MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED01

Total Repeats: 35057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_009620	CGC	2	6	582168	582173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376259
13002	NC_009620	CTGC	2	8	582186	582193	0 %	25 %	25 %	50 %	150376259
13003	NC_009620	GTC	2	6	582259	582264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376259
13004	NC_009620	CGG	2	6	582267	582272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376259
13005	NC_009620	CGG	2	6	582285	582290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376259
13006	NC_009620	CTG	2	6	582328	582333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376259
13007	NC_009620	ACG	2	6	582355	582360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376259
13008	NC_009620	GAG	2	6	582370	582375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150376259
13009	NC_009620	GCT	2	6	582405	582410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376259
13010	NC_009620	ATG	2	6	582418	582423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376259
13011	NC_009620	GC	3	6	582447	582452	0 %	0 %	50 %	50 %	150376259
13012	NC_009620	CG	4	8	582517	582524	0 %	0 %	50 %	50 %	150376260
13013	NC_009620	GC	3	6	582579	582584	0 %	0 %	50 %	50 %	150376260
13014	NC_009620	TGC	2	6	582790	582795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376260
13015	NC_009620	TGA	2	6	582823	582828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376260
13016	NC_009620	GCC	2	6	582839	582844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376260
13017	NC_009620	G	6	6	582848	582853	0 %	0 %	100 %	0 %	150376260
13018	NC_009620	GTG	2	6	582870	582875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150376260
13019	NC_009620	CGC	2	6	582932	582937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376260
13020	NC_009620	CGG	2	6	582978	582983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376260
13021	NC_009620	TCGCC	2	10	583043	583052	0 %	20 %	20 %	60 %	150376260
13022	NC_009620	GCG	2	6	583117	583122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376260
13023	NC_009620	TGC	2	6	583128	583133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376260
13024	NC_009620	CCG	2	6	583158	583163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376260
13025	NC_009620	TCG	2	6	583174	583179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376260
13026	NC_009620	AGG	2	6	583218	583223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150376260
13027	NC_009620	CG	3	6	583240	583245	0 %	0 %	50 %	50 %	150376260
13028	NC_009620	GTC	2	6	583254	583259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376260
13029	NC_009620	CCG	2	6	583296	583301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376260
13030	NC_009620	GAC	2	6	583304	583309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376260
13031	NC_009620	CTT	2	6	583356	583361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150376260
13032	NC_009620	GGCG	2	8	583370	583377	0 %	0 %	75 %	25 %	150376260
13033	NC_009620	GGGA	2	8	583503	583510	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_009620	TCG	2	6	583551	583556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376261
13035	NC_009620	CG	3	6	583697	583702	0 %	0 %	50 %	50 %	150376261
13036	NC_009620	GCC	2	6	583730	583735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376261
13037	NC_009620	TC	3	6	583756	583761	0 %	50 %	0 %	50 %	150376261
13038	NC_009620	GCA	2	6	583821	583826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376261
13039	NC_009620	GC	3	6	583859	583864	0 %	0 %	50 %	50 %	150376261
13040	NC_009620	TGC	2	6	583887	583892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376261
13041	NC_009620	CCGG	2	8	584001	584008	0 %	0 %	50 %	50 %	150376261
13042	NC_009620	CG	4	8	584017	584024	0 %	0 %	50 %	50 %	150376261
13043	NC_009620	GCG	2	6	584082	584087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376261
13044	NC_009620	ATG	2	6	584102	584107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376261
13045	NC_009620	GC	3	6	584126	584131	0 %	0 %	50 %	50 %	150376261
13046	NC_009620	CCG	2	6	584269	584274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376261
13047	NC_009620	GAG	2	6	584321	584326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150376261
13048	NC_009620	TGA	2	6	584337	584342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376261
13049	NC_009620	CGA	2	6	584349	584354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376261
13050	NC_009620	CCT	2	6	584355	584360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150376261
13051	NC_009620	CTCG	2	8	584431	584438	0 %	25 %	25 %	50 %	150376261
13052	NC_009620	TGG	2	6	584496	584501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150376261
13053	NC_009620	GGA	2	6	584539	584544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150376261
13054	NC_009620	GAC	2	6	584630	584635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376261
13055	NC_009620	GC	3	6	584741	584746	0 %	0 %	50 %	50 %	150376261
13056	NC_009620	CGG	2	6	584772	584777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13057	NC_009620	CG	3	6	584789	584794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13058	NC_009620	TCG	2	6	584811	584816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_009620	CAG	2	6	584836	584841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_009620	GCA	2	6	584846	584851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_009620	TCG	2	6	584867	584872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_009620	CAA	2	6	584956	584961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13063	NC_009620	CCG	4	12	584984	584995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13064	NC_009620	ATG	2	6	585011	585016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_009620	GC	3	6	585059	585064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13066	NC_009620	AGC	2	6	585065	585070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_009620	CGA	2	6	585096	585101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_009620	GAG	2	6	585143	585148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_009620	CGG	2	6	585170	585175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13070	NC_009620	