MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 102272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
90001	NC_010102	GCC	2	6	4264170	4264175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617250
90002	NC_010102	AGG	2	6	4264208	4264213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161617250
90003	NC_010102	GCA	2	6	4264303	4264308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617250
90004	NC_010102	TTC	2	6	4264320	4264325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617250
90005	NC_010102	ATA	2	6	4264386	4264391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161617250
90006	NC_010102	GTG	2	6	4264392	4264397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617250
90007	NC_010102	CCG	2	6	4264450	4264455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617250
90008	NC_010102	AGGT	2	8	4264477	4264484	25 %	25 %	50 %	0 %	161617250
90009	NC_010102	GAC	2	6	4264518	4264523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617250
90010	NC_010102	CGG	2	6	4264532	4264537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617250
90011	NC_010102	CTT	2	6	4264556	4264561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617250
90012	NC_010102	CGCCAG	2	12	4264587	4264598	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	161617250
90013	NC_010102	GCC	2	6	4264617	4264622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617250
90014	NC_010102	TGG	2	6	4264631	4264636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617250
90015	NC_010102	CGC	2	6	4264637	4264642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617250
90016	NC_010102	GC	4	8	4264654	4264661	0 %	0 %	50 %	50 %	161617250
90017	NC_010102	CAG	2	6	4264701	4264706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617250
90018	NC_010102	GC	3	6	4264715	4264720	0 %	0 %	50 %	50 %	161617250
90019	NC_010102	GCA	3	9	4264766	4264774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617250
90020	NC_010102	GC	3	6	4264817	4264822	0 %	0 %	50 %	50 %	161617250
90021	NC_010102	CCG	3	9	4264915	4264923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617250
90022	NC_010102	T	6	6	4264949	4264954	0 %	100 %	0 %	0 %	161617250
90023	NC_010102	GC	3	6	4264963	4264968	0 %	0 %	50 %	50 %	161617250
90024	NC_010102	CGC	2	6	4264997	4265002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617250
90025	NC_010102	CCAG	2	8	4265096	4265103	25 %	0 %	25 %	50 %	161617250
90026	NC_010102	AAT	2	6	4265123	4265128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161617250
90027	NC_010102	CG	3	6	4265137	4265142	0 %	0 %	50 %	50 %	161617250
90028	NC_010102	AAT	2	6	4265181	4265186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161617250
90029	NC_010102	TC	3	6	4265201	4265206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90030	NC_010102	TTG	2	6	4265291	4265296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161617251
90031	NC_010102	AAGG	2	8	4265308	4265315	50 %	0 %	50 %	0 %	161617251
90032	NC_010102	GCC	2	6	4265376	4265381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617251
90033	NC_010102	CGC	2	6	4265449	4265454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617251
90034	NC_010102	GCC	2	6	4265508	4265513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617251
90035	NC_010102	CGG	2	6	4265539	4265544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617251
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90037	NC_010102	T	6	6	4265567	4265572	0 %	100 %	0 %	0 %	161617251
90038	NC_010102	CGG	2	6	4265599	4265604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617251
90039	NC_010102	CTT	2	6	4265656	4265661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617251
90040	NC_010102	CCA	2	6	4265662	4265667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617251
90041	NC_010102	TCGCG	2	10	4265674	4265683	0 %	20 %	40 %	40 %	161617251
90042	NC_010102	CTT	2	6	4265710	4265715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617251
90043	NC_010102	GCA	2	6	4265740	4265745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617251
90044	NC_010102	AGAT	2	8	4265752	4265759	50 %	25 %	25 %	0 %	161617251
90045	NC_010102	GCTG	2	8	4265765	4265772	0 %	25 %	50 %	25 %	161617251
90046	NC_010102	TGG	2	6	4265788	4265793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617251
90047	NC_010102	GC	3	6	4265816	4265821	0 %	0 %	50 %	50 %	161617251
90048	NC_010102	AGTTCA	2	12	4265884	4265895	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161617252
90049	NC_010102	GCA	2	6	4265900	4265905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617252
90050	NC_010102	CGG	2	6	4265921	4265926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617252
90051	NC_010102	GCG	2	6	4265929	4265934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617252
90052	NC_010102	TTC	2	6	4265955	4265960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617252
90053	NC_010102	ATG	2	6	4265965	4265970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617252
90054	NC_010102	CGG	2	6	4265971	4265976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617252
90055	NC_010102	ATG	2	6	4266040	4266045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617252
90056	NC_010102	GC	3	6	4266087	4266092	0 %	0 %	50 %	50 %	161617252
90057	NC_010102	TGG	2	6	4266101	4266106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617252
90058	NC_010102	CG	3	6	4266179	4266184	0 %	0 %	50 %	50 %	161617252
90059	NC_010102	AGCGGC	2	12	4266215	4266226	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	161617252
90060	NC_010102	CAG	3	9	4266231	4266239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617252
