MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 68839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_009641	ACC	2	6	1709249	1709254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151221752
41002	NC_009641	TTA	2	6	1709286	1709291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151221752
41003	NC_009641	TGT	2	6	1709322	1709327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151221752
41004	NC_009641	ATC	2	6	1709334	1709339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221752
41005	NC_009641	TA	4	8	1709369	1709376	50 %	50 %	0 %	0 %	151221752
41006	NC_009641	CTC	2	6	1709404	1709409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41007	NC_009641	T	6	6	1709421	1709426	0 %	100 %	0 %	0 %	151221753
41008	NC_009641	GAA	2	6	1709456	1709461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151221753
41009	NC_009641	TTC	2	6	1709462	1709467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151221753
41010	NC_009641	TCT	2	6	1709487	1709492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151221753
41011	NC_009641	TAG	2	6	1709548	1709553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151221753
41012	NC_009641	TA	3	6	1709597	1709602	50 %	50 %	0 %	0 %	151221753
41013	NC_009641	ATC	2	6	1709660	1709665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221753
41014	NC_009641	TAA	2	6	1709683	1709688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151221753
41015	NC_009641	TAC	2	6	1709773	1709778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221753
41016	NC_009641	CCG	2	6	1709901	1709906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	151221753
41017	NC_009641	CTA	2	6	1709932	1709937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221753
41018	NC_009641	T	7	7	1710068	1710074	0 %	100 %	0 %	0 %	151221753
41019	NC_009641	CAG	2	6	1710088	1710093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151221753
41020	NC_009641	TCA	2	6	1710108	1710113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221753
41021	NC_009641	CAT	2	6	1710119	1710124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221753
41022	NC_009641	AAT	2	6	1710177	1710182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151221753
41023	NC_009641	ATG	2	6	1710197	1710202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151221753
41024	NC_009641	CTT	2	6	1710217	1710222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151221753
41025	NC_009641	TAAAC	2	10	1710245	1710254	60 %	20 %	0 %	20 %	151221753
41026	NC_009641	ATA	2	6	1710330	1710335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151221753
41027	NC_009641	GTGTG	2	10	1710476	1710485	0 %	40 %	60 %	0 %	151221753
41028	NC_009641	TA	3	6	1710577	1710582	50 %	50 %	0 %	0 %	151221754
41029	NC_009641	ACT	2	6	1710663	1710668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221754
41030	NC_009641	ATAA	2	8	1710756	1710763	75 %	25 %	0 %	0 %	151221754
41031	NC_009641	AT	3	6	1710764	1710769	50 %	50 %	0 %	0 %	151221754
41032	NC_009641	CAA	2	6	1710788	1710793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151221754
41033	NC_009641	TAA	2	6	1710885	1710890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151221754
41034	NC_009641	ATA	2	6	1710915	1710920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151221754
41035	NC_009641	ATGTA	2	10	1710987	1710996	40 %	40 %	20 %	0 %	151221754
41036	NC_009641	TAA	2	6	1711035	1711040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151221754
41037	NC_009641	TCA	2	6	1711042	1711047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221754
41038	NC_009641	CTG	2	6	1711061	1711066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151221754
41039	NC_009641	TGC	2	6	1711071	1711076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151221754
41040	NC_009641	CTTT	2	8	1711087	1711094	0 %	75 %	0 %	25 %	151221754
41041	NC_009641	ATC	2	6	1711122	1711127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221754
41042	NC_009641	TGG	2	6	1711146	1711151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151221754
41043	NC_009641	TCTT	2	8	1711179	1711186	0 %	75 %	0 %	25 %	151221754
41044	NC_009641	ATG	2	6	1711213	1711218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151221754
41045	NC_009641	TTA	2	6	1711282	1711287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151221754
41046	NC_009641	TTAACA	2	12	1711349	1711360	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	151221754
41047	NC_009641	TCT	2	6	1711381	1711386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151221754
41048	NC_009641	AAATGT	2	12	1711474	1711485	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	151221754
41049	NC_009641	TAA	2	6	1711515	1711520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151221754
41050	NC_009641	TTC	2	6	1711587	1711592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151221754
41051	NC_009641	TC	4	8	1711607	1711614	0 %	50 %	0 %	50 %	151221755
41052	NC_009641	TTC	2	6	1711735	1711740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151221755
41053	NC_009641	TAA	2	6	1711794	1711799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151221755
41054	NC_009641	TCA	2	6	1711806	1711811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221755
41055	NC_009641	GTT	2	6	1711874	1711879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151221755
41056	NC_009641	TTCA	2	8	1711900	1711907	25 %	50 %	0 %	25 %	151221755
41057	NC_009641	TCA	2	6	1711997	1712002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221755
41058	NC_009641	TAA	2	6	1712031	1712036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151221755
41059	NC_009641	GTT	2	6	1712129	1712134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151221755
41060	NC_009641	ATA	2	6	1712201	1712206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151221755
41061	NC_009641	CTT	2	6	1712241	1712246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151221755
41062	NC_009641	CAA	2	6	1712247	1712252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151221755
41063	NC_009641	ACT	2	6	1712254	1712259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221755
41064	NC_009641	TCA	2	6	1712273	1712278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221755
41065	NC_009641	AAACA	2	10	1712281	1712290	80 %	0 %	0 %	20 %	151221755
41066	NC_009641	TGT	2	6	1712404	1712409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151221755
41067	NC_009641	G	6	6	1712423	1712428	0 %	0 %	100 %	0 %	151221755
