MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus gordonii str. Challis substr. CH1 chromosome

Total Repeats: 45023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009785	TGA	2	6	140819	140824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150337
3002	NC_009785	CTT	2	6	140839	140844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150337
3003	NC_009785	A	6	6	140847	140852	100 %	0 %	0 %	0 %	157150337
3004	NC_009785	GGAA	2	8	140939	140946	50 %	0 %	50 %	0 %	157150337
3005	NC_009785	GCA	2	6	140974	140979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150337
3006	NC_009785	A	6	6	141004	141009	100 %	0 %	0 %	0 %	157150337
3007	NC_009785	TCAG	2	8	141019	141026	25 %	25 %	25 %	25 %	157150337
3008	NC_009785	AGG	2	6	141062	141067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157150337
3009	NC_009785	TGA	2	6	141125	141130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149878
3010	NC_009785	GCCAGG	2	12	141200	141211	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	157149878
3011	NC_009785	AAG	2	6	141224	141229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149878
3012	NC_009785	AATC	2	8	141267	141274	50 %	25 %	0 %	25 %	157149878
3013	NC_009785	GTC	2	6	141302	141307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149878
3014	NC_009785	AGA	2	6	141327	141332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149878
3015	NC_009785	TGG	2	6	141375	141380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149878
3016	NC_009785	ACC	2	6	141488	141493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149878
3017	NC_009785	TGA	2	6	141600	141605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149878
3018	NC_009785	GAA	2	6	141646	141651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149878
3019	NC_009785	TTC	2	6	141658	141663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149878
3020	NC_009785	ATGA	2	8	141664	141671	50 %	25 %	25 %	0 %	157149878
3021	NC_009785	GA	3	6	141675	141680	50 %	0 %	50 %	0 %	157149878
3022	NC_009785	CGC	2	6	141752	141757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149878
3023	NC_009785	CAG	2	6	141770	141775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149878
3024	NC_009785	TCA	2	6	141815	141820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149878
3025	NC_009785	ACT	2	6	141836	141841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149878
3026	NC_009785	TCG	2	6	141870	141875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149878
3027	NC_009785	CGT	2	6	141889	141894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149878
3028	NC_009785	CCG	2	6	142099	142104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149878
3029	NC_009785	GTCTC	2	10	142125	142134	0 %	40 %	20 %	40 %	157149878
3030	NC_009785	TGC	2	6	142176	142181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149878
3031	NC_009785	GCC	2	6	142201	142206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149878
3032	NC_009785	ATCA	2	8	142318	142325	50 %	25 %	0 %	25 %	157149878
3033	NC_009785	CTGGG	2	10	142366	142375	0 %	20 %	60 %	20 %	157149878
3034	NC_009785	AGG	2	6	142454	142459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149878
3035	NC_009785	AAGA	2	8	142460	142467	75 %	0 %	25 %	0 %	157149878
3036	NC_009785	GCG	2	6	142580	142585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157151262
3037	NC_009785	AAT	2	6	142608	142613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157151262
3038	NC_009785	GGTC	2	8	142643	142650	0 %	25 %	50 %	25 %	157151262
3039	NC_009785	GAG	2	6	142701	142706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157151262
3040	NC_009785	TGA	2	6	142811	142816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151262
3041	NC_009785	CTG	2	6	142902	142907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157151262
3042	NC_009785	CGC	2	6	142965	142970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157151262
3043	NC_009785	CTA	2	6	143021	143026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157151262
3044	NC_009785	GAA	2	6	143043	143048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157151262
3045	NC_009785	ATG	2	6	143073	143078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151262
3046	NC_009785	T	6	6	143168	143173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_009785	T	7	7	143261	143267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_009785	CTTT	2	8	143283	143290	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3049	NC_009785	AAG	2	6	143370	143375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_009785	TATT	2	8	143398	143405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_009785	ACTA	2	8	143406	143413	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3052	NC_009785	GTA	2	6	143521	143526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_009785	TGAA	2	8	143527	143534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_009785	A	7	7	143565	143571	100 %	0 %	0 %	0 %	157150806
3055	NC_009785	ATCAA	2	10	143665	143674	60 %	20 %	0 %	20 %	157150806
3056	NC_009785	TAG	2	6	143687	143692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150806
3057	NC_009785	AGCT	2	8	143920	143927	25 %	25 %	25 %	25 %	157150806
3058	NC_009785	CAG	2	6	144004	144009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150806
3059	NC_009785	CAG	2	6	144073	144078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150806
3060	NC_009785	GCT	2	6	144108	144113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150806
3061	NC_009785	TCAAG	2	10	144114	144123	40 %	20 %	20 %	20 %	157150806
