MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 69189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_009632	AT	3	6	529648	529653	50 %	50 %	0 %	0 %	150392976
12502	NC_009632	AAC	2	6	529698	529703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392976
12503	NC_009632	TTA	2	6	529716	529721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392976
12504	NC_009632	GCA	2	6	529814	529819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392976
12505	NC_009632	TCA	2	6	529843	529848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392976
12506	NC_009632	TGG	2	6	529888	529893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392976
12507	NC_009632	GAA	2	6	529919	529924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392976
12508	NC_009632	ATT	2	6	529937	529942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392976
12509	NC_009632	GGT	2	6	529973	529978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392976
12510	NC_009632	TTA	2	6	529986	529991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392976
12511	NC_009632	GTG	2	6	530028	530033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392976
12512	NC_009632	TGT	2	6	530038	530043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392976
12513	NC_009632	TGG	2	6	530083	530088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392976
12514	NC_009632	GTG	2	6	530139	530144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392976
12515	NC_009632	TTG	2	6	530181	530186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392976
12516	NC_009632	AAT	2	6	530189	530194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392976
12517	NC_009632	AAG	2	6	530232	530237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392976
12518	NC_009632	CATT	2	8	530244	530251	25 %	50 %	0 %	25 %	150392976
12519	NC_009632	GAA	2	6	530264	530269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392976
12520	NC_009632	CA	3	6	530277	530282	50 %	0 %	0 %	50 %	150392976
12521	NC_009632	GTC	2	6	530336	530341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392976
12522	NC_009632	ATG	2	6	530372	530377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392976
12523	NC_009632	A	6	6	530379	530384	100 %	0 %	0 %	0 %	150392976
12524	NC_009632	ATGAAG	2	12	530412	530423	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150392976
12525	NC_009632	CAT	2	6	530587	530592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392977
12526	NC_009632	CAA	2	6	530602	530607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392977
12527	NC_009632	AGA	2	6	530619	530624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392977
12528	NC_009632	ACA	2	6	530682	530687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392977
12529	NC_009632	ATC	2	6	530753	530758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392977
12530	NC_009632	TG	3	6	530851	530856	0 %	50 %	50 %	0 %	150392977
12531	NC_009632	ATT	2	6	530905	530910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392977
12532	NC_009632	CAG	2	6	530996	531001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392977
12533	NC_009632	CTG	3	9	531008	531016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392977
12534	NC_009632	CTA	2	6	531028	531033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392977
12535	NC_009632	TTA	2	6	531079	531084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392977
12536	NC_009632	CGT	2	6	531130	531135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392977
12537	NC_009632	GAA	2	6	531148	531153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392977
12538	NC_009632	TTGATA	2	12	531191	531202	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150392977
12539	NC_009632	ATG	2	6	531224	531229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392977
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12541	NC_009632	ATT	2	6	531314	531319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392977
12542	NC_009632	TGA	2	6	531354	531359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392977
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12544	NC_009632	CAT	2	6	531518	531523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392977
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12546	NC_009632	AAG	2	6	531704	531709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392977
12547	NC_009632	CTG	2	6	531728	531733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392977
12548	NC_009632	TAT	3	9	531740	531748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392977
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12550	NC_009632	GAT	2	6	531826	531831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392977
12551	NC_009632	TAA	2	6	531846	531851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392977
12552	NC_009632	TGC	2	6	531864	531869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392977
12553	NC_009632	AAG	2	6	531914	531919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392977
12554	NC_009632	TGG	2	6	531990	531995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_009632	ACGTTG	2	12	531998	532009	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12556	NC_009632	AAT	2	6	532032	532037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_009632	TATC	2	8	532042	532049	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12558	NC_009632	ACA	2	6	532095	532100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12559	NC_009632	ATTA	2	8	532106	532113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_009632	AGT	2	6	532116	532121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_009632	T	6	6	532124	532129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_009632	AT	3	6	532221	532226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_009632	AGG	2	6	532243	532248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_009632	TCC	2	6	532327	532332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12565	NC_009632	TA	4	8	532357	532364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_009632	T	6	6	532399	532404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_009632	T	7	7	532425	532431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_009632	T	6	6	532502	532507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_009632	ATG	2	6	532520	532525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_009632	TG	3	6	532533	532538	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_009632	GTG	2	6	532617	532622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12572	NC_009632	GAG	2	6	532650	532655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_009632	AAAATA	2	12	532720	532731	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_009632	TTG	2	6	532734	532739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12575	NC_009632	AT	3	6	532801	532806	50 %	50 %	0 %	0 %	150392978
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12587	NC_009632	TTGG	2	8	533325	533332	0 %	50 %	50 %	0 %	150392978
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12591	NC_009632	TAT	2	6	533626	533631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392978
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12593	NC_009632	AT	3	6	533720	533725	50 %	50 %	0 %	0 %	150392978
12594	NC_009632	CAC	2	6	533739	533744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392978
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12601	NC_009632	GTTGGT	2	12	534074	534085	0 %	50 %	50 %	0 %	150392978
12602	NC_009632	CATT	2	8	534096	534103	25 %	50 %	0 %	25 %	150392978
12603	NC_009632	GCTATT	2	12	534146	534157	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150392978
12604	NC_009632	GAAA	2	8	534211	534218	75 %	0 %	25 %	0 %	150392978
12605	NC_009632	TTG	2	6	534219	534224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392978
12606	NC_009632	TAA	2	6	534230	534235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392978
12607	NC_009632	A	6	6	534239	534244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_009632	CGTT	2	8	534249	534256	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12609	NC_009632	TTA	2	6	534270	534275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_009632	GGT	2	6	534284	534289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_009632	TG	3	6	534293	534298	0 %	50 %	50 %	0 %	150392979
12612	NC_009632	GAAA	2	8	534301	534308	75 %	0 %	25 %	0 %	150392979
12613	NC_009632	ACG	2	6	534362	534367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392979
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12622	NC_009632	GCC	2	6	534700	534705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150392979
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