MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010334	CTT	2	6	250124	250129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_010334	TCTT	2	8	250165	250172	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4503	NC_010334	AAC	2	6	250304	250309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622150
4504	NC_010334	GCC	2	6	250316	250321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622150
4505	NC_010334	AAT	2	6	250345	250350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622150
4506	NC_010334	GTA	2	6	250368	250373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622150
4507	NC_010334	TGA	2	6	250393	250398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622150
4508	NC_010334	CTG	2	6	250408	250413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622150
4509	NC_010334	AGT	2	6	250491	250496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622150
4510	NC_010334	TAA	2	6	250579	250584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622150
4511	NC_010334	ATCA	2	8	250631	250638	50 %	25 %	0 %	25 %	167622150
4512	NC_010334	CGC	2	6	250645	250650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622150
4513	NC_010334	CAA	2	6	250810	250815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622150
4514	NC_010334	CTC	2	6	250844	250849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167622150
4515	NC_010334	GCC	2	6	250985	250990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622150
4516	NC_010334	T	6	6	251030	251035	0 %	100 %	0 %	0 %	167622150
4517	NC_010334	GCA	2	6	251056	251061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622150
4518	NC_010334	TA	3	6	251159	251164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_010334	CAT	2	6	251212	251217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622151
4520	NC_010334	TGC	2	6	251303	251308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622151
4521	NC_010334	AGAT	2	8	251321	251328	50 %	25 %	25 %	0 %	167622151
4522	NC_010334	AG	3	6	251362	251367	50 %	0 %	50 %	0 %	167622151
4523	NC_010334	GTC	2	6	251369	251374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622151
4524	NC_010334	GCT	2	6	251409	251414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622151
4525	NC_010334	GGC	2	6	251497	251502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622151
4526	NC_010334	AGA	2	6	251508	251513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622151
4527	NC_010334	ATC	2	6	251575	251580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622151
4528	NC_010334	TGG	2	6	251691	251696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622151
4529	NC_010334	AG	4	8	251707	251714	50 %	0 %	50 %	0 %	167622151
4530	NC_010334	GCT	2	6	251757	251762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622151
4531	NC_010334	GA	3	6	251940	251945	50 %	0 %	50 %	0 %	167622151
4532	NC_010334	CTAT	2	8	251981	251988	25 %	50 %	0 %	25 %	167622151
4533	NC_010334	TAA	2	6	252043	252048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622151
4534	NC_010334	CGTGG	2	10	252144	252153	0 %	20 %	60 %	20 %	167622151
4535	NC_010334	CTT	2	6	252190	252195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622151
4536	NC_010334	GCA	2	6	252312	252317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622151
4537	NC_010334	CA	4	8	252546	252553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4538	NC_010334	T	6	6	252564	252569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_010334	CA	4	8	252705	252712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4540	NC_010334	T	7	7	252723	252729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_010334	CA	4	8	252865	252872	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4542	NC_010334	T	6	6	252883	252888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_010334	A	6	6	252900	252905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_010334	GCT	2	6	252931	252936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_010334	CTT	2	6	252996	253001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622152
4546	NC_010334	AGTG	2	8	253012	253019	25 %	25 %	50 %	0 %	167622152
4547	NC_010334	CGC	2	6	253025	253030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622152
4548	NC_010334	CCG	2	6	253072	253077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622152
4549	NC_010334	GCAC	2	8	253093	253100	25 %	0 %	25 %	50 %	167622152
4550	NC_010334	GAC	2	6	253256	253261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622152
4551	NC_010334	AGTG	2	8	253393	253400	25 %	25 %	50 %	0 %	167622152
4552	NC_010334	GCT	2	6	253436	253441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622152
4553	NC_010334	CAA	2	6	253442	253447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622152
4554	NC_010334	GC	3	6	253585	253590	0 %	0 %	50 %	50 %	167622152
4555	NC_010334	GGT	2	6	253647	253652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622152
4556	NC_010334	TTG	2	6	253666	253671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622152
4557	NC_010334	TTG	2	6	253759	253764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622152
4558	NC_010334	GAA	2	6	253818	253823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622152
4559	NC_010334	AAC	2	6	253968	253973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622152
4560	NC_010334	GTAA	2	8	253986	253993	50 %	25 %	25 %	0 %	167622152
4561	NC_010334	GTG	2	6	254018	254023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622152
4562	NC_010334	TCTT	2	8	254077	254084	0 %	75 %	0 %	25 %	167622152
4563	NC_010334	TGG	2	6	254117	254122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622152
4564	NC_010334	GTT	2	6	254190	254195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622152
4565	NC_010334	TCT	2	6	254287	254292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622152
4566	NC_010334	CAT	2	6	254357	254362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622152
4567	NC_010334	GTGA	2	8	254375	254382	25 %	25 %	50 %	0 %	167622152
4568	NC_010334	AGC	2	6	254390	254395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622152
4569	NC_010334	AGTT	2	8	254489	254496	25 %	50 %	25 %	0 %	167622152
4570	NC_010334	CTT	2	6	254519	254524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622152
4571	NC_010334	TGT	2	6	254657	254662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622152
4572	NC_010334	CGC	2	6	254663	254668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622152
4573	NC_010334	ATC	2	6	254688	254693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622152
4574	NC_010334	ATG	2	6	254722	254727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622152
4575	NC_010334	TGGC	2	8	254783	254790	0 %	25 %	50 %	25 %	167622152
4576	NC_010334	TAGCTA	2	12	254884	254895	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167622152
4577	NC_010334	CCAT	2	8	254896	254903	25 %	25 %	0 %	50 %	167622152
4578	NC_010334	GGC	2	6	255006	255011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622152
4579	NC_010334	GCA	2	6	255025	255030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622152
4580	NC_010334	GTTC	2	8	255053	255060	0 %	50 %	25 %	25 %	167622152
4581	NC_010334	TAT	2	6	255086	255091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622152
4582	NC_010334	GTA	2	6	255139	255144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622152
