MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED01

Total Repeats: 35057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_009620	TGC	2	6	454313	454318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376145
10002	NC_009620	CGC	2	6	454325	454330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376145
10003	NC_009620	TTCG	2	8	454346	454353	0 %	50 %	25 %	25 %	150376145
10004	NC_009620	ATC	2	6	454381	454386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150376145
10005	NC_009620	GCCC	2	8	454388	454395	0 %	0 %	25 %	75 %	150376145
10006	NC_009620	GCGG	2	8	454505	454512	0 %	0 %	75 %	25 %	150376145
10007	NC_009620	GCCG	2	8	454584	454591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10008	NC_009620	GAG	2	6	454592	454597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_009620	GAG	2	6	454635	454640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_009620	GAAT	2	8	454644	454651	50 %	25 %	25 %	0 %	150376146
10011	NC_009620	GAA	2	6	454676	454681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150376146
10012	NC_009620	GGC	2	6	454702	454707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376146
10013	NC_009620	GCA	2	6	454717	454722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376146
10014	NC_009620	ATC	2	6	454763	454768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150376146
10015	NC_009620	CTG	2	6	454828	454833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376146
10016	NC_009620	ATG	2	6	454895	454900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376146
10017	NC_009620	C	6	6	454921	454926	0 %	0 %	0 %	100 %	150376146
10018	NC_009620	CGGATC	2	12	454944	454955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150376146
10019	NC_009620	GGC	2	6	455011	455016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376146
10020	NC_009620	CTT	2	6	455041	455046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150376146
10021	NC_009620	GCG	2	6	455117	455122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376146
10022	NC_009620	GGC	2	6	455123	455128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376146
10023	NC_009620	GAT	2	6	455134	455139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376146
10024	NC_009620	CGC	2	6	455200	455205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376146
10025	NC_009620	TGA	2	6	455229	455234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376146
10026	NC_009620	ATG	2	6	455438	455443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376146
10027	NC_009620	TGGC	2	8	455481	455488	0 %	25 %	50 %	25 %	150376146
10028	NC_009620	ACGG	2	8	455528	455535	25 %	0 %	50 %	25 %	150376146
10029	NC_009620	ACC	2	6	455579	455584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150376146
10030	NC_009620	TGA	2	6	455622	455627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376146
10031	NC_009620	GGC	2	6	455648	455653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376146
10032	NC_009620	CTGC	2	8	455674	455681	0 %	25 %	25 %	50 %	150376146
10033	NC_009620	CGT	2	6	455719	455724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376146
10034	NC_009620	CCG	2	6	455806	455811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376146
10035	NC_009620	GAT	2	6	455848	455853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376146
10036	NC_009620	CGT	2	6	455857	455862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376146
10037	NC_009620	TTC	2	6	455906	455911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150376146
10038	NC_009620	GCG	2	6	455916	455921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376146
10039	NC_009620	CGG	2	6	455940	455945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376146
10040	NC_009620	TGC	2	6	455946	455951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376146
10041	NC_009620	CTG	2	6	455957	455962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376146
10042	NC_009620	CGG	2	6	455978	455983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376146
10043	NC_009620	TGGC	2	8	456133	456140	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10044	NC_009620	CCG	2	6	456176	456181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10045	NC_009620	CCG	2	6	456200	456205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10046	NC_009620	CGG	2	6	456220	456225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_009620	GCCG	2	8	456263	456270	0 %	0 %	50 %	50 %	150376147
10048	NC_009620	TCC	2	6	456294	456299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150376147
10049	NC_009620	CGGA	2	8	456374	456381	25 %	0 %	50 %	25 %	150376147
10050	NC_009620	GGA	2	6	456406	456411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150376147
10051	NC_009620	GAA	2	6	456413	456418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150376147
10052	NC_009620	ATG	2	6	456441	456446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376147
10053	NC_009620	GTC	2	6	456464	456469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376147
10054	NC_009620	GA	3	6	456492	456497	50 %	0 %	50 %	0 %	150376147
10055	NC_009620	CAT	2	6	456562	456567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150376147
