MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 68839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_009641	ATT	2	6	481009	481014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_009641	TAA	2	6	481067	481072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_009641	TAA	2	6	481091	481096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_009641	TAA	2	6	481101	481106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_009641	TGA	2	6	481130	481135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_009641	T	7	7	481148	481154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_009641	TCA	2	6	481167	481172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11508	NC_009641	TAT	2	6	481183	481188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_009641	ATA	2	6	481191	481196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_009641	ATG	2	6	481207	481212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_009641	AGG	2	6	481260	481265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_009641	A	8	8	481278	481285	100 %	0 %	0 %	0 %	151220641
11513	NC_009641	TAT	2	6	481297	481302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220641
11514	NC_009641	CA	3	6	481358	481363	50 %	0 %	0 %	50 %	151220641
11515	NC_009641	ATCTA	2	10	481447	481456	40 %	40 %	0 %	20 %	151220641
11516	NC_009641	TAG	2	6	481510	481515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220641
11517	NC_009641	TAC	2	6	481547	481552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220641
11518	NC_009641	TCATTA	2	12	481571	481582	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	151220641
11519	NC_009641	AAT	2	6	481637	481642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220641
11520	NC_009641	TTTA	2	8	481646	481653	25 %	75 %	0 %	0 %	151220641
11521	NC_009641	TAG	2	6	481711	481716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220641
11522	NC_009641	A	6	6	481812	481817	100 %	0 %	0 %	0 %	151220641
11523	NC_009641	AAT	2	6	481838	481843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220641
11524	NC_009641	TA	3	6	481849	481854	50 %	50 %	0 %	0 %	151220641
11525	NC_009641	CAA	2	6	481908	481913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220641
11526	NC_009641	TA	3	6	481959	481964	50 %	50 %	0 %	0 %	151220641
11527	NC_009641	TCG	2	6	481996	482001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220641
11528	NC_009641	TGG	2	6	482033	482038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220641
11529	NC_009641	TAA	2	6	482044	482049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220641
11530	NC_009641	GCA	2	6	482066	482071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220641
11531	NC_009641	ATGTT	2	10	482142	482151	20 %	60 %	20 %	0 %	151220641
11532	NC_009641	GTA	2	6	482175	482180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220641
11533	NC_009641	AAT	2	6	482255	482260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220641
11534	NC_009641	AT	3	6	482266	482271	50 %	50 %	0 %	0 %	151220641
11535	NC_009641	TA	3	6	482288	482293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_009641	AT	3	6	482295	482300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_009641	TTG	2	6	482380	482385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_009641	AAT	2	6	482497	482502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220642
11539	NC_009641	TTA	2	6	482516	482521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220642
11540	NC_009641	AAC	2	6	482526	482531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220642
11541	NC_009641	T	6	6	482541	482546	0 %	100 %	0 %	0 %	151220642
11542	NC_009641	GTG	2	6	482555	482560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220642
11543	NC_009641	T	6	6	482628	482633	0 %	100 %	0 %	0 %	151220642
11544	NC_009641	ATA	3	9	482731	482739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220642
11545	NC_009641	TCT	2	6	482753	482758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_009641	ACT	2	6	482808	482813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_009641	AT	3	6	482815	482820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_009641	GAT	2	6	482880	482885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220643
11549	NC_009641	GAA	2	6	482905	482910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220643
11550	NC_009641	TAT	2	6	482956	482961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220643
11551	NC_009641	GGT	2	6	482968	482973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220643
11552	NC_009641	AGA	2	6	482979	482984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220643
11553	NC_009641	AGA	2	6	483024	483029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220643
11554	NC_009641	TTAACA	2	12	483037	483048	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	151220643
11555	NC_009641	AAT	2	6	483169	483174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220643
11556	NC_009641	ATG	2	6	483209	483214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220643
11557	NC_009641	CTG	2	6	483227	483232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220643
11558	NC_009641	TGG	2	6	483255	483260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220643
11559	NC_009641	AAT	2	6	483272	483277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220643
11560	NC_009641	CAT	2	6	483283	483288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220644
11561	NC_009641	ATT	2	6	483312	483317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220644
11562	NC_009641	AAGTGA	2	12	483340	483351	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	151220644
11563	NC_009641	ATGG	2	8	483428	483435	25 %	25 %	50 %	0 %	151220644
11564	NC_009641	TG	3	6	483443	483448	0 %	50 %	50 %	0 %	151220644
11565	NC_009641	T	6	6	483452	483457	0 %	100 %	0 %	0 %	151220644
