MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 102272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
89001	NC_010102	TAA	2	6	4218270	4218275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161617197
89002	NC_010102	AGG	2	6	4218324	4218329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161617197
89003	NC_010102	AACAG	2	10	4218396	4218405	60 %	0 %	20 %	20 %	161617198
89004	NC_010102	CGG	2	6	4218421	4218426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617198
89005	NC_010102	CGA	2	6	4218496	4218501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617198
89006	NC_010102	GTCG	2	8	4218506	4218513	0 %	25 %	50 %	25 %	161617198
89007	NC_010102	CGC	2	6	4218669	4218674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617198
89008	NC_010102	GCC	2	6	4218682	4218687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617198
89009	NC_010102	GAA	2	6	4218771	4218776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161617198
89010	NC_010102	GGT	2	6	4218788	4218793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617198
89011	NC_010102	GCA	2	6	4218819	4218824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617198
89012	NC_010102	TGA	2	6	4218841	4218846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617198
89013	NC_010102	CCG	2	6	4218870	4218875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617198
89014	NC_010102	TTA	2	6	4218952	4218957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617198
89015	NC_010102	GC	3	6	4219008	4219013	0 %	0 %	50 %	50 %	161617198
89016	NC_010102	CCG	2	6	4219023	4219028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617198
89017	NC_010102	CAC	2	6	4219050	4219055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617198
89018	NC_010102	GTC	2	6	4219064	4219069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617198
89019	NC_010102	ACC	2	6	4219073	4219078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617198
89020	NC_010102	CGG	2	6	4219099	4219104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617198
89021	NC_010102	CTG	2	6	4219106	4219111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617198
89022	NC_010102	GCG	2	6	4219182	4219187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617198
89023	NC_010102	TTTC	2	8	4219250	4219257	0 %	75 %	0 %	25 %	161617198
89024	NC_010102	TCA	2	6	4219299	4219304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617199
89025	NC_010102	CAAAA	2	10	4219316	4219325	80 %	0 %	0 %	20 %	161617199
89026	NC_010102	TGG	2	6	4219338	4219343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617199
89027	NC_010102	GCC	3	9	4219346	4219354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617199
89028	NC_010102	CAG	2	6	4219391	4219396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617199
89029	NC_010102	GGC	2	6	4219415	4219420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617199
89030	NC_010102	GAC	2	6	4219426	4219431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617199
89031	NC_010102	GAT	2	6	4219490	4219495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617199
89032	NC_010102	CAT	2	6	4219513	4219518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617199
89033	NC_010102	GCT	2	6	4219525	4219530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617199
89034	NC_010102	CGA	2	6	4219552	4219557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617199
89035	NC_010102	CAG	2	6	4219577	4219582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617199
89036	NC_010102	TAC	2	6	4219598	4219603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617199
89037	NC_010102	CGA	2	6	4219620	4219625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617199
89038	NC_010102	ATT	2	6	4219709	4219714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617199
89039	NC_010102	AACG	2	8	4219735	4219742	50 %	0 %	25 %	25 %	161617199
89040	NC_010102	GCC	2	6	4219745	4219750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617199
89041	NC_010102	GCG	2	6	4219766	4219771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617199
89042	NC_010102	TGC	2	6	4219773	4219778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617199
89043	NC_010102	GC	3	6	4219809	4219814	0 %	0 %	50 %	50 %	161617199
89044	NC_010102	ATA	2	6	4219836	4219841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161617199
89045	NC_010102	GCG	2	6	4219865	4219870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617199
89046	NC_010102	GGC	3	9	4219873	4219881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617199
89047	NC_010102	ATT	2	6	4219922	4219927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617199
89048	NC_010102	GCC	2	6	4219928	4219933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617199
89049	NC_010102	CTG	2	6	4219961	4219966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617199
89050	NC_010102	GAT	2	6	4219984	4219989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617199
