MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 chromosome

Total Repeats: 84108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_009636	GAC	2	6	439814	439819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150395633
10002	NC_009636	CGG	2	6	439870	439875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150395633
10003	NC_009636	GTC	2	6	439926	439931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150395633
10004	NC_009636	GAC	2	6	440081	440086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150395633
10005	NC_009636	CGC	2	6	440140	440145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150395633
10006	NC_009636	GCA	2	6	440146	440151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150395633
10007	NC_009636	CG	4	8	440158	440165	0 %	0 %	50 %	50 %	150395633
10008	NC_009636	CTT	2	6	440182	440187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150395633
10009	NC_009636	ATG	2	6	440291	440296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150395634
10010	NC_009636	CTTC	2	8	440301	440308	0 %	50 %	0 %	50 %	150395634
10011	NC_009636	AAC	2	6	440398	440403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150395634
10012	NC_009636	ATG	3	9	440483	440491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150395634
10013	NC_009636	TTC	2	6	440506	440511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150395634
10014	NC_009636	ACG	3	9	440528	440536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150395634
10015	NC_009636	CGGA	2	8	440548	440555	25 %	0 %	50 %	25 %	150395634
10016	NC_009636	CCG	2	6	440616	440621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10017	NC_009636	CTC	2	6	440636	440641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10018	NC_009636	GCT	2	6	440676	440681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_009636	TC	3	6	440802	440807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10020	NC_009636	TCCT	2	8	440828	440835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10021	NC_009636	GCCG	2	8	440909	440916	0 %	0 %	50 %	50 %	150395635
10022	NC_009636	ACG	2	6	440919	440924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150395635
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10026	NC_009636	TCT	2	6	441168	441173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150395635
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10029	NC_009636	CGAGAC	2	12	441277	441288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150395635
10030	NC_009636	CGTTC	2	10	441334	441343	0 %	40 %	20 %	40 %	150395635
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10033	NC_009636	CGA	2	6	441649	441654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150395635
10034	NC_009636	CAGA	2	8	441676	441683	50 %	0 %	25 %	25 %	150395635
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10047	NC_009636	GCTGA	2	10	442398	442407	20 %	20 %	40 %	20 %	150395636
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10051	NC_009636	TCTT	2	8	442572	442579	0 %	75 %	0 %	25 %	150395636
10052	NC_009636	CGA	2	6	442592	442597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150395636
10053	NC_009636	CGA	2	6	442643	442648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150395636
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10055	NC_009636	CGG	2	6	442775	442780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_009636	ATC	2	6	442844	442849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_009636	ATT	2	6	442859	442864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_009636	CG	3	6	442877	442882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10059	NC_009636	GAC	2	6	442968	442973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_009636	CG	3	6	442976	442981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10061	NC_009636	TGCG	2	8	443070	443077	0 %	25 %	50 %	25 %	150395637
10062	NC_009636	GC	3	6	443143	443148	0 %	0 %	50 %	50 %	150395637
10063	NC_009636	GCCG	2	8	443156	443163	0 %	0 %	50 %	50 %	150395637
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10066	NC_009636	GGA	2	6	443443	443448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150395637
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10070	NC_009636	GGTC	2	8	443589	443596	0 %	25 %	50 %	25 %	150395637
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10074	NC_009636	CGG	3	9	443968	443976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150395637
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10078	NC_009636	CGA	2	6	444145	444150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150395637
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10081	NC_009636	CGA	2	6	444220	444225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150395637
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10101	NC_009636	TGA	2	6	444972	444977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150395637
10102	NC_009636	GAC	2	6	445015	445020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150395637
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10108	NC_009636	GAG	2	6	445433	445438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150395637
10109	NC_009636	ACG	2	6	445515	445520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150395637
10110	NC_009636	GC	3	6	445572	445577	0 %	0 %	50 %	50 %	150395637
10111	NC_009636	GGC	2	6	445621	445626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150395637
10112	NC_009636	CGT	2	6	445630	445635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150395637
