MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 68935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_010079	TTG	2	6	2283498	2283503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55002	NC_010079	TTTG	2	8	2283575	2283582	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55003	NC_010079	TTC	2	6	2283616	2283621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55004	NC_010079	CTT	2	6	2283720	2283725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55005	NC_010079	TGT	2	6	2283730	2283735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55006	NC_010079	AAC	2	6	2283772	2283777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55007	NC_010079	TTC	2	6	2283787	2283792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55008	NC_010079	GCT	3	9	2283797	2283805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55009	NC_010079	TGT	2	6	2283811	2283816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55010	NC_010079	ATTG	2	8	2283841	2283848	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55011	NC_010079	TGT	2	6	2283880	2283885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55012	NC_010079	TGC	2	6	2283886	2283891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55013	NC_010079	ATG	2	6	2283963	2283968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55014	NC_010079	TGT	2	6	2283986	2283991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55015	NC_010079	ATA	2	6	2284013	2284018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55016	NC_010079	GTTT	2	8	2284115	2284122	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55017	NC_010079	ATT	2	6	2284141	2284146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55018	NC_010079	TGC	2	6	2284174	2284179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55019	NC_010079	T	6	6	2284198	2284203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55020	NC_010079	TGT	2	6	2284208	2284213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55021	NC_010079	GCT	2	6	2284214	2284219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55022	NC_010079	TGC	2	6	2284258	2284263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55023	NC_010079	TTG	2	6	2284378	2284383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55024	NC_010079	TGT	2	6	2284414	2284419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55025	NC_010079	TAT	2	6	2284428	2284433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55026	NC_010079	TTG	3	9	2284450	2284458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55027	NC_010079	ATT	2	6	2284528	2284533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55029	NC_010079	CTT	2	6	2284656	2284661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55030	NC_010079	GT	4	8	2284664	2284671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55031	NC_010079	TACTG	2	10	2284753	2284762	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55032	NC_010079	TGT	2	6	2284783	2284788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55033	NC_010079	ATT	2	6	2284798	2284803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55034	NC_010079	AATG	2	8	2284990	2284997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55035	NC_010079	TGT	2	6	2285023	2285028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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55037	NC_010079	TAAA	2	8	2285106	2285113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55038	NC_010079	TAA	2	6	2285175	2285180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55039	NC_010079	TTG	2	6	2285187	2285192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55040	NC_010079	TAG	2	6	2285217	2285222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55041	NC_010079	TAA	2	6	2285229	2285234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55042	NC_010079	TTTACA	2	12	2285252	2285263	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55043	NC_010079	GTT	2	6	2285422	2285427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55044	NC_010079	ACAGTT	2	12	2285459	2285470	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55045	NC_010079	ATC	2	6	2285506	2285511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55049	NC_010079	GCTG	2	8	2285624	2285631	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55050	NC_010079	ATT	3	9	2285653	2285661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55051	NC_010079	TTGTGC	2	12	2285722	2285733	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55052	NC_010079	TGC	2	6	2285788	2285793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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55054	NC_010079	CTG	2	6	2285838	2285843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55055	NC_010079	TTGG	2	8	2285851	2285858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55056	NC_010079	GCTG	2	8	2285867	2285874	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55057	NC_010079	CTG	2	6	2285970	2285975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55058	NC_010079	TGT	2	6	2285983	2285988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55059	NC_010079	TAG	2	6	2285994	2285999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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55061	NC_010079	TGT	2	6	2286068	2286073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55062	NC_010079	TCC	2	6	2286095	2286100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55063	NC_010079	ATT	2	6	2286107	2286112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55064	NC_010079	AGT	2	6	2286153	2286158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55065	NC_010079	AATTAA	2	12	2286194	2286205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55067	NC_010079	TA	3	6	2286218	2286223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55068	NC_010079	ATT	2	6	2286304	2286309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55069	NC_010079	A	6	6	2286321	2286326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55070	NC_010079	TATT	2	8	2286361	2286368	25 %	75 %	0 %	0 %	161510366
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55109	NC_010079	TAT	2	6	2288442	2288447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161510367
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55113	NC_010079	AGCA	2	8	2288725	2288732	50 %	0 %	25 %	25 %	161510368
55114	NC_010079	TCG	2	6	2288761	2288766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161510368
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55120	NC_010079	ATTA	2	8	2288992	2288999	50 %	50 %	0 %	0 %	161510368
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