MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 chromosome

Total Repeats: 84108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_009636	GCC	2	6	841078	841083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150396006
19002	NC_009636	ATC	2	6	841168	841173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150396007
19003	NC_009636	CG	3	6	841499	841504	0 %	0 %	50 %	50 %	150396007
19004	NC_009636	AGGG	2	8	841510	841517	25 %	0 %	75 %	0 %	150396007
19005	NC_009636	TCG	2	6	841558	841563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150396007
19006	NC_009636	TTG	2	6	841582	841587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150396007
19007	NC_009636	ATT	2	6	841599	841604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150396007
19008	NC_009636	AGA	2	6	841609	841614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150396007
19009	NC_009636	CGC	2	6	841725	841730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150396007
19010	NC_009636	CCG	2	6	841831	841836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150396007
19011	NC_009636	GCC	2	6	841846	841851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150396007
19012	NC_009636	TTC	2	6	841881	841886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19013	NC_009636	TCG	2	6	841941	841946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19014	NC_009636	TAA	2	6	842039	842044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19015	NC_009636	GCT	2	6	842084	842089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19016	NC_009636	CGGG	2	8	842153	842160	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19017	NC_009636	AAC	2	6	842192	842197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19018	NC_009636	GTATGC	2	12	842229	842240	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150396008
19019	NC_009636	CAC	3	9	842242	842250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150396008
19020	NC_009636	GCC	2	6	842288	842293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150396008
19021	NC_009636	CGC	2	6	842296	842301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150396008
19022	NC_009636	CGA	2	6	842311	842316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150396008
19023	NC_009636	GCT	2	6	842324	842329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150396008
19024	NC_009636	CAA	3	9	842428	842436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150396008
19025	NC_009636	TCGG	2	8	842438	842445	0 %	25 %	50 %	25 %	150396008
19026	NC_009636	GGC	3	9	842450	842458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150396008
19027	NC_009636	GGC	2	6	842465	842470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150396008
19028	NC_009636	CAG	2	6	842561	842566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150396008
19029	NC_009636	ACGGC	2	10	842625	842634	20 %	0 %	40 %	40 %	150396008
19030	NC_009636	CGA	2	6	842680	842685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150396008
19031	NC_009636	CGGC	2	8	842706	842713	0 %	0 %	50 %	50 %	150396008
19032	NC_009636	ACA	2	6	842739	842744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150396008
19033	NC_009636	GC	4	8	842750	842757	0 %	0 %	50 %	50 %	150396008
19034	NC_009636	CGG	2	6	842800	842805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150396008
19035	NC_009636	ACG	2	6	842807	842812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150396008
19036	NC_009636	A	7	7	842888	842894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19037	NC_009636	CTTT	2	8	842912	842919	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19038	NC_009636	GCTT	2	8	843107	843114	0 %	50 %	25 %	25 %	150396009
19039	NC_009636	GAC	2	6	843228	843233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150396009
19040	NC_009636	AGG	2	6	843238	843243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150396009
19041	NC_009636	CGAT	2	8	843334	843341	25 %	25 %	25 %	25 %	150396009
19042	NC_009636	CG	3	6	843372	843377	0 %	0 %	50 %	50 %	150396009
19043	NC_009636	ATG	2	6	843486	843491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150396009
19044	NC_009636	GGCG	2	8	843525	843532	0 %	0 %	75 %	25 %	150396009
19045	NC_009636	CAT	2	6	843561	843566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150396009
19046	NC_009636	GCA	2	6	843577	843582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150396010
19047	NC_009636	AGGGC	2	10	843620	843629	20 %	0 %	60 %	20 %	150396010
19048	NC_009636	AGC	2	6	843672	843677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150396010
19049	NC_009636	GGC	2	6	843737	843742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150396010
19050	NC_009636	GTC	2	6	843765	843770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150396010
19051	NC_009636	GCCG	2	8	843773	843780	0 %	0 %	50 %	50 %	150396010
19052	NC_009636	GGA	2	6	843795	843800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150396010
19053	NC_009636	TC	3	6	843809	843814	0 %	50 %	0 %	50 %	150396010
19054	NC_009636	GGC	2	6	843818	843823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150396010
