MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella pealeana ATCC 700345 chromosome

Total Repeats: 93356

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009901	TTTAC	2	10	26223	26232	20 %	60 %	0 %	20 %	157959851
502	NC_009901	ATT	2	6	26315	26320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_009901	TAG	2	6	26396	26401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_009901	ATT	2	6	26424	26429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157959852
505	NC_009901	CCAAA	2	10	26447	26456	60 %	0 %	0 %	40 %	157959852
506	NC_009901	T	6	6	26660	26665	0 %	100 %	0 %	0 %	157959852
507	NC_009901	TGG	2	6	26677	26682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959852
508	NC_009901	GAA	2	6	26726	26731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959852
509	NC_009901	GCA	2	6	26759	26764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959852
510	NC_009901	GATT	2	8	26786	26793	25 %	50 %	25 %	0 %	157959852
511	NC_009901	TGA	2	6	26821	26826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959852
512	NC_009901	CCGA	2	8	26856	26863	25 %	0 %	25 %	50 %	157959852
513	NC_009901	ACTG	2	8	26886	26893	25 %	25 %	25 %	25 %	157959852
514	NC_009901	A	6	6	26958	26963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_009901	T	6	6	26981	26986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_009901	ATT	2	6	27080	27085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157959853
517	NC_009901	AAC	2	6	27153	27158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157959853
518	NC_009901	TACT	2	8	27185	27192	25 %	50 %	0 %	25 %	157959853
519	NC_009901	TGGAC	2	10	27215	27224	20 %	20 %	40 %	20 %	157959853
520	NC_009901	CTAAAG	2	12	27257	27268	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157959853
521	NC_009901	ATT	2	6	27355	27360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157959853
522	NC_009901	A	6	6	27387	27392	100 %	0 %	0 %	0 %	157959853
523	NC_009901	ACAAG	2	10	27471	27480	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
524	NC_009901	CTAT	2	8	27481	27488	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
525	NC_009901	GAT	2	6	27542	27547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959854
526	NC_009901	TGG	2	6	27578	27583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959854
527	NC_009901	CTT	2	6	27650	27655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959854
528	NC_009901	GAC	2	6	27710	27715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959854
529	NC_009901	GAA	2	6	27734	27739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959854
530	NC_009901	TATC	2	8	27834	27841	25 %	50 %	0 %	25 %	157959854
531	NC_009901	AAT	2	6	27869	27874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157959854
532	NC_009901	AATGA	2	10	27891	27900	60 %	20 %	20 %	0 %	157959854
533	NC_009901	CAGA	2	8	27976	27983	50 %	0 %	25 %	25 %	157959854
534	NC_009901	AAG	2	6	28025	28030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959854
535	NC_009901	TAT	2	6	28120	28125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157959854
536	NC_009901	TGC	2	6	28131	28136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959854
537	NC_009901	GAG	2	6	28164	28169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157959854
538	NC_009901	TA	3	6	28178	28183	50 %	50 %	0 %	0 %	157959854
539	NC_009901	A	6	6	28239	28244	100 %	0 %	0 %	0 %	157959854
540	NC_009901	CAG	3	9	28248	28256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959854
541	NC_009901	AG	3	6	28324	28329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_009901	TAA	2	6	28398	28403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157959855
543	NC_009901	TCT	2	6	28437	28442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959855
544	NC_009901	TTTA	2	8	28496	28503	25 %	75 %	0 %	0 %	157959855
545	NC_009901	CAG	2	6	28529	28534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959855
546	NC_009901	TGC	2	6	28586	28591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959855
547	NC_009901	TTAC	2	8	28644	28651	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
548	NC_009901	AGTC	2	8	28683	28690	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
549	NC_009901	ATT	2	6	28741	28746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_009901	ATA	2	6	28754	28759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_009901	ATG	2	6	28953	28958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959856
552	NC_009901	ATG	2	6	29002	29007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959856
553	NC_009901	TG	3	6	29025	29030	0 %	50 %	50 %	0 %	157959856
554	NC_009901	CTT	2	6	29108	29113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959856
555	NC_009901	TGT	2	6	29123	29128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959856
556	NC_009901	ATA	2	6	29161	29166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157959856
557	NC_009901	ATG	2	6	29268	29273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959856
558	NC_009901	TGAT	2	8	29323	29330	25 %	50 %	25 %	0 %	157959856
559	NC_009901	ACC	2	6	29365	29370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157959856
560	NC_009901	A	6	6	29402	29407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_009901	T	6	6	29425	29430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_009901	GGC	2	6	29499	29504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157959857
563	NC_009901	TAG	2	6	29506	29511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959857
