MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 69189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54002	NC_009632	AT	3	6	2267350	2267355	50 %	50 %	0 %	0 %	150394624
54003	NC_009632	TAA	2	6	2267414	2267419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150394624
54004	NC_009632	TAA	2	6	2267546	2267551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150394624
54005	NC_009632	TAT	2	6	2267637	2267642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150394624
54006	NC_009632	CCA	2	6	2267691	2267696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150394624
54007	NC_009632	TG	3	6	2267700	2267705	0 %	50 %	50 %	0 %	150394624
54008	NC_009632	AAG	2	6	2267779	2267784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150394624
54009	NC_009632	ACC	2	6	2267793	2267798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150394624
54010	NC_009632	T	6	6	2267799	2267804	0 %	100 %	0 %	0 %	150394624
54011	NC_009632	TTTG	2	8	2267864	2267871	0 %	75 %	25 %	0 %	150394624
54012	NC_009632	T	7	7	2267882	2267888	0 %	100 %	0 %	0 %	150394624
54013	NC_009632	ATC	2	6	2267944	2267949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394624
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54015	NC_009632	ACA	2	6	2268081	2268086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150394625
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54017	NC_009632	GAT	2	6	2268116	2268121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150394625
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54027	NC_009632	ATCA	2	8	2268422	2268429	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54028	NC_009632	ATA	2	6	2268461	2268466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54029	NC_009632	TTG	2	6	2268498	2268503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54030	NC_009632	A	7	7	2268505	2268511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54031	NC_009632	ATA	2	6	2268600	2268605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150394626
54032	NC_009632	TTCT	2	8	2268623	2268630	0 %	75 %	0 %	25 %	150394626
54033	NC_009632	TGA	2	6	2268673	2268678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150394626
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54035	NC_009632	ATC	2	6	2268690	2268695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394626
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54055	NC_009632	TGAT	2	8	2269463	2269470	25 %	50 %	25 %	0 %	150394626
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54110	NC_009632	TAT	2	6	2272218	2272223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54118	NC_009632	TTG	2	6	2272496	2272501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150394630
54119	NC_009632	ATG	2	6	2272523	2272528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150394630
54120	NC_009632	TTC	2	6	2272529	2272534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394630
54121	NC_009632	TGA	2	6	2272602	2272607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150394630
54122	NC_009632	TAA	2	6	2272701	2272706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150394631
54123	NC_009632	TAT	2	6	2272752	2272757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150394631
54124	NC_009632	TA	4	8	2272775	2272782	50 %	50 %	0 %	0 %	150394631
54125	NC_009632	CGC	2	6	2272783	2272788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150394631
54126	NC_009632	ATTTTC	2	12	2272795	2272806	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150394631
54127	NC_009632	CAT	2	6	2272824	2272829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394631
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54129	NC_009632	CAT	2	6	2272854	2272859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394631
54130	NC_009632	TGAA	2	8	2272877	2272884	50 %	25 %	25 %	0 %	150394631
54131	NC_009632	TTA	2	6	2272913	2272918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150394631
54132	NC_009632	AGA	2	6	2272939	2272944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150394631
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54136	NC_009632	CTT	2	6	2273181	2273186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394631
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54139	NC_009632	TAA	2	6	2273317	2273322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150394631
54140	NC_009632	CTAC	2	8	2273327	2273334	25 %	25 %	0 %	50 %	150394631
54141	NC_009632	TGA	2	6	2273362	2273367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150394631
54142	NC_009632	ATAG	2	8	2273391	2273398	50 %	25 %	25 %	0 %	150394631
54143	NC_009632	AT	3	6	2273557	2273562	50 %	50 %	0 %	0 %	150394631
54144	NC_009632	CTT	2	6	2273574	2273579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394631
54145	NC_009632	TGC	2	6	2273593	2273598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150394631
54146	NC_009632	ACC	2	6	2273635	2273640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150394631
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54148	NC_009632	ATA	2	6	2273756	2273761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150394631
54149	NC_009632	TAA	2	6	2273858	2273863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150394632
54150	NC_009632	T	7	7	2273870	2273876	0 %	100 %	0 %	0 %	150394632
54151	NC_009632	ATTT	2	8	2273885	2273892	25 %	75 %	0 %	0 %	150394632
54152	NC_009632	ATT	2	6	2273896	2273901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150394632
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54154	NC_009632	TGAT	2	8	2273984	2273991	25 %	50 %	25 %	0 %	150394632
54155	NC_009632	TA	3	6	2274087	2274092	50 %	50 %	0 %	0 %	150394632
54156	NC_009632	TGG	2	6	2274093	2274098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150394632
54157	NC_009632	CTT	2	6	2274128	2274133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394632
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54172	NC_009632	CTG	2	6	2274831	2274836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150394633
54173	NC_009632	TGT	2	6	2274860	2274865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150394633
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54187	NC_009632	CTC	2	6	2275474	2275479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150394633
