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8494	NC_010334	CAT	2	6	467416	467421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622339
8495	NC_010334	CAA	2	6	467557	467562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622339
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8499	NC_010334	CGG	2	6	467658	467663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622339
8500	NC_010334	AGC	2	6	467682	467687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622339

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