90061	NC_010102	CCT	2	6	4266263	4266268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161617252
90062	NC_010102	TGC	2	6	4266272	4266277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617252
90063	NC_010102	CTG	2	6	4266327	4266332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617252
90064	NC_010102	CAG	2	6	4266351	4266356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617252
90065	NC_010102	CAA	2	6	4266399	4266404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161617252
90066	NC_010102	GGC	2	6	4266407	4266412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617252
90067	NC_010102	GGC	2	6	4266447	4266452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617252
90068	NC_010102	GC	3	6	4266464	4266469	0 %	0 %	50 %	50 %	161617252
90069	NC_010102	GAACC	2	10	4266512	4266521	40 %	0 %	20 %	40 %	161617252
90070	NC_010102	CGC	2	6	4266536	4266541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617252
90071	NC_010102	CG	3	6	4266594	4266599	0 %	0 %	50 %	50 %	161617252
90072	NC_010102	TGT	2	6	4266620	4266625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161617252
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90078	NC_010102	GCT	2	6	4266809	4266814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617252
90079	NC_010102	ATC	2	6	4266868	4266873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617252
90080	NC_010102	CG	3	6	4266906	4266911	0 %	0 %	50 %	50 %	161617252
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90086	NC_010102	GC	3	6	4267124	4267129	0 %	0 %	50 %	50 %	161617252
90087	NC_010102	GGC	2	6	4267227	4267232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617252
90088	NC_010102	GC	3	6	4267260	4267265	0 %	0 %	50 %	50 %	161617252
90089	NC_010102	GCT	2	6	4267286	4267291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617252
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90099	NC_010102	GCGA	2	8	4267698	4267705	25 %	0 %	50 %	25 %	161617252
90100	NC_010102	GC	3	6	4267745	4267750	0 %	0 %	50 %	50 %	161617252
90101	NC_010102	GGC	2	6	4267839	4267844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617252
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90104	NC_010102	AC	3	6	4268010	4268015	50 %	0 %	0 %	50 %	161617252
90105	NC_010102	ACG	2	6	4268054	4268059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617252
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90109	NC_010102	GC	3	6	4268328	4268333	0 %	0 %	50 %	50 %	161617252
90110	NC_010102	CT	3	6	4268385	4268390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90111	NC_010102	TC	3	6	4268402	4268407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90112	NC_010102	AGG	2	6	4268421	4268426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90113	NC_010102	ATGTA	2	10	4268471	4268480	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90114	NC_010102	TGA	2	6	4268733	4268738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617253
90115	NC_010102	TGG	2	6	4268766	4268771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617254
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90117	NC_010102	A	6	6	4268852	4268857	100 %	0 %	0 %	0 %	161617254
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90234	NC_010102	GGC	2	6	4273730	4273735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617259
90235	NC_010102	GGC	2	6	4273775	4273780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617259
90236	NC_010102	CTTTCA	2	12	4273823	4273834	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	161617259
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90238	NC_010102	CGGCG	2	10	4273983	4273992	0 %	0 %	60 %	40 %	161617259
90239	NC_010102	TCA	2	6	4273999	4274004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617259
90240	NC_010102	GC	3	6	4274030	4274035	0 %	0 %	50 %	50 %	161617259
90241	NC_010102	TAG	2	6	4274088	4274093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617259
90242	NC_010102	CAAT	2	8	4274102	4274109	50 %	25 %	0 %	25 %	161617259
90243	NC_010102	TGC	2	6	4274119	4274124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617259
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90245	NC_010102	GC	3	6	4274190	4274195	0 %	0 %	50 %	50 %	161617259
90246	NC_010102	TGC	2	6	4274221	4274226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617259
90247	NC_010102	CTG	2	6	4274259	4274264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617259
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90251	NC_010102	AAAT	2	8	4274467	4274474	75 %	25 %	0 %	0 %	161617259
90252	NC_010102	GCAGCG	2	12	4274480	4274491	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	161617259
90253	NC_010102	TGA	2	6	4274498	4274503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617259
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90255	NC_010102	CGT	2	6	4274525	4274530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617259
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90258	NC_010102	GA	3	6	4274645	4274650	50 %	0 %	50 %	0 %	161617260
90259	NC_010102	AGCGTT	2	12	4274669	4274680	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161617260
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90262	NC_010102	CTG	2	6	4274882	4274887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617261
90263	NC_010102	CG	3	6	4274916	4274921	0 %	0 %	50 %	50 %	161617261
90264	NC_010102	CTGC	2	8	4274928	4274935	0 %	25 %	25 %	50 %	161617261
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90300	NC_010102	A	6	6	4276568	4276573	100 %	0 %	0 %	0 %	161617262