3062	NC_009785	GCT	2	6	144129	144134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150806
3063	NC_009785	AGTG	2	8	144140	144147	25 %	25 %	50 %	0 %	157150806
3064	NC_009785	CTG	2	6	144157	144162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150806
3065	NC_009785	CTG	2	6	144367	144372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150806
3066	NC_009785	AGA	2	6	144380	144385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150806
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3068	NC_009785	CAA	2	6	144482	144487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150806
3069	NC_009785	ATGA	2	8	144678	144685	50 %	25 %	25 %	0 %	157150806
3070	NC_009785	ATAA	2	8	144686	144693	75 %	25 %	0 %	0 %	157150806
3071	NC_009785	TAA	2	6	144771	144776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_009785	AGAA	2	8	144799	144806	75 %	0 %	25 %	0 %	157151228
3073	NC_009785	ATCA	2	8	144819	144826	50 %	25 %	0 %	25 %	157151228
3074	NC_009785	CAGC	2	8	144852	144859	25 %	0 %	25 %	50 %	157151228
3075	NC_009785	CTT	2	6	144954	144959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157151228
3076	NC_009785	GAT	2	6	144998	145003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151228
3077	NC_009785	TGA	2	6	145057	145062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151228
3078	NC_009785	TGA	2	6	145170	145175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151228
3079	NC_009785	GGC	2	6	145249	145254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157151228
3080	NC_009785	ATT	2	6	145289	145294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157151228
3081	NC_009785	GAC	2	6	145342	145347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157151228
3082	NC_009785	TGA	2	6	145393	145398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151228
3083	NC_009785	TCA	2	6	145475	145480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157151228
3084	NC_009785	CTA	2	6	145522	145527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157151228
3085	NC_009785	TACGCT	2	12	145532	145543	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	157151228
3086	NC_009785	CAG	2	6	145569	145574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157151228
3087	NC_009785	GGC	2	6	145624	145629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157151228
3088	NC_009785	CTA	2	6	145630	145635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157151228
3089	NC_009785	CTT	2	6	145705	145710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157151228
3090	NC_009785	AAG	2	6	145730	145735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157151228
3091	NC_009785	TCTG	2	8	145810	145817	0 %	50 %	25 %	25 %	157151228
3092	NC_009785	GGC	2	6	145849	145854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157151228
3093	NC_009785	GCT	2	6	145946	145951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157151228
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3095	NC_009785	ACG	2	6	146234	146239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157151228
3096	NC_009785	TGC	2	6	146242	146247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157151228
3097	NC_009785	CAG	2	6	146262	146267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157151228
3098	NC_009785	T	6	6	146333	146338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_009785	GAA	2	6	146383	146388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_009785	GAC	2	6	146399	146404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150772
3101	NC_009785	A	7	7	146409	146415	100 %	0 %	0 %	0 %	157150772
3102	NC_009785	TAGC	2	8	146491	146498	25 %	25 %	25 %	25 %	157150772
3103	NC_009785	CAT	2	6	146540	146545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150772
3104	NC_009785	GA	3	6	146628	146633	50 %	0 %	50 %	0 %	157150772
3105	NC_009785	TC	3	6	146698	146703	0 %	50 %	0 %	50 %	157150772
3106	NC_009785	GGCA	2	8	146712	146719	25 %	0 %	50 %	25 %	157150772
3107	NC_009785	GAT	2	6	146720	146725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150772
3108	NC_009785	G	6	6	146763	146768	0 %	0 %	100 %	0 %	157150772
3109	NC_009785	TTGG	2	8	146781	146788	0 %	50 %	50 %	0 %	157150772
3110	NC_009785	TGA	2	6	146812	146817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150772
3111	NC_009785	ATGT	2	8	146865	146872	25 %	50 %	25 %	0 %	157150772
3112	NC_009785	TCT	2	6	146876	146881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150772
3113	NC_009785	CT	3	6	146899	146904	0 %	50 %	0 %	50 %	157150772
3114	NC_009785	ATG	2	6	147090	147095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150772
3115	NC_009785	CGGG	2	8	147096	147103	0 %	0 %	75 %	25 %	157150772
3116	NC_009785	TGCC	2	8	147196	147203	0 %	25 %	25 %	50 %	157150772
3117	NC_009785	GCAACA	2	12	147213	147224	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	157150772
3118	NC_009785	CT	3	6	147466	147471	0 %	50 %	0 %	50 %	157150772
3119	NC_009785	CAT	2	6	147536	147541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150772
3120	NC_009785	TTG	2	6	147552	147557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150772
3121	NC_009785	CTGGG	2	10	147590	147599	0 %	20 %	60 %	20 %	157150772
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3497	NC_009785	AGC	2	6	166577	166582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3499	NC_009785	A	6	6	166685	166690	100 %	0 %	0 %	0 %	157150074
3500	NC_009785	AAG	2	6	166752	166757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150074

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