MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sediminis HAW-EB3 chromosome

Total Repeats: 97847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_009831	C	6	6	1039822	1039827	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18502	NC_009831	AAT	2	6	1039828	1039833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18503	NC_009831	GA	3	6	1039840	1039845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18504	NC_009831	AAC	2	6	1039995	1040000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157374013
18505	NC_009831	AC	3	6	1040161	1040166	50 %	0 %	0 %	50 %	157374013
18506	NC_009831	ACG	2	6	1040178	1040183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157374013
18507	NC_009831	GCT	2	6	1040247	1040252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157374013
18508	NC_009831	TCG	2	6	1040278	1040283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157374013
18509	NC_009831	GGTT	2	8	1040430	1040437	0 %	50 %	50 %	0 %	157374013
18510	NC_009831	TGGC	2	8	1040471	1040478	0 %	25 %	50 %	25 %	157374013
18511	NC_009831	CG	3	6	1040520	1040525	0 %	0 %	50 %	50 %	157374013
18512	NC_009831	GAA	2	6	1040532	1040537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157374013
18513	NC_009831	CAA	2	6	1040560	1040565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157374013
18514	NC_009831	CTG	2	6	1040570	1040575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157374013
18515	NC_009831	ACA	2	6	1040580	1040585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157374013
18516	NC_009831	TTGGTT	2	12	1040587	1040598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157374013
18517	NC_009831	AG	3	6	1040754	1040759	50 %	0 %	50 %	0 %	157374013
18518	NC_009831	CGT	2	6	1040826	1040831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157374013
18519	NC_009831	TTA	2	6	1040833	1040838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157374013
18520	NC_009831	CTG	2	6	1040851	1040856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157374013
18521	NC_009831	TTCA	2	8	1040880	1040887	25 %	50 %	0 %	25 %	157374013
18522	NC_009831	CGC	2	6	1041047	1041052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157374013
18523	NC_009831	CAT	2	6	1041098	1041103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157374013
18524	NC_009831	GGT	2	6	1041123	1041128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157374013
18525	NC_009831	TCA	2	6	1041130	1041135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157374013
18526	NC_009831	ATG	2	6	1041153	1041158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157374013
18527	NC_009831	TCA	2	6	1041266	1041271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157374013
18528	NC_009831	TG	3	6	1041317	1041322	0 %	50 %	50 %	0 %	157374013
18529	NC_009831	TGC	2	6	1041335	1041340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157374013
18530	NC_009831	GAA	2	6	1041359	1041364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157374013
18531	NC_009831	CAT	2	6	1041391	1041396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157374013
18532	NC_009831	CAG	2	6	1041441	1041446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157374013
18533	NC_009831	TGGT	2	8	1041736	1041743	0 %	50 %	50 %	0 %	157374013
18534	NC_009831	TGA	2	6	1041781	1041786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157374013
18535	NC_009831	GTT	2	6	1042056	1042061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18536	NC_009831	A	6	6	1042067	1042072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18537	NC_009831	CAAT	2	8	1042113	1042120	50 %	25 %	0 %	25 %	157374014
18538	NC_009831	TTC	2	6	1042146	1042151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157374014
18539	NC_009831	TCAGAT	2	12	1042180	1042191	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157374014
18540	NC_009831	ATACG	2	10	1042243	1042252	40 %	20 %	20 %	20 %	157374014
18541	NC_009831	GCT	2	6	1042277	1042282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157374014
18542	NC_009831	TGA	2	6	1042315	1042320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157374014
18543	NC_009831	CTC	2	6	1042477	1042482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157374014
18544	NC_009831	CGA	2	6	1042497	1042502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157374014
18545	NC_009831	CAC	2	6	1042520	1042525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157374014
18546	NC_009831	CTT	2	6	1042526	1042531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157374014
18547	NC_009831	ACA	2	6	1042568	1042573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157374014
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18549	NC_009831	ATGA	2	8	1042655	1042662	50 %	25 %	25 %	0 %	157374014
18550	NC_009831	GAA	2	6	1042698	1042703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157374014
18551	NC_009831	CG	3	6	1042704	1042709	0 %	0 %	50 %	50 %	157374014
18552	NC_009831	GTCA	2	8	1042716	1042723	25 %	25 %	25 %	25 %	157374014
18553	NC_009831	ATT	2	6	1042724	1042729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157374014
18554	NC_009831	GCT	2	6	1043035	1043040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157374014
18555	NC_009831	GAT	2	6	1043098	1043103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157374014
18556	NC_009831	A	7	7	1043121	1043127	100 %	0 %	0 %	0 %	157374014
18557	NC_009831	TAT	2	6	1043172	1043177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18558	NC_009831	TTTTAA	2	12	1043369	1043380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18559	NC_009831	TAT	2	6	1043405	1043410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157374015
18560	NC_009831	GTG	2	6	1043487	1043492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157374015
18561	NC_009831	TGC	2	6	1043513	1043518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157374015
18562	NC_009831	CTA	2	6	1043524	1043529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157374015
18563	NC_009831	GCC	2	6	1043553	1043558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157374015
18564	NC_009831	GTC	2	6	1043581	1043586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157374015
18565	NC_009831	TTG	2	6	1043716	1043721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157374015
18566	NC_009831	GAA	2	6	1043753	1043758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157374015
18567	NC_009831	ACG	2	6	1043761	1043766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157374015
18568	NC_009831	GATG	2	8	1043810	1043817	25 %	25 %	50 %	0 %	157374015
18569	NC_009831	TGG	2	6	1043966	1043971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157374015
