MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 plasmid pSJH101

Total Repeats: 791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009619	AGT	2	6	4	9	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009619	T	6	6	17	22	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009619	ATTA	2	8	47	54	50 %	50 %	0 %	0 %	150375693
4	NC_009619	TTG	2	6	56	61	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150375693
5	NC_009619	ACAGC	2	10	92	101	40 %	0 %	20 %	40 %	150375693
6	NC_009619	TGA	2	6	105	110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375693
7	NC_009619	ATG	2	6	119	124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375693
8	NC_009619	CCT	2	6	154	159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_009619	CT	3	6	158	163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009619	GA	3	6	180	185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009619	TAT	3	9	196	204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009619	GTC	2	6	243	248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009619	TA	3	6	255	260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009619	T	6	6	267	272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009619	CAAGA	2	10	280	289	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009619	CT	3	6	331	336	0 %	50 %	0 %	50 %	150375694
17	NC_009619	TAA	2	6	351	356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375694
18	NC_009619	AAT	2	6	357	362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375694
19	NC_009619	TA	3	6	405	410	50 %	50 %	0 %	0 %	150375694
20	NC_009619	ATG	2	6	421	426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375694
21	NC_009619	AC	3	6	473	478	50 %	0 %	0 %	50 %	150375694
22	NC_009619	TCT	2	6	485	490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375694
23	NC_009619	ATA	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375694
24	NC_009619	TCT	2	6	519	524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375694
25	NC_009619	T	6	6	534	539	0 %	100 %	0 %	0 %	150375694
26	NC_009619	ATC	2	6	568	573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375694
27	NC_009619	A	6	6	578	583	100 %	0 %	0 %	0 %	150375694
28	NC_009619	ATCAC	2	10	620	629	40 %	20 %	0 %	40 %	150375694
29	NC_009619	AAT	3	9	709	717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375695
30	NC_009619	TA	3	6	733	738	50 %	50 %	0 %	0 %	150375695
31	NC_009619	AAT	2	6	739	744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375695
32	NC_009619	CAA	2	6	771	776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150375695
33	NC_009619	AAG	2	6	824	829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375695
34	NC_009619	AAAATT	2	12	830	841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375695
35	NC_009619	AGTA	2	8	856	863	50 %	25 %	25 %	0 %	150375695
36	NC_009619	TTCA	2	8	979	986	25 %	50 %	0 %	25 %	150375695
37	NC_009619	T	6	6	991	996	0 %	100 %	0 %	0 %	150375695
38	NC_009619	CT	3	6	999	1004	0 %	50 %	0 %	50 %	150375695
39	NC_009619	ATC	2	6	1018	1023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375695
40	NC_009619	ACTA	2	8	1123	1130	50 %	25 %	0 %	25 %	150375695
41	NC_009619	ATA	2	6	1139	1144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375695
42	NC_009619	A	6	6	1204	1209	100 %	0 %	0 %	0 %	150375695
43	NC_009619	TAA	2	6	1213	1218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375695
44	NC_009619	TAA	2	6	1225	1230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375695
45	NC_009619	CTG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375695
46	NC_009619	CAG	3	9	1257	1265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375695
47	NC_009619	CAA	2	6	1266	1271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150375695
48	NC_009619	ATA	2	6	1283	1288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375695
49	NC_009619	TAT	2	6	1316	1321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009619	AAT	2	6	1336	1341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009619	TTC	2	6	1471	1476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009619	T	6	6	1491	1496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009619	TTA	2	6	1596	1601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009619	ATAA	2	8	1631	1638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009619	TCG	2	6	1711	1716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009619	TCG	2	6	1793	1798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009619	T	7	7	1800	1806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009619	AATT	2	8	1854	1861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009619	CTA	2	6	1876	1881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009619	T	6	6	1920	1925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009619	CGA	2	6	1935	1940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009619	GAAA	2	8	1950	1957	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009619	AATA	2	8	1958	1965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009619	GAAA	2	8	1974	1981	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009619	T	6	6	2014	2019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009619	TA	3	6	2094	2099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009619	AAAT	2	8	2125	2132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009619	AT	3	6	2131	2136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009619	CAAAAA	2	12	2145	2156	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_009619	CAAGA	2	10	2282	2291	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009619	A	7	7	2315	2321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009619	ATCTA	2	10	2328	2337	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_009619	ATT	2	6	2387	2392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009619	CTTT	2	8	2403	2410	0 %	75 %	0 %	25 %	150375696
