MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 68839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009641	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009641	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009641	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009641	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009641	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009641	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009641	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009641	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009641	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009641	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009641	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220213
12	NC_009641	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220213
13	NC_009641	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220213
14	NC_009641	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220213
15	NC_009641	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220213
16	NC_009641	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220213
17	NC_009641	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220213
18	NC_009641	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220213
19	NC_009641	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	151220213
20	NC_009641	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220213
21	NC_009641	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	151220213
22	NC_009641	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220213
23	NC_009641	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220213
24	NC_009641	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220213
25	NC_009641	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220213
26	NC_009641	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220213
27	NC_009641	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220213
28	NC_009641	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151220213
29	NC_009641	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220213
30	NC_009641	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220213
31	NC_009641	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151220213
32	NC_009641	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220213
33	NC_009641	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220213
34	NC_009641	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151220213
35	NC_009641	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	151220213
36	NC_009641	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	151220213
37	NC_009641	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220213
38	NC_009641	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220213
39	NC_009641	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	151220213
40	NC_009641	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	151220213
41	NC_009641	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	151220213
42	NC_009641	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220213
43	NC_009641	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220213
44	NC_009641	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	151220213
45	NC_009641	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	151220213
46	NC_009641	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220213
47	NC_009641	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220213
48	NC_009641	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009641	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009641	AC	3	6	2007	2012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009641	C	6	6	2076	2081	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_009641	CTA	3	9	2095	2103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009641	TA	3	6	2123	2128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009641	TA	4	8	2131	2138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009641	TAAT	2	8	2157	2164	50 %	50 %	0 %	0 %	151220214
56	NC_009641	ATT	2	6	2188	2193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220214
57	NC_009641	TTA	2	6	2194	2199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220214
58	NC_009641	AAC	2	6	2237	2242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220214
59	NC_009641	AGT	2	6	2387	2392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220214
60	NC_009641	TTG	2	6	2410	2415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220214
61	NC_009641	A	7	7	2423	2429	100 %	0 %	0 %	0 %	151220214
62	NC_009641	ATTA	2	8	2477	2484	50 %	50 %	0 %	0 %	151220214
63	NC_009641	AATTT	2	10	2500	2509	40 %	60 %	0 %	0 %	151220214
64	NC_009641	TTA	2	6	2538	2543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220214
65	NC_009641	CAATT	2	10	2566	2575	40 %	40 %	0 %	20 %	151220214
66	NC_009641	CAAA	2	8	2607	2614	75 %	0 %	0 %	25 %	151220214
67	NC_009641	GACT	2	8	2699	2706	25 %	25 %	25 %	25 %	151220214
68	NC_009641	AGA	2	6	2738	2743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220214
69	NC_009641	TCA	2	6	2764	2769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220214
70	NC_009641	TAAA	2	8	2794	2801	75 %	25 %	0 %	0 %	151220214
71	NC_009641	GAA	2	6	2817	2822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220214
72	NC_009641	TCT	2	6	2833	2838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151220214
73	NC_009641	TTTA	2	8	2855	2862	25 %	75 %	0 %	0 %	151220214
74	NC_009641	ATT	2	6	2891	2896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220214
75	NC_009641	ACA	2	6	2916	2921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220214
76	NC_009641	AAATT	2	10	2944	2953	60 %	40 %	0 %	0 %	151220214
77	NC_009641	TTA	2	6	3000	3005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220214
78	NC_009641	GGT	2	6	3015	3020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220214
79	NC_009641	TTA	2	6	3028	3033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220214
80	NC_009641	TGA	2	6	3047	3052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220214
81	NC_009641	GTT	2	6	3054	3059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220214
82	NC_009641	TCT	2	6	3066	3071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151220214
83	NC_009641	AGA	2	6	3098	3103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220214
84	NC_009641	GGT	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220214
85	NC_009641	TTCA	2	8	3143	3150	25 %	50 %	0 %	25 %	151220214
86	NC_009641	AT	3	6	3158	3163	50 %	50 %	0 %	0 %	151220214
87	NC_009641	GATG	2	8	3164	3171	25 %	25 %	50 %	0 %	151220214
88	NC_009641	ATG	2	6	3190	3195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220214
89	NC_009641	GTTGAA	2	12	3198	3209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220214
90	NC_009641	TTC	2	6	3210	3215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151220214
91	NC_009641	GAC	2	6	3252	3257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220214
92	NC_009641	AATT	2	8	3268	3275	50 %	50 %	0 %	0 %	151220214
