MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 68935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53502	NC_010079	ATC	2	6	2223834	2223839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510312
53503	NC_010079	ATAA	2	8	2223861	2223868	75 %	25 %	0 %	0 %	161510312
53504	NC_010079	GTTT	2	8	2223896	2223903	0 %	75 %	25 %	0 %	161510312
53505	NC_010079	TCA	2	6	2223964	2223969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510312
53506	NC_010079	ACGTA	2	10	2224026	2224035	40 %	20 %	20 %	20 %	161510312
53507	NC_010079	TTC	2	6	2224045	2224050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161510312
53508	NC_010079	CCA	2	6	2224072	2224077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161510312
53509	NC_010079	GAA	2	6	2224125	2224130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161510312
53510	NC_010079	AAG	2	6	2224144	2224149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161510312
53511	NC_010079	TTG	2	6	2224178	2224183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161510312
53512	NC_010079	TGC	2	6	2224269	2224274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161510312
53513	NC_010079	TAA	2	6	2224281	2224286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510312
53514	NC_010079	CTA	2	6	2224288	2224293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510312
53515	NC_010079	TAA	3	9	2224344	2224352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510312
53516	NC_010079	GCT	3	9	2224369	2224377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161510312
53517	NC_010079	ATC	2	6	2224389	2224394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510312
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53519	NC_010079	AT	3	6	2224465	2224470	50 %	50 %	0 %	0 %	161510312
53520	NC_010079	AAT	2	6	2224471	2224476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510312
53521	NC_010079	TGC	2	6	2224497	2224502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161510312
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53523	NC_010079	CAATTG	2	12	2224634	2224645	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161510312
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53525	NC_010079	T	6	6	2224779	2224784	0 %	100 %	0 %	0 %	161510312
53526	NC_010079	AAC	2	6	2224851	2224856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161510312
53527	NC_010079	TTC	2	6	2224869	2224874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161510312
53528	NC_010079	CTA	2	6	2225015	2225020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510312
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53530	NC_010079	CTC	2	6	2225183	2225188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53531	NC_010079	TAAT	2	8	2225193	2225200	50 %	50 %	0 %	0 %	161510313
53532	NC_010079	CCA	2	6	2225287	2225292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161510313
53533	NC_010079	TTG	2	6	2225343	2225348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161510313
53534	NC_010079	CTT	2	6	2225378	2225383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161510313
53535	NC_010079	TTG	2	6	2225408	2225413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161510313
53536	NC_010079	TA	3	6	2225438	2225443	50 %	50 %	0 %	0 %	161510313
53537	NC_010079	TAT	2	6	2225489	2225494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161510313
53538	NC_010079	CAT	2	6	2225508	2225513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510313
53539	NC_010079	ACG	2	6	2225562	2225567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161510313
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53545	NC_010079	GCCT	2	8	2225744	2225751	0 %	25 %	25 %	50 %	161510314
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53552	NC_010079	TCT	2	6	2226036	2226041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161510314
53553	NC_010079	AAT	2	6	2226282	2226287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53554	NC_010079	TA	3	6	2226297	2226302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53555	NC_010079	A	7	7	2226304	2226310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53556	NC_010079	CGA	2	6	2226311	2226316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53557	NC_010079	TAA	2	6	2226373	2226378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53558	NC_010079	TA	3	6	2226395	2226400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53559	NC_010079	CAT	2	6	2226403	2226408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53562	NC_010079	TGC	3	9	2226646	2226654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161510315
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53565	NC_010079	TA	3	6	2226690	2226695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53566	NC_010079	ATT	2	6	2226696	2226701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53578	NC_010079	T	7	7	2227296	2227302	0 %	100 %	0 %	0 %	161510316
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53594	NC_010079	ATA	2	6	2227875	2227880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53595	NC_010079	TTG	2	6	2227912	2227917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53596	NC_010079	A	7	7	2227919	2227925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53597	NC_010079	ATA	2	6	2228014	2228019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510318
53598	NC_010079	TTCT	2	8	2228037	2228044	0 %	75 %	0 %	25 %	161510318
53599	NC_010079	TGA	2	6	2228087	2228092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161510318
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53601	NC_010079	ATC	2	6	2228104	2228109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510318
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53605	NC_010079	CTT	2	6	2228241	2228246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161510318
53606	NC_010079	AAAAT	2	10	2228270	2228279	80 %	20 %	0 %	0 %	161510318
53607	NC_010079	T	6	6	2228284	2228289	0 %	100 %	0 %	0 %	161510318
53608	NC_010079	CTA	2	6	2228307	2228312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510318
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53610	NC_010079	AT	3	6	2228454	2228459	50 %	50 %	0 %	0 %	161510318
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53614	NC_010079	ATG	2	6	2228534	2228539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161510318
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53978	NC_010079	TTA	2	6	2243519	2243524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53979	NC_010079	ATTT	3	12	2243529	2243540	25 %	75 %	0 %	0 %	161510332
53980	NC_010079	CTA	2	6	2243668	2243673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510332
53981	NC_010079	ACCAT	2	10	2243703	2243712	40 %	20 %	0 %	40 %	161510332
53982	NC_010079	ATT	2	6	2243738	2243743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161510332
53983	NC_010079	ACGATG	2	12	2243753	2243764	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	161510332
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53985	NC_010079	CTT	2	6	2243812	2243817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161510332
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