MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 68839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009641	A	6	6	20439	20444	100 %	0 %	0 %	0 %	151220226
502	NC_009641	CAA	2	6	20463	20468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220226
503	NC_009641	TTGAAG	2	12	20512	20523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220226
504	NC_009641	GGT	2	6	20544	20549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220226
505	NC_009641	AGTA	2	8	20564	20571	50 %	25 %	25 %	0 %	151220226
506	NC_009641	ATTC	2	8	20649	20656	25 %	50 %	0 %	25 %	151220226
507	NC_009641	AAG	2	6	20692	20697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220226
508	NC_009641	AC	3	6	20717	20722	50 %	0 %	0 %	50 %	151220226
509	NC_009641	GTCT	2	8	20820	20827	0 %	50 %	25 %	25 %	151220227
510	NC_009641	ATT	2	6	20836	20841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220227
511	NC_009641	TAC	2	6	20862	20867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220227
512	NC_009641	ATG	2	6	20929	20934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220227
513	NC_009641	ATA	2	6	20948	20953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220227
514	NC_009641	TGT	2	6	20964	20969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220227
515	NC_009641	TGAA	2	8	21005	21012	50 %	25 %	25 %	0 %	151220227
516	NC_009641	ACG	2	6	21058	21063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220227
517	NC_009641	TAT	2	6	21076	21081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220227
518	NC_009641	GCAT	2	8	21099	21106	25 %	25 %	25 %	25 %	151220227
519	NC_009641	GATT	2	8	21116	21123	25 %	50 %	25 %	0 %	151220227
520	NC_009641	ATG	2	6	21146	21151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220227
521	NC_009641	ATG	2	6	21158	21163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220227
522	NC_009641	ATC	2	6	21216	21221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220227
523	NC_009641	CAG	2	6	21356	21361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220227
524	NC_009641	GGTA	2	8	21606	21613	25 %	25 %	50 %	0 %	151220227
525	NC_009641	TGA	2	6	21639	21644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220227
526	NC_009641	GTC	2	6	21683	21688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220227
527	NC_009641	TGATTG	2	12	21716	21727	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	151220227
528	NC_009641	ACT	2	6	21728	21733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220227
529	NC_009641	ACA	2	6	21777	21782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220227
530	NC_009641	TC	3	6	21797	21802	0 %	50 %	0 %	50 %	151220227
531	NC_009641	GTG	2	6	21866	21871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220227
532	NC_009641	AAC	2	6	21875	21880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220227
533	NC_009641	ATG	2	6	21898	21903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220227
534	NC_009641	TGA	2	6	21966	21971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220227
535	NC_009641	GGC	2	6	21985	21990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	151220227
536	NC_009641	GAT	2	6	21997	22002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220227
537	NC_009641	GAT	2	6	22006	22011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220227
538	NC_009641	GGT	2	6	22012	22017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220227
539	NC_009641	ATG	2	6	22034	22039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220227
540	NC_009641	TGAAAT	2	12	22047	22058	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	151220227
541	NC_009641	AGTTA	2	10	22095	22104	40 %	40 %	20 %	0 %	151220227
542	NC_009641	ATA	2	6	22121	22126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220227
543	NC_009641	ATG	2	6	22159	22164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220227
544	NC_009641	A	6	6	22166	22171	100 %	0 %	0 %	0 %	151220227
545	NC_009641	AAT	2	6	22184	22189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_009641	GAT	2	6	22196	22201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_009641	AT	3	6	22239	22244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_009641	TCA	2	6	22448	22453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220228
549	NC_009641	GTA	2	6	22457	22462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220228
550	NC_009641	AAGGAA	2	12	22485	22496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220228
551	NC_009641	CG	3	6	22534	22539	0 %	0 %	50 %	50 %	151220228
552	NC_009641	GGT	2	6	22547	22552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220228
553	NC_009641	AAT	2	6	22553	22558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220228
554	NC_009641	GTT	2	6	22661	22666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220228
555	NC_009641	GAA	2	6	22790	22795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220228
556	NC_009641	GTG	2	6	22803	22808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220228
557	NC_009641	A	6	6	22829	22834	100 %	0 %	0 %	0 %	151220228
558	NC_009641	ATT	2	6	22918	22923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220228
559	NC_009641	CAT	2	6	22983	22988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220228
560	NC_009641	TGA	2	6	22990	22995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220228
561	NC_009641	GAA	2	6	23003	23008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220228
562	NC_009641	TAT	2	6	23009	23014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220228
563	NC_009641	GCA	2	6	23015	23020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220228
564	NC_009641	ATT	2	6	23284	23289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220228