4583	NC_010334	ACC	2	6	255150	255155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622152
4584	NC_010334	CAT	2	6	255182	255187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622152
4585	NC_010334	CCA	2	6	255200	255205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622152
4586	NC_010334	TTTG	2	8	255258	255265	0 %	75 %	25 %	0 %	167622152
4587	NC_010334	TCA	3	9	255269	255277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622152
4588	NC_010334	TC	3	6	255282	255287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4589	NC_010334	TCT	2	6	255295	255300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_010334	ACG	2	6	255321	255326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_010334	A	6	6	255328	255333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_010334	T	6	6	255394	255399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_010334	CAG	2	6	255410	255415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_010334	TAT	2	6	255521	255526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_010334	CGG	3	9	255760	255768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622153
4596	NC_010334	GTCA	2	8	255774	255781	25 %	25 %	25 %	25 %	167622153
4597	NC_010334	ACCG	2	8	255817	255824	25 %	0 %	25 %	50 %	167622153
4598	NC_010334	AGA	2	6	255928	255933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622153
4599	NC_010334	AAAG	2	8	256111	256118	75 %	0 %	25 %	0 %	167622153
4600	NC_010334	GAT	2	6	256232	256237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622153
4601	NC_010334	GCA	2	6	256304	256309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622153
4602	NC_010334	AG	3	6	256366	256371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_010334	GAGGC	2	10	256458	256467	20 %	0 %	60 %	20 %	167622154
4604	NC_010334	AAG	2	6	256470	256475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622154
4605	NC_010334	TGC	2	6	256529	256534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622154
4606	NC_010334	ATC	2	6	256557	256562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622154
4607	NC_010334	ATTA	2	8	256598	256605	50 %	50 %	0 %	0 %	167622154
4608	NC_010334	GGC	2	6	256610	256615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622154
4609	NC_010334	ATG	2	6	256632	256637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622154
4610	NC_010334	ACC	3	9	256648	256656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622154
4611	NC_010334	CAG	2	6	256724	256729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622154
4612	NC_010334	ACG	2	6	256734	256739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622154
4613	NC_010334	ATC	2	6	256776	256781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622154
4614	NC_010334	GTGA	2	8	256785	256792	25 %	25 %	50 %	0 %	167622154
4615	NC_010334	TGG	2	6	256885	256890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622154
4616	NC_010334	GCG	2	6	256937	256942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622154
4617	NC_010334	GTC	3	9	256973	256981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622154
4618	NC_010334	GCGGTG	2	12	257037	257048	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	167622154
4619	NC_010334	ATG	2	6	257070	257075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622154
4620	NC_010334	TCAA	2	8	257136	257143	50 %	25 %	0 %	25 %	167622154
4621	NC_010334	TCC	2	6	257172	257177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167622154
4622	NC_010334	CGT	2	6	257221	257226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622154
4623	NC_010334	GAC	2	6	257227	257232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622154
4624	NC_010334	AT	3	6	257244	257249	50 %	50 %	0 %	0 %	167622154
4625	NC_010334	TCA	3	9	257253	257261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622154
4626	NC_010334	GCG	2	6	257300	257305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622154
4627	NC_010334	CACTC	2	10	257479	257488	20 %	20 %	0 %	60 %	167622154
4628	NC_010334	TCT	2	6	257496	257501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622154
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4630	NC_010334	AGT	2	6	257661	257666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622154
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4632	NC_010334	TGC	2	6	257721	257726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622154
4633	NC_010334	GTT	2	6	257812	257817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622154
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4635	NC_010334	GTT	2	6	257941	257946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4636	NC_010334	AAT	2	6	257958	257963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4637	NC_010334	AGG	2	6	258011	258016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4638	NC_010334	GT	3	6	258030	258035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4639	NC_010334	A	9	9	258057	258065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4640	NC_010334	CCA	2	6	258153	258158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4645	NC_010334	CGG	2	6	258536	258541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622155
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4648	NC_010334	TTC	2	6	258744	258749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622155
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4655	NC_010334	AG	4	8	259114	259121	50 %	0 %	50 %	0 %	167622155
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4657	NC_010334	CGC	2	6	259196	259201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622155
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4661	NC_010334	TTGTT	2	10	259355	259364	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4662	NC_010334	AT	3	6	259436	259441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4663	NC_010334	TGTA	2	8	259540	259547	25 %	50 %	25 %	0 %	167622156
4664	NC_010334	TGC	2	6	259553	259558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622156
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4689	NC_010334	TTG	2	6	260930	260935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4690	NC_010334	ATT	2	6	260938	260943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4691	NC_010334	TAC	2	6	260992	260997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4730	NC_010334	ACCGAC	2	12	263163	263174	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	167622159
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4740	NC_010334	TCA	2	6	263834	263839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622160
4741	NC_010334	TCT	2	6	263853	263858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622160
4742	NC_010334	CGG	2	6	263964	263969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622160
4743	NC_010334	CTG	2	6	264102	264107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622160
4744	NC_010334	GAT	2	6	264109	264114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622160
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4998	NC_010334	AGA	2	6	276735	276740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622170
4999	NC_010334	CTC	2	6	276765	276770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167622170
5000	NC_010334	TGC	2	6	276866	276871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622170

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