MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sediminis HAW-EB3 chromosome

Total Repeats: 97847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12003	NC_009831	TCG	2	6	674131	674136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373695
12004	NC_009831	TCAG	2	8	674161	674168	25 %	25 %	25 %	25 %	157373695
12005	NC_009831	CCT	2	6	674287	674292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157373695
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12009	NC_009831	TCA	2	6	674430	674435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373695
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12120	NC_009831	TGG	2	6	680559	680564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373700
12121	NC_009831	TGC	2	6	680565	680570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373700
12122	NC_009831	GCA	2	6	680602	680607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373700
12123	NC_009831	TGA	2	6	680613	680618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373700
12124	NC_009831	TCT	2	6	680652	680657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373700
12125	NC_009831	CGT	2	6	680756	680761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373700
12126	NC_009831	TA	3	6	680772	680777	50 %	50 %	0 %	0 %	157373700
12127	NC_009831	GAAT	2	8	680789	680796	50 %	25 %	25 %	0 %	157373701
12128	NC_009831	CGC	2	6	680833	680838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157373701
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12130	NC_009831	GTTT	2	8	680943	680950	0 %	75 %	25 %	0 %	157373701
12131	NC_009831	TG	3	6	680990	680995	0 %	50 %	50 %	0 %	157373701
12132	NC_009831	TGA	2	6	681128	681133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373701
12133	NC_009831	CGG	2	6	681134	681139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157373701
12134	NC_009831	AAG	2	6	681157	681162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373701
12135	NC_009831	CAC	2	6	681234	681239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157373701
12136	NC_009831	TTG	2	6	681296	681301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157373701
12137	NC_009831	ATT	2	6	681379	681384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157373701
12138	NC_009831	GCA	2	6	681394	681399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12139	NC_009831	GAA	2	6	681418	681423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12140	NC_009831	A	7	7	681527	681533	100 %	0 %	0 %	0 %	157373702
12141	NC_009831	GGC	2	6	681694	681699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157373702
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12143	NC_009831	TCGT	2	8	681798	681805	0 %	50 %	25 %	25 %	157373702
12144	NC_009831	GGT	2	6	681850	681855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373702
12145	NC_009831	GT	3	6	681951	681956	0 %	50 %	50 %	0 %	157373702
12146	NC_009831	GAATC	2	10	681963	681972	40 %	20 %	20 %	20 %	157373702
12147	NC_009831	TGG	2	6	682027	682032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373702
12148	NC_009831	TAT	2	6	682036	682041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157373702
12149	NC_009831	CCG	2	6	682047	682052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157373702
12150	NC_009831	T	6	6	682093	682098	0 %	100 %	0 %	0 %	157373702
12151	NC_009831	CGT	2	6	682100	682105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373702
12152	NC_009831	GTGA	2	8	682118	682125	25 %	25 %	50 %	0 %	157373702
12153	NC_009831	CGT	2	6	682127	682132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373702
12154	NC_009831	GT	3	6	682143	682148	0 %	50 %	50 %	0 %	157373702
12155	NC_009831	GCT	2	6	682150	682155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373702
12156	NC_009831	CGTG	2	8	682186	682193	0 %	25 %	50 %	25 %	157373702
12157	NC_009831	AGATC	2	10	682213	682222	40 %	20 %	20 %	20 %	157373702
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12161	NC_009831	GGT	2	6	682394	682399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373702
12162	NC_009831	CG	3	6	682522	682527	0 %	0 %	50 %	50 %	157373702
12163	NC_009831	CATTAT	2	12	682555	682566	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157373702
12164	NC_009831	CCG	2	6	682635	682640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157373702
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12166	NC_009831	CCTG	2	8	682745	682752	0 %	25 %	25 %	50 %	157373702
12167	NC_009831	AG	3	6	682805	682810	50 %	0 %	50 %	0 %	157373702
12168	NC_009831	CGA	2	6	682840	682845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373702
12169	NC_009831	GT	3	6	682920	682925	0 %	50 %	50 %	0 %	157373702
12170	NC_009831	TATG	2	8	682960	682967	25 %	50 %	25 %	0 %	157373702
12171	NC_009831	AAAT	2	8	682972	682979	75 %	25 %	0 %	0 %	157373702
12172	NC_009831	TAA	2	6	682989	682994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157373702
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12177	NC_009831	TGA	2	6	683315	683320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373703
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12184	NC_009831	ATG	2	6	683744	683749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373703
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12199	NC_009831	CTG	2	6	684862	684867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373703
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12204	NC_009831	TA	4	8	685068	685075	50 %	50 %	0 %	0 %	157373703
12205	NC_009831	GGT	2	6	685134	685139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373703
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12222	NC_009831	TAC	2	6	686156	686161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373703
12223	NC_009831	CT	4	8	686198	686205	0 %	50 %	0 %	50 %	157373703
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12225	NC_009831	TC	4	8	686405	686412	0 %	50 %	0 %	50 %	157373703
12226	NC_009831	GATA	2	8	686595	686602	50 %	25 %	25 %	0 %	157373703
12227	NC_009831	GATG	2	8	686631	686638	25 %	25 %	50 %	0 %	157373703
12228	NC_009831	CAC	2	6	686754	686759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157373703
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12230	NC_009831	AAG	2	6	687005	687010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373703
12231	NC_009831	AGA	2	6	687011	687016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373703
12232	NC_009831	CAGC	2	8	687137	687144	25 %	0 %	25 %	50 %	157373703
12233	NC_009831	AAGAT	2	10	687149	687158	60 %	20 %	20 %	0 %	157373703
12234	NC_009831	GAAG	2	8	687168	687175	50 %	0 %	50 %	0 %	157373703
12235	NC_009831	TCT	2	6	687259	687264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373704
12236	NC_009831	GAG	2	6	687281	687286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157373704
12237	NC_009831	TGC	2	6	687308	687313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373704
12238	NC_009831	TGG	2	6	687322	687327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373704
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12465	NC_009831	GA	3	6	700777	700782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12466	NC_009831	TGA	2	6	700942	700947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373715
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12481	NC_009831	TGT	2	6	701726	701731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157373715
12482	NC_009831	TGG	2	6	701740	701745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373715
12483	NC_009831	TGG	2	6	701767	701772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373715
12484	NC_009831	AGA	2	6	701852	701857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373716
12485	NC_009831	TCACA	2	10	701858	701867	40 %	20 %	0 %	40 %	157373716
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