10113	NC_009636	GCTC	2	8	445808	445815	0 %	25 %	25 %	50 %	150395637
10114	NC_009636	CG	4	8	445867	445874	0 %	0 %	50 %	50 %	150395637
10115	NC_009636	GCC	2	6	445880	445885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150395637
10116	NC_009636	CGGC	2	8	446025	446032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10117	NC_009636	GGAA	2	8	446034	446041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_009636	GCC	2	6	446073	446078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150395638
10119	NC_009636	GCC	2	6	446085	446090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150395638
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10121	NC_009636	CGA	2	6	446174	446179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150395638
10122	NC_009636	CCG	2	6	446205	446210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150395638
10123	NC_009636	C	6	6	446256	446261	0 %	0 %	0 %	100 %	150395638
10124	NC_009636	CAG	3	9	446265	446273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150395638
10125	NC_009636	GCA	2	6	446291	446296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150395638
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10149	NC_009636	CTG	2	6	447395	447400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10153	NC_009636	CTGG	2	8	447559	447566	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10154	NC_009636	CAAG	2	8	447598	447605	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10185	NC_009636	CGGC	2	8	448672	448679	0 %	0 %	50 %	50 %	150395641
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10231	NC_009636	TTC	2	6	450513	450518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150395642
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10233	NC_009636	GCT	2	6	450558	450563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10234	NC_009636	GCCT	2	8	450583	450590	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10235	NC_009636	GCG	2	6	450658	450663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150395643
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10239	NC_009636	TCG	2	6	450784	450789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150395643
10240	NC_009636	GC	3	6	450794	450799	0 %	0 %	50 %	50 %	150395643
10241	NC_009636	GGC	2	6	450816	450821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150395643
10242	NC_009636	GGAA	2	8	450833	450840	50 %	0 %	50 %	0 %	150395643
10243	NC_009636	GTCG	2	8	450865	450872	0 %	25 %	50 %	25 %	150395643
10244	NC_009636	ATC	2	6	451039	451044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150395643
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10257	NC_009636	TCAT	2	8	451590	451597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10273	NC_009636	TA	3	6	452534	452539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10274	NC_009636	CTTATA	2	12	452545	452556	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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10276	NC_009636	TAC	2	6	452574	452579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10278	NC_009636	TAT	2	6	452589	452594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10279	NC_009636	AAT	2	6	452695	452700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10280	NC_009636	CAGG	2	8	452704	452711	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10281	NC_009636	GGC	2	6	452718	452723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10282	NC_009636	GC	3	6	452814	452819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10283	NC_009636	TCGG	2	8	452831	452838	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10284	NC_009636	GC	4	8	452858	452865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10285	NC_009636	GTTC	2	8	452874	452881	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10286	NC_009636	GGCG	2	8	452903	452910	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10287	NC_009636	GCAA	2	8	452951	452958	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10288	NC_009636	CA	5	10	452974	452983	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10348	NC_009636	CGAT	2	8	454986	454993	25 %	25 %	25 %	25 %	150395646
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10358	NC_009636	GGA	2	6	455260	455265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150395646
10359	NC_009636	TC	3	6	455276	455281	0 %	50 %	0 %	50 %	150395646
10360	NC_009636	CCGATC	2	12	455283	455294	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	150395646
10361	NC_009636	CGC	2	6	455374	455379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150395646
10362	NC_009636	AGG	2	6	455382	455387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150395646
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10364	NC_009636	GGGC	2	8	455446	455453	0 %	0 %	75 %	25 %	150395646
10365	NC_009636	GCT	2	6	455508	455513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150395646
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10367	NC_009636	GCGG	2	8	455629	455636	0 %	0 %	75 %	25 %	150395646
10368	NC_009636	GC	3	6	455639	455644	0 %	0 %	50 %	50 %	150395646
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10481	NC_009636	CGCACG	2	12	460819	460830	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	150395651
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10483	NC_009636	GCG	2	6	460909	460914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10486	NC_009636	TCG	2	6	461065	461070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150395652
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