565	NC_009641	CAT	2	6	23303	23308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220228
566	NC_009641	AG	3	6	23312	23317	50 %	0 %	50 %	0 %	151220228
567	NC_009641	ACA	3	9	23336	23344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220228
568	NC_009641	CGT	2	6	23354	23359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220228
569	NC_009641	GGTT	2	8	23363	23370	0 %	50 %	50 %	0 %	151220228
570	NC_009641	TCG	2	6	23395	23400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220228
571	NC_009641	AGA	2	6	23575	23580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220228
572	NC_009641	AGA	2	6	23602	23607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220228
573	NC_009641	ATGTA	2	10	23653	23662	40 %	40 %	20 %	0 %	151220228
574	NC_009641	TCT	2	6	23673	23678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151220228
575	NC_009641	AACA	2	8	23697	23704	75 %	0 %	0 %	25 %	151220228
576	NC_009641	TA	3	6	23734	23739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_009641	AGG	2	6	23788	23793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_009641	TGCT	2	8	23803	23810	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
579	NC_009641	TCGAT	2	10	23817	23826	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
580	NC_009641	A	6	6	23836	23841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_009641	AGA	2	6	23878	23883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_009641	GAT	2	6	23887	23892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_009641	AAG	2	6	23927	23932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_009641	ATT	2	6	24019	24024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_009641	TTC	2	6	24070	24075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_009641	A	6	6	24076	24081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_009641	A	6	6	24099	24104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_009641	ATCT	2	8	24137	24144	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
589	NC_009641	CGG	2	6	24195	24200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_009641	T	6	6	24233	24238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_009641	GCCT	2	8	24265	24272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
592	NC_009641	T	7	7	24341	24347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_009641	ATATT	2	10	24355	24364	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_009641	AT	3	6	24373	24378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_009641	TTA	2	6	24490	24495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_009641	TTC	2	6	24527	24532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_009641	CCA	2	6	24544	24549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_009641	TCC	2	6	24551	24556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_009641	AAT	2	6	24588	24593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_009641	ATTT	2	8	24597	24604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_009641	TAT	2	6	24649	24654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_009641	TCA	2	6	24668	24673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_009641	CCG	2	6	24699	24704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_009641	TAA	2	6	24713	24718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_009641	A	6	6	24717	24722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_009641	AT	3	6	24728	24733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_009641	TA	3	6	24779	24784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_009641	T	6	6	24853	24858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_009641	A	6	6	24883	24888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_009641	ATA	2	6	24896	24901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_009641	GTT	2	6	24944	24949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220229
612	NC_009641	TGA	3	9	24955	24963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220229
613	NC_009641	A	7	7	24997	25003	100 %	0 %	0 %	0 %	151220229
614	NC_009641	ATG	2	6	25038	25043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220229
615	NC_009641	GAA	3	9	25061	25069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220229
616	NC_009641	A	6	6	25139	25144	100 %	0 %	0 %	0 %	151220229
617	NC_009641	AAT	3	9	25156	25164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220229
618	NC_009641	CGT	2	6	25283	25288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220229
619	NC_009641	A	6	6	25379	25384	100 %	0 %	0 %	0 %	151220229
620	NC_009641	TGAATT	2	12	25414	25425	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	151220229
621	NC_009641	ATT	2	6	25431	25436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220229
622	NC_009641	TTA	2	6	25475	25480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220229
623	NC_009641	GTAC	2	8	25514	25521	25 %	25 %	25 %	25 %	151220229
624	NC_009641	TCG	2	6	25537	25542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220229
625	NC_009641	GAT	2	6	25562	25567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220229
626	NC_009641	AT	3	6	25582	25587	50 %	50 %	0 %	0 %	151220229
627	NC_009641	TCC	2	6	25614	25619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	151220229
628	NC_009641	AAC	2	6	25620	25625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220229
629	NC_009641	AAC	2	6	25659	25664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220230
630	NC_009641	GCT	2	6	25765	25770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220230
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632	NC_009641	TTA	2	6	25880	25885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220230
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