MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus gordonii str. Challis substr. CH1 chromosome

Total Repeats: 45023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_009785	GCT	2	6	2006175	2006180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150594
41002	NC_009785	CAC	2	6	2006203	2006208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157150594
41003	NC_009785	TCA	2	6	2006241	2006246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150594
41004	NC_009785	GTT	2	6	2006254	2006259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150594
41005	NC_009785	T	7	7	2006329	2006335	0 %	100 %	0 %	0 %	157150594
41006	NC_009785	GAA	2	6	2006433	2006438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150594
41007	NC_009785	CT	3	6	2006445	2006450	0 %	50 %	0 %	50 %	157150594
41008	NC_009785	TCC	3	9	2006489	2006497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157150594
41009	NC_009785	GTT	2	6	2006514	2006519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150594
41010	NC_009785	T	7	7	2006530	2006536	0 %	100 %	0 %	0 %	157150594
41011	NC_009785	A	7	7	2006563	2006569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41012	NC_009785	T	6	6	2006610	2006615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41013	NC_009785	GTA	2	6	2006651	2006656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150124
41014	NC_009785	TCT	2	6	2006673	2006678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150124
41015	NC_009785	TCA	2	6	2006755	2006760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150124
41016	NC_009785	CAT	2	6	2006821	2006826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150124
41017	NC_009785	AGA	2	6	2006834	2006839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150124
41018	NC_009785	TCA	2	6	2006850	2006855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150124
41019	NC_009785	TCA	2	6	2006871	2006876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150124
41020	NC_009785	TTC	2	6	2006901	2006906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150124
41021	NC_009785	CTA	2	6	2007060	2007065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150124
41022	NC_009785	CTT	2	6	2007083	2007088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150124
41023	NC_009785	GACT	2	8	2007105	2007112	25 %	25 %	25 %	25 %	157150124
41024	NC_009785	GTT	2	6	2007135	2007140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150124
41025	NC_009785	ATAA	2	8	2007179	2007186	75 %	25 %	0 %	0 %	157150124
41026	NC_009785	CTT	2	6	2007236	2007241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150124
41027	NC_009785	TCC	2	6	2007254	2007259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41028	NC_009785	ATA	2	6	2007395	2007400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150940
41029	NC_009785	CTGT	2	8	2007473	2007480	0 %	50 %	25 %	25 %	157150940
41030	NC_009785	CTCC	2	8	2007509	2007516	0 %	25 %	0 %	75 %	157150940
41031	NC_009785	ATAG	2	8	2007517	2007524	50 %	25 %	25 %	0 %	157150940
41032	NC_009785	TGTT	2	8	2007582	2007589	0 %	75 %	25 %	0 %	157150940
41033	NC_009785	TCC	2	6	2007602	2007607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41034	NC_009785	GAC	2	6	2007650	2007655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150209
41035	NC_009785	AGCTCA	2	12	2007667	2007678	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157150209
41036	NC_009785	GCC	2	6	2007713	2007718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157150209
41037	NC_009785	GCA	2	6	2007727	2007732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150209
41038	NC_009785	TAT	2	6	2007760	2007765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150209
41039	NC_009785	CAT	2	6	2007943	2007948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150209
41040	NC_009785	ATG	2	6	2008104	2008109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150209
41041	NC_009785	TCATC	2	10	2008162	2008171	20 %	40 %	0 %	40 %	157150209
41042	NC_009785	CAA	2	6	2008210	2008215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150209
41043	NC_009785	CAA	2	6	2008247	2008252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150209
41044	NC_009785	CTG	2	6	2008269	2008274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150209
41045	NC_009785	TCA	2	6	2008291	2008296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150209
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41047	NC_009785	GCA	2	6	2008381	2008386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150209
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41050	NC_009785	TGC	2	6	2008446	2008451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150209
41051	NC_009785	CAA	2	6	2008472	2008477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150209
41052	NC_009785	GCA	2	6	2008504	2008509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150209
41053	NC_009785	GCT	2	6	2008581	2008586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150209
41054	NC_009785	GGCA	2	8	2008684	2008691	25 %	0 %	50 %	25 %	157150209
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41056	NC_009785	ACCC	2	8	2008898	2008905	25 %	0 %	0 %	75 %	157150209
41057	NC_009785	TAC	2	6	2008924	2008929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150209
41058	NC_009785	TGAT	2	8	2008935	2008942	25 %	50 %	25 %	0 %	157150209
41059	NC_009785	CTT	2	6	2008970	2008975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150209
41060	NC_009785	TCA	2	6	2008999	2009004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150209
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41062	NC_009785	AAT	2	6	2009240	2009245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150209
41063	NC_009785	TGA	2	6	2009271	2009276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150209
41064	NC_009785	GAT	2	6	2009284	2009289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150209
41065	NC_009785	CGCTG	2	10	2009333	2009342	0 %	20 %	40 %	40 %	157150209
41066	NC_009785	CT	3	6	2009401	2009406	0 %	50 %	0 %	50 %	157150209
41067	NC_009785	CA	3	6	2009427	2009432	50 %	0 %	0 %	50 %	157150209
41068	NC_009785	GCAG	2	8	2009433	2009440	25 %	0 %	50 %	25 %	157150209
41069	NC_009785	AAG	2	6	2009493	2009498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150209
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41071	NC_009785	TTTC	2	8	2009582	2009589	0 %	75 %	0 %	25 %	157150209
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41073	NC_009785	GCTG	2	8	2009698	2009705	0 %	25 %	50 %	25 %	157150209
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41077	NC_009785	CAT	2	6	2009855	2009860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150209
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41082	NC_009785	CAT	2	6	2010095	2010100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149800
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41084	NC_009785	TTA	2	6	2010314	2010319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41085	NC_009785	TTA	2	6	2010342	2010347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41086	NC_009785	A	6	6	2010404	2010409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41087	NC_009785	TCT	2	6	2010428	2010433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41088	NC_009785	TAG	2	6	2010500	2010505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150803
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41093	NC_009785	GCT	2	6	2010827	2010832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150803
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41098	NC_009785	AGCCA	2	10	2011375	2011384	40 %	0 %	20 %	40 %	157150803
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41100	NC_009785	GCA	2	6	2011430	2011435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150803
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41102	NC_009785	CTT	2	6	2011453	2011458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150803
41103	NC_009785	CCA	2	6	2011497	2011502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157150803
41104	NC_009785	ATG	2	6	2011549	2011554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150803
41105	NC_009785	TCT	2	6	2011580	2011585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150803
41106	NC_009785	TCC	2	6	2011594	2011599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157150803
41107	NC_009785	CTT	2	6	2011642	2011647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150803
41108	NC_009785	ATTTTC	2	12	2011690	2011701	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157150803
41109	NC_009785	TCG	2	6	2011728	2011733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150803
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41111	NC_009785	T	6	6	2011879	2011884	0 %	100 %	0 %	0 %	157150803
41112	NC_009785	CCA	2	6	2011899	2011904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157150803
41113	NC_009785	T	7	7	2011950	2011956	0 %	100 %	0 %	0 %	157150803
41114	NC_009785	T	6	6	2011972	2011977	0 %	100 %	0 %	0 %	157151144
41115	NC_009785	AAT	2	6	2012011	2012016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157151144
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41117	NC_009785	TCA	2	6	2012285	2012290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157151144
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41481	NC_009785	CTT	2	6	2030164	2030169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150445
41482	NC_009785	TCA	2	6	2030211	2030216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150445
41483	NC_009785	CAG	2	6	2030272	2030277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150445
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41485	NC_009785	ACG	2	6	2030300	2030305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150445
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