11566	NC_009641	CAA	2	6	483674	483679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220644
11567	NC_009641	AT	3	6	483688	483693	50 %	50 %	0 %	0 %	151220644
11568	NC_009641	TCG	2	6	483708	483713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220644
11569	NC_009641	TAAAT	2	10	483749	483758	60 %	40 %	0 %	0 %	151220644
11570	NC_009641	TCG	2	6	483778	483783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11571	NC_009641	CAA	2	6	483788	483793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11572	NC_009641	ATG	2	6	483797	483802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_009641	ATC	2	6	483826	483831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11574	NC_009641	AT	3	6	483875	483880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_009641	CTTAA	2	10	483891	483900	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11576	NC_009641	TCA	2	6	483933	483938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220645
11577	NC_009641	TTA	2	6	483964	483969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220645
11578	NC_009641	ATA	2	6	484029	484034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220645
11579	NC_009641	AAAT	2	8	484036	484043	75 %	25 %	0 %	0 %	151220645
11580	NC_009641	AAAT	2	8	484105	484112	75 %	25 %	0 %	0 %	151220645
11581	NC_009641	CCA	2	6	484125	484130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151220645
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11583	NC_009641	AAT	2	6	484200	484205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220645
11584	NC_009641	AAT	2	6	484301	484306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220645
11585	NC_009641	TTG	2	6	484370	484375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220645
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11587	NC_009641	CAA	2	6	484433	484438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220645
11588	NC_009641	TTG	2	6	484441	484446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220645
11589	NC_009641	AAT	3	9	484520	484528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220645
11590	NC_009641	GAC	2	6	484544	484549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220645
11591	NC_009641	CAATA	2	10	484574	484583	60 %	20 %	0 %	20 %	151220645
11592	NC_009641	TAA	2	6	484585	484590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220645
11593	NC_009641	ATC	2	6	484656	484661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220645
11594	NC_009641	CATT	2	8	484696	484703	25 %	50 %	0 %	25 %	151220645
11595	NC_009641	CCT	2	6	484711	484716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	151220646
11596	NC_009641	ACC	2	6	484777	484782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151220646
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11598	NC_009641	T	6	6	484847	484852	0 %	100 %	0 %	0 %	151220646
11599	NC_009641	AAT	2	6	484895	484900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220646
11600	NC_009641	ATA	2	6	484922	484927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220646
11601	NC_009641	TG	3	6	484974	484979	0 %	50 %	50 %	0 %	151220646
11602	NC_009641	ATA	2	6	485033	485038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220646
11603	NC_009641	GGT	2	6	485084	485089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220646
11604	NC_009641	AT	4	8	485138	485145	50 %	50 %	0 %	0 %	151220646
11605	NC_009641	A	6	6	485171	485176	100 %	0 %	0 %	0 %	151220646
11606	NC_009641	TTG	2	6	485250	485255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220646
11607	NC_009641	ACCA	2	8	485386	485393	50 %	0 %	0 %	50 %	151220646
11608	NC_009641	ATA	2	6	485394	485399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220646
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11610	NC_009641	TGA	2	6	485421	485426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220646
11611	NC_009641	CTT	2	6	485446	485451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151220646
11612	NC_009641	TATAA	2	10	485455	485464	60 %	40 %	0 %	0 %	151220646
11613	NC_009641	TAA	2	6	485491	485496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220646
11614	NC_009641	GT	3	6	485506	485511	0 %	50 %	50 %	0 %	151220646
11615	NC_009641	TGA	2	6	485549	485554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220646
11616	NC_009641	TCG	3	9	485559	485567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220646
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11618	NC_009641	GAA	2	6	485660	485665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220646
11619	NC_009641	TGT	2	6	485700	485705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220646
11620	NC_009641	ATT	2	6	485716	485721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220646
11621	NC_009641	TAAA	2	8	485727	485734	75 %	25 %	0 %	0 %	151220646
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11623	NC_009641	TAAA	2	8	485790	485797	75 %	25 %	0 %	0 %	151220646
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11990	NC_009641	GA	3	6	502016	502021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11991	NC_009641	ATTT	2	8	502039	502046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11992	NC_009641	A	7	7	502059	502065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11994	NC_009641	A	6	6	502128	502133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11996	NC_009641	TGT	2	6	502218	502223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11997	NC_009641	TATT	2	8	502248	502255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11998	NC_009641	CAAA	2	8	502264	502271	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11999	NC_009641	CAACT	2	10	502273	502282	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12000	NC_009641	AATT	2	8	502310	502317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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