MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 102272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
96001	NC_010102	AGC	2	6	4551343	4551348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617553
96002	NC_010102	GCT	2	6	4551351	4551356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617553
96003	NC_010102	CGA	2	6	4551382	4551387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617553
96004	NC_010102	A	8	8	4551422	4551429	100 %	0 %	0 %	0 %	161617553
96005	NC_010102	GAA	2	6	4551460	4551465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161617553
96006	NC_010102	TCCC	2	8	4551527	4551534	0 %	25 %	0 %	75 %	161617553
96007	NC_010102	GGCA	2	8	4551565	4551572	25 %	0 %	50 %	25 %	161617553
96008	NC_010102	TGC	2	6	4551656	4551661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617553
96009	NC_010102	TCT	2	6	4551740	4551745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617554
96010	NC_010102	TGGC	2	8	4551799	4551806	0 %	25 %	50 %	25 %	161617554
96011	NC_010102	GCG	2	6	4551922	4551927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617554
96012	NC_010102	CAG	2	6	4552014	4552019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617554
96013	NC_010102	AGC	2	6	4552028	4552033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617554
96014	NC_010102	TGA	2	6	4552068	4552073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617554
96015	NC_010102	TCT	2	6	4552083	4552088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617554
96016	NC_010102	TGG	2	6	4552235	4552240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617554
96017	NC_010102	ACA	2	6	4552251	4552256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161617554
96018	NC_010102	GCA	2	6	4552294	4552299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617554
96019	NC_010102	GCA	2	6	4552389	4552394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617554
96020	NC_010102	TGC	2	6	4552418	4552423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617554
96021	NC_010102	GAA	2	6	4552474	4552479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161617554
96022	NC_010102	GGTC	2	8	4552554	4552561	0 %	25 %	50 %	25 %	161617554
96023	NC_010102	AG	3	6	4552587	4552592	50 %	0 %	50 %	0 %	161617554
96024	NC_010102	GCA	2	6	4552735	4552740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617554
96025	NC_010102	GCA	2	6	4552801	4552806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617554
96026	NC_010102	TCTT	2	8	4552809	4552816	0 %	75 %	0 %	25 %	161617554
96027	NC_010102	TCG	2	6	4552887	4552892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617554
96028	NC_010102	GGA	2	6	4552947	4552952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161617554
96029	NC_010102	ATC	2	6	4553008	4553013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617554
96030	NC_010102	GAC	2	6	4553023	4553028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617554
96031	NC_010102	CA	3	6	4553062	4553067	50 %	0 %	0 %	50 %	161617554
96032	NC_010102	TGA	2	6	4553141	4553146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617554
96033	NC_010102	ATG	2	6	4553152	4553157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617554
96034	NC_010102	AGC	2	6	4553226	4553231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617554
96035	NC_010102	CATGGG	2	12	4553270	4553281	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	161617554
96036	NC_010102	CTG	2	6	4553437	4553442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617554
96037	NC_010102	G	6	6	4553468	4553473	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
96038	NC_010102	CAG	2	6	4553621	4553626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617555
96039	NC_010102	CAC	2	6	4553656	4553661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617555
96040	NC_010102	ACC	2	6	4553669	4553674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617555
96041	NC_010102	AG	3	6	4553778	4553783	50 %	0 %	50 %	0 %	161617555
96042	NC_010102	TGT	2	6	4553836	4553841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161617555
96043	NC_010102	AAG	2	6	4554008	4554013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161617556
96044	NC_010102	CA	3	6	4554108	4554113	50 %	0 %	0 %	50 %	161617556
96045	NC_010102	T	6	6	4554119	4554124	0 %	100 %	0 %	0 %	161617556
96046	NC_010102	GA	3	6	4554166	4554171	50 %	0 %	50 %	0 %	161617556
96047	NC_010102	ATC	2	6	4554180	4554185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617556
96048	NC_010102	CTGC	2	8	4554213	4554220	0 %	25 %	25 %	50 %	161617556
96049	NC_010102	TGGT	2	8	4554253	4554260	0 %	50 %	50 %	0 %	161617556
96050	NC_010102	CTC	2	6	4554271	4554276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161617556
96051	NC_010102	GCA	2	6	4554294	4554299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617556
96052	NC_010102	GAA	2	6	4554311	4554316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161617556
96053	NC_010102	AAT	2	6	4554335	4554340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161617556
96054	NC_010102	CTG	2	6	4554484	4554489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617556
96055	NC_010102	CCA	2	6	4554491	4554496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617556
96056	NC_010102	TGA	2	6	4554526	4554531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617556
96057	NC_010102	AAC	2	6	4554549	4554554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161617556
96058	NC_010102	ACA	2	6	4554600	4554605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161617556
96059	NC_010102	CAGGA	2	10	4554668	4554677	40 %	0 %	40 %	20 %	161617556
96060	NC_010102	CAC	2	6	4554691	4554696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617556
96061	NC_010102	GCC	2	6	4554710	4554715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617556
96062	NC_010102	A	6	6	4554741	4554746	100 %	0 %	0 %	0 %	161617556
96063	NC_010102	TCCGT	2	10	4554752	4554761	0 %	40 %	20 %	40 %	161617556
96064	NC_010102	TGA	2	6	4554770	4554775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617556
96065	NC_010102	A	6	6	4554829	4554834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96066	NC_010102	ATGA	2	8	4554869	4554876	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96067	NC_010102	TTG	2	6	4554908	4554913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96068	NC_010102	CCTTT	2	10	4554935	4554944	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
96069	NC_010102	AGA	2	6	4555007	4555012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161617557
96070	NC_010102	CAT	2	6	4555047	4555052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617557
