MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 chromosome

Total Repeats: 158435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_009511	GC	3	6	542747	542752	0 %	0 %	50 %	50 %	148553427
16003	NC_009511	GCT	2	6	542822	542827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553427
16004	NC_009511	CCG	2	6	542828	542833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553427
16005	NC_009511	GC	4	8	542845	542852	0 %	0 %	50 %	50 %	148553427
16006	NC_009511	CCG	3	9	542947	542955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553427
16007	NC_009511	CCG	2	6	542975	542980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553427
16008	NC_009511	CGGCG	2	10	542984	542993	0 %	0 %	60 %	40 %	148553427
16009	NC_009511	TCG	2	6	542995	543000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553427
16010	NC_009511	TGG	2	6	543018	543023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148553427
16011	NC_009511	CGA	2	6	543044	543049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553427
16012	NC_009511	CATC	2	8	543059	543066	25 %	25 %	0 %	50 %	148553427
16013	NC_009511	GCT	2	6	543116	543121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553427
16014	NC_009511	CG	3	6	543125	543130	0 %	0 %	50 %	50 %	148553427
16015	NC_009511	CGG	2	6	543142	543147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553427
16016	NC_009511	GGC	3	9	543162	543170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553427
16017	NC_009511	CGC	3	9	543188	543196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553427
16018	NC_009511	GC	3	6	543250	543255	0 %	0 %	50 %	50 %	148553427
16019	NC_009511	GC	3	6	543260	543265	0 %	0 %	50 %	50 %	148553427
16020	NC_009511	GCC	2	6	543273	543278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553427
16021	NC_009511	GGC	2	6	543280	543285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553427
16022	NC_009511	GGC	2	6	543330	543335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553427
16023	NC_009511	CCG	2	6	543337	543342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553427
16024	NC_009511	CG	3	6	543369	543374	0 %	0 %	50 %	50 %	148553427
16025	NC_009511	CGA	2	6	543380	543385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553427
16026	NC_009511	TCGC	2	8	543399	543406	0 %	25 %	25 %	50 %	148553427
16027	NC_009511	GCG	2	6	543417	543422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553427
16028	NC_009511	GCT	2	6	543428	543433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553427
16029	NC_009511	CAC	2	6	543444	543449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148553427
16030	NC_009511	CGG	2	6	543484	543489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553427
16031	NC_009511	CGCC	2	8	543494	543501	0 %	0 %	25 %	75 %	148553427
16032	NC_009511	GCG	2	6	543507	543512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553427
16033	NC_009511	CGG	2	6	543536	543541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553427
16034	NC_009511	ATCTCG	2	12	543544	543555	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148553427
16035	NC_009511	GCGGT	2	10	543577	543586	0 %	20 %	60 %	20 %	148553427
16036	NC_009511	GCC	2	6	543596	543601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16037	NC_009511	CCCCA	2	10	543607	543616	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
16038	NC_009511	CAT	2	6	543652	543657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553428
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16040	NC_009511	CGA	2	6	543681	543686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553428
16041	NC_009511	CG	3	6	543689	543694	0 %	0 %	50 %	50 %	148553428
16042	NC_009511	CAT	2	6	543817	543822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553428
16043	NC_009511	CGT	2	6	543904	543909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553428
16044	NC_009511	CAT	2	6	543935	543940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553428
16045	NC_009511	CGC	3	9	543990	543998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553428
16046	NC_009511	CCGC	2	8	544002	544009	0 %	0 %	25 %	75 %	148553428
16047	NC_009511	CAT	2	6	544042	544047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553428
16048	NC_009511	CGA	2	6	544063	544068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553428
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16050	NC_009511	GTC	2	6	544127	544132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553428
16051	NC_009511	CGAAC	2	10	544138	544147	40 %	0 %	20 %	40 %	148553428
16052	NC_009511	GCA	2	6	544189	544194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553428
16053	NC_009511	GAC	2	6	544229	544234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553428
16054	NC_009511	GACC	2	8	544252	544259	25 %	0 %	25 %	50 %	148553428
16055	NC_009511	GTC	2	6	544316	544321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553428
16056	NC_009511	CTA	2	6	544342	544347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553428
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16058	NC_009511	CTC	2	6	544414	544419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148553428
16059	NC_009511	CG	3	6	544441	544446	0 %	0 %	50 %	50 %	148553428
16060	NC_009511	GAG	2	6	544466	544471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148553428
16061	NC_009511	TCG	2	6	544491	544496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553428
16062	NC_009511	GTG	2	6	544514	544519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148553428
16063	NC_009511	GTC	2	6	544540	544545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553428
16064	NC_009511	CCGG	2	8	544555	544562	0 %	0 %	50 %	50 %	148553428
16065	NC_009511	CTT	2	6	544597	544602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148553428
16066	NC_009511	GC	3	6	544612	544617	0 %	0 %	50 %	50 %	148553428