19055	NC_009636	AAT	2	6	843838	843843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150396010
19056	NC_009636	TGG	2	6	843885	843890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150396010
19057	NC_009636	GCCG	2	8	843928	843935	0 %	0 %	50 %	50 %	150396010
19058	NC_009636	TCC	2	6	843993	843998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150396010
19059	NC_009636	GGAAAG	2	12	844100	844111	50 %	0 %	50 %	0 %	150396010
19060	NC_009636	TGC	2	6	844162	844167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150396010
19061	NC_009636	CGG	2	6	844187	844192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150396010
19062	NC_009636	CTT	2	6	844204	844209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150396010
19063	NC_009636	TGG	2	6	844228	844233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150396010
19064	NC_009636	CGC	2	6	844291	844296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150396010
19065	NC_009636	TCA	2	6	844326	844331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19066	NC_009636	GGAC	2	8	844349	844356	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19067	NC_009636	AGCGA	2	10	844377	844386	40 %	0 %	40 %	20 %	150396011
19068	NC_009636	GCC	2	6	844423	844428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150396011
19069	NC_009636	GTC	2	6	844514	844519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150396011
19070	NC_009636	GGCGAT	2	12	844606	844617	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	150396011
19071	NC_009636	GTAG	2	8	844626	844633	25 %	25 %	50 %	0 %	150396011
19072	NC_009636	TGC	2	6	844636	844641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150396011
19073	NC_009636	TGA	2	6	844662	844667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150396011
19074	NC_009636	CAT	2	6	844701	844706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150396011
19075	NC_009636	GAC	2	6	844717	844722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150396011
19076	NC_009636	CGG	3	9	844743	844751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150396011
19077	NC_009636	TGC	2	6	844752	844757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150396011
19078	NC_009636	CAA	2	6	844770	844775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150396011
19079	NC_009636	AGG	2	6	844782	844787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150396011
19080	NC_009636	CTC	2	6	844891	844896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150396012
19081	NC_009636	AGC	2	6	844911	844916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150396012
19082	NC_009636	AGG	2	6	844964	844969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150396012
19083	NC_009636	CGT	2	6	845035	845040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150396012
19084	NC_009636	AGA	2	6	845157	845162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150396012
19085	NC_009636	GCC	2	6	845164	845169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150396012
19086	NC_009636	GCG	2	6	845176	845181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150396012
19087	NC_009636	CCA	2	6	845202	845207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150396012
19088	NC_009636	AGG	2	6	845236	845241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150396012
19089	NC_009636	CGA	2	6	845244	845249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150396012
19090	NC_009636	GGC	2	6	845273	845278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150396012
19091	NC_009636	GCCA	2	8	845294	845301	25 %	0 %	25 %	50 %	150396012
19092	NC_009636	TCC	2	6	845366	845371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150396012
19093	NC_009636	GCCC	2	8	845454	845461	0 %	0 %	25 %	75 %	150396012
19094	NC_009636	CGG	2	6	845481	845486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150396012
19095	NC_009636	GCG	2	6	845507	845512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150396012
19096	NC_009636	GCCG	2	8	845541	845548	0 %	0 %	50 %	50 %	150396012
19097	NC_009636	TCT	2	6	845571	845576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150396012
19098	NC_009636	TTG	2	6	845765	845770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19099	NC_009636	GATG	2	8	845772	845779	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19100	NC_009636	GCCAT	2	10	845805	845814	20 %	20 %	20 %	40 %	150396013
19101	NC_009636	GC	3	6	845902	845907	0 %	0 %	50 %	50 %	150396013
19102	NC_009636	GCGCG	2	10	845948	845957	0 %	0 %	60 %	40 %	150396013
19103	NC_009636	CG	3	6	845999	846004	0 %	0 %	50 %	50 %	150396013
19104	NC_009636	CGAC	2	8	846029	846036	25 %	0 %	25 %	50 %	150396013
19105	NC_009636	CGA	2	6	846110	846115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150396013
19106	NC_009636	CGC	2	6	846119	846124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150396013
19107	NC_009636	TTC	2	6	846252	846257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150396013
19108	NC_009636	GTG	2	6	846354	846359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150396013
