MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 68839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_009641	ATAG	2	8	630335	630342	50 %	25 %	25 %	0 %	151220759
15002	NC_009641	AAAAC	2	10	630352	630361	80 %	0 %	0 %	20 %	151220759
15003	NC_009641	GCA	2	6	630461	630466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220759
15004	NC_009641	ATT	2	6	630490	630495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220759
15005	NC_009641	GTTA	2	8	630512	630519	25 %	50 %	25 %	0 %	151220759
15006	NC_009641	TAG	2	6	630528	630533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220759
15007	NC_009641	AG	3	6	630532	630537	50 %	0 %	50 %	0 %	151220759
15008	NC_009641	TCT	2	6	630600	630605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151220759
15009	NC_009641	CAT	2	6	630606	630611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220759
15010	NC_009641	AAT	2	6	630701	630706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220759
15011	NC_009641	ATT	2	6	630755	630760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220759
15012	NC_009641	TAC	2	6	630771	630776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220759
15013	NC_009641	ATT	2	6	630831	630836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220759
15014	NC_009641	TG	3	6	630839	630844	0 %	50 %	50 %	0 %	151220759
15015	NC_009641	TCG	2	6	630855	630860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220759
15016	NC_009641	TAT	2	6	630861	630866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220759
15017	NC_009641	TAA	2	6	630892	630897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220759
15018	NC_009641	ATA	2	6	631002	631007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220759
15019	NC_009641	CAG	2	6	631017	631022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220759
15020	NC_009641	AGC	2	6	631078	631083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220759
15021	NC_009641	TGT	2	6	631096	631101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220759
15022	NC_009641	TGGT	2	8	631117	631124	0 %	50 %	50 %	0 %	151220759
15023	NC_009641	CAA	2	6	631128	631133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220759
15024	NC_009641	TCA	2	6	631135	631140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220759
15025	NC_009641	GCAATT	2	12	631217	631228	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	151220759
15026	NC_009641	ATG	2	6	631229	631234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220759
15027	NC_009641	TGA	2	6	631263	631268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220759
15028	NC_009641	TAT	2	6	631306	631311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220759
15029	NC_009641	CAA	2	6	631314	631319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220759
15030	NC_009641	TAG	2	6	631374	631379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220759
15031	NC_009641	GAA	2	6	631407	631412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220759
15032	NC_009641	TTA	2	6	631467	631472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220759
15033	NC_009641	ATT	2	6	631492	631497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220759
15034	NC_009641	AACA	2	8	631505	631512	75 %	0 %	0 %	25 %	151220759
15035	NC_009641	TAT	2	6	631549	631554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220759
15036	NC_009641	TCAT	2	8	631568	631575	25 %	50 %	0 %	25 %	151220759
15037	NC_009641	GTT	2	6	631585	631590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220759
15038	NC_009641	GCA	2	6	631610	631615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220759
15039	NC_009641	ATC	2	6	631655	631660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220759
15040	NC_009641	ATG	2	6	631710	631715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220759
15041	NC_009641	TGA	2	6	631756	631761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220759
15042	NC_009641	GAA	2	6	631769	631774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220759
15043	NC_009641	GAAAAA	2	12	631778	631789	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	151220759
15044	NC_009641	ATA	2	6	631795	631800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220759
15045	NC_009641	CTT	2	6	631820	631825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15046	NC_009641	T	6	6	631848	631853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_009641	TAT	2	6	631855	631860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_009641	TA	4	8	631893	631900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_009641	AATT	2	8	631976	631983	50 %	50 %	0 %	0 %	151220760
15050	NC_009641	AAT	2	6	632001	632006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220760
15051	NC_009641	ATTG	2	8	632054	632061	25 %	50 %	25 %	0 %	151220760
15052	NC_009641	TAA	2	6	632075	632080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220760
15053	NC_009641	T	6	6	632088	632093	0 %	100 %	0 %	0 %	151220760
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15056	NC_009641	TA	3	6	632229	632234	50 %	50 %	0 %	0 %	151220760
15057	NC_009641	GAA	2	6	632255	632260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220760
15058	NC_009641	CCAT	2	8	632272	632279	25 %	25 %	0 %	50 %	151220760
15059	NC_009641	GATA	2	8	632304	632311	50 %	25 %	25 %	0 %	151220760
15060	NC_009641	AGA	2	6	632341	632346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220760
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15065	NC_009641	ACC	2	6	632747	632752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151220761
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15069	NC_009641	T	6	6	632836	632841	0 %	100 %	0 %	0 %	151220761
15070	NC_009641	TTGT	2	8	632877	632884	0 %	75 %	25 %	0 %	151220761
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15074	NC_009641	TCT	2	6	633060	633065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151220761
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15079	NC_009641	GTT	2	6	633249	633254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_009641	A	6	6	633264	633269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_009641	TAA	3	9	633289	633297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_009641	TAG	2	6	633311	633316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_009641	ATT	2	6	633348	633353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_009641	A	7	7	633355	633361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15085	NC_009641	ATA	2	6	633402	633407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15086	NC_009641	TAG	2	6	633484	633489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15087	NC_009641	ACT	2	6	633510	633515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15088	NC_009641	ATA	2	6	633556	633561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_009641	AT	4	8	633571	633578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_009641	T	7	7	633686	633692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15092	NC_009641	TGT	2	6	633802	633807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220762
15093	NC_009641	TCA	2	6	633809	633814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220762
15094	NC_009641	T	7	7	633834	633840	0 %	100 %	0 %	0 %	151220762