18570	NC_009831	TTG	3	9	1044031	1044039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157374015
18571	NC_009831	GCA	2	6	1044066	1044071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157374015
18572	NC_009831	GAA	2	6	1044117	1044122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157374015
18573	NC_009831	GTG	2	6	1044154	1044159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157374015
18574	NC_009831	ACCG	2	8	1044173	1044180	25 %	0 %	25 %	50 %	157374015
18575	NC_009831	CGA	2	6	1044251	1044256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157374015
18576	NC_009831	GGT	3	9	1044429	1044437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157374015
18577	NC_009831	AT	3	6	1044485	1044490	50 %	50 %	0 %	0 %	157374015
18578	NC_009831	GCG	2	6	1044565	1044570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157374015
18579	NC_009831	A	6	6	1044601	1044606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18580	NC_009831	TAA	2	6	1044607	1044612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18581	NC_009831	A	8	8	1044641	1044648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18582	NC_009831	ATTC	2	8	1044713	1044720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18583	NC_009831	AATC	2	8	1044746	1044753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18584	NC_009831	TAT	2	6	1044788	1044793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18585	NC_009831	A	6	6	1044800	1044805	100 %	0 %	0 %	0 %	157374016
18586	NC_009831	TGC	2	6	1044840	1044845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157374016
18587	NC_009831	AAC	2	6	1044880	1044885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157374016
18588	NC_009831	CAT	2	6	1044903	1044908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157374016
18589	NC_009831	GCT	2	6	1044913	1044918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157374016
18590	NC_009831	TG	3	6	1045035	1045040	0 %	50 %	50 %	0 %	157374016
18591	NC_009831	ATG	2	6	1045111	1045116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157374016
18592	NC_009831	GTT	2	6	1045235	1045240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157374016
18593	NC_009831	GAA	2	6	1045270	1045275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157374016
18594	NC_009831	TGC	2	6	1045287	1045292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157374016
18595	NC_009831	CG	3	6	1045467	1045472	0 %	0 %	50 %	50 %	157374016
18596	NC_009831	TTC	2	6	1045503	1045508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157374016
18597	NC_009831	TCA	2	6	1045535	1045540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157374016
18598	NC_009831	GGT	2	6	1045549	1045554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157374016
18599	NC_009831	TAC	2	6	1045752	1045757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157374016
18600	NC_009831	TCTAA	2	10	1045875	1045884	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18601	NC_009831	TCGT	2	8	1045973	1045980	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18602	NC_009831	A	6	6	1046087	1046092	100 %	0 %	0 %	0 %	157374017
18603	NC_009831	TGC	2	6	1046131	1046136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157374017
18604	NC_009831	CGG	2	6	1046176	1046181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157374017
18605	NC_009831	TA	3	6	1046301	1046306	50 %	50 %	0 %	0 %	157374017
18606	NC_009831	GGTGA	2	10	1046318	1046327	20 %	20 %	60 %	0 %	157374017
18607	NC_009831	TAC	2	6	1046339	1046344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157374017
18608	NC_009831	CGTT	2	8	1046388	1046395	0 %	50 %	25 %	25 %	157374017
18609	NC_009831	T	6	6	1046863	1046868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18610	NC_009831	C	7	7	1046901	1046907	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18611	NC_009831	TTTA	2	8	1046910	1046917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18612	NC_009831	AGCTAT	2	12	1046944	1046955	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18613	NC_009831	CT	3	6	1047224	1047229	0 %	50 %	0 %	50 %	157374018
18614	NC_009831	CCT	2	6	1047330	1047335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157374018
18615	NC_009831	GAT	2	6	1047350	1047355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157374018
18616	NC_009831	ATA	2	6	1047372	1047377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157374018
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18618	NC_009831	TTA	2	6	1047464	1047469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157374018
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18971	NC_009831	TGA	3	9	1066941	1066949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157374032
18972	NC_009831	CTG	2	6	1067051	1067056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157374032
18973	NC_009831	CGA	2	6	1067112	1067117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157374032
18974	NC_009831	GC	3	6	1067144	1067149	0 %	0 %	50 %	50 %	157374032
18975	NC_009831	CAT	2	6	1067171	1067176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157374032
18976	NC_009831	TTG	2	6	1067193	1067198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18977	NC_009831	AAT	2	6	1067268	1067273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18978	NC_009831	GCAC	2	8	1067333	1067340	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18979	NC_009831	TTA	2	6	1067355	1067360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18980	NC_009831	TTTA	2	8	1067366	1067373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18981	NC_009831	TAA	2	6	1067400	1067405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18982	NC_009831	AGC	2	6	1067432	1067437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18983	NC_009831	TGC	3	9	1067543	1067551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157374033
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18990	NC_009831	GATG	2	8	1067915	1067922	25 %	25 %	50 %	0 %	157374033
18991	NC_009831	ATC	2	6	1068106	1068111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157374033
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18995	NC_009831	AATT	2	8	1068222	1068229	50 %	50 %	0 %	0 %	157374033
18996	NC_009831	T	6	6	1068266	1068271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18997	NC_009831	TC	3	6	1068304	1068309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18998	NC_009831	GAT	2	6	1068413	1068418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157374034
18999	NC_009831	CGC	2	6	1068441	1068446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157374034
19000	NC_009831	TTA	2	6	1068512	1068517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157374034

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