19109	NC_009636	TGA	2	6	846397	846402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150396013
19110	NC_009636	GC	3	6	846417	846422	0 %	0 %	50 %	50 %	150396013
19111	NC_009636	TCG	2	6	846442	846447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150396013
19112	NC_009636	CGA	2	6	846469	846474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150396013
19113	NC_009636	TCG	2	6	846700	846705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150396013
19114	NC_009636	GCG	3	9	846826	846834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150396013
19115	NC_009636	TTCCA	2	10	846837	846846	20 %	40 %	0 %	40 %	150396013
19116	NC_009636	TCG	2	6	846880	846885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150396013
19117	NC_009636	GCT	2	6	846992	846997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150396013
19118	NC_009636	AGC	2	6	847033	847038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150396013
19119	NC_009636	CGA	2	6	847064	847069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150396013
19120	NC_009636	GGC	2	6	847176	847181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150396013
19121	NC_009636	CTG	2	6	847194	847199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150396013
19122	NC_009636	GTC	2	6	847209	847214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150396013
19123	NC_009636	GCC	3	9	847217	847225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150396013
19124	NC_009636	GCA	2	6	847313	847318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150396013
19125	NC_009636	CGA	2	6	847400	847405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150396013
19126	NC_009636	CGA	2	6	847571	847576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150396013
19127	NC_009636	TCCT	2	8	847614	847621	0 %	50 %	0 %	50 %	150396013
19128	NC_009636	GAAG	2	8	847658	847665	50 %	0 %	50 %	0 %	150396013
19129	NC_009636	GCCG	2	8	847666	847673	0 %	0 %	50 %	50 %	150396013
19130	NC_009636	GGA	2	6	847691	847696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150396013
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19142	NC_009636	GGA	2	6	848282	848287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150396014
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19144	NC_009636	TCG	2	6	848380	848385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150396014
19145	NC_009636	CGGC	2	8	848404	848411	0 %	0 %	50 %	50 %	150396014
19146	NC_009636	CAT	2	6	848513	848518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150396014
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19149	NC_009636	CGA	2	6	848613	848618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19150	NC_009636	ATGGC	2	10	848665	848674	20 %	20 %	40 %	20 %	150396015
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19152	NC_009636	GCC	2	6	848809	848814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150396015
19153	NC_009636	CGA	2	6	848819	848824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150396015
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19155	NC_009636	GT	4	8	848904	848911	0 %	50 %	50 %	0 %	150396015
19156	NC_009636	AGAA	2	8	848988	848995	75 %	0 %	25 %	0 %	150396015
19157	NC_009636	GAT	2	6	849018	849023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150396015
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19193	NC_009636	TCG	2	6	850577	850582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19195	NC_009636	CG	3	6	850613	850618	0 %	0 %	50 %	50 %	150396017
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19219	NC_009636	CAT	2	6	851818	851823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19221	NC_009636	GT	3	6	851879	851884	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19222	NC_009636	CCGC	2	8	851893	851900	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19223	NC_009636	GAAT	2	8	851919	851926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19224	NC_009636	TGA	2	6	851933	851938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19225	NC_009636	CGA	2	6	852045	852050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150396018
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19227	NC_009636	GTG	2	6	852121	852126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150396018
19228	NC_009636	ATC	2	6	852127	852132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150396018
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19232	NC_009636	TCA	2	6	852308	852313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150396018
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19235	NC_009636	CCTGA	2	10	852388	852397	20 %	20 %	20 %	40 %	150396018
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19482	NC_009636	CAT	2	6	863413	863418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19483	NC_009636	GCC	2	6	863445	863450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19484	NC_009636	CG	3	6	863468	863473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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