MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 68839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_009641	CTTTT	2	10	2254330	2254339	0 %	80 %	0 %	20 %	151222248
54002	NC_009641	TAT	2	6	2254381	2254386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151222248
54003	NC_009641	CAA	2	6	2254393	2254398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151222248
54004	NC_009641	ATA	2	6	2254418	2254423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151222248
54005	NC_009641	TCA	2	6	2254443	2254448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222248
54006	NC_009641	AT	3	6	2254452	2254457	50 %	50 %	0 %	0 %	151222248
54007	NC_009641	AAAT	2	8	2254461	2254468	75 %	25 %	0 %	0 %	151222248
54008	NC_009641	TGTC	2	8	2254588	2254595	0 %	50 %	25 %	25 %	151222248
54009	NC_009641	TAA	2	6	2254637	2254642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151222248
54010	NC_009641	A	6	6	2254656	2254661	100 %	0 %	0 %	0 %	151222248
54011	NC_009641	AT	3	6	2254699	2254704	50 %	50 %	0 %	0 %	151222248
54012	NC_009641	ACA	2	6	2254725	2254730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151222248
54013	NC_009641	ATT	2	6	2254775	2254780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151222248
54014	NC_009641	AAT	2	6	2254822	2254827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151222249
54015	NC_009641	ATT	2	6	2254877	2254882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151222249
54016	NC_009641	TAAT	2	8	2254893	2254900	50 %	50 %	0 %	0 %	151222249
54017	NC_009641	TCA	2	6	2254904	2254909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222249
54018	NC_009641	CTA	2	6	2254953	2254958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222249
54019	NC_009641	TTG	2	6	2254992	2254997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151222249
54020	NC_009641	ATC	3	9	2255044	2255052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222249
54021	NC_009641	CTT	2	6	2255070	2255075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222249
54022	NC_009641	AAAT	2	8	2255089	2255096	75 %	25 %	0 %	0 %	151222249
54023	NC_009641	ATTC	2	8	2255121	2255128	25 %	50 %	0 %	25 %	151222249
54024	NC_009641	GATTT	2	10	2255191	2255200	20 %	60 %	20 %	0 %	151222249
54025	NC_009641	AT	3	6	2255214	2255219	50 %	50 %	0 %	0 %	151222249
54026	NC_009641	AAT	2	6	2255275	2255280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151222249
54027	NC_009641	GCT	2	6	2255285	2255290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151222249
54028	NC_009641	T	6	6	2255329	2255334	0 %	100 %	0 %	0 %	151222249
54029	NC_009641	TGT	2	6	2255339	2255344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151222249
54030	NC_009641	ATCA	2	8	2255530	2255537	50 %	25 %	0 %	25 %	151222249
54031	NC_009641	AAG	2	6	2255553	2255558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151222249
54032	NC_009641	CTT	2	6	2255583	2255588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222249
54033	NC_009641	ACT	2	6	2255609	2255614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222249
54034	NC_009641	ACC	2	6	2255617	2255622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151222249
54035	NC_009641	A	6	6	2255732	2255737	100 %	0 %	0 %	0 %	151222249
54036	NC_009641	TTTCAA	2	12	2255808	2255819	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	151222249
54037	NC_009641	TTC	2	6	2255866	2255871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222249
54038	NC_009641	TATT	2	8	2255924	2255931	25 %	75 %	0 %	0 %	151222249
54039	NC_009641	TA	3	6	2255938	2255943	50 %	50 %	0 %	0 %	151222249
54040	NC_009641	TGT	2	6	2255954	2255959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151222249
54041	NC_009641	T	6	6	2255970	2255975	0 %	100 %	0 %	0 %	151222249
54042	NC_009641	ATC	2	6	2256007	2256012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54043	NC_009641	ATT	2	6	2256039	2256044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54044	NC_009641	ATG	2	6	2256068	2256073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54045	NC_009641	TTTA	2	8	2256088	2256095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54046	NC_009641	TAA	2	6	2256106	2256111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54047	NC_009641	ACA	2	6	2256203	2256208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54048	NC_009641	CAA	2	6	2256227	2256232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54049	NC_009641	AGT	2	6	2256256	2256261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54050	NC_009641	AGG	2	6	2256266	2256271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54051	NC_009641	AATG	2	8	2256289	2256296	50 %	25 %	25 %	0 %	151222250
54052	NC_009641	GGT	2	6	2256325	2256330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151222250
54053	NC_009641	ATTAG	2	10	2256341	2256350	40 %	40 %	20 %	0 %	151222250
54054	NC_009641	CAAA	2	8	2256414	2256421	75 %	0 %	0 %	25 %	151222250
54055	NC_009641	CATT	2	8	2256446	2256453	25 %	50 %	0 %	25 %	151222250
54056	NC_009641	GTT	2	6	2256497	2256502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151222250
54057	NC_009641	TTA	2	6	2256546	2256551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151222250
54058	NC_009641	ATG	3	9	2256564	2256572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151222250
54059	NC_009641	TTG	2	6	2256582	2256587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151222250
54060	NC_009641	ATG	2	6	2256600	2256605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151222250
54061	NC_009641	GCA	2	6	2256656	2256661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151222250
54062	NC_009641	TCAT	2	8	2256664	2256671	25 %	50 %	0 %	25 %	151222250
54063	NC_009641	AAACG	2	10	2256710	2256719	60 %	0 %	20 %	20 %	151222250
54064	NC_009641	ATG	2	6	2256726	2256731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151222250
54065	NC_009641	AAAT	2	8	2256746	2256753	75 %	25 %	0 %	0 %	151222250