75	NC_009619	A	7	7	2470	2476	100 %	0 %	0 %	0 %	150375696
76	NC_009619	TCA	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375696
77	NC_009619	TAAAA	2	10	2502	2511	80 %	20 %	0 %	0 %	150375696
78	NC_009619	A	6	6	2508	2513	100 %	0 %	0 %	0 %	150375696
79	NC_009619	TA	3	6	2568	2573	50 %	50 %	0 %	0 %	150375696
80	NC_009619	TCAT	2	8	2587	2594	25 %	50 %	0 %	25 %	150375696
81	NC_009619	AT	3	6	2627	2632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009619	AAAT	2	8	2635	2642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009619	CTTA	2	8	2660	2667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009619	TTA	2	6	2683	2688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009619	ATT	2	6	2718	2723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375697
86	NC_009619	AAT	2	6	2727	2732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375697
87	NC_009619	GAA	2	6	2785	2790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375697
88	NC_009619	A	6	6	2792	2797	100 %	0 %	0 %	0 %	150375697
89	NC_009619	AAGA	2	8	2863	2870	75 %	0 %	25 %	0 %	150375697
90	NC_009619	A	6	6	2935	2940	100 %	0 %	0 %	0 %	150375697
91	NC_009619	A	7	7	2950	2956	100 %	0 %	0 %	0 %	150375697
92	NC_009619	AGA	2	6	2964	2969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375697
93	NC_009619	TAA	2	6	3036	3041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375697
94	NC_009619	A	6	6	3056	3061	100 %	0 %	0 %	0 %	150375697
95	NC_009619	AT	3	6	3088	3093	50 %	50 %	0 %	0 %	150375697
96	NC_009619	ACA	2	6	3101	3106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150375697
97	NC_009619	A	7	7	3106	3112	100 %	0 %	0 %	0 %	150375697
98	NC_009619	A	6	6	3131	3136	100 %	0 %	0 %	0 %	150375697
99	NC_009619	TTA	2	6	3170	3175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375697
100	NC_009619	GTA	2	6	3269	3274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375697
101	NC_009619	ACT	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375697
102	NC_009619	CGG	2	6	3336	3341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375697
103	NC_009619	TTC	2	6	3518	3523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009619	T	6	6	3538	3543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009619	TTAT	2	8	3564	3571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009619	A	6	6	3578	3583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009619	AT	3	6	3595	3600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009619	TG	3	6	3611	3616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009619	TC	3	6	3718	3723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009619	TTA	2	6	3745	3750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009619	AAAT	2	8	3866	3873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009619	AT	3	6	3872	3877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009619	CAAA	2	8	3888	3895	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009619	T	6	6	3920	3925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009619	TTTAA	2	10	4035	4044	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009619	TACA	2	8	4185	4192	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009619	T	6	6	4220	4225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009619	A	7	7	4239	4245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009619	ATA	2	6	4272	4277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009619	T	7	7	4320	4326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009619	TCA	2	6	4347	4352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009619	CCA	2	6	4422	4427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_009619	T	7	7	4485	4491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009619	CGT	2	6	4492	4497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009619	GAT	2	6	4515	4520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009619	ATT	2	6	4568	4573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375698
127	NC_009619	ATATT	2	10	4582	4591	40 %	60 %	0 %	0 %	150375698
128	NC_009619	TTC	2	6	4629	4634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375698
129	NC_009619	T	6	6	4722	4727	0 %	100 %	0 %	0 %	150375698
130	NC_009619	AAG	2	6	4739	4744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375698
131	NC_009619	T	7	7	4809	4815	0 %	100 %	0 %	0 %	150375698
132	NC_009619	TAA	2	6	4866	4871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375698
133	NC_009619	TTAG	2	8	4876	4883	25 %	50 %	25 %	0 %	150375698
134	NC_009619	ATC	2	6	4917	4922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375698
135	NC_009619	TCAT	2	8	4996	5003	25 %	50 %	0 %	25 %	150375698
136	NC_009619	ATT	2	6	5007	5012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375698
137	NC_009619	CTTC	2	8	5141	5148	0 %	50 %	0 %	50 %	150375698
138	NC_009619	TCT	2	6	5173	5178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375698
139	NC_009619	TTTA	2	8	5241	5248	25 %	75 %	0 %	0 %	150375698
140	NC_009619	CGT	2	6	5254	5259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375698
141	NC_009619	T	7	7	5292	5298	0 %	100 %	0 %	0 %	150375698
142	NC_009619	CTTTT	2	10	5310	5319	0 %	80 %	0 %	20 %	150375698
143	NC_009619	T	6	6	5316	5321	0 %	100 %	0 %	0 %	150375698
144	NC_009619	TCA	2	6	5380	5385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375698
145	NC_009619	TTAG	2	8	5452	5459	25 %	50 %	25 %	0 %	150375698
146	NC_009619	TCTT	2	8	5508	5515	0 %	75 %	0 %	25 %	150375698
147	NC_009619	A	6	6	5556	5561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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