54188	NC_009632	CTT	3	9	2275494	2275502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394633
54189	NC_009632	ATC	2	6	2275504	2275509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394633
54190	NC_009632	TTC	2	6	2275525	2275530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394633
54191	NC_009632	TTC	2	6	2275543	2275548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394633
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54193	NC_009632	T	6	6	2275584	2275589	0 %	100 %	0 %	0 %	150394633
54194	NC_009632	ACA	2	6	2275640	2275645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150394633
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54202	NC_009632	CTA	2	6	2275853	2275858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394634
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54205	NC_009632	CTG	2	6	2275995	2276000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150394634
54206	NC_009632	CTA	2	6	2276010	2276015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394634
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54209	NC_009632	ATC	2	6	2276170	2276175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394634
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54211	NC_009632	CTT	2	6	2276222	2276227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394634
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54213	NC_009632	TTC	2	6	2276242	2276247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394634
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54215	NC_009632	TAT	2	6	2276348	2276353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54216	NC_009632	ATT	2	6	2276415	2276420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54217	NC_009632	TA	3	6	2276443	2276448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54218	NC_009632	CTT	2	6	2276468	2276473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54219	NC_009632	TAA	2	6	2276506	2276511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54220	NC_009632	AAC	2	6	2276537	2276542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54221	NC_009632	CTT	2	6	2276557	2276562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54222	NC_009632	TA	3	6	2276579	2276584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54223	NC_009632	TAC	2	6	2276589	2276594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54224	NC_009632	TAAA	2	8	2276600	2276607	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54225	NC_009632	A	6	6	2276605	2276610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54226	NC_009632	GTT	2	6	2276663	2276668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150394635
54227	NC_009632	TTG	2	6	2276688	2276693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150394635
54228	NC_009632	GCA	2	6	2276715	2276720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150394635
54229	NC_009632	CAT	2	6	2276810	2276815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394635
54230	NC_009632	GTA	3	9	2276859	2276867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150394635
54231	NC_009632	ATT	2	6	2276913	2276918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150394635
54232	NC_009632	TAAT	2	8	2276995	2277002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54233	NC_009632	TA	3	6	2277019	2277024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54234	NC_009632	TTA	2	6	2277029	2277034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150394636
54235	NC_009632	TCT	2	6	2277063	2277068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394636
54236	NC_009632	GCT	2	6	2277082	2277087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150394636
54237	NC_009632	GAA	2	6	2277089	2277094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150394636
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54243	NC_009632	GAA	2	6	2277419	2277424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150394636
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54273	NC_009632	AGTA	2	8	2278381	2278388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54274	NC_009632	ATAG	2	8	2278389	2278396	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54275	NC_009632	ATAA	2	8	2278409	2278416	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54311	NC_009632	ATTACT	2	12	2279966	2279977	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150394637
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54313	NC_009632	ATT	2	6	2280021	2280026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150394637
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54316	NC_009632	TTAT	2	8	2280055	2280062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54317	NC_009632	ACATT	2	10	2280083	2280092	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54318	NC_009632	AAAAT	2	10	2280124	2280133	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54321	NC_009632	TAAA	2	8	2280171	2280178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54322	NC_009632	CAT	2	6	2280193	2280198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54323	NC_009632	AAT	2	6	2280203	2280208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54326	NC_009632	AACT	2	8	2280404	2280411	50 %	25 %	0 %	25 %	150394638
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54328	NC_009632	GA	3	6	2280516	2280521	50 %	0 %	50 %	0 %	150394638
54329	NC_009632	TAAT	2	8	2280522	2280529	50 %	50 %	0 %	0 %	150394638
54330	NC_009632	TTC	2	6	2280569	2280574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394638
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54334	NC_009632	ATT	2	6	2280657	2280662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54335	NC_009632	AAT	2	6	2280807	2280812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150394639
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54340	NC_009632	ATT	2	6	2281176	2281181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150394639
54341	NC_009632	TGC	2	6	2281203	2281208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150394639
54342	NC_009632	AT	3	6	2281219	2281224	50 %	50 %	0 %	0 %	150394639
54343	NC_009632	TTG	2	6	2281298	2281303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150394639
