MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sediminis HAW-EB3 chromosome

Total Repeats: 97847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_009831	GCG	2	6	365748	365753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157373454
6502	NC_009831	ATT	2	6	365768	365773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157373454
6503	NC_009831	AG	3	6	365793	365798	50 %	0 %	50 %	0 %	157373454
6504	NC_009831	TG	3	6	365953	365958	0 %	50 %	50 %	0 %	157373454
6505	NC_009831	CTAA	2	8	365990	365997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6506	NC_009831	TGT	2	6	365998	366003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_009831	TA	3	6	366015	366020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_009831	CT	4	8	366129	366136	0 %	50 %	0 %	50 %	157373455
6509	NC_009831	AT	3	6	366198	366203	50 %	50 %	0 %	0 %	157373455
6510	NC_009831	TCA	2	6	366328	366333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373455
6511	NC_009831	AAC	2	6	366337	366342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157373455
6512	NC_009831	TTG	2	6	366348	366353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157373455
6513	NC_009831	TC	3	6	366431	366436	0 %	50 %	0 %	50 %	157373455
6514	NC_009831	TTA	2	6	366517	366522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157373455
6515	NC_009831	CAGA	2	8	366621	366628	50 %	0 %	25 %	25 %	157373455
6516	NC_009831	CT	3	6	366699	366704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6517	NC_009831	CAA	2	6	366735	366740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157373456
6518	NC_009831	T	6	6	366753	366758	0 %	100 %	0 %	0 %	157373456
6519	NC_009831	CAT	2	6	366846	366851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373456
6520	NC_009831	AGA	2	6	366852	366857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373456
6521	NC_009831	CAT	2	6	366876	366881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373456
6522	NC_009831	CAAT	2	8	366950	366957	50 %	25 %	0 %	25 %	157373456
6523	NC_009831	T	6	6	366957	366962	0 %	100 %	0 %	0 %	157373456
6524	NC_009831	GAAGA	2	10	367031	367040	60 %	0 %	40 %	0 %	157373456
6525	NC_009831	GAA	2	6	367140	367145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373456
6526	NC_009831	TTA	2	6	367340	367345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157373456
6527	NC_009831	T	6	6	367372	367377	0 %	100 %	0 %	0 %	157373456
6528	NC_009831	CAG	2	6	367624	367629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373456
6529	NC_009831	CCCGGT	2	12	367667	367678	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	157373456
6530	NC_009831	GAAATC	2	12	367693	367704	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157373456
6531	NC_009831	GCG	2	6	367730	367735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157373456
6532	NC_009831	CTTGC	2	10	367873	367882	0 %	40 %	20 %	40 %	157373456
6533	NC_009831	TGA	2	6	367883	367888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373456
6534	NC_009831	AGG	2	6	367889	367894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157373456
6535	NC_009831	GCG	2	6	367898	367903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157373456
6536	NC_009831	TCAG	2	8	367946	367953	25 %	25 %	25 %	25 %	157373456
6537	NC_009831	TATG	2	8	368069	368076	25 %	50 %	25 %	0 %	157373457
6538	NC_009831	CAG	2	6	368097	368102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373457
6539	NC_009831	CAT	2	6	368145	368150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373457
6540	NC_009831	A	6	6	368181	368186	100 %	0 %	0 %	0 %	157373457
6541	NC_009831	GAG	2	6	368249	368254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157373457
6542	NC_009831	AGT	2	6	368269	368274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373457
6543	NC_009831	ATGGCG	2	12	368371	368382	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157373457
6544	NC_009831	A	6	6	368473	368478	100 %	0 %	0 %	0 %	157373457
6545	NC_009831	AGC	2	6	368512	368517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373457
6546	NC_009831	CAA	2	6	368687	368692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157373457
6547	NC_009831	ATAA	2	8	368712	368719	75 %	25 %	0 %	0 %	157373457
6548	NC_009831	AGGT	2	8	368764	368771	25 %	25 %	50 %	0 %	157373457
6549	NC_009831	CAAT	2	8	368792	368799	50 %	25 %	0 %	25 %	157373457
6550	NC_009831	TC	3	6	368867	368872	0 %	50 %	0 %	50 %	157373457
6551	NC_009831	TGC	2	6	368926	368931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373457
6552	NC_009831	ATC	3	9	368976	368984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373457
6553	NC_009831	GAT	2	6	369015	369020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373457
6554	NC_009831	A	6	6	369061	369066	100 %	0 %	0 %	0 %	157373457
6555	NC_009831	AATTT	2	10	369077	369086	40 %	60 %	0 %	0 %	157373457
6556	NC_009831	GAAG	2	8	369127	369134	50 %	0 %	50 %	0 %	157373457
6557	NC_009831	TAGGC	2	10	369157	369166	20 %	20 %	40 %	20 %	157373457
6558	NC_009831	CGCAG	2	10	369195	369204	20 %	0 %	40 %	40 %	157373457
6559	NC_009831	CTG	2	6	369216	369221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373457
6560	NC_009831	T	6	6	369326	369331	0 %	100 %	0 %	0 %	157373457
6561	NC_009831	TCGC	2	8	369345	369352	0 %	25 %	25 %	50 %	157373457
6562	NC_009831	CAG	2	6	369414	369419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373457
6563	NC_009831	TCA	2	6	369446	369451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373457
6564	NC_009831	TGG	2	6	369470	369475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373457
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6566	NC_009831	GCC	2	6	369763	369768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157373457
6567	NC_009831	CAG	2	6	369810	369815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373457
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6571	NC_009831	CT	3	6	370111	370116	0 %	50 %	0 %	50 %	157373457
6572	NC_009831	GGCTT	2	10	370140	370149	0 %	40 %	40 %	20 %	157373457
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6575	NC_009831	TCT	2	6	370231	370236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373457
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6579	NC_009831	TGGCT	2	10	370409	370418	0 %	40 %	40 %	20 %	157373458
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6590	NC_009831	CTG	2	6	371041	371046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373458
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6594	NC_009831	GTTTCA	2	12	371303	371314	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157373459
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6596	NC_009831	GAC	2	6	371359	371364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373459
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6605	NC_009831	TGC	2	6	371922	371927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373460
6606	NC_009831	T	6	6	372001	372006	0 %	100 %	0 %	0 %	157373460
6607	NC_009831	GC	3	6	372067	372072	0 %	0 %	50 %	50 %	157373460
6608	NC_009831	CGAT	2	8	372148	372155	25 %	25 %	25 %	25 %	157373460
6609	NC_009831	GCC	2	6	372213	372218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157373460
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