16067	NC_009511	CG	3	6	544623	544628	0 %	0 %	50 %	50 %	148553428
16068	NC_009511	CGG	2	6	544663	544668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16069	NC_009511	AAG	2	6	544680	544685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16070	NC_009511	CCATGG	2	12	544765	544776	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148553429
16071	NC_009511	GGA	2	6	544814	544819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148553429
16072	NC_009511	TCG	2	6	544834	544839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553429
16073	NC_009511	TCGA	2	8	544908	544915	25 %	25 %	25 %	25 %	148553429
16074	NC_009511	GGC	3	9	544916	544924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553429
16075	NC_009511	TCG	2	6	544974	544979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553429
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16080	NC_009511	GC	3	6	545179	545184	0 %	0 %	50 %	50 %	148553429
16081	NC_009511	CCA	2	6	545206	545211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148553429
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16083	NC_009511	TCG	2	6	545290	545295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553429
16084	NC_009511	GCT	2	6	545303	545308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553429
16085	NC_009511	CAA	2	6	545378	545383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148553429
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16087	NC_009511	GCC	2	6	545501	545506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553429
16088	NC_009511	GC	3	6	545509	545514	0 %	0 %	50 %	50 %	148553429
16089	NC_009511	GACC	2	8	545519	545526	25 %	0 %	25 %	50 %	148553429
16090	NC_009511	TGC	2	6	545527	545532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553429
16091	NC_009511	CCG	2	6	545539	545544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553429
16092	NC_009511	TTC	2	6	545652	545657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148553429
16093	NC_009511	CCGG	2	8	545758	545765	0 %	0 %	50 %	50 %	148553429
16094	NC_009511	GACC	2	8	545798	545805	25 %	0 %	25 %	50 %	148553429
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16099	NC_009511	CGA	2	6	545996	546001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553429
16100	NC_009511	GACC	2	8	546011	546018	25 %	0 %	25 %	50 %	148553429
16101	NC_009511	CGG	2	6	546121	546126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553429
16102	NC_009511	GCG	2	6	546142	546147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553429
16103	NC_009511	GAG	2	6	546189	546194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148553429
16104	NC_009511	GC	3	6	546256	546261	0 %	0 %	50 %	50 %	148553429
16105	NC_009511	ATC	2	6	546324	546329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553429
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16107	NC_009511	ACGAC	2	10	546448	546457	40 %	0 %	20 %	40 %	148553429
16108	NC_009511	CGGC	2	8	546478	546485	0 %	0 %	50 %	50 %	148553429
16109	NC_009511	CGG	3	9	546532	546540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553429
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16112	NC_009511	GCG	2	6	546809	546814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553429
16113	NC_009511	CCGG	2	8	546826	546833	0 %	0 %	50 %	50 %	148553429
16114	NC_009511	GCGG	2	8	546852	546859	0 %	0 %	75 %	25 %	148553430
16115	NC_009511	CGT	2	6	546861	546866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553430
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16119	NC_009511	CGGCC	2	10	546984	546993	0 %	0 %	40 %	60 %	148553430
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16222	NC_009511	AGA	2	6	550287	550292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148553432
16223	NC_009511	GAT	2	6	550360	550365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148553432
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16225	NC_009511	TCG	3	9	550409	550417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553432
16226	NC_009511	GACGGT	2	12	550426	550437	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148553432
16227	NC_009511	CG	3	6	550495	550500	0 %	0 %	50 %	50 %	148553432
16228	NC_009511	GAA	2	6	550543	550548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148553432
16229	NC_009511	GTG	2	6	550552	550557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148553432
16230	NC_009511	GC	3	6	550558	550563	0 %	0 %	50 %	50 %	148553432
16231	NC_009511	GCC	2	6	550597	550602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553432
16232	NC_009511	GC	3	6	550604	550609	0 %	0 %	50 %	50 %	148553432
16233	NC_009511	CGA	2	6	550621	550626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553432
16234	NC_009511	GCG	2	6	550731	550736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553432
16235	NC_009511	CTTC	2	8	550758	550765	0 %	50 %	0 %	50 %	148553432
16236	NC_009511	GCG	2	6	550786	550791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553432
16237	NC_009511	CGG	2	6	550854	550859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16238	NC_009511	TCG	2	6	550873	550878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16239	NC_009511	GCCC	2	8	550908	550915	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16240	NC_009511	ATG	2	6	550934	550939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148553433
16241	NC_009511	TCGCA	2	10	550992	551001	20 %	20 %	20 %	40 %	148553433
16242	NC_009511	GCCCG	2	10	551012	551021	0 %	0 %	40 %	60 %	148553433
16243	NC_009511	GCG	2	6	551064	551069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553433
16244	NC_009511	TGCCA	2	10	551072	551081	20 %	20 %	20 %	40 %	148553433
16245	NC_009511	CGC	2	6	551115	551120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553433