15095	NC_009641	ATC	2	6	633886	633891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220762
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15101	NC_009641	TCAAT	2	10	634140	634149	40 %	40 %	0 %	20 %	151220762
15102	NC_009641	ATA	2	6	634254	634259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220762
15103	NC_009641	TTATA	2	10	634281	634290	40 %	60 %	0 %	0 %	151220762
15104	NC_009641	TGA	2	6	634312	634317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220762
15105	NC_009641	ATG	2	6	634398	634403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220762
15106	NC_009641	ATAAA	2	10	634417	634426	80 %	20 %	0 %	0 %	151220762
15107	NC_009641	ACCA	2	8	634437	634444	50 %	0 %	0 %	50 %	151220762
15108	NC_009641	GCT	2	6	634457	634462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220762
15109	NC_009641	ATC	2	6	634492	634497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15110	NC_009641	TAA	2	6	634609	634614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_009641	AGG	2	6	634627	634632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_009641	TTA	2	6	634647	634652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220763
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15114	NC_009641	CTTGAT	2	12	634815	634826	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	151220763
15115	NC_009641	AATT	2	8	634840	634847	50 %	50 %	0 %	0 %	151220763
15116	NC_009641	ACG	2	6	634898	634903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220763
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15120	NC_009641	TAGT	2	8	634999	635006	25 %	50 %	25 %	0 %	151220763
15121	NC_009641	GCA	2	6	635010	635015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220763
15122	NC_009641	ATC	2	6	635052	635057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220763
15123	NC_009641	TCT	2	6	635092	635097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151220763
15124	NC_009641	TGA	2	6	635111	635116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220763
15125	NC_009641	CAAT	2	8	635140	635147	50 %	25 %	0 %	25 %	151220763
15126	NC_009641	CAA	2	6	635248	635253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220763
15127	NC_009641	GAC	2	6	635271	635276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220763
15128	NC_009641	AAG	2	6	635290	635295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220763
15129	NC_009641	CAA	2	6	635310	635315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220763
15130	NC_009641	GAA	3	9	635322	635330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220763
15131	NC_009641	TGC	2	6	635369	635374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220763
15132	NC_009641	A	6	6	635397	635402	100 %	0 %	0 %	0 %	151220763
15133	NC_009641	ATG	2	6	635503	635508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220763
15134	NC_009641	GCT	2	6	635563	635568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220763
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15136	NC_009641	CAG	2	6	635602	635607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220763
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15138	NC_009641	TTC	2	6	635680	635685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151220764
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15141	NC_009641	TGT	2	6	635761	635766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220764
15142	NC_009641	TCA	2	6	635779	635784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220764
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15145	NC_009641	AT	3	6	635928	635933	50 %	50 %	0 %	0 %	151220764
15146	NC_009641	AAC	2	6	635959	635964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220764
15147	NC_009641	TGA	2	6	635968	635973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220764
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15151	NC_009641	AAG	2	6	636384	636389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220764
15152	NC_009641	GATAC	2	10	636399	636408	40 %	20 %	20 %	20 %	151220764
15153	NC_009641	GAAA	2	8	636428	636435	75 %	0 %	25 %	0 %	151220764
15154	NC_009641	CAT	2	6	636567	636572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15155	NC_009641	ATGAT	2	10	636586	636595	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15156	NC_009641	ATA	2	6	636600	636605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15157	NC_009641	TAA	2	6	636610	636615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15158	NC_009641	TA	4	8	636658	636665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15159	NC_009641	GAAA	2	8	636680	636687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15160	NC_009641	TAG	2	6	636717	636722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15161	NC_009641	TA	3	6	636729	636734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15162	NC_009641	ATT	3	9	636740	636748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15163	NC_009641	GTA	2	6	636750	636755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15164	NC_009641	AGTT	2	8	636857	636864	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15165	NC_009641	ATA	2	6	636914	636919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15166	NC_009641	AAT	2	6	636922	636927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15167	NC_009641	ATG	2	6	636981	636986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15168	NC_009641	TAA	2	6	636995	637000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15169	NC_009641	AAT	2	6	637006	637011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15170	NC_009641	TGACA	2	10	637046	637055	40 %	20 %	20 %	20 %	151220765
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15182	NC_009641	GTGAT	2	10	637696	637705	20 %	40 %	40 %	0 %	151220765
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15222	NC_009641	TAC	2	6	639546	639551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220767
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15229	NC_009641	TG	3	6	639878	639883	0 %	50 %	50 %	0 %	151220767
15230	NC_009641	TGG	3	9	639927	639935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220767
15231	NC_009641	A	6	6	639977	639982	100 %	0 %	0 %	0 %	151220767
15232	NC_009641	ATG	2	6	639986	639991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220767
15233	NC_009641	ATC	2	6	640067	640072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15234	NC_009641	TAATT	2	10	640073	640082	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15235	NC_009641	AGA	2	6	640083	640088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15236	NC_009641	T	6	6	640100	640105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15237	NC_009641	A	7	7	640131	640137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15238	NC_009641	ATAG	2	8	640154	640161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15239	NC_009641	A	6	6	640170	640175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15240	NC_009641	CGA	2	6	640186	640191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15241	NC_009641	AAAG	2	8	640204	640211	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15242	NC_009641	TGA	2	6	640247	640252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220768
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