96071	NC_010102	ACC	2	6	4555085	4555090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617557
96072	NC_010102	GAA	2	6	4555164	4555169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161617557
96073	NC_010102	TGC	2	6	4555288	4555293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617557
96074	NC_010102	AC	3	6	4555317	4555322	50 %	0 %	0 %	50 %	161617557
96075	NC_010102	GAT	2	6	4555334	4555339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617557
96076	NC_010102	AAT	2	6	4555359	4555364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161617557
96077	NC_010102	CAG	2	6	4555386	4555391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617557
96078	NC_010102	GCTG	2	8	4555444	4555451	0 %	25 %	50 %	25 %	161617557
96079	NC_010102	TGC	2	6	4555462	4555467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617557
96080	NC_010102	GGGAA	2	10	4555480	4555489	40 %	0 %	60 %	0 %	161617557
96081	NC_010102	CCT	2	6	4555550	4555555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96082	NC_010102	ATTT	2	8	4555560	4555567	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96083	NC_010102	GA	3	6	4555598	4555603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96084	NC_010102	TCT	2	6	4555608	4555613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96085	NC_010102	ATC	2	6	4555627	4555632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96086	NC_010102	GAG	2	6	4555768	4555773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96087	NC_010102	AC	3	6	4555789	4555794	50 %	0 %	0 %	50 %	161617558
96088	NC_010102	AGC	2	6	4555809	4555814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617558
96089	NC_010102	TTAA	2	8	4555845	4555852	50 %	50 %	0 %	0 %	161617558
96090	NC_010102	CTA	2	6	4555865	4555870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617558
96091	NC_010102	CGT	2	6	4555909	4555914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617558
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96098	NC_010102	C	6	6	4556371	4556376	0 %	0 %	0 %	100 %	161617558
96099	NC_010102	GCA	2	6	4556439	4556444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617558
96100	NC_010102	TTG	2	6	4556527	4556532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161617558
96101	NC_010102	G	6	6	4556542	4556547	0 %	0 %	100 %	0 %	161617558
96102	NC_010102	TTG	2	6	4556639	4556644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161617558
96103	NC_010102	CTG	2	6	4556658	4556663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617558
96104	NC_010102	GACA	2	8	4556665	4556672	50 %	0 %	25 %	25 %	161617558
96105	NC_010102	GTTC	2	8	4556693	4556700	0 %	50 %	25 %	25 %	161617558
96106	NC_010102	TCTA	2	8	4556723	4556730	25 %	50 %	0 %	25 %	161617558
96107	NC_010102	T	6	6	4556813	4556818	0 %	100 %	0 %	0 %	161617558
96108	NC_010102	GT	3	6	4556906	4556911	0 %	50 %	50 %	0 %	161617558
96109	NC_010102	GCA	2	6	4556913	4556918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617558
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96111	NC_010102	TGT	2	6	4557068	4557073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161617559
96112	NC_010102	AAAG	2	8	4557074	4557081	75 %	0 %	25 %	0 %	161617559
96113	NC_010102	CA	3	6	4557270	4557275	50 %	0 %	0 %	50 %	161617559
96114	NC_010102	TGA	2	6	4557397	4557402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617559
96115	NC_010102	CAC	2	6	4557441	4557446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617559
96116	NC_010102	CAT	2	6	4557529	4557534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617559
96117	NC_010102	GCA	2	6	4557575	4557580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96118	NC_010102	ACT	2	6	4557608	4557613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617560
96119	NC_010102	TCT	2	6	4557655	4557660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617560
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96191	NC_010102	TCCT	2	8	4561146	4561153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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96220	NC_010102	AGC	2	6	4562617	4562622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96221	NC_010102	TGG	2	6	4562682	4562687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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96224	NC_010102	AT	3	6	4562748	4562753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96225	NC_010102	TG	3	6	4562765	4562770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96226	NC_010102	TCA	2	6	4563012	4563017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617566
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96229	NC_010102	AAC	2	6	4563113	4563118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96230	NC_010102	CA	3	6	4563233	4563238	50 %	0 %	0 %	50 %	161617567
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96232	NC_010102	TAAT	2	8	4563403	4563410	50 %	50 %	0 %	0 %	161617567
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96472	NC_010102	GAG	2	6	4577916	4577921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161617589
96473	NC_010102	GCCT	2	8	4577936	4577943	0 %	25 %	25 %	50 %	161617589
96474	NC_010102	CTGGG	2	10	4577960	4577969	0 %	20 %	60 %	20 %	161617589
96475	NC_010102	TCA	2	6	4577975	4577980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617589
96476	NC_010102	GGA	2	6	4578085	4578090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161617589
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96481	NC_010102	CAT	2	6	4578233	4578238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617589
96482	NC_010102	GAA	2	6	4578333	4578338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161617589
96483	NC_010102	AACA	2	8	4578344	4578351	75 %	0 %	0 %	25 %	161617589
96484	NC_010102	TGC	2	6	4578473	4578478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617589
96485	NC_010102	GTC	2	6	4578536	4578541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617589
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96487	NC_010102	TGC	2	6	4578632	4578637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617589
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96490	NC_010102	GCTG	2	8	4578727	4578734	0 %	25 %	50 %	25 %	161617589
96491	NC_010102	ATC	2	6	4578737	4578742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617589
96492	NC_010102	T	7	7	4578830	4578836	0 %	100 %	0 %	0 %	161617589
96493	NC_010102	A	6	6	4578886	4578891	100 %	0 %	0 %	0 %	161617589
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96499	NC_010102	GAT	2	6	4579144	4579149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617590
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