54066	NC_009641	TCAA	2	8	2256759	2256766	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54067	NC_009641	TAT	2	6	2256825	2256830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54068	NC_009641	A	6	6	2256842	2256847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54069	NC_009641	ATTT	2	8	2256887	2256894	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54070	NC_009641	GATT	2	8	2257046	2257053	25 %	50 %	25 %	0 %	151222251
54071	NC_009641	TTAA	2	8	2257081	2257088	50 %	50 %	0 %	0 %	151222251
54072	NC_009641	ATA	2	6	2257103	2257108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151222251
54073	NC_009641	TAA	2	6	2257230	2257235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151222251
54074	NC_009641	ACA	2	6	2257304	2257309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151222252
54075	NC_009641	T	6	6	2257339	2257344	0 %	100 %	0 %	0 %	151222252
54076	NC_009641	AAC	2	6	2257345	2257350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151222252
54077	NC_009641	TAA	2	6	2257384	2257389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151222252
54078	NC_009641	CTT	2	6	2257398	2257403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222252
54079	NC_009641	T	7	7	2257419	2257425	0 %	100 %	0 %	0 %	151222252
54080	NC_009641	ATC	2	6	2257456	2257461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222252
54081	NC_009641	CAT	2	6	2257489	2257494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222252
54082	NC_009641	T	6	6	2257543	2257548	0 %	100 %	0 %	0 %	151222252
54083	NC_009641	TCG	2	6	2257610	2257615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151222252
54084	NC_009641	TAA	2	6	2257629	2257634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151222252
54085	NC_009641	TGC	2	6	2257654	2257659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151222252
54086	NC_009641	AATT	2	8	2257665	2257672	50 %	50 %	0 %	0 %	151222252
54087	NC_009641	CTT	2	6	2257695	2257700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222252
54088	NC_009641	TTTG	2	8	2257714	2257721	0 %	75 %	25 %	0 %	151222252
54089	NC_009641	CTT	2	6	2257803	2257808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222252
54090	NC_009641	AAT	2	6	2257861	2257866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151222252
54091	NC_009641	ATT	2	6	2257888	2257893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151222252
54092	NC_009641	TGCG	2	8	2257909	2257916	0 %	25 %	50 %	25 %	151222252
54093	NC_009641	TCT	2	6	2257931	2257936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222252
54094	NC_009641	CAG	2	6	2257995	2258000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151222252
54095	NC_009641	ATTGA	2	10	2258039	2258048	40 %	40 %	20 %	0 %	151222252
54096	NC_009641	T	6	6	2258080	2258085	0 %	100 %	0 %	0 %	151222252
54097	NC_009641	ACC	2	6	2258212	2258217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151222252
54098	NC_009641	GCT	2	6	2258267	2258272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151222252
54099	NC_009641	ACC	2	6	2258311	2258316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151222252
54100	NC_009641	TATCA	2	10	2258362	2258371	40 %	40 %	0 %	20 %	151222252
54101	NC_009641	TGC	2	6	2258398	2258403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151222252
54102	NC_009641	TCA	3	9	2258408	2258416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222252
54103	NC_009641	AAAT	2	8	2258429	2258436	75 %	25 %	0 %	0 %	151222252
54104	NC_009641	GCC	2	6	2258488	2258493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	151222252
54105	NC_009641	AATT	2	8	2258502	2258509	50 %	50 %	0 %	0 %	151222252
54106	NC_009641	GTT	2	6	2258516	2258521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151222252
54107	NC_009641	AAT	2	6	2258548	2258553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151222252
54108	NC_009641	ATC	2	6	2258573	2258578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54109	NC_009641	ATT	2	6	2258648	2258653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54110	NC_009641	TTA	2	6	2258702	2258707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54111	NC_009641	ATC	2	6	2258759	2258764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54112	NC_009641	ATG	2	6	2258774	2258779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54113	NC_009641	TA	3	6	2258804	2258809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54114	NC_009641	AATCTG	2	12	2258852	2258863	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	151222253
54115	NC_009641	TCT	2	6	2258941	2258946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222253
54116	NC_009641	TACG	2	8	2258951	2258958	25 %	25 %	25 %	25 %	151222253
54117	NC_009641	TCT	2	6	2259016	2259021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222253
54118	NC_009641	CAA	2	6	2259120	2259125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151222253
54119	NC_009641	AAT	2	6	2259135	2259140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151222253
54120	NC_009641	TG	3	6	2259150	2259155	0 %	50 %	50 %	0 %	151222253
54121	NC_009641	CAC	2	6	2259171	2259176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151222253
54122	NC_009641	TTG	2	6	2259189	2259194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151222253
54123	NC_009641	CAT	2	6	2259197	2259202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222253
54124	NC_009641	TGA	2	6	2259233	2259238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151222253
54125	NC_009641	TCT	2	6	2259274	2259279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222253
54126	NC_009641	TCG	2	6	2259293	2259298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151222253
54127	NC_009641	CTG	2	6	2259368	2259373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151222253
54128	NC_009641	CA	3	6	2259396	2259401	50 %	0 %	0 %	50 %	151222253
54129	NC_009641	GAT	2	6	2259435	2259440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151222253