CG	3	6	585176	585181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13071	NC_009620	AAC	2	6	585280	585285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13072	NC_009620	CCG	2	6	585289	585294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13073	NC_009620	GACGC	2	10	585357	585366	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13074	NC_009620	TCA	2	6	585383	585388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13075	NC_009620	GAC	2	6	585437	585442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13076	NC_009620	GAT	2	6	585444	585449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_009620	CGA	2	6	585488	585493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13078	NC_009620	GTC	2	6	585520	585525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13079	NC_009620	GAG	2	6	585543	585548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_009620	GCC	2	6	585574	585579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13081	NC_009620	CTG	2	6	585680	585685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376262
13082	NC_009620	CGA	2	6	585718	585723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376262
13083	NC_009620	CGG	2	6	585801	585806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376262
13084	NC_009620	TGG	2	6	585884	585889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150376262
13085	NC_009620	GAC	2	6	585959	585964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13086	NC_009620	TCA	2	6	586037	586042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150376263
13087	NC_009620	GAG	2	6	586147	586152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150376263
13088	NC_009620	GC	3	6	586207	586212	0 %	0 %	50 %	50 %	150376263
13089	NC_009620	CGC	2	6	586251	586256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376263
13090	NC_009620	TAT	2	6	586258	586263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150376263
13091	NC_009620	GCT	2	6	586323	586328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376263
13092	NC_009620	CGC	2	6	586430	586435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376263
13093	NC_009620	GCGCG	2	10	586497	586506	0 %	0 %	60 %	40 %	150376263
13094	NC_009620	TCC	2	6	586520	586525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150376263
13095	NC_009620	GCCGC	2	10	586553	586562	0 %	0 %	40 %	60 %	150376263
13096	NC_009620	CAG	2	6	586573	586578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376263
13097	NC_009620	GCC	2	6	586598	586603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376263
13098	NC_009620	GCG	2	6	586622	586627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376263
13099	NC_009620	AGGC	2	8	586634	586641	25 %	0 %	50 %	25 %	150376263
13100	NC_009620	GC	3	6	586683	586688	0 %	0 %	50 %	50 %	150376263
13101	NC_009620	CCG	2	6	586695	586700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376263
13102	NC_009620	CGA	2	6	586701	586706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376263
13103	NC_009620	GAT	2	6	586714	586719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376263
13104	NC_009620	GAA	2	6	586741	586746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150376263
13105	NC_009620	GAT	2	6	586896	586901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376263
13106	NC_009620	GCA	2	6	586946	586951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376263
13107	NC_009620	GAT	2	6	586998	587003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376263
13108	NC_009620	CGG	2	6	587005	587010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376263
13109	NC_009620	CAAG	2	8	587013	587020	50 %	0 %	25 %	25 %	150376263
13110	NC_009620	CGAC	2	8	587024	587031	25 %	0 %	25 %	50 %	150376263
13111	NC_009620	GTG	2	6	587062	587067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150376263
13112	NC_009620	TCGCC	2	10	587219	587228	0 %	20 %	20 %	60 %	150376263
13113	NC_009620	GTGCCG	2	12	587260	587271	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	150376263
13114	NC_009620	CCT	2	6	587346	587351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150376263
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13116	NC_009620	TCT	2	6	587450	587455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150376263
13117	NC_009620	GAC	2	6	587457	587462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376263
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13119	NC_009620	TCG	2	6	587507	587512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376263
13120	NC_009620	TGA	2	6	587522	587527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376263
13121	NC_009620	CCG	2	6	587530	587535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376263
13122	NC_009620	CGA	3	9	587568	587576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376263
13123	NC_009620	TCC	2	6	587605	587610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150376263
13124	NC_009620	TCG	2	6	587630	587635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376263
13125	NC_009620	CGC	2	6	587673	587678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376263
13126	NC_009620	TTC	2	6	587716	587721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150376263
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13128	NC_009620	CTG	2	6	587905	587910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376263
13129	NC_009620	ATC	2	6	587944	587949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150376263
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13132	NC_009620	GGC	2	6	587997	588002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376263
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13137	NC_009620	GCT	2	6	588174	588179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376263
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13142	NC_009620	TGG	2	6	588329	588334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150376263
13143	NC_009620	TCGT	2	8	588356	588363	0 %	50 %	25 %	25 %	150376263
13144	NC_009620	TGC	2	6	588383	588388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376263
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13147	NC_009620	CGG	2	6	588522	588527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376263
