MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 102272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
88001	NC_010102	CGT	2	6	4172673	4172678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88002	NC_010102	TTAT	2	8	4172687	4172694	25 %	75 %	0 %	0 %	161617140
88003	NC_010102	CTG	2	6	4172717	4172722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617140
88004	NC_010102	GAGC	2	8	4172744	4172751	25 %	0 %	50 %	25 %	161617140
88005	NC_010102	AGA	2	6	4172779	4172784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161617140
88006	NC_010102	TA	3	6	4172788	4172793	50 %	50 %	0 %	0 %	161617140
88007	NC_010102	TTG	2	6	4172827	4172832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161617140
88008	NC_010102	CCA	2	6	4172850	4172855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617140
88009	NC_010102	CCA	2	6	4172898	4172903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617140
88010	NC_010102	TTCCC	2	10	4173013	4173022	0 %	40 %	0 %	60 %	161617140
88011	NC_010102	CAG	2	6	4173108	4173113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617140
88012	NC_010102	GTT	2	6	4173125	4173130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161617140
88013	NC_010102	TGC	2	6	4173147	4173152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617140
88014	NC_010102	GCA	2	6	4173161	4173166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617140
88015	NC_010102	ATT	2	6	4173297	4173302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617140
88016	NC_010102	CAT	2	6	4173311	4173316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617140
88017	NC_010102	AAT	2	6	4173318	4173323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161617140
88018	NC_010102	T	6	6	4173357	4173362	0 %	100 %	0 %	0 %	161617140
88019	NC_010102	CTT	2	6	4173482	4173487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617140
88020	NC_010102	GAA	2	6	4173588	4173593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161617140
88021	NC_010102	GCC	2	6	4173654	4173659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617140
88022	NC_010102	T	6	6	4173663	4173668	0 %	100 %	0 %	0 %	161617140
88023	NC_010102	GC	3	6	4173677	4173682	0 %	0 %	50 %	50 %	161617140
88024	NC_010102	CGC	2	6	4173741	4173746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617140
88025	NC_010102	GCA	2	6	4173761	4173766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617140
88026	NC_010102	TCT	2	6	4173799	4173804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617140
88027	NC_010102	CAGC	2	8	4173825	4173832	25 %	0 %	25 %	50 %	161617140
88028	NC_010102	CAC	2	6	4173846	4173851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617140
88029	NC_010102	CGGT	2	8	4173877	4173884	0 %	25 %	50 %	25 %	161617140
88030	NC_010102	CCAG	2	8	4173893	4173900	25 %	0 %	25 %	50 %	161617140
88031	NC_010102	GCG	2	6	4173951	4173956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617141
88032	NC_010102	CAT	2	6	4173963	4173968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617141
88033	NC_010102	TGA	2	6	4174053	4174058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617141
88034	NC_010102	CG	3	6	4174065	4174070	0 %	0 %	50 %	50 %	161617141
88035	NC_010102	AG	3	6	4174149	4174154	50 %	0 %	50 %	0 %	161617141
88036	NC_010102	AAG	2	6	4174203	4174208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161617141
88037	NC_010102	GC	4	8	4174215	4174222	0 %	0 %	50 %	50 %	161617141
88038	NC_010102	CGC	2	6	4174322	4174327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617141
88039	NC_010102	GCG	2	6	4174331	4174336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617141
88040	NC_010102	GCT	2	6	4174415	4174420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617141
88041	NC_010102	TCG	2	6	4174429	4174434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617141
88042	NC_010102	T	7	7	4174499	4174505	0 %	100 %	0 %	0 %	161617141
88043	NC_010102	ATC	2	6	4174551	4174556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617141
88044	NC_010102	CGC	2	6	4174557	4174562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617141
88045	NC_010102	CTG	2	6	4174623	4174628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617141
88046	NC_010102	CAG	2	6	4174632	4174637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617141
88047	NC_010102	CGC	2	6	4174668	4174673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617141
88048	NC_010102	CAG	3	9	4174724	4174732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617141
88049	NC_010102	CAGC	2	8	4174766	4174773	25 %	0 %	25 %	50 %	161617141
88050	NC_010102	CCG	2	6	4174783	4174788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617141
88051	NC_010102	GTT	2	6	4174818	4174823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161617141
88052	NC_010102	T	6	6	4174853	4174858	0 %	100 %	0 %	0 %	161617142
88053	NC_010102	GGC	2	6	4174963	4174968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617142
88054	NC_010102	GATC	2	8	4175037	4175044	25 %	25 %	25 %	25 %	161617142
88055	NC_010102	TCA	2	6	4175070	4175075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617142
88056	NC_010102	GGT	3	9	4175089	4175097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617142
88057	NC_010102	TCA	2	6	4175127	4175132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617142
88058	NC_010102	CA	3	6	4175169	4175174	50 %	0 %	0 %	50 %	161617142
88059	NC_010102	CGG	2	6	4175178	4175183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617142
88060	NC_010102	CGG	2	6	4175187	4175192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617142
88061	NC_010102	GTT	2	6	4175221	4175226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161617142
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88063	NC_010102	GC	3	6	4175306	4175311	0 %	0 %	50 %	50 %	161617142
88064	NC_010102	CGT	2	6	4175323	4175328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617142
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88066	NC_010102	CAA	2	6	4175344	4175349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161617142