54344	NC_009632	AAG	2	6	2281342	2281347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150394639
54345	NC_009632	ACT	2	6	2281360	2281365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394639
54346	NC_009632	AGC	2	6	2281377	2281382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150394639
54347	NC_009632	TTG	2	6	2281436	2281441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150394639
54348	NC_009632	TCA	2	6	2281522	2281527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394639
54349	NC_009632	TCC	2	6	2281593	2281598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150394639
54350	NC_009632	CA	3	6	2281611	2281616	50 %	0 %	0 %	50 %	150394639
54351	NC_009632	T	6	6	2281617	2281622	0 %	100 %	0 %	0 %	150394639
54352	NC_009632	CAT	2	6	2281644	2281649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394639
54353	NC_009632	TAT	2	6	2281679	2281684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150394639
54354	NC_009632	GCA	2	6	2281693	2281698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150394639
54355	NC_009632	TCT	2	6	2281762	2281767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394639
54356	NC_009632	TAA	2	6	2281836	2281841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150394639
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54359	NC_009632	ATT	2	6	2281984	2281989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54361	NC_009632	GATT	2	8	2282064	2282071	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54362	NC_009632	AT	3	6	2282097	2282102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54369	NC_009632	TATT	2	8	2282305	2282312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54370	NC_009632	A	6	6	2282326	2282331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54394	NC_009632	A	7	7	2283321	2283327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54396	NC_009632	ATA	2	6	2283435	2283440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54411	NC_009632	TTA	2	6	2284105	2284110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54449	NC_009632	AAGC	2	8	2285799	2285806	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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54452	NC_009632	TTAC	2	8	2285853	2285860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54453	NC_009632	TAAA	2	8	2285939	2285946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54454	NC_009632	A	7	7	2285944	2285950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54455	NC_009632	ATC	2	6	2286032	2286037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54457	NC_009632	A	6	6	2286057	2286062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54458	NC_009632	TCT	2	6	2286076	2286081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394643
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54460	NC_009632	TTCATC	2	12	2286114	2286125	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	150394643
54461	NC_009632	TTC	2	6	2286126	2286131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394643
54462	NC_009632	TGAT	2	8	2286148	2286155	25 %	50 %	25 %	0 %	150394643
54463	NC_009632	TTC	3	9	2286156	2286164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394643
54464	NC_009632	TCT	2	6	2286175	2286180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394643
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54466	NC_009632	ATC	2	6	2286201	2286206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394643
54467	NC_009632	ATC	2	6	2286222	2286227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394643
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54470	NC_009632	TCT	2	6	2286271	2286276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394643
54471	NC_009632	TCA	2	6	2286277	2286282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394643
54472	NC_009632	ATC	2	6	2286336	2286341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394643
54473	NC_009632	A	6	6	2286388	2286393	100 %	0 %	0 %	0 %	150394643
54474	NC_009632	TTC	2	6	2286444	2286449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394643
54475	NC_009632	GAT	2	6	2286483	2286488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150394643
54476	NC_009632	AAT	2	6	2286523	2286528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150394643
54477	NC_009632	TCA	2	6	2286556	2286561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394643
54478	NC_009632	TTTGT	2	10	2286566	2286575	0 %	80 %	20 %	0 %	150394643
54479	NC_009632	TA	4	8	2286649	2286656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54480	NC_009632	ATC	2	6	2286738	2286743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394644
54481	NC_009632	ATT	2	6	2286795	2286800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150394644
54482	NC_009632	ATC	2	6	2286814	2286819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394644
54483	NC_009632	T	6	6	2286844	2286849	0 %	100 %	0 %	0 %	150394644
54484	NC_009632	TAAG	2	8	2286852	2286859	50 %	25 %	25 %	0 %	150394644
54485	NC_009632	AGC	2	6	2286924	2286929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150394644
54486	NC_009632	ATCA	2	8	2286984	2286991	50 %	25 %	0 %	25 %	150394644
54487	NC_009632	TCT	2	6	2287033	2287038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394644
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54489	NC_009632	CTA	3	9	2287181	2287189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394644
54490	NC_009632	GAT	2	6	2287196	2287201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150394644
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54492	NC_009632	A	6	6	2287362	2287367	100 %	0 %	0 %	0 %	150394644
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54495	NC_009632	CAT	2	6	2287430	2287435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394644
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54497	NC_009632	AT	3	6	2287461	2287466	50 %	50 %	0 %	0 %	150394644
54498	NC_009632	TTG	2	6	2287467	2287472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150394644
54499	NC_009632	TTCA	2	8	2287476	2287483	25 %	50 %	0 %	25 %	150394644
54500	NC_009632	TCA	2	6	2287516	2287521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394644

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