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13149	NC_009620	CGG	2	6	588619	588624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376264
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13152	NC_009620	CGA	2	6	588916	588921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376264
13153	NC_009620	TTC	2	6	588980	588985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150376264
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13156	NC_009620	CAG	2	6	589139	589144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376264
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13159	NC_009620	GGC	2	6	589283	589288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376264
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13192	NC_009620	CG	4	8	590690	590697	0 %	0 %	50 %	50 %	150376266
13193	NC_009620	CGT	2	6	590753	590758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376266
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13223	NC_009620	TGA	2	6	591995	592000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376266
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13225	NC_009620	TTG	2	6	592120	592125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150376266
13226	NC_009620	CCT	2	6	592145	592150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150376266
13227	NC_009620	CACG	2	8	592175	592182	25 %	0 %	25 %	50 %	150376266
13228	NC_009620	TCGC	2	8	592248	592255	0 %	25 %	25 %	50 %	150376266
13229	NC_009620	GGC	2	6	592287	592292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376266
13230	NC_009620	ACG	2	6	592345	592350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376266
13231	NC_009620	TCT	2	6	592385	592390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150376266
13232	NC_009620	GAAAAT	2	12	592394	592405	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150376266
13233	NC_009620	TCG	2	6	592453	592458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376266
13234	NC_009620	GCC	2	6	592467	592472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376266
13235	NC_009620	CGT	2	6	592479	592484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376266
13236	NC_009620	CCA	2	6	592525	592530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150376266
13237	NC_009620	TGG	2	6	592559	592564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150376266
13238	NC_009620	GCA	2	6	592606	592611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13239	NC_009620	GGTT	2	8	592655	592662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13240	NC_009620	CCG	2	6	592663	592668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13241	NC_009620	GCG	2	6	592750	592755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13242	NC_009620	GATCG	2	10	592766	592775	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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13345	NC_009620	CTTT	2	8	597758	597765	0 %	75 %	0 %	25 %	150376272
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13363	NC_009620	GTC	2	6	598416	598421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376273
13364	NC_009620	ATGC	2	8	598449	598456	25 %	25 %	25 %	25 %	150376273
13365	NC_009620	TGGA	2	8	598458	598465	25 %	25 %	50 %	0 %	150376273
13366	NC_009620	GAT	2	6	598487	598492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376273
13367	NC_009620	ATC	2	6	598584	598589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150376273
13368	NC_009620	CGG	2	6	598594	598599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376273
13369	NC_009620	GCA	2	6	598618	598623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376273
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13399	NC_009620	TCG	2	6	599702	599707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13400	NC_009620	CTG	2	6	599740	599745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13401	NC_009620	ATG	2	6	599771	599776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13403	NC_009620	GAC	2	6	599818	599823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13405	NC_009620	GGC	2	6	599878	599883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13407	NC_009620	AAAT	2	8	599946	599953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13408	NC_009620	ATA	2	6	599965	599970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13450	NC_009620	GTC	2	6	601484	601489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376275
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13467	NC_009620	GCGG	2	8	602124	602131	0 %	0 %	75 %	25 %	150376275
13468	NC_009620	AACG	2	8	602214	602221	50 %	0 %	25 %	25 %	150376275
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13471	NC_009620	CCT	2	6	602379	602384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150376275
13472	NC_009620	CGC	2	6	602397	602402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376275
13473	NC_009620	TGC	2	6	602408	602413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376275
13474	NC_009620	TGA	2	6	602591	602596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376275
13475	NC_009620	CAG	2	6	602617	602622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376275
13476	NC_009620	TTCG	2	8	602644	602651	0 %	50 %	25 %	25 %	150376275
13477	NC_009620	GCG	2	6	602681	602686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376275
13478	NC_009620	TTCGAC	2	12	602716	602727	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150376275
13479	NC_009620	TCG	2	6	602744	602749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376275
13480	NC_009620	CCA	3	9	602798	602806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150376275
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13482	NC_009620	CGG	2	6	602841	602846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376275
13483	NC_009620	GAG	2	6	602854	602859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150376275
13484	NC_009620	ACGG	2	8	602911	602918	25 %	0 %	50 %	25 %	150376275
13485	NC_009620	GATA	2	8	603009	603016	50 %	25 %	25 %	0 %	150376275
13486	NC_009620	GCC	2	6	603043	603048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376275
13487	NC_009620	CGG	2	6	603052	603057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376275
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