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54131	NC_009641	TCC	2	6	2259518	2259523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54132	NC_009641	TTGA	2	8	2259560	2259567	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54133	NC_009641	CATA	2	8	2259619	2259626	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54134	NC_009641	AAAC	2	8	2259653	2259660	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54135	NC_009641	ACA	2	6	2259703	2259708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54137	NC_009641	ATT	2	6	2259792	2259797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54138	NC_009641	AT	3	6	2259910	2259915	50 %	50 %	0 %	0 %	151222254
54139	NC_009641	T	6	6	2259925	2259930	0 %	100 %	0 %	0 %	151222254
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54148	NC_009641	A	6	6	2260412	2260417	100 %	0 %	0 %	0 %	151222254
54149	NC_009641	CTA	2	6	2260464	2260469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222254
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54151	NC_009641	ATG	2	6	2260502	2260507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151222254
54152	NC_009641	TAT	2	6	2260635	2260640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54153	NC_009641	TAAG	2	8	2260661	2260668	50 %	25 %	25 %	0 %	151222255
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54162	NC_009641	TTC	2	6	2260961	2260966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222255
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54168	NC_009641	ATTA	2	8	2261142	2261149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54169	NC_009641	TTATA	2	10	2261150	2261159	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54175	NC_009641	ATCA	2	8	2261297	2261304	50 %	25 %	0 %	25 %	151222256
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54189	NC_009641	TATT	2	8	2261836	2261843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54190	NC_009641	T	6	6	2261854	2261859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54191	NC_009641	TTA	3	9	2261901	2261909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54193	NC_009641	TTA	2	6	2262017	2262022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54195	NC_009641	ATCCT	2	10	2262130	2262139	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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54221	NC_009641	TATTT	2	10	2263297	2263306	20 %	80 %	0 %	0 %	151222257
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54228	NC_009641	AAC	2	6	2263629	2263634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54229	NC_009641	TAAG	2	8	2263734	2263741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54230	NC_009641	ACA	2	6	2263759	2263764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54231	NC_009641	AC	3	6	2263788	2263793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54232	NC_009641	TATTT	2	10	2263830	2263839	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54233	NC_009641	A	6	6	2263909	2263914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54234	NC_009641	TA	3	6	2263952	2263957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54235	NC_009641	TGCT	2	8	2263969	2263976	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54236	NC_009641	ATTA	2	8	2264059	2264066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54237	NC_009641	TA	3	6	2264075	2264080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54238	NC_009641	CAA	2	6	2264084	2264089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54239	NC_009641	ACT	2	6	2264100	2264105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54240	NC_009641	TCA	2	6	2264141	2264146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54241	NC_009641	TCT	2	6	2264169	2264174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54242	NC_009641	TAT	2	6	2264187	2264192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54243	NC_009641	AATT	2	8	2264212	2264219	50 %	50 %	0 %	0 %	151222258
54244	NC_009641	GCA	2	6	2264246	2264251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151222258
54245	NC_009641	ATTA	2	8	2264253	2264260	50 %	50 %	0 %	0 %	151222258
54246	NC_009641	CTA	2	6	2264339	2264344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222258
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54248	NC_009641	AT	3	6	2264425	2264430	50 %	50 %	0 %	0 %	151222258
54249	NC_009641	TTA	2	6	2264464	2264469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54250	NC_009641	ATC	2	6	2264488	2264493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222259
54251	NC_009641	AGT	2	6	2264556	2264561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151222259
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54267	NC_009641	TGT	3	9	2265456	2265464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54271	NC_009641	TAA	2	6	2265694	2265699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54274	NC_009641	TTA	2	6	2265845	2265850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151222260
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54286	NC_009641	TATT	2	8	2266528	2266535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54287	NC_009641	TAC	2	6	2266602	2266607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54288	NC_009641	ATTAA	2	10	2266617	2266626	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54289	NC_009641	AAAT	2	8	2266684	2266691	75 %	25 %	0 %	0 %	151222261
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54357	NC_009641	ACA	2	6	2269220	2269225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151222263
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54487	NC_009641	TTG	2	6	2273804	2273809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151222267
54488	NC_009641	TTC	2	6	2273861	2273866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222267
54489	NC_009641	ATC	2	6	2273886	2273891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222267
54490	NC_009641	AAC	2	6	2273934	2273939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151222267
54491	NC_009641	GCT	2	6	2273967	2273972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151222267
54492	NC_009641	ATC	2	6	2274021	2274026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222267
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