MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 68935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54002	NC_010079	TGT	2	6	2244704	2244709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161510332
54003	NC_010079	AAC	2	6	2244728	2244733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161510332
54004	NC_010079	TAA	2	6	2244761	2244766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510332
54005	NC_010079	CAC	2	6	2244826	2244831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161510332
54006	NC_010079	T	6	6	2244839	2244844	0 %	100 %	0 %	0 %	161510332
54007	NC_010079	CAT	2	6	2244949	2244954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510332
54008	NC_010079	TAA	2	6	2245058	2245063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510332
54009	NC_010079	AGA	2	6	2245073	2245078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161510332
54010	NC_010079	ATG	2	6	2245099	2245104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161510332
54011	NC_010079	AAAT	2	8	2245126	2245133	75 %	25 %	0 %	0 %	161510332
54012	NC_010079	CCT	2	6	2245149	2245154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54013	NC_010079	ATT	2	6	2245156	2245161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54014	NC_010079	TCA	2	6	2245177	2245182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54015	NC_010079	AACAT	2	10	2245201	2245210	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54016	NC_010079	AAGC	2	8	2245213	2245220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54017	NC_010079	GTT	2	6	2245229	2245234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54018	NC_010079	AAATT	2	10	2245253	2245262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54019	NC_010079	TTAC	2	8	2245267	2245274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54020	NC_010079	TAAA	2	8	2245353	2245360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54021	NC_010079	A	7	7	2245358	2245364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54024	NC_010079	A	6	6	2245471	2245476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54052	NC_010079	TAAG	2	8	2246266	2246273	50 %	25 %	25 %	0 %	161510335
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54071	NC_010079	TA	3	6	2247000	2247005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54073	NC_010079	TAT	2	6	2247035	2247040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54100	NC_010079	TA	3	6	2248246	2248251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54101	NC_010079	TTTTA	2	10	2248259	2248268	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54102	NC_010079	TAT	2	6	2248303	2248308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54103	NC_010079	TTAC	2	8	2248316	2248323	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54104	NC_010079	TCAAT	2	10	2248327	2248336	40 %	40 %	0 %	20 %	161510337
54105	NC_010079	ACCA	2	8	2248381	2248388	50 %	0 %	0 %	50 %	161510337
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54240	NC_010079	T	6	6	2253893	2253898	0 %	100 %	0 %	0 %	161510342
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54254	NC_010079	TTA	2	6	2254515	2254520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54255	NC_010079	ATC	2	6	2254572	2254577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54257	NC_010079	TA	3	6	2254617	2254622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54258	NC_010079	AATCTG	2	12	2254665	2254676	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161510343
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