10056	NC_009620	GAT	2	6	456568	456573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376147
10057	NC_009620	GGT	3	9	456574	456582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150376147
10058	NC_009620	GTG	4	12	456590	456601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150376147
10059	NC_009620	ATCGAG	2	12	456602	456613	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150376147
10060	NC_009620	TGA	3	9	456784	456792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376147
10061	NC_009620	CGG	2	6	456799	456804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376147
10062	NC_009620	CGA	2	6	456805	456810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376147
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10064	NC_009620	GAA	2	6	456938	456943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150376147
10065	NC_009620	GGGTC	2	10	456958	456967	0 %	20 %	60 %	20 %	150376147
10066	NC_009620	CGA	2	6	456985	456990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376147
10067	NC_009620	CGA	2	6	457060	457065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376147
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10070	NC_009620	TCC	2	6	457104	457109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150376147
10071	NC_009620	GCCGT	2	10	457178	457187	0 %	20 %	40 %	40 %	150376147
10072	NC_009620	TCAG	2	8	457188	457195	25 %	25 %	25 %	25 %	150376147
10073	NC_009620	CGT	2	6	457211	457216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376147
10074	NC_009620	TGGT	2	8	457275	457282	0 %	50 %	50 %	0 %	150376147
10075	NC_009620	TCGTT	2	10	457296	457305	0 %	60 %	20 %	20 %	150376148
10076	NC_009620	ATG	2	6	457354	457359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376148
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10079	NC_009620	GAT	2	6	457414	457419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376148
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10082	NC_009620	CGA	2	6	457530	457535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376148
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10084	NC_009620	CTG	2	6	457606	457611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376148
10085	NC_009620	GCC	2	6	457615	457620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376148
10086	NC_009620	GGAT	2	8	457646	457653	25 %	25 %	50 %	0 %	150376148
10087	NC_009620	GCG	2	6	457739	457744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376148
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10090	NC_009620	CGA	2	6	457860	457865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376148
10091	NC_009620	G	6	6	457914	457919	0 %	0 %	100 %	0 %	150376148
10092	NC_009620	CCTG	2	8	457935	457942	0 %	25 %	25 %	50 %	150376148
10093	NC_009620	GCC	2	6	457952	457957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376148
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10100	NC_009620	CGC	2	6	458249	458254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376148
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10103	NC_009620	CGA	2	6	458343	458348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376148
10104	NC_009620	TCA	2	6	458391	458396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150376148
10105	NC_009620	GCC	2	6	458432	458437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376148
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10107	NC_009620	ACG	2	6	458474	458479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376148
10108	NC_009620	GCA	2	6	458573	458578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376148
10109	NC_009620	CGA	2	6	458652	458657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376148
10110	NC_009620	GCC	2	6	458716	458721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376148
10111	NC_009620	TTCC	2	8	458731	458738	0 %	50 %	0 %	50 %	150376148
10112	NC_009620	AGC	2	6	458780	458785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376148
10113	NC_009620	GC	3	6	458784	458789	0 %	0 %	50 %	50 %	150376148
10114	NC_009620	CGA	2	6	458847	458852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376148
10115	NC_009620	TTGCCG	2	12	458945	458956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376148
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10118	NC_009620	CGG	2	6	459127	459132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376148
10119	NC_009620	CCGC	2	8	459207	459214	0 %	0 %	25 %	75 %	150376148
10120	NC_009620	CGG	2	6	459243	459248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376148
10121	NC_009620	GCG	2	6	459324	459329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376148
10122	NC_009620	GCA	2	6	459339	459344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376148
10123	NC_009620	CG	3	6	459345	459350	0 %	0 %	50 %	50 %	150376148
10124	NC_009620	TGG	2	6	459359	459364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150376148
10125	NC_009620	AGCGCC	2	12	459389	459400	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	150376148
10126	NC_009620	GC	3	6	459424	459429	0 %	0 %	50 %	50 %	150376148
10127	NC_009620	TGC	2	6	459441	459446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376148
10128	NC_009620	CGC	2	6	459499	459504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376148