16246	NC_009511	GCTATC	2	12	551136	551147	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148553433
16247	NC_009511	CGA	2	6	551161	551166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553433
16248	NC_009511	TCG	2	6	551184	551189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553433
16249	NC_009511	GCCG	2	8	551224	551231	0 %	0 %	50 %	50 %	148553433
16250	NC_009511	GC	3	6	551285	551290	0 %	0 %	50 %	50 %	148553433
16251	NC_009511	CG	3	6	551296	551301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16252	NC_009511	GGC	2	6	551336	551341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553434
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16254	NC_009511	GCG	2	6	551393	551398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553434
16255	NC_009511	GGC	2	6	551419	551424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553434
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16258	NC_009511	GCTG	2	8	551491	551498	0 %	25 %	50 %	25 %	148553434
16259	NC_009511	GCTC	2	8	551500	551507	0 %	25 %	25 %	50 %	148553434
16260	NC_009511	GCG	2	6	551605	551610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553434
16261	NC_009511	CAGCG	2	10	551649	551658	20 %	0 %	40 %	40 %	148553434
16262	NC_009511	CGGG	2	8	551674	551681	0 %	0 %	75 %	25 %	148553434
16263	NC_009511	GCCG	3	12	551686	551697	0 %	0 %	50 %	50 %	148553434
16264	NC_009511	CCA	2	6	551704	551709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148553434
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16278	NC_009511	GTC	2	6	552190	552195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553435
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16280	NC_009511	CG	3	6	552301	552306	0 %	0 %	50 %	50 %	148553435
16281	NC_009511	AAAGG	2	10	552391	552400	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16282	NC_009511	G	7	7	552443	552449	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16283	NC_009511	GTC	3	9	552482	552490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553436
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16285	NC_009511	CAT	2	6	552506	552511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553436
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16289	NC_009511	ATG	2	6	552723	552728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148553436
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16309	NC_009511	CTG	2	6	553748	553753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553437
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16314	NC_009511	CG	3	6	553871	553876	0 %	0 %	50 %	50 %	148553437
16315	NC_009511	TCG	2	6	553897	553902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553437
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16349	NC_009511	CGG	2	6	555007	555012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553437
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16352	NC_009511	CGA	3	9	555055	555063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553437
16353	NC_009511	TCG	2	6	555082	555087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553437
16354	NC_009511	CGG	2	6	555103	555108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553437
16355	NC_009511	CGG	2	6	555111	555116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553437
16356	NC_009511	CGGCCA	2	12	555154	555165	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148553437
16357	NC_009511	GCA	2	6	555175	555180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553437
16358	NC_009511	AGC	2	6	555186	555191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553437
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16360	NC_009511	TCG	2	6	555246	555251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553437
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16362	NC_009511	CGG	2	6	555322	555327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553437
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16389	NC_009511	CCG	2	6	556174	556179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553438
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16455	NC_009511	CCGC	2	8	558275	558282	0 %	0 %	25 %	75 %	148553439
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16464	NC_009511	CGT	2	6	558549	558554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553439
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16468	NC_009511	ATC	2	6	558652	558657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553439
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16471	NC_009511	ACCG	2	8	558700	558707	25 %	0 %	25 %	50 %	148553439
16472	NC_009511	CAGC	2	8	558759	558766	25 %	0 %	25 %	50 %	148553439
16473	NC_009511	CCT	2	6	558770	558775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148553439
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16475	NC_009511	GCA	2	6	558859	558864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553440
16476	NC_009511	GCT	3	9	558868	558876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553440
16477	NC_009511	CTT	2	6	558923	558928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148553440
16478	NC_009511	GCCAGC	2	12	558936	558947	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148553440
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16480	NC_009511	CG	4	8	559042	559049	0 %	0 %	50 %	50 %	148553440
16481	NC_009511	AGC	3	9	559053	559061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553440
16482	NC_009511	CCAG	2	8	559129	559136	25 %	0 %	25 %	50 %	148553440
16483	NC_009511	GTC	2	6	559142	559147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553440
16484	NC_009511	CGAT	2	8	559171	559178	25 %	25 %	25 %	25 %	148553440
16485	NC_009511	GAA	2	6	559235	559240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148553440
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