MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus gordonii str. Challis substr. CH1 chromosome

Total Repeats: 45023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_009785	TAAA	2	8	317213	317220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_009785	T	6	6	317276	317281	0 %	100 %	0 %	0 %	157151619
6503	NC_009785	CCAA	2	8	317302	317309	50 %	0 %	0 %	50 %	157151619
6504	NC_009785	ATG	2	6	317323	317328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151619
6505	NC_009785	CAT	2	6	317387	317392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157151619
6506	NC_009785	GAG	2	6	317421	317426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157151619
6507	NC_009785	AGG	2	6	317476	317481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157151619
6508	NC_009785	TTGA	2	8	317676	317683	25 %	50 %	25 %	0 %	157151619
6509	NC_009785	TGG	2	6	317690	317695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157151619
6510	NC_009785	CT	3	6	317743	317748	0 %	50 %	0 %	50 %	157151619
6511	NC_009785	TCC	2	6	317806	317811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157151619
6512	NC_009785	GGGGC	2	10	317826	317835	0 %	0 %	80 %	20 %	157151619
6513	NC_009785	GAA	2	6	317844	317849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157151619
6514	NC_009785	CAT	2	6	317886	317891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157151619
6515	NC_009785	GGC	2	6	317966	317971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157151619
6516	NC_009785	GGA	2	6	318023	318028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157151619
6517	NC_009785	GTG	2	6	318067	318072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157151619
6518	NC_009785	AGA	3	9	318131	318139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157151619
6519	NC_009785	TAC	2	6	318186	318191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157151619
6520	NC_009785	CTGA	2	8	318231	318238	25 %	25 %	25 %	25 %	157151619
6521	NC_009785	TC	3	6	318255	318260	0 %	50 %	0 %	50 %	157151619
6522	NC_009785	TGA	2	6	318422	318427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151619
6523	NC_009785	GTG	2	6	318492	318497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157151619
6524	NC_009785	GAA	2	6	318557	318562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157151619
6525	NC_009785	AAG	2	6	318624	318629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157151619
6526	NC_009785	A	6	6	318687	318692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_009785	T	6	6	318717	318722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_009785	CAA	2	6	318792	318797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_009785	TTCTT	2	10	318885	318894	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6530	NC_009785	CTTT	2	8	318923	318930	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6531	NC_009785	TTC	2	6	318956	318961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_009785	GAAGGA	2	12	319056	319067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_009785	AAT	2	6	319097	319102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149761
6534	NC_009785	GCTG	2	8	319177	319184	0 %	25 %	50 %	25 %	157149761
6535	NC_009785	GA	3	6	319314	319319	50 %	0 %	50 %	0 %	157149761
6536	NC_009785	GAA	2	6	319445	319450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149761
6537	NC_009785	ATT	2	6	319474	319479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149761
6538	NC_009785	AAGA	2	8	319529	319536	75 %	0 %	25 %	0 %	157149761
6539	NC_009785	A	7	7	319571	319577	100 %	0 %	0 %	0 %	157149761
6540	NC_009785	TTTG	2	8	319594	319601	0 %	75 %	25 %	0 %	157149761
6541	NC_009785	GAA	2	6	319613	319618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149761
6542	NC_009785	ATA	2	6	319635	319640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149761
6543	NC_009785	ATCC	2	8	319689	319696	25 %	25 %	0 %	50 %	157149761
6544	NC_009785	AGG	2	6	319740	319745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149761
6545	NC_009785	TAG	2	6	319876	319881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150245
6546	NC_009785	CTGA	2	8	319919	319926	25 %	25 %	25 %	25 %	157150245
6547	NC_009785	GAC	2	6	319960	319965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150245
6548	NC_009785	TGT	2	6	319969	319974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150245
6549	NC_009785	GCA	2	6	319975	319980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150245
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6551	NC_009785	GGAG	2	8	320176	320183	25 %	0 %	75 %	0 %	157150245
6552	NC_009785	TTA	2	6	320245	320250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150245
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6555	NC_009785	AACC	2	8	320476	320483	50 %	0 %	0 %	50 %	157150245
6556	NC_009785	CAG	2	6	320506	320511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150245
6557	NC_009785	GAG	2	6	320513	320518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157150245
6558	NC_009785	CAG	2	6	320546	320551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150245
6559	NC_009785	GAC	2	6	320594	320599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150245
6560	NC_009785	TCG	2	6	320688	320693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_009785	GTA	2	6	320743	320748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_009785	TC	3	6	320840	320845	0 %	50 %	0 %	50 %	157151645
6563	NC_009785	TTC	2	6	320846	320851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157151645
6564	NC_009785	GCTAA	2	10	320867	320876	40 %	20 %	20 %	20 %	157151645
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6567	NC_009785	GAC	2	6	321046	321051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157151645
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6571	NC_009785	TGT	2	6	321390	321395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157151645
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6574	NC_009785	GAG	2	6	321463	321468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157151645
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6594	NC_009785	GACA	2	8	322292	322299	50 %	0 %	25 %	25 %	157150404
6595	NC_009785	TCC	2	6	322304	322309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157150404
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6597	NC_009785	T	6	6	322442	322447	0 %	100 %	0 %	0 %	157150404
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6599	NC_009785	T	9	9	322618	322626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6613	NC_009785	ATG	2	6	323151	323156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150482
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6617	NC_009785	T	7	7	323325	323331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_009785	GTC	2	6	323585	323590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150611
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6998	NC_009785	ATGT	2	8	342656	342663	25 %	50 %	25 %	0 %	157151510
6999	NC_009785	GAAG	2	8	342679	342686	50 %	0 %	50 %	0 %	157151510
7000	NC_009785	AGT	2	6	342697	342702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151510

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