10129	NC_009620	ACG	2	6	459551	459556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376148
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10131	NC_009620	TCC	2	6	459628	459633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150376149
10132	NC_009620	GAT	2	6	459654	459659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376149
10133	NC_009620	CTCG	2	8	459717	459724	0 %	25 %	25 %	50 %	150376149
10134	NC_009620	CAG	2	6	459741	459746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376149
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10138	NC_009620	CTG	2	6	459816	459821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376149
10139	NC_009620	CGC	2	6	459873	459878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376149
10140	NC_009620	CGG	2	6	459890	459895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376149
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10145	NC_009620	CGG	2	6	460146	460151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376150
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10149	NC_009620	GCG	2	6	460385	460390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376150
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10152	NC_009620	TGC	2	6	460513	460518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376150
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10156	NC_009620	CGAAG	2	10	460735	460744	40 %	0 %	40 %	20 %	150376150
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10164	NC_009620	CGC	2	6	460987	460992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10187	NC_009620	CAA	2	6	461834	461839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10192	NC_009620	AT	4	8	462142	462149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10193	NC_009620	TTA	2	6	462150	462155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10194	NC_009620	TCA	2	6	462166	462171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10196	NC_009620	GGC	2	6	462248	462253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376152
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10211	NC_009620	CG	3	6	463137	463142	0 %	0 %	50 %	50 %	150376152
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10214	NC_009620	GCT	2	6	463252	463257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376152
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10219	NC_009620	TGCA	2	8	463430	463437	25 %	25 %	25 %	25 %	150376152
10220	NC_009620	GGCC	2	8	463451	463458	0 %	0 %	50 %	50 %	150376152
10221	NC_009620	GCA	2	6	463463	463468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376152
10222	NC_009620	CAA	2	6	463524	463529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10223	NC_009620	ATG	2	6	463545	463550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10224	NC_009620	GAG	2	6	463563	463568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10225	NC_009620	CAT	2	6	463569	463574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150376153
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10227	NC_009620	AGA	2	6	463585	463590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150376153
10228	NC_009620	CGG	2	6	463604	463609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376153
10229	NC_009620	GGA	2	6	463698	463703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150376153
10230	NC_009620	CAG	2	6	463783	463788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376153
10231	NC_009620	GCCA	2	8	463825	463832	25 %	0 %	25 %	50 %	150376153
10232	NC_009620	CGC	2	6	463875	463880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376153
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10234	NC_009620	TCG	2	6	464033	464038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376153
10235	NC_009620	AGG	2	6	464063	464068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150376153
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10237	NC_009620	TCG	2	6	464369	464374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376153
10238	NC_009620	CGA	2	6	464399	464404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376153
10239	NC_009620	CCG	2	6	464614	464619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10240	NC_009620	TCGA	2	8	464658	464665	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10241	NC_009620	GCA	2	6	464706	464711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10242	NC_009620	C	6	6	464754	464759	0 %	0 %	0 %	100 %	150376154
10243	NC_009620	TGCGG	2	10	464846	464855	0 %	20 %	60 %	20 %	150376154
10244	NC_009620	ACG	2	6	464877	464882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376154
10245	NC_009620	CG	4	8	464881	464888	0 %	0 %	50 %	50 %	150376154
10246	NC_009620	TTC	2	6	464946	464951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150376154
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10248	NC_009620	GCA	2	6	465006	465011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376154
10249	NC_009620	GCCGCG	2	12	465050	465061	0 %	0 %	50 %	50 %	150376154
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10253	NC_009620	GAC	2	6	465202	465207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376154
