MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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82120	NC_010334	CAA	2	6	4533283	4533288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167625641
82121	NC_010334	CT	3	6	4533353	4533358	0 %	50 %	0 %	50 %	167625641
82122	NC_010334	GAT	2	6	4533397	4533402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167625641
82123	NC_010334	TGA	2	6	4533406	4533411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167625641
82124	NC_010334	TGA	2	6	4533605	4533610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167625641
82125	NC_010334	GCA	2	6	4533621	4533626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167625641
82126	NC_010334	CAA	2	6	4533762	4533767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167625641
82127	NC_010334	TCA	2	6	4533768	4533773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625641
82128	NC_010334	CCAT	2	8	4533794	4533801	25 %	25 %	0 %	50 %	167625641
82129	NC_010334	TATC	2	8	4533822	4533829	25 %	50 %	0 %	25 %	167625641
82130	NC_010334	AAGT	2	8	4533899	4533906	50 %	25 %	25 %	0 %	167625641
82131	NC_010334	TC	3	6	4533914	4533919	0 %	50 %	0 %	50 %	167625641
82132	NC_010334	A	6	6	4533962	4533967	100 %	0 %	0 %	0 %	167625641
82133	NC_010334	CTT	2	6	4534211	4534216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167625642
82134	NC_010334	TATC	2	8	4534366	4534373	25 %	50 %	0 %	25 %	167625642
82135	NC_010334	GCCTCA	2	12	4534407	4534418	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	167625642
82136	NC_010334	AGCTGC	2	12	4534449	4534460	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	167625642
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82138	NC_010334	GC	3	6	4534631	4534636	0 %	0 %	50 %	50 %	167625642
82139	NC_010334	CCAG	2	8	4534639	4534646	25 %	0 %	25 %	50 %	167625642
82140	NC_010334	ATC	2	6	4534664	4534669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625642
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82142	NC_010334	AAT	2	6	4534733	4534738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167625642
82143	NC_010334	TAT	2	6	4534765	4534770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167625642
82144	NC_010334	TAA	2	6	4534771	4534776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167625642
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82146	NC_010334	TTG	2	6	4534905	4534910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167625642
82147	NC_010334	AAT	3	9	4535034	4535042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167625642
82148	NC_010334	CTT	2	6	4535094	4535099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82149	NC_010334	TGA	2	6	4535183	4535188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82150	NC_010334	AAAAT	2	10	4535214	4535223	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82151	NC_010334	CAA	2	6	4535274	4535279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82152	NC_010334	T	6	6	4535287	4535292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82153	NC_010334	GGCT	2	8	4535393	4535400	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82154	NC_010334	TCTTA	2	10	4535401	4535410	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82155	NC_010334	TCAT	2	8	4535412	4535419	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82156	NC_010334	TCTGAC	2	12	4535457	4535468	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167625643
82157	NC_010334	CAT	2	6	4535491	4535496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625643
82158	NC_010334	CAC	2	6	4535558	4535563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167625643
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82165	NC_010334	TGC	2	6	4535784	4535789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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82167	NC_010334	TGC	2	6	4535865	4535870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167625644
82168	NC_010334	GTAA	2	8	4536100	4536107	50 %	25 %	25 %	0 %	167625644
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82174	NC_010334	CTG	2	6	4536322	4536327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167625644
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82200	NC_010334	TCA	2	6	4538015	4538020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625645
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82202	NC_010334	GTGATG	2	12	4538127	4538138	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	167625645
82203	NC_010334	CCA	2	6	4538207	4538212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167625645
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82205	NC_010334	GATC	2	8	4538270	4538277	25 %	25 %	25 %	25 %	167625645
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82207	NC_010334	TTTA	2	8	4538553	4538560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82208	NC_010334	A	6	6	4538743	4538748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82209	NC_010334	TTA	2	6	4538794	4538799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167625646
82210	NC_010334	TCT	2	6	4538808	4538813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167625646
82211	NC_010334	CTG	2	6	4538841	4538846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167625646