41068	NC_009641	TAA	2	6	1712478	1712483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151221755
41069	NC_009641	AT	3	6	1712519	1712524	50 %	50 %	0 %	0 %	151221755
41070	NC_009641	TTC	2	6	1712566	1712571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151221755
41071	NC_009641	ATTG	2	8	1712579	1712586	25 %	50 %	25 %	0 %	151221755
41072	NC_009641	TCAT	2	8	1712600	1712607	25 %	50 %	0 %	25 %	151221755
41073	NC_009641	ACA	2	6	1712609	1712614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41074	NC_009641	TCA	2	6	1712676	1712681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221756
41075	NC_009641	ATTT	2	8	1712692	1712699	25 %	75 %	0 %	0 %	151221756
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41077	NC_009641	TAA	2	6	1712816	1712821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151221756
41078	NC_009641	TCT	2	6	1712832	1712837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151221756
41079	NC_009641	TCATTT	2	12	1712925	1712936	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	151221756
41080	NC_009641	TTAA	2	8	1713015	1713022	50 %	50 %	0 %	0 %	151221756
41081	NC_009641	TCT	2	6	1713042	1713047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151221756
41082	NC_009641	ACT	2	6	1713050	1713055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221756
41083	NC_009641	AAT	2	6	1713066	1713071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151221756
41084	NC_009641	CAG	2	6	1713175	1713180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151221756
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41086	NC_009641	GT	3	6	1713194	1713199	0 %	50 %	50 %	0 %	151221756
41087	NC_009641	CATACT	2	12	1713258	1713269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221757
41088	NC_009641	AATT	2	8	1713270	1713277	50 %	50 %	0 %	0 %	151221757
41089	NC_009641	TCT	2	6	1713322	1713327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151221757
41090	NC_009641	TTG	2	6	1713368	1713373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151221757
41091	NC_009641	TTC	2	6	1713378	1713383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151221757
41092	NC_009641	TGA	2	6	1713397	1713402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151221757
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41094	NC_009641	TAGA	2	8	1713563	1713570	50 %	25 %	25 %	0 %	151221757
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41097	NC_009641	TAAA	2	8	1713678	1713685	75 %	25 %	0 %	0 %	151221757
41098	NC_009641	CAT	2	6	1713708	1713713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221757
41099	NC_009641	CAT	2	6	1713797	1713802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221758
41100	NC_009641	CTG	2	6	1713842	1713847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151221758
41101	NC_009641	AGTC	2	8	1713860	1713867	25 %	25 %	25 %	25 %	151221758
41102	NC_009641	CAT	3	9	1713914	1713922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221758
41103	NC_009641	TA	3	6	1713962	1713967	50 %	50 %	0 %	0 %	151221758
41104	NC_009641	CTC	2	6	1713990	1713995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	151221758
41105	NC_009641	TTC	2	6	1713996	1714001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151221758
41106	NC_009641	TTC	2	6	1714026	1714031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151221758
41107	NC_009641	ATA	2	6	1714052	1714057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151221758
41108	NC_009641	TTG	2	6	1714082	1714087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151221758
41109	NC_009641	TCT	2	6	1714120	1714125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151221758
41110	NC_009641	CTA	2	6	1714175	1714180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221758
41111	NC_009641	TCT	2	6	1714195	1714200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151221758
41112	NC_009641	ATCA	2	8	1714281	1714288	50 %	25 %	0 %	25 %	151221758
41113	NC_009641	TC	3	6	1714308	1714313	0 %	50 %	0 %	50 %	151221758
41114	NC_009641	ACA	2	6	1714417	1714422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151221758
41115	NC_009641	GATA	2	8	1714485	1714492	50 %	25 %	25 %	0 %	151221758
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41117	NC_009641	TAA	2	6	1714542	1714547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151221758
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41358	NC_009641	CGTAT	2	10	1724881	1724890	20 %	40 %	20 %	20 %	151221770
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41374	NC_009641	AAT	2	6	1725413	1725418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41478	NC_009641	T	6	6	1730215	1730220	0 %	100 %	0 %	0 %	151221775
41479	NC_009641	CTT	2	6	1730251	1730256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151221775
41480	NC_009641	A	6	6	1730398	1730403	100 %	0 %	0 %	0 %	151221775
41481	NC_009641	AAT	2	6	1730477	1730482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151221775
41482	NC_009641	TTTG	2	8	1730508	1730515	0 %	75 %	25 %	0 %	151221775
41483	NC_009641	ATT	2	6	1730556	1730561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151221776
41484	NC_009641	TGT	2	6	1730565	1730570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151221776
41485	NC_009641	CCAT	2	8	1730772	1730779	25 %	25 %	0 %	50 %	151221776
41486	NC_009641	CGTT	2	8	1730792	1730799	0 %	50 %	25 %	25 %	151221776
41487	NC_009641	CAG	2	6	1730800	1730805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151221776
41488	NC_009641	CA	3	6	1730807	1730812	50 %	0 %	0 %	50 %	151221776
41489	NC_009641	TCA	2	6	1730823	1730828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221776
41490	NC_009641	TAA	2	6	1730843	1730848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151221776
41491	NC_009641	TTC	2	6	1730858	1730863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151221776
41492	NC_009641	AAGAT	2	10	1730930	1730939	60 %	20 %	20 %	0 %	151221776
41493	NC_009641	ATC	2	6	1730948	1730953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221776
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41497	NC_009641	CAC	2	6	1731094	1731099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151221776
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41499	NC_009641	GTG	2	6	1731148	1731153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151221776
41500	NC_009641	T	7	7	1731273	1731279	0 %	100 %	0 %	0 %	151221776

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