MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 68839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_009641	AT	3	6	1210714	1210719	50 %	50 %	0 %	0 %	151221317
29003	NC_009641	GAT	2	6	1210721	1210726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151221317
29004	NC_009641	TAT	2	6	1210754	1210759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151221317
29005	NC_009641	ATGA	2	8	1210772	1210779	50 %	25 %	25 %	0 %	151221317
29006	NC_009641	TTG	2	6	1210833	1210838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151221317
29007	NC_009641	ACA	2	6	1210856	1210861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151221317
29008	NC_009641	TAT	2	6	1210892	1210897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151221317
29009	NC_009641	TA	3	6	1210928	1210933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29010	NC_009641	AGG	2	6	1210994	1210999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	151221318
29011	NC_009641	ATTA	2	8	1211042	1211049	50 %	50 %	0 %	0 %	151221318
29012	NC_009641	T	6	6	1211066	1211071	0 %	100 %	0 %	0 %	151221318
29013	NC_009641	GCT	2	6	1211103	1211108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151221318
29014	NC_009641	TTTA	2	8	1211159	1211166	25 %	75 %	0 %	0 %	151221318
29015	NC_009641	T	7	7	1211275	1211281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29016	NC_009641	GTA	2	6	1211315	1211320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29017	NC_009641	CAT	2	6	1211393	1211398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29018	NC_009641	CAG	2	6	1211486	1211491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29019	NC_009641	TAC	2	6	1211520	1211525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29020	NC_009641	AAT	2	6	1211595	1211600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29021	NC_009641	TAG	2	6	1211626	1211631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29022	NC_009641	T	7	7	1211681	1211687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29023	NC_009641	TATAA	2	10	1211704	1211713	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29024	NC_009641	GATT	2	8	1211731	1211738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29025	NC_009641	GGA	2	6	1211739	1211744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29026	NC_009641	A	6	6	1211757	1211762	100 %	0 %	0 %	0 %	151221319
29027	NC_009641	AT	3	6	1211825	1211830	50 %	50 %	0 %	0 %	151221319
29028	NC_009641	CTA	2	6	1211836	1211841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221319
29029	NC_009641	ACATC	2	10	1211892	1211901	40 %	20 %	0 %	40 %	151221319
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29039	NC_009641	TGC	2	6	1212303	1212308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151221320
29040	NC_009641	AAT	2	6	1212317	1212322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151221320
29041	NC_009641	GTT	2	6	1212386	1212391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151221320
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29052	NC_009641	AT	3	6	1212967	1212972	50 %	50 %	0 %	0 %	151221320
29053	NC_009641	TGG	2	6	1213027	1213032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151221320
29054	NC_009641	AT	3	6	1213084	1213089	50 %	50 %	0 %	0 %	151221320
29055	NC_009641	TTA	2	6	1213127	1213132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151221320
29056	NC_009641	ATT	2	6	1213186	1213191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29057	NC_009641	TCGTTT	2	12	1213212	1213223	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29058	NC_009641	T	8	8	1213221	1213228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29059	NC_009641	TAT	2	6	1213320	1213325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29061	NC_009641	AG	3	6	1213374	1213379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29062	NC_009641	AT	3	6	1213403	1213408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29063	NC_009641	AGT	2	6	1213447	1213452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29064	NC_009641	TAC	2	6	1213455	1213460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29065	NC_009641	TTC	2	6	1213463	1213468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29066	NC_009641	TA	3	6	1213488	1213493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29067	NC_009641	T	6	6	1213526	1213531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29083	NC_009641	T	7	7	1214275	1214281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29103	NC_009641	CTT	2	6	1215122	1215127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151221322
29104	NC_009641	ATCA	2	8	1215149	1215156	50 %	25 %	0 %	25 %	151221322
29105	NC_009641	TAT	2	6	1215188	1215193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151221322
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29117	NC_009641	A	6	6	1215594	1215599	100 %	0 %	0 %	0 %	151221322
29118	NC_009641	AGG	2	6	1215625	1215630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29119	NC_009641	TAT	2	6	1215649	1215654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151221323
29120	NC_009641	ACATCA	2	12	1215849	1215860	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	151221323
29121	NC_009641	TTA	2	6	1215924	1215929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151221323
29122	NC_009641	TAA	2	6	1215947	1215952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151221323
29123	NC_009641	CTA	2	6	1215953	1215958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221323
29124	NC_009641	ACA	2	6	1216013	1216018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151221323
29125	NC_009641	AT	3	6	1216050	1216055	50 %	50 %	0 %	0 %	151221323
29126	NC_009641	GAA	2	6	1216056	1216061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151221323
29127	NC_009641	GTA	2	6	1216126	1216131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151221323
29128	NC_009641	TGA	2	6	1216193	1216198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151221323
29129	NC_009641	GAT	2	6	1216227	1216232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151221323