89051	NC_010102	CGG	2	6	4220064	4220069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617199
89052	NC_010102	TGG	2	6	4220070	4220075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617199
89053	NC_010102	ATT	2	6	4220087	4220092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617199
89054	NC_010102	GTGA	2	8	4220108	4220115	25 %	25 %	50 %	0 %	161617199
89055	NC_010102	CGG	2	6	4220124	4220129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617199
89056	NC_010102	TGT	2	6	4220147	4220152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161617199
89057	NC_010102	TAT	2	6	4220173	4220178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617199
89058	NC_010102	TGATAC	2	12	4220200	4220211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161617199
89059	NC_010102	CCA	2	6	4220217	4220222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617199
89060	NC_010102	ATT	2	6	4220274	4220279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617199
89061	NC_010102	CTG	2	6	4220380	4220385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89062	NC_010102	T	6	6	4220453	4220458	0 %	100 %	0 %	0 %	161617200
89063	NC_010102	ATC	2	6	4220459	4220464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617200
89064	NC_010102	CAG	2	6	4220468	4220473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617200
89065	NC_010102	CAGC	2	8	4220500	4220507	25 %	0 %	25 %	50 %	161617200
89066	NC_010102	ATT	2	6	4220594	4220599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617200
89067	NC_010102	TCC	2	6	4220600	4220605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161617200
89068	NC_010102	GGT	2	6	4220623	4220628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617200
89069	NC_010102	CGCGC	3	15	4220731	4220745	0 %	0 %	40 %	60 %	161617200
89070	NC_010102	GC	4	8	4220742	4220749	0 %	0 %	50 %	50 %	161617200
89071	NC_010102	AT	3	6	4220849	4220854	50 %	50 %	0 %	0 %	161617200
89072	NC_010102	CTT	2	6	4220866	4220871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617200
89073	NC_010102	CGC	2	6	4220889	4220894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617200
89074	NC_010102	TTA	2	6	4220924	4220929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617200
89075	NC_010102	CCG	2	6	4220979	4220984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617200
89076	NC_010102	CGC	2	6	4221007	4221012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617200
89077	NC_010102	GCT	2	6	4221022	4221027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617200
89078	NC_010102	CAGA	2	8	4221037	4221044	50 %	0 %	25 %	25 %	161617200
89079	NC_010102	GACAA	2	10	4221057	4221066	60 %	0 %	20 %	20 %	161617200
89080	NC_010102	TCTG	2	8	4221131	4221138	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89081	NC_010102	CCTG	2	8	4221176	4221183	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89082	NC_010102	CGT	2	6	4221190	4221195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89083	NC_010102	A	6	6	4221206	4221211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89084	NC_010102	TTC	2	6	4221256	4221261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617201
89085	NC_010102	TCA	2	6	4221265	4221270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617201
89086	NC_010102	T	6	6	4221336	4221341	0 %	100 %	0 %	0 %	161617201
89087	NC_010102	GCT	2	6	4221342	4221347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617201
89088	NC_010102	GTG	2	6	4221348	4221353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617201
89089	NC_010102	GCGG	2	8	4221380	4221387	0 %	0 %	75 %	25 %	161617201
89090	NC_010102	CTG	2	6	4221444	4221449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617202
89091	NC_010102	ATC	2	6	4221505	4221510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617202
89092	NC_010102	TCA	2	6	4221535	4221540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617202
89093	NC_010102	GCG	2	6	4221679	4221684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617203
89094	NC_010102	TAA	2	6	4221688	4221693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161617203
89095	NC_010102	TTA	2	6	4221720	4221725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617203
89096	NC_010102	TTCC	2	8	4221790	4221797	0 %	50 %	0 %	50 %	161617203
89097	NC_010102	A	6	6	4221829	4221834	100 %	0 %	0 %	0 %	161617203
89098	NC_010102	TAT	2	6	4221847	4221852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617203
89099	NC_010102	GTA	2	6	4221883	4221888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617203
89100	NC_010102	GAC	2	6	4221890	4221895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617203
89101	NC_010102	TTC	2	6	4221963	4221968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617203
89102	NC_010102	T	6	6	4221976	4221981	0 %	100 %	0 %	0 %	161617203
89103	NC_010102	CCA	2	6	4222036	4222041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617204
89104	NC_010102	GC	3	6	4222049	4222054	0 %	0 %	50 %	50 %	161617204
89105	NC_010102	CTG	2	6	4222092	4222097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617204