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10262	NC_009620	CGG	2	6	465563	465568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376154
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10273	NC_009620	CTG	2	6	466063	466068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376155
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10297	NC_009620	GCATC	2	10	467005	467014	20 %	20 %	20 %	40 %	150376156
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10327	NC_009620	ACGG	2	8	468370	468377	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10328	NC_009620	GGC	2	6	468488	468493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376157
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10346	NC_009620	ATCG	2	8	469367	469374	25 %	25 %	25 %	25 %	150376158
10347	NC_009620	CTC	2	6	469393	469398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150376158
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10349	NC_009620	GCA	2	6	469439	469444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376158
10350	NC_009620	TCCCG	2	10	469446	469455	0 %	20 %	20 %	60 %	150376158
10351	NC_009620	GGC	2	6	469468	469473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376158
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10356	NC_009620	CG	3	6	469738	469743	0 %	0 %	50 %	50 %	150376158
10357	NC_009620	GCC	2	6	469763	469768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376158
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10360	NC_009620	TCGC	2	8	469958	469965	0 %	25 %	25 %	50 %	150376158
10361	NC_009620	TGC	2	6	469969	469974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376158
10362	NC_009620	CCGA	2	8	470015	470022	25 %	0 %	25 %	50 %	150376158
10363	NC_009620	GTG	2	6	470028	470033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150376158
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10409	NC_009620	CG	3	6	471859	471864	0 %	0 %	50 %	50 %	150376160
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10465	NC_009620	CGG	2	6	474478	474483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376162
10466	NC_009620	TGC	2	6	474494	474499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376162
10467	NC_009620	AGCGGC	2	12	474503	474514	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	150376162
10468	NC_009620	AGA	2	6	474525	474530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150376162
10469	NC_009620	TCC	2	6	474549	474554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150376162
10470	NC_009620	GCC	2	6	474578	474583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376162
10471	NC_009620	GCC	2	6	474679	474684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10472	NC_009620	CCAG	2	8	474715	474722	25 %	0 %	25 %	50 %	150376163
10473	NC_009620	CGG	2	6	474766	474771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376163
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10476	NC_009620	GCAG	2	8	474981	474988	25 %	0 %	50 %	25 %	150376163
10477	NC_009620	CG	3	6	475003	475008	0 %	0 %	50 %	50 %	150376163
10478	NC_009620	CGA	2	6	475044	475049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376163
10479	NC_009620	GGT	2	6	475114	475119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150376163
10480	NC_009620	TCG	2	6	475127	475132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376163
10481	NC_009620	CTGCG	2	10	475168	475177	0 %	20 %	40 %	40 %	150376163
10482	NC_009620	CGAT	2	8	475184	475191	25 %	25 %	25 %	25 %	150376163
10483	NC_009620	CATG	2	8	475206	475213	25 %	25 %	25 %	25 %	150376163
10484	NC_009620	TGG	2	6	475238	475243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150376163
10485	NC_009620	CAG	2	6	475338	475343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376163
10486	NC_009620	GC	3	6	475354	475359	0 %	0 %	50 %	50 %	150376163
10487	NC_009620	GGC	2	6	475413	475418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376163
10488	NC_009620	TCG	2	6	475463	475468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376163
10489	NC_009620	CG	3	6	475467	475472	0 %	0 %	50 %	50 %	150376163
10490	NC_009620	CCG	3	9	475586	475594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376164
10491	NC_009620	GCCGCA	2	12	475603	475614	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	150376164
10492	NC_009620	TCG	2	6	475694	475699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376164
10493	NC_009620	CGC	2	6	475761	475766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376164
10494	NC_009620	GCG	2	6	475805	475810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376164
10495	NC_009620	GCC	2	6	475930	475935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376164
10496	NC_009620	TCG	2	6	475949	475954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376164
10497	NC_009620	GGC	2	6	475990	475995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376164
10498	NC_009620	TGC	2	6	476001	476006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376164
10499	NC_009620	TCG	2	6	476042	476047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376164
10500	NC_009620	CCGT	3	12	476117	476128	0 %	25 %	25 %	50 %	150376164

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