82212	NC_010334	AGC	2	6	4538859	4538864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167625646
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82214	NC_010334	TGA	2	6	4539110	4539115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167625646
82215	NC_010334	CAC	2	6	4539252	4539257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167625646
82216	NC_010334	TAA	2	6	4539279	4539284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167625646
82217	NC_010334	TCT	2	6	4539306	4539311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167625646
82218	NC_010334	TGCT	2	8	4539358	4539365	0 %	50 %	25 %	25 %	167625646
82219	NC_010334	ATC	2	6	4539406	4539411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625646
82220	NC_010334	GT	3	6	4539540	4539545	0 %	50 %	50 %	0 %	167625646
82221	NC_010334	CAC	2	6	4539603	4539608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167625646
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82223	NC_010334	TCC	2	6	4539755	4539760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167625646
82224	NC_010334	GCTTA	2	10	4539865	4539874	20 %	40 %	20 %	20 %	167625646
82225	NC_010334	AAG	2	6	4539893	4539898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167625646
82226	NC_010334	ACT	2	6	4540034	4540039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625646
82227	NC_010334	GTTAGC	2	12	4540121	4540132	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167625646
82228	NC_010334	AGG	2	6	4540222	4540227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167625646
82229	NC_010334	GTT	2	6	4540228	4540233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167625646
82230	NC_010334	GGA	2	6	4540241	4540246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167625646
82231	NC_010334	CAT	3	9	4540257	4540265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625646
82232	NC_010334	TCA	2	6	4540341	4540346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625646
82233	NC_010334	TCA	2	6	4540364	4540369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82234	NC_010334	T	7	7	4540370	4540376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82235	NC_010334	TTA	2	6	4540389	4540394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82236	NC_010334	CAAA	2	8	4540413	4540420	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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82472	NC_010334	GAT	2	6	4553089	4553094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167625656
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82474	NC_010334	GTAC	2	8	4553290	4553297	25 %	25 %	25 %	25 %	167625656
82475	NC_010334	TCA	2	6	4553380	4553385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625656
82476	NC_010334	TGT	2	6	4553393	4553398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167625656
82477	NC_010334	TTA	2	6	4553404	4553409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167625656
82478	NC_010334	ATC	2	6	4553488	4553493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625656
82479	NC_010334	TCAA	2	8	4553506	4553513	50 %	25 %	0 %	25 %	167625656
82480	NC_010334	ATC	2	6	4553593	4553598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625656
82481	NC_010334	ATC	3	9	4553704	4553712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167625656
82482	NC_010334	TAA	2	6	4553744	4553749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167625656
82483	NC_010334	AAT	2	6	4553793	4553798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167625656
82484	NC_010334	TGCTGT	2	12	4553830	4553841	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	167625656
82485	NC_010334	ACC	2	6	4553898	4553903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167625656
82486	NC_010334	AACC	2	8	4553973	4553980	50 %	0 %	0 %	50 %	167625656
82487	NC_010334	GA	3	6	4554021	4554026	50 %	0 %	50 %	0 %	167625656
82488	NC_010334	TGG	2	6	4554060	4554065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167625656
82489	NC_010334	ATA	3	9	4554124	4554132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167625656
82490	NC_010334	TTA	2	6	4554137	4554142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167625656
82491	NC_010334	ATTTTC	2	12	4554185	4554196	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82492	NC_010334	ATTA	2	8	4554256	4554263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82493	NC_010334	A	6	6	4554287	4554292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82494	NC_010334	TAAT	2	8	4554297	4554304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82495	NC_010334	TAGA	2	8	4554376	4554383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82496	NC_010334	CAA	2	6	4554387	4554392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82497	NC_010334	TAA	2	6	4554457	4554462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82498	NC_010334	A	6	6	4554490	4554495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82499	NC_010334	ATA	2	6	4554515	4554520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82500	NC_010334	CTG	2	6	4554554	4554559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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