89106	NC_010102	CTT	2	6	4222229	4222234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617204
89107	NC_010102	GAC	2	6	4222236	4222241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617204
89108	NC_010102	TCC	2	6	4222305	4222310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161617204
89109	NC_010102	GGC	2	6	4222386	4222391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617204
89110	NC_010102	GC	3	6	4222403	4222408	0 %	0 %	50 %	50 %	161617204
89111	NC_010102	TTA	2	6	4222423	4222428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617204
89112	NC_010102	ACG	2	6	4222460	4222465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617204
89113	NC_010102	AGA	2	6	4222505	4222510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161617204
89114	NC_010102	CAG	2	6	4222560	4222565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617204
89115	NC_010102	A	6	6	4222653	4222658	100 %	0 %	0 %	0 %	161617204
89116	NC_010102	GAC	2	6	4222749	4222754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617204
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89132	NC_010102	TTATT	2	10	4223666	4223675	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89133	NC_010102	T	6	6	4223674	4223679	0 %	100 %	0 %	0 %	161617205
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89234	NC_010102	GGC	2	6	4228283	4228288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617209
89235	NC_010102	GCT	2	6	4228289	4228294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617209
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89302	NC_010102	ATTG	2	8	4231645	4231652	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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89342	NC_010102	TGC	2	6	4233508	4233513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617216
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89346	NC_010102	CGG	2	6	4233802	4233807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617218
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89469	NC_010102	TC	3	6	4239841	4239846	0 %	50 %	0 %	50 %	161617226
89470	NC_010102	TTA	2	6	4239870	4239875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617226
89471	NC_010102	CCG	2	6	4239886	4239891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617226
89472	NC_010102	AGCC	2	8	4239978	4239985	25 %	0 %	25 %	50 %	161617226
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89474	NC_010102	GCCC	2	8	4240075	4240082	0 %	0 %	25 %	75 %	161617226
89475	NC_010102	CCA	2	6	4240129	4240134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617226
89476	NC_010102	ACG	2	6	4240161	4240166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617226
89477	NC_010102	TGA	2	6	4240201	4240206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617226
89478	NC_010102	CGG	2	6	4240312	4240317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617226
89479	NC_010102	CAG	2	6	4240328	4240333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617226
89480	NC_010102	CCA	2	6	4240361	4240366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617226
89481	NC_010102	CGA	2	6	4240381	4240386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617226
89482	NC_010102	CGC	2	6	4240391	4240396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617226
89483	NC_010102	CCAG	2	8	4240432	4240439	25 %	0 %	25 %	50 %	161617226
89484	NC_010102	TGT	3	9	4240458	4240466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161617226
89485	NC_010102	TGA	2	6	4240518	4240523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89486	NC_010102	TTC	2	6	4240658	4240663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617227
89487	NC_010102	GC	4	8	4240694	4240701	0 %	0 %	50 %	50 %	161617227
89488	NC_010102	GGT	2	6	4240712	4240717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617227
89489	NC_010102	GGC	2	6	4240733	4240738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617227
89490	NC_010102	GACG	2	8	4240820	4240827	25 %	0 %	50 %	25 %	161617227
89491	NC_010102	TGG	2	6	4240861	4240866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617227
89492	NC_010102	GGC	2	6	4240897	4240902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617227
89493	NC_010102	GATCA	2	10	4240916	4240925	40 %	20 %	20 %	20 %	161617227
89494	NC_010102	AGC	2	6	4241180	4241185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617227
89495	NC_010102	CTT	2	6	4241188	4241193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617227
89496	NC_010102	CAAC	2	8	4241194	4241201	50 %	0 %	0 %	50 %	161617227
89497	NC_010102	GTTTCT	2	12	4241236	4241247	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	161617227
89498	NC_010102	CTGG	2	8	4241279	4241286	0 %	25 %	50 %	25 %	161617227
89499	NC_010102	CGGCG	2	10	4241330	4241339	0 %	0 %	60 %	40 %	161617227
89500	NC_010102	TCG	2	6	4241364	4241369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617227

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