564	NC_009901	ATG	2	6	29666	29671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959857
565	NC_009901	AGC	2	6	29675	29680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959857
566	NC_009901	GTT	2	6	29749	29754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959857
567	NC_009901	AC	3	6	29769	29774	50 %	0 %	0 %	50 %	157959857
568	NC_009901	TGC	2	6	29789	29794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959857
569	NC_009901	GCC	2	6	29848	29853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157959857
570	NC_009901	GTT	2	6	29954	29959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959857
571	NC_009901	TAC	2	6	29968	29973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157959857
572	NC_009901	AGCGC	2	10	29988	29997	20 %	0 %	40 %	40 %	157959857
573	NC_009901	CTG	2	6	30017	30022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959857
574	NC_009901	CGT	2	6	30090	30095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959857
575	NC_009901	TGC	2	6	30116	30121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959857
576	NC_009901	AGC	2	6	30140	30145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959857
577	NC_009901	GGT	2	6	30169	30174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959857
578	NC_009901	TGC	2	6	30202	30207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959857
579	NC_009901	GCC	2	6	30232	30237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157959857
580	NC_009901	CATGG	2	10	30253	30262	20 %	20 %	40 %	20 %	157959857
581	NC_009901	AAG	2	6	30305	30310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959857
582	NC_009901	AATA	2	8	30337	30344	75 %	25 %	0 %	0 %	157959857
583	NC_009901	G	6	6	30369	30374	0 %	0 %	100 %	0 %	157959857
584	NC_009901	ACC	2	6	30421	30426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157959857
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586	NC_009901	GTA	2	6	30489	30494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959857
587	NC_009901	ACA	2	6	30540	30545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157959857
588	NC_009901	GTG	3	9	30557	30565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959857
589	NC_009901	GAA	2	6	30583	30588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959857
590	NC_009901	TAG	2	6	30670	30675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959857
591	NC_009901	GCTG	2	8	30733	30740	0 %	25 %	50 %	25 %	157959857
592	NC_009901	CAG	2	6	30747	30752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959857
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595	NC_009901	T	6	6	30906	30911	0 %	100 %	0 %	0 %	157959858
596	NC_009901	AGA	2	6	30915	30920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959858
597	NC_009901	CTT	2	6	30961	30966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959858
598	NC_009901	AAG	2	6	30974	30979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959858
599	NC_009901	CTT	2	6	31032	31037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959858
600	NC_009901	CACG	2	8	31041	31048	25 %	0 %	25 %	50 %	157959858
601	NC_009901	TGG	2	6	31059	31064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959858
602	NC_009901	CTG	2	6	31152	31157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959858
603	NC_009901	TAG	2	6	31210	31215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959858
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605	NC_009901	CGATAT	2	12	31248	31259	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157959858
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607	NC_009901	TTC	2	6	31313	31318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959858
608	NC_009901	GGC	2	6	31342	31347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157959858
609	NC_009901	TCG	2	6	31364	31369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959858
610	NC_009901	TTC	2	6	31408	31413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959858
611	NC_009901	AAC	2	6	31418	31423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157959858
612	NC_009901	CAC	2	6	31440	31445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157959858
613	NC_009901	GTG	2	6	31454	31459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959858
614	NC_009901	ACC	2	6	31564	31569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157959858
615	NC_009901	CGCA	2	8	31627	31634	25 %	0 %	25 %	50 %	157959858
616	NC_009901	GGC	2	6	31638	31643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157959858
617	NC_009901	GAA	2	6	31654	31659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959858
618	NC_009901	ATA	2	6	31700	31705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157959858
619	NC_009901	AGC	2	6	31768	31773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959858
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621	NC_009901	GGC	2	6	31881	31886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157959858
622	NC_009901	TCA	2	6	31925	31930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157959858
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624	NC_009901	GCC	2	6	31939	31944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157959858
625	NC_009901	TGG	2	6	32037	32042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959858
626	NC_009901	ACC	2	6	32177	32182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157959858
627	NC_009901	GCC	2	6	32281	32286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157959858
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