MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella baltica OS195 chromosome

Total Repeats: 94146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009997	CAA	2	6	38	43	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009997	AGTA	2	8	48	55	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009997	TAG	2	6	143	148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009997	TAA	2	6	206	211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009997	TGA	2	6	259	264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009997	CA	3	6	276	281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009997	T	6	6	306	311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009997	T	6	6	353	358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009997	GAT	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009997	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160873127
11	NC_009997	CAG	2	6	439	444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160873127
12	NC_009997	ATGG	2	8	478	485	25 %	25 %	50 %	0 %	160873127
13	NC_009997	GTC	2	6	620	625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873127
14	NC_009997	ACG	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160873127
15	NC_009997	AGCCG	2	10	723	732	20 %	0 %	40 %	40 %	160873127
16	NC_009997	GGT	2	6	850	855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160873127
17	NC_009997	ATT	2	6	867	872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160873127
18	NC_009997	TTG	2	6	907	912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160873127
19	NC_009997	AAT	2	6	940	945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160873127
20	NC_009997	GAA	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160873127
21	NC_009997	TAC	2	6	1039	1044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160873127
22	NC_009997	GAT	2	6	1069	1074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873127
23	NC_009997	T	6	6	1081	1086	0 %	100 %	0 %	0 %	160873127
24	NC_009997	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160873127
25	NC_009997	TTC	2	6	1114	1119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160873127
26	NC_009997	CTTG	2	8	1134	1141	0 %	50 %	25 %	25 %	160873127
27	NC_009997	ATT	2	6	1156	1161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160873127
28	NC_009997	TTGG	2	8	1223	1230	0 %	50 %	50 %	0 %	160873127
29	NC_009997	CCA	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160873127
30	NC_009997	AG	3	6	1299	1304	50 %	0 %	50 %	0 %	160873127
31	NC_009997	CTT	2	6	1332	1337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160873127
32	NC_009997	CGTG	2	8	1362	1369	0 %	25 %	50 %	25 %	160873127
33	NC_009997	GCC	2	6	1418	1423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160873127
34	NC_009997	TAC	2	6	1522	1527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160873127
35	NC_009997	TGT	2	6	1547	1552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160873127
36	NC_009997	CG	3	6	1575	1580	0 %	0 %	50 %	50 %	160873127
37	NC_009997	TAAC	2	8	1616	1623	50 %	25 %	0 %	25 %	160873127
38	NC_009997	TGG	2	6	1653	1658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160873127
39	NC_009997	CAC	2	6	1668	1673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160873127
40	NC_009997	AG	3	6	1713	1718	50 %	0 %	50 %	0 %	160873127
41	NC_009997	AGA	2	6	1731	1736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160873127
42	NC_009997	TCT	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160873127
43	NC_009997	GT	3	6	1838	1843	0 %	50 %	50 %	0 %	160873128
44	NC_009997	CCT	2	6	1885	1890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160873128
45	NC_009997	AAGT	2	8	1896	1903	50 %	25 %	25 %	0 %	160873128
46	NC_009997	TCAC	2	8	1906	1913	25 %	25 %	0 %	50 %	160873128
47	NC_009997	GAA	2	6	1979	1984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160873128
48	NC_009997	TAC	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160873128
49	NC_009997	GCT	2	6	2011	2016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873128
50	NC_009997	AAC	2	6	2061	2066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160873128
51	NC_009997	ATA	2	6	2070	2075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160873128
52	NC_009997	TGC	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873128
53	NC_009997	AGA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160873128
54	NC_009997	TTA	2	6	2245	2250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160873128
55	NC_009997	GC	3	6	2290	2295	0 %	0 %	50 %	50 %	160873128
56	NC_009997	CGAC	2	8	2301	2308	25 %	0 %	25 %	50 %	160873128
57	NC_009997	AAGC	2	8	2579	2586	50 %	0 %	25 %	25 %	160873128
58	NC_009997	CGAA	2	8	2610	2617	50 %	0 %	25 %	25 %	160873128
59	NC_009997	GTG	2	6	2625	2630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160873128
60	NC_009997	GAA	2	6	2687	2692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160873128
61	NC_009997	ATC	2	6	2702	2707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160873128
62	NC_009997	ACA	2	6	2718	2723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160873128
63	NC_009997	CAA	2	6	2773	2778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160873128
64	NC_009997	GAT	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873128
65	NC_009997	GAA	2	6	2849	2854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160873128
66	NC_009997	ATGT	2	8	2861	2868	25 %	50 %	25 %	0 %	160873128
67	NC_009997	GGC	2	6	2952	2957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009997	GCA	2	6	2972	2977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009997	TAGCCT	2	12	3005	3016	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009997	ATTT	2	8	3218	3225	25 %	75 %	0 %	0 %	160873129
71	NC_009997	CGTT	2	8	3239	3246	0 %	50 %	25 %	25 %	160873129
72	NC_009997	TAA	2	6	3274	3279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160873129