93	NC_009641	ATAAAT	2	12	3299	3310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009641	ATTA	2	8	3324	3331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009641	T	6	6	3347	3352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009641	AAT	2	6	3359	3364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009641	GCA	2	6	3392	3397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009641	TAA	2	6	3454	3459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009641	TTTAAA	2	12	3476	3487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009641	A	6	6	3544	3549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009641	A	6	6	3570	3575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009641	AATT	2	8	3580	3587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009641	A	7	7	3636	3642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009641	AT	3	6	3649	3654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009641	ATT	2	6	3680	3685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009641	AAG	2	6	3693	3698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009641	GTA	2	6	3701	3706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009641	ATT	2	6	3749	3754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009641	TGG	2	6	3760	3765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009641	ATTA	2	8	3799	3806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009641	TTCT	2	8	3889	3896	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009641	TCAT	2	8	3900	3907	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009641	ATG	2	6	3959	3964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220215
114	NC_009641	A	6	6	4183	4188	100 %	0 %	0 %	0 %	151220215
115	NC_009641	GTC	2	6	4223	4228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220215
116	NC_009641	AT	3	6	4236	4241	50 %	50 %	0 %	0 %	151220215
117	NC_009641	AGA	2	6	4272	4277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220215
118	NC_009641	CTC	2	6	4298	4303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	151220215
119	NC_009641	GAC	2	6	4310	4315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220215
120	NC_009641	CTG	2	6	4346	4351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220215
121	NC_009641	AAT	2	6	4399	4404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220215
122	NC_009641	A	7	7	4430	4436	100 %	0 %	0 %	0 %	151220215
123	NC_009641	CAG	2	6	4465	4470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220215
124	NC_009641	AAG	2	6	4571	4576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220215
125	NC_009641	ATT	2	6	4589	4594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220215
126	NC_009641	GAA	2	6	4642	4647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220215
127	NC_009641	ATA	2	6	4667	4672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220215
128	NC_009641	GAT	2	6	4720	4725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220215
129	NC_009641	TTA	3	9	4855	4863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220215
130	NC_009641	GAT	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220215
131	NC_009641	TTA	2	6	4906	4911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220215
132	NC_009641	ACA	2	6	5066	5071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220216
133	NC_009641	GTAT	2	8	5138	5145	25 %	50 %	25 %	0 %	151220216
134	NC_009641	AG	4	8	5160	5167	50 %	0 %	50 %	0 %	151220216
135	NC_009641	ATA	2	6	5198	5203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220216
136	NC_009641	CAAAT	2	10	5231	5240	60 %	20 %	0 %	20 %	151220216
137	NC_009641	GTT	2	6	5245	5250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220216
138	NC_009641	A	6	6	5315	5320	100 %	0 %	0 %	0 %	151220216
139	NC_009641	TGG	2	6	5364	5369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220216
140	NC_009641	TGGCGG	2	12	5376	5387	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	151220216
141	NC_009641	TGG	2	6	5400	5405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220216
142	NC_009641	TCA	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220216
143	NC_009641	TA	3	6	5481	5486	50 %	50 %	0 %	0 %	151220216
144	NC_009641	TCA	2	6	5487	5492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220216
145	NC_009641	A	6	6	5500	5505	100 %	0 %	0 %	0 %	151220216
146	NC_009641	AAG	2	6	5528	5533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220216
147	NC_009641	CAG	2	6	5626	5631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220216
148	NC_009641	AG	3	6	5638	5643	50 %	0 %	50 %	0 %	151220216
149	NC_009641	TGA	2	6	5691	5696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220216
150	NC_009641	AGA	2	6	5709	5714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220216
151	NC_009641	ATG	2	6	5783	5788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220216
152	NC_009641	TCA	2	6	5802	5807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220216
153	NC_009641	GAT	2	6	5815	5820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220216
154	NC_009641	GGT	2	6	5905	5910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220216
155	NC_009641	AGA	2	6	5985	5990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220216
156	NC_009641	TATC	2	8	6041	6048	25 %	50 %	0 %	25 %	151220216
157	NC_009641	ATT	2	6	6126	6131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220216
158	NC_009641	TAT	2	6	6198	6203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220216
159	NC_009641	GGC	2	6	6204	6209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	151220216
160	NC_009641	TGC	2	6	6222	6227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220216
161	NC_009641	A	6	6	6229	6234	100 %	0 %	0 %	0 %	151220216
162	NC_009641	CGT	2	6	6250	6255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220216
163	NC_009641	GAA	2	6	6319	6324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220216
164	NC_009641	G	6	6	6358	6363	0 %	0 %	100 %	0 %	151220216
165	NC_009641	TAGA	2	8	6446	6453	50 %	25 %	25 %	0 %	151220216
166	NC_009641	TGGA	2	8	6572	6579	25 %	25 %	50 %	0 %	151220216
167	NC_009641	TTA	2	6	6598	6603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220216
168	NC_009641	TTC	2	6	6607	6612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151220216
169	NC_009641	TAT	2	6	6700	6705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220216
170	NC_009641	TGAAT	2	10	6741	6750	40 %	40 %	20 %	0 %	151220216
171	NC_009641	AATG	2	8	6795	6802	50 %	25 %	25 %	0 %	151220216
172	NC_009641	ACA	2	6	6820	6825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220216
173	NC_009641	AGA	2	6	6939	6944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220216
174	NC_009641	TGAAC	2	10	6982	6991	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
175	NC_009641	AGG	2	6	6998	7003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	151220217
176	NC_009641	TCAA	2	8	7026	7033	50 %	25 %	0 %	25 %	151220217
177	NC_009641	TCG	2	6	7149	7154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220217
178	NC_009641	A	6	6	7204	7209	100 %	0 %	0 %	0 %	151220217
179	NC_009641	GTTATC	2	12	7304	7315	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	151220217
180	NC_009641	TTG	2	6	7319	7324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220217
181	NC_009641	ATGG	2	8	7348	7355	25 %	25 %	50 %	0 %	151220217
182	NC_009641	GCA	3	9	7363	7371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220217
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186	NC_009641	TTA	2	6	7510	7515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220217
187	NC_009641	GGTA	2	8	7539	7546	25 %	25 %	50 %	0 %	151220217
188	NC_009641	CCA	2	6	7561	7566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151220217
189	NC_009641	TAAG	2	8	7604	7611	50 %	25 %	25 %	0 %	151220217
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194	NC_009641	TTG	2	6	7787	7792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220217
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251	NC_009641	A	6	6	9677	9682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_009641	TGG	2	6	9813	9818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220218
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268	NC_009641	AT	3	6	10628	10633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_009641	TAT	2	6	10653	10658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_009641	ATT	2	6	10739	10744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_009641	A	6	6	16413	16418	100 %	0 %	0 %	0 %	151220223
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