MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 68839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53501	NC_009641	CTA	2	6	2234272	2234277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222229
53502	NC_009641	ATTA	2	8	2234318	2234325	50 %	50 %	0 %	0 %	151222229
53503	NC_009641	TTG	3	9	2234360	2234368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151222229
53504	NC_009641	ATT	2	6	2234381	2234386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151222229
53505	NC_009641	TGC	2	6	2234417	2234422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151222229
53506	NC_009641	T	6	6	2234480	2234485	0 %	100 %	0 %	0 %	151222229
53507	NC_009641	TTC	2	6	2234489	2234494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222229
53508	NC_009641	ACC	2	6	2234510	2234515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151222229
53509	NC_009641	TG	3	6	2234536	2234541	0 %	50 %	50 %	0 %	151222229
53510	NC_009641	GTT	2	6	2234547	2234552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151222229
53511	NC_009641	CTA	2	6	2234596	2234601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222229
53512	NC_009641	TCA	2	6	2234751	2234756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222229
53513	NC_009641	ACC	2	6	2234849	2234854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151222229
53514	NC_009641	CCA	2	6	2235024	2235029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151222229
53515	NC_009641	TTA	2	6	2235063	2235068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151222229
53516	NC_009641	TC	4	8	2235159	2235166	0 %	50 %	0 %	50 %	151222229
53517	NC_009641	CTTG	2	8	2235190	2235197	0 %	50 %	25 %	25 %	151222229
53518	NC_009641	CTT	2	6	2235222	2235227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53519	NC_009641	A	7	7	2235230	2235236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53520	NC_009641	CCA	2	6	2235260	2235265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151222230
53521	NC_009641	ACAT	2	8	2235340	2235347	50 %	25 %	0 %	25 %	151222230
53522	NC_009641	ATGC	2	8	2235355	2235362	25 %	25 %	25 %	25 %	151222230
53523	NC_009641	CTCC	2	8	2235458	2235465	0 %	25 %	0 %	75 %	151222230
53524	NC_009641	ACG	2	6	2235482	2235487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151222230
53525	NC_009641	CTT	2	6	2235492	2235497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222230
53526	NC_009641	T	6	6	2235654	2235659	0 %	100 %	0 %	0 %	151222230
53527	NC_009641	AT	3	6	2235696	2235701	50 %	50 %	0 %	0 %	151222230
53528	NC_009641	A	6	6	2235712	2235717	100 %	0 %	0 %	0 %	151222230
53529	NC_009641	TAA	2	6	2235739	2235744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151222230
53530	NC_009641	TAAAAA	2	12	2235779	2235790	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53531	NC_009641	CTC	2	6	2235813	2235818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53532	NC_009641	TAT	2	6	2235819	2235824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53533	NC_009641	CTA	2	6	2235866	2235871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222231
53534	NC_009641	ATA	2	6	2235876	2235881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151222231
53535	NC_009641	TTTTAA	2	12	2235884	2235895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151222231
53536	NC_009641	TTC	2	6	2235911	2235916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222231
53537	NC_009641	TACA	2	8	2235926	2235933	50 %	25 %	0 %	25 %	151222231
53538	NC_009641	CTT	2	6	2235973	2235978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222231
53539	NC_009641	ATA	2	6	2236065	2236070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151222231
53540	NC_009641	TTG	2	6	2236097	2236102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151222231
53541	NC_009641	ATG	2	6	2236124	2236129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151222231
53542	NC_009641	TTC	2	6	2236130	2236135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222231
53543	NC_009641	TGA	2	6	2236203	2236208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151222231
53544	NC_009641	TAA	2	6	2236302	2236307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151222232
53545	NC_009641	TAT	2	6	2236353	2236358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151222232
53546	NC_009641	TA	4	8	2236376	2236383	50 %	50 %	0 %	0 %	151222232
53547	NC_009641	CGC	2	6	2236384	2236389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	151222232
53548	NC_009641	ATTTTC	2	12	2236396	2236407	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	151222232
53549	NC_009641	CAT	2	6	2236425	2236430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222232
53550	NC_009641	CTTG	2	8	2236442	2236449	0 %	50 %	25 %	25 %	151222232
53551	NC_009641	CAT	2	6	2236455	2236460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222232
53552	NC_009641	TGAA	2	8	2236478	2236485	50 %	25 %	25 %	0 %	151222232
53553	NC_009641	TTA	2	6	2236514	2236519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151222232
53554	NC_009641	AGA	2	6	2236540	2236545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151222232
53555	NC_009641	TAA	2	6	2236587	2236592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151222232