73	NC_009997	CGA	3	9	3280	3288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160873129
74	NC_009997	GTG	2	6	3360	3365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160873129
75	NC_009997	TCG	2	6	3553	3558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873129
76	NC_009997	CG	3	6	3753	3758	0 %	0 %	50 %	50 %	160873129
77	NC_009997	ACT	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160873129
78	NC_009997	ATT	2	6	3916	3921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160873129
79	NC_009997	ACA	2	6	3961	3966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160873129
80	NC_009997	GAT	2	6	3995	4000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873129
81	NC_009997	TCCG	2	8	4003	4010	0 %	25 %	25 %	50 %	160873129
82	NC_009997	CTG	2	6	4092	4097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873129
83	NC_009997	AC	3	6	4114	4119	50 %	0 %	0 %	50 %	160873129
84	NC_009997	GA	3	6	4180	4185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009997	ATA	2	6	4186	4191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160873130
86	NC_009997	TTC	2	6	4211	4216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160873130
87	NC_009997	CGA	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160873130
88	NC_009997	CAT	2	6	4302	4307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160873130
89	NC_009997	AGT	2	6	4319	4324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873130
90	NC_009997	GAA	2	6	4446	4451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160873130
91	NC_009997	GCA	2	6	4461	4466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160873130
92	NC_009997	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160873130
93	NC_009997	CGA	2	6	4505	4510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160873130
94	NC_009997	TCG	2	6	4595	4600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873130
95	NC_009997	TGA	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873130
96	NC_009997	ACA	2	6	4819	4824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160873130
97	NC_009997	GAAT	2	8	4826	4833	50 %	25 %	25 %	0 %	160873130
98	NC_009997	ATT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160873130
99	NC_009997	TAA	2	6	4883	4888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160873130
100	NC_009997	CAA	2	6	4898	4903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160873130
101	NC_009997	CAA	2	6	5003	5008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160873130
102	NC_009997	TGG	2	6	5024	5029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160873130
103	NC_009997	CGA	2	6	5129	5134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160873130
104	NC_009997	AGTGA	2	10	5220	5229	40 %	20 %	40 %	0 %	160873130
105	NC_009997	TTG	2	6	5305	5310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160873130
106	NC_009997	GCCCGT	2	12	5328	5339	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	160873130
107	NC_009997	GCG	2	6	5343	5348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160873130
108	NC_009997	CGT	2	6	5370	5375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873130
109	NC_009997	GGT	2	6	5394	5399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160873130
110	NC_009997	CTG	2	6	5473	5478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873130
111	NC_009997	TGT	2	6	5575	5580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160873130
112	NC_009997	AAG	2	6	5587	5592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160873130
113	NC_009997	CGA	2	6	5633	5638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160873130
114	NC_009997	CAT	4	12	5669	5680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160873130
115	NC_009997	CTT	3	9	5729	5737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160873130
116	NC_009997	ATTG	2	8	5753	5760	25 %	50 %	25 %	0 %	160873130
117	NC_009997	CCA	2	6	5787	5792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160873130
118	NC_009997	GCAA	2	8	5812	5819	50 %	0 %	25 %	25 %	160873130
119	NC_009997	ACCCA	2	10	5893	5902	40 %	0 %	0 %	60 %	160873130
120	NC_009997	TTG	2	6	5971	5976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160873130
121	NC_009997	AGC	2	6	5986	5991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160873130
122	NC_009997	ACC	2	6	6025	6030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160873130
123	NC_009997	TGG	2	6	6103	6108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160873130
124	NC_009997	AGC	2	6	6117	6122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160873130
125	NC_009997	CTG	2	6	6136	6141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873130
126	NC_009997	ACTA	2	8	6210	6217	50 %	25 %	0 %	25 %	160873130
127	NC_009997	CTT	2	6	6233	6238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160873130
128	NC_009997	GCG	2	6	6276	6281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160873130
129	NC_009997	GGC	2	6	6303	6308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160873130
130	NC_009997	AAG	2	6	6334	6339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160873130
131	NC_009997	TGA	2	6	6494	6499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873130
132	NC_009997	GTT	2	6	6518	6523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160873130
133	NC_009997	TCG	2	6	6554	6559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873130
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135	NC_009997	CAA	2	6	6750	6755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160873131
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389	NC_009997	AAC	2	6	21790	21795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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391	NC_009997	TTGC	2	8	21838	21845	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
392	NC_009997	TGT	2	6	21847	21852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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