29130	NC_009641	GTTAT	2	10	1216254	1216263	20 %	60 %	20 %	0 %	151221323
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29132	NC_009641	GCA	2	6	1216311	1216316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151221323
29133	NC_009641	GAT	2	6	1216317	1216322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151221323
29134	NC_009641	ATC	2	6	1216324	1216329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221323
29135	NC_009641	TAG	2	6	1216432	1216437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151221323
29136	NC_009641	TGA	2	6	1216502	1216507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151221323
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29139	NC_009641	ATTA	2	8	1216543	1216550	50 %	50 %	0 %	0 %	151221324
29140	NC_009641	ACA	2	6	1216582	1216587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151221324
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29142	NC_009641	CAT	2	6	1216660	1216665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221324
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29144	NC_009641	TGG	2	6	1216729	1216734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151221324
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29149	NC_009641	TGG	2	6	1217092	1217097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151221324
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29152	NC_009641	CTA	2	6	1217232	1217237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221324
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29154	NC_009641	AGA	2	6	1217323	1217328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151221324
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29217	NC_009641	ATT	2	6	1220299	1220304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151221326
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29220	NC_009641	A	6	6	1220561	1220566	100 %	0 %	0 %	0 %	151221326
29221	NC_009641	GAA	2	6	1220749	1220754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151221326
29222	NC_009641	TGA	2	6	1220759	1220764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151221326
29223	NC_009641	GGA	2	6	1220809	1220814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	151221326
29224	NC_009641	GCCACA	2	12	1220943	1220954	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	151221326
29225	NC_009641	TGC	2	6	1220994	1220999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151221326
29226	NC_009641	GTA	2	6	1221019	1221024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151221326
29227	NC_009641	CTT	2	6	1221029	1221034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151221326
29228	NC_009641	GGT	2	6	1221043	1221048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151221326
29229	NC_009641	GATA	2	8	1221139	1221146	50 %	25 %	25 %	0 %	151221326
29230	NC_009641	ATT	2	6	1221199	1221204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151221326
29231	NC_009641	GTG	2	6	1221245	1221250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151221326
29232	NC_009641	CCA	2	6	1221268	1221273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151221326
29233	NC_009641	AGA	2	6	1221285	1221290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151221326
29234	NC_009641	ACTAT	2	10	1221311	1221320	40 %	40 %	0 %	20 %	151221326
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29475	NC_009641	TCA	2	6	1231057	1231062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151221334
29476	NC_009641	ATT	2	6	1231084	1231089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151221334
29477	NC_009641	A	7	7	1231105	1231111	100 %	0 %	0 %	0 %	151221334
29478	NC_009641	ATT	2	6	1231114	1231119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151221334
29479	NC_009641	TAT	3	9	1231173	1231181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151221334
29480	NC_009641	GAA	2	6	1231214	1231219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151221334
29481	NC_009641	GCA	2	6	1231235	1231240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151221334
29482	NC_009641	TTA	2	6	1231254	1231259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151221334
29483	NC_009641	GCA	2	6	1231302	1231307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151221334
29484	NC_009641	CAA	2	6	1231319	1231324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151221334
29485	NC_009641	ATT	2	6	1231370	1231375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151221334
29486	NC_009641	ATTGAT	2	12	1231443	1231454	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	151221334
29487	NC_009641	GAT	3	9	1231460	1231468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151221334
29488	NC_009641	ATT	2	6	1231481	1231486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29489	NC_009641	TTA	2	6	1231652	1231657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29490	NC_009641	TACT	2	8	1231698	1231705	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29491	NC_009641	AAAC	2	8	1231729	1231736	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29492	NC_009641	TATC	2	8	1231806	1231813	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29493	NC_009641	ACT	2	6	1231823	1231828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29494	NC_009641	ATT	2	6	1231832	1231837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29495	NC_009641	ATAA	2	8	1231909	1231916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29496	NC_009641	T	6	6	1231918	1231923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29497	NC_009641	TATG	2	8	1231929	1231936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29498	NC_009641	CAAA	2	8	1231948	1231955	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29499	NC_009641	GTT	2	6	1232030	1232035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151221335
29500	NC_009641	TGG	2	6	1232040	1232045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151221335

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