53556	NC_009641	GTG	2	6	2236599	2236604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151222232
53557	NC_009641	TGC	2	6	2236708	2236713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151222232
53558	NC_009641	CTT	2	6	2236782	2236787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222232
53559	NC_009641	GTT	2	6	2236853	2236858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151222232
53560	NC_009641	AGC	2	6	2236891	2236896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151222232
53561	NC_009641	TAA	2	6	2236918	2236923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151222232
53562	NC_009641	CTAC	2	8	2236928	2236935	25 %	25 %	0 %	50 %	151222232
53563	NC_009641	TGA	2	6	2236963	2236968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151222232
53564	NC_009641	ATAG	2	8	2236992	2236999	50 %	25 %	25 %	0 %	151222232
53565	NC_009641	AT	3	6	2237158	2237163	50 %	50 %	0 %	0 %	151222232
53566	NC_009641	CTT	2	6	2237175	2237180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222232
53567	NC_009641	TGC	2	6	2237194	2237199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151222232
53568	NC_009641	ACC	2	6	2237236	2237241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151222232
53569	NC_009641	TTAT	2	8	2237348	2237355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53570	NC_009641	ATA	2	6	2237357	2237362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53571	NC_009641	TAA	2	6	2237459	2237464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151222233
53572	NC_009641	T	7	7	2237471	2237477	0 %	100 %	0 %	0 %	151222233
53573	NC_009641	ATTT	2	8	2237486	2237493	25 %	75 %	0 %	0 %	151222233
53574	NC_009641	ATT	2	6	2237497	2237502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151222233
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53577	NC_009641	TA	3	6	2237688	2237693	50 %	50 %	0 %	0 %	151222233
53578	NC_009641	TGG	2	6	2237694	2237699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151222233
53579	NC_009641	ATTA	2	8	2237733	2237740	50 %	50 %	0 %	0 %	151222233
53580	NC_009641	TGAT	2	8	2237778	2237785	25 %	50 %	25 %	0 %	151222233
53581	NC_009641	ATT	2	6	2237796	2237801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151222233
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53583	NC_009641	CAT	2	6	2237921	2237926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222233
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53585	NC_009641	CTT	2	6	2237957	2237962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222233
53586	NC_009641	TA	3	6	2238036	2238041	50 %	50 %	0 %	0 %	151222233
53587	NC_009641	TAA	2	6	2238057	2238062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151222233
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53589	NC_009641	ATC	2	6	2238111	2238116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222233
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53591	NC_009641	ATT	2	6	2238250	2238255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151222233
53592	NC_009641	TCTG	2	8	2238272	2238279	0 %	50 %	25 %	25 %	151222234
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53600	NC_009641	AATTTC	2	12	2238670	2238681	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	151222234
53601	NC_009641	ACC	2	6	2238844	2238849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151222234
53602	NC_009641	CTA	2	6	2238870	2238875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222234
53603	NC_009641	ATAC	2	8	2238913	2238920	50 %	25 %	0 %	25 %	151222234
53604	NC_009641	TCA	2	6	2238950	2238955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222234
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53606	NC_009641	TCA	2	6	2238995	2239000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222234
53607	NC_009641	AAT	2	6	2239019	2239024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151222234
53608	NC_009641	CTT	2	6	2239035	2239040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222234
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53613	NC_009641	TTC	2	6	2239144	2239149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151222234
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53615	NC_009641	T	6	6	2239185	2239190	0 %	100 %	0 %	0 %	151222234
53616	NC_009641	ACA	2	6	2239241	2239246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151222234
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53979	NC_009641	CATA	2	8	2253222	2253229	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53980	NC_009641	CAA	2	6	2253246	2253251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53981	NC_009641	CAA	2	6	2253412	2253417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53982	NC_009641	A	6	6	2253519	2253524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53983	NC_009641	ACT	2	6	2253551	2253556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53984	NC_009641	CAACA	2	10	2253559	2253568	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
53985	NC_009641	CAT	2	6	2253712	2253717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151222248
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