90301	NC_010102	CAG	2	6	4276586	4276591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617262
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90304	NC_010102	CGG	2	6	4276662	4276667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617263
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90314	NC_010102	GCA	2	6	4277109	4277114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617263
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90328	NC_010102	CGT	2	6	4277745	4277750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617263
90329	NC_010102	GTC	2	6	4277764	4277769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617263
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90331	NC_010102	CAG	3	9	4277824	4277832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617263
90332	NC_010102	CAGC	2	8	4277838	4277845	25 %	0 %	25 %	50 %	161617263
90333	NC_010102	GGC	2	6	4277881	4277886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617263
90334	NC_010102	GATC	2	8	4277887	4277894	25 %	25 %	25 %	25 %	161617263
90335	NC_010102	GCA	2	6	4277970	4277975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617263
90336	NC_010102	AGTTC	2	10	4277988	4277997	20 %	40 %	20 %	20 %	161617263
90337	NC_010102	GCTT	2	8	4278011	4278018	0 %	50 %	25 %	25 %	161617263
90338	NC_010102	CGG	2	6	4278149	4278154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617263
90339	NC_010102	GCT	2	6	4278240	4278245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617263
90340	NC_010102	CAG	2	6	4278256	4278261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617263
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90342	NC_010102	GC	3	6	4278332	4278337	0 %	0 %	50 %	50 %	161617263
90343	NC_010102	T	6	6	4278340	4278345	0 %	100 %	0 %	0 %	161617263
90344	NC_010102	CTT	2	6	4278375	4278380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617263
90345	NC_010102	GGCGT	2	10	4278404	4278413	0 %	20 %	60 %	20 %	161617263
90346	NC_010102	CCG	2	6	4278510	4278515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617263
90347	NC_010102	CGC	2	6	4278540	4278545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617263
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90466	NC_010102	TGG	2	6	4284495	4284500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617268
90467	NC_010102	GCG	2	6	4284530	4284535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617268
90468	NC_010102	CAGC	2	8	4284550	4284557	25 %	0 %	25 %	50 %	161617268
90469	NC_010102	TGC	2	6	4284606	4284611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617268
90470	NC_010102	CTG	2	6	4284656	4284661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617268
90471	NC_010102	CGTAC	2	10	4284674	4284683	20 %	20 %	20 %	40 %	161617268
90472	NC_010102	CAA	2	6	4284719	4284724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161617268
90473	NC_010102	CAA	2	6	4284765	4284770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161617268
90474	NC_010102	TGC	2	6	4284783	4284788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617268
90475	NC_010102	AG	3	6	4284919	4284924	50 %	0 %	50 %	0 %	161617268
90476	NC_010102	TGA	2	6	4284952	4284957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617268
90477	NC_010102	ATG	2	6	4284962	4284967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617268
90478	NC_010102	ATC	2	6	4284984	4284989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617268
90479	NC_010102	ATCGCG	2	12	4284999	4285010	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161617268
90480	NC_010102	GGCG	2	8	4285027	4285034	0 %	0 %	75 %	25 %	161617268
90481	NC_010102	TGG	2	6	4285158	4285163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617268
90482	NC_010102	CGG	2	6	4285164	4285169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617268
90483	NC_010102	ACT	2	6	4285183	4285188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617268
90484	NC_010102	CGT	2	6	4285262	4285267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617268
90485	NC_010102	CGC	2	6	4285296	4285301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617268
90486	NC_010102	ATGG	2	8	4285346	4285353	25 %	25 %	50 %	0 %	161617268
90487	NC_010102	CGC	2	6	4285397	4285402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617269
90488	NC_010102	GGT	2	6	4285439	4285444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617269
90489	NC_010102	AAT	2	6	4285508	4285513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161617269
90490	NC_010102	CGG	2	6	4285516	4285521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617269
90491	NC_010102	CGA	2	6	4285603	4285608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617269
90492	NC_010102	GC	3	6	4285636	4285641	0 %	0 %	50 %	50 %	161617269
90493	NC_010102	CTG	2	6	4285676	4285681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617269
90494	NC_010102	GGC	2	6	4285805	4285810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617269
90495	NC_010102	CTGT	2	8	4285905	4285912	0 %	50 %	25 %	25 %	161617269
90496	NC_010102	CCAGCG	2	12	4285930	4285941	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	161617269
90497	NC_010102	T	6	6	4285994	4285999	0 %	100 %	0 %	0 %	161617269
90498	NC_010102	ATG	2	6	4286016	4286021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617269
90499	NC_010102	CAT	2	6	4286026	4286031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617269
90500	NC_010102	CGC	2	6	4286077	4286082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617269

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