88067	NC_010102	CATC	2	8	4175391	4175398	25 %	25 %	0 %	50 %	161617142
88068	NC_010102	CAAA	2	8	4175517	4175524	75 %	0 %	0 %	25 %	161617142
88069	NC_010102	GAAC	2	8	4175528	4175535	50 %	0 %	25 %	25 %	161617142
88070	NC_010102	GCT	2	6	4175596	4175601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617142
88071	NC_010102	GC	3	6	4175610	4175615	0 %	0 %	50 %	50 %	161617142
88072	NC_010102	CGT	2	6	4175640	4175645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617142
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88075	NC_010102	TCTG	2	8	4175797	4175804	0 %	50 %	25 %	25 %	161617143
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88078	NC_010102	GCG	2	6	4176030	4176035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617144
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88080	NC_010102	GC	3	6	4176064	4176069	0 %	0 %	50 %	50 %	161617144
88081	NC_010102	GAC	2	6	4176099	4176104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617144
88082	NC_010102	CTG	2	6	4176117	4176122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617144
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88084	NC_010102	GTC	2	6	4176182	4176187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617144
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88086	NC_010102	TTA	2	6	4176252	4176257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617144
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88088	NC_010102	TGG	2	6	4176421	4176426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617144
88089	NC_010102	CGC	2	6	4176440	4176445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617144
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88091	NC_010102	GCG	2	6	4176579	4176584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617144
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88101	NC_010102	CGC	2	6	4176963	4176968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617145
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88105	NC_010102	A	6	6	4177086	4177091	100 %	0 %	0 %	0 %	161617145
88106	NC_010102	ACG	2	6	4177155	4177160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617145
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88112	NC_010102	CGG	2	6	4177321	4177326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617145
88113	NC_010102	AG	3	6	4177379	4177384	50 %	0 %	50 %	0 %	161617145
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88117	NC_010102	GCG	2	6	4177497	4177502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617145
88118	NC_010102	GAC	2	6	4177623	4177628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617145
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88233	NC_010102	GAT	2	6	4184078	4184083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617156
88234	NC_010102	CAC	2	6	4184091	4184096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617156
88235	NC_010102	TGCGCG	2	12	4184101	4184112	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	161617156
88236	NC_010102	CAGC	2	8	4184156	4184163	25 %	0 %	25 %	50 %	161617156
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88245	NC_010102	GAT	2	6	4184636	4184641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617157
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88260	NC_010102	AATG	2	8	4185267	4185274	50 %	25 %	25 %	0 %	161617158
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88345	NC_010102	GCG	2	6	4189441	4189446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617159
88346	NC_010102	CG	3	6	4189533	4189538	0 %	0 %	50 %	50 %	161617159
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88473	NC_010102	CTC	2	6	4194689	4194694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161617168
88474	NC_010102	CAG	2	6	4194719	4194724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617168
88475	NC_010102	GC	3	6	4194760	4194765	0 %	0 %	50 %	50 %	161617168
88476	NC_010102	GAC	2	6	4194811	4194816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617168
88477	NC_010102	CTC	2	6	4194824	4194829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161617168
88478	NC_010102	GC	3	6	4194933	4194938	0 %	0 %	50 %	50 %	161617169
88479	NC_010102	CCAG	2	8	4194960	4194967	25 %	0 %	25 %	50 %	161617169
88480	NC_010102	TCT	2	6	4194977	4194982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617169
88481	NC_010102	CG	3	6	4195086	4195091	0 %	0 %	50 %	50 %	161617169
88482	NC_010102	CG	3	6	4195127	4195132	0 %	0 %	50 %	50 %	161617169
88483	NC_010102	GCA	2	6	4195167	4195172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617169
88484	NC_010102	GC	3	6	4195398	4195403	0 %	0 %	50 %	50 %	161617169
88485	NC_010102	GCG	2	6	4195454	4195459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617169
88486	NC_010102	GAT	2	6	4195516	4195521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617169
88487	NC_010102	GAT	2	6	4195531	4195536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617169
88488	NC_010102	ATCG	2	8	4195717	4195724	25 %	25 %	25 %	25 %	161617169
88489	NC_010102	GCC	3	9	4195729	4195737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617169
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88492	NC_010102	GGT	2	6	4195833	4195838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617169
88493	NC_010102	CAG	2	6	4195879	4195884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617169
88494	NC_010102	TCA	2	6	4196016	4196021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617169
88495	NC_010102	A	7	7	4196033	4196039	100 %	0 %	0 %	0 %	161617169
88496	NC_010102	TTC	2	6	4196209	4196214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617170
88497	NC_010102	TATC	2	8	4196286	4196293	25 %	50 %	0 %	25 %	161617170
88498	NC_010102	TGGCC	2	10	4196385	4196394	0 %	20 %	40 %	40 %	161617170
88499	NC_010102	CCAT	2	8	4196415	4196422	25 %	25 %	0 %	50 %	161617170
88500	NC_010102	ACC	2	6	4196450	4196455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617170

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