MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sediminis HAW-EB3 chromosome

Total Repeats: 97847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_009831	CAT	2	6	620174	620179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373646
11002	NC_009831	AGC	2	6	620239	620244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373646
11003	NC_009831	TGG	2	6	620249	620254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373646
11004	NC_009831	TTCA	2	8	620309	620316	25 %	50 %	0 %	25 %	157373646
11005	NC_009831	TCA	2	6	620340	620345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373646
11006	NC_009831	TAA	2	6	620439	620444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157373646
11007	NC_009831	GAT	2	6	620507	620512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373646
11008	NC_009831	TGG	2	6	620518	620523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373646
11009	NC_009831	CAC	2	6	620572	620577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157373646
11010	NC_009831	GCA	2	6	620578	620583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373646
11011	NC_009831	CGA	2	6	620665	620670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373646
11012	NC_009831	GC	3	6	620722	620727	0 %	0 %	50 %	50 %	157373646
11013	NC_009831	CAC	2	6	620728	620733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157373646
11014	NC_009831	TTTATC	2	12	620759	620770	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157373646
11015	NC_009831	TTA	2	6	620920	620925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157373646
11016	NC_009831	CGG	2	6	620957	620962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157373646
11017	NC_009831	GCTT	2	8	620973	620980	0 %	50 %	25 %	25 %	157373646
11018	NC_009831	GTG	2	6	621019	621024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373646
11019	NC_009831	CAG	2	6	621047	621052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373646
11020	NC_009831	CT	3	6	621062	621067	0 %	50 %	0 %	50 %	157373646
11021	NC_009831	TCT	2	6	621081	621086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373646
11022	NC_009831	CAG	2	6	621170	621175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373646
11023	NC_009831	GC	3	6	621189	621194	0 %	0 %	50 %	50 %	157373646
11024	NC_009831	AC	3	6	621196	621201	50 %	0 %	0 %	50 %	157373646
11025	NC_009831	GCT	2	6	621326	621331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_009831	GC	3	6	621348	621353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11027	NC_009831	GAG	2	6	621401	621406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_009831	AAT	2	6	621409	621414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_009831	T	6	6	621450	621455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_009831	GAT	2	6	621478	621483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_009831	GTT	2	6	621490	621495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_009831	TTC	2	6	621605	621610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11033	NC_009831	TTGCC	2	10	621616	621625	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11034	NC_009831	AGATA	2	10	621682	621691	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_009831	CTT	2	6	621703	621708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11036	NC_009831	TGA	2	6	621751	621756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_009831	GGAG	2	8	621769	621776	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_009831	TG	3	6	621818	621823	0 %	50 %	50 %	0 %	157373647
11039	NC_009831	TG	3	6	621885	621890	0 %	50 %	50 %	0 %	157373647
11040	NC_009831	ACCT	2	8	621897	621904	25 %	25 %	0 %	50 %	157373647
11041	NC_009831	TCA	2	6	621921	621926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373647
11042	NC_009831	AAT	2	6	621991	621996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157373647
11043	NC_009831	TAT	2	6	622003	622008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157373647
11044	NC_009831	AAC	2	6	622042	622047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157373647
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11047	NC_009831	AG	3	6	622118	622123	50 %	0 %	50 %	0 %	157373647
11048	NC_009831	ACC	2	6	622126	622131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157373647
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11050	NC_009831	TTTA	2	8	622343	622350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_009831	ATG	2	6	622359	622364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_009831	TAA	2	6	622410	622415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_009831	TG	3	6	622470	622475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_009831	TA	3	6	622487	622492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_009831	AT	3	6	622505	622510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_009831	TTA	2	6	622544	622549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_009831	GTT	2	6	622683	622688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_009831	A	7	7	622726	622732	100 %	0 %	0 %	0 %	157373648
11059	NC_009831	TTG	2	6	622804	622809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157373648
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11061	NC_009831	TAA	2	6	622891	622896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157373648
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11063	NC_009831	TAA	2	6	622930	622935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157373648
11064	NC_009831	TTAAG	2	10	622938	622947	40 %	40 %	20 %	0 %	157373648
11065	NC_009831	TAT	2	6	622953	622958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_009831	G	7	7	622968	622974	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_009831	TGG	2	6	623008	623013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_009831	GAG	2	6	623108	623113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_009831	GAT	2	6	623117	623122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_009831	ATATT	2	10	623201	623210	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_009831	TAAA	2	8	623254	623261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_009831	CTT	2	6	623291	623296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11073	NC_009831	T	6	6	623299	623304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_009831	GTT	2	6	623338	623343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_009831	GAA	2	6	623344	623349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_009831	CTG	2	6	623371	623376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11077	NC_009831	TGGT	2	8	623377	623384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_009831	AAC	2	6	623413	623418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_009831	ATA	2	6	623454	623459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_009831	TGAATG	2	12	623463	623474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_009831	TTTTG	2	10	623494	623503	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_009831	TGGA	2	8	623515	623522	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_009831	T	7	7	623536	623542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_009831	AGG	2	6	623575	623580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_009831	T	6	6	623586	623591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11089	NC_009831	C	6	6	623827	623832	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11090	NC_009831	GTTC	2	8	623849	623856	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11091	NC_009831	TTTC	2	8	623923	623930	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11092	NC_009831	TTGT	2	8	623962	623969	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_009831	ATGA	2	8	623989	623996	50 %	25 %	25 %	0 %	157373649
11094	NC_009831	A	6	6	624001	624006	100 %	0 %	0 %	0 %	157373649
11095	NC_009831	TGG	2	6	624182	624187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373649
11096	NC_009831	CGA	2	6	624251	624256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373649
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11098	NC_009831	TTGTCA	2	12	624278	624289	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157373649
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11101	NC_009831	CAGT	2	8	624375	624382	25 %	25 %	25 %	25 %	157373649
11102	NC_009831	GGCG	2	8	624390	624397	0 %	0 %	75 %	25 %	157373649
11103	NC_009831	GTC	2	6	624409	624414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373649
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11106	NC_009831	CGA	2	6	624537	624542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373649
11107	NC_009831	GAT	2	6	624586	624591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373649
11108	NC_009831	GAT	2	6	624609	624614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373649
11109	NC_009831	ATT	2	6	624646	624651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157373649
11110	NC_009831	TGG	2	6	624663	624668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373649
11111	NC_009831	CAT	2	6	624747	624752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373649
11112	NC_009831	ATGG	2	8	624775	624782	25 %	25 %	50 %	0 %	157373649
11113	NC_009831	TGA	2	6	624854	624859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373649
11114	NC_009831	ATG	2	6	624940	624945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373649
11115	NC_009831	GAT	2	6	624961	624966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373649
11116	NC_009831	GTT	2	6	624973	624978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_009831	GGT	2	6	625012	625017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373650
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11120	NC_009831	TTTC	2	8	625322	625329	0 %	75 %	0 %	25 %	157373650
11121	NC_009831	ACC	2	6	625333	625338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157373650
11122	NC_009831	GAT	2	6	625389	625394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373650
11123	NC_009831	CA	3	6	625418	625423	50 %	0 %	0 %	50 %	157373650
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