MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 chromosome

Total Repeats: 158435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_009511	CTGG	2	8	272894	272901	0 %	25 %	50 %	25 %	148553191
8003	NC_009511	CG	3	6	272935	272940	0 %	0 %	50 %	50 %	148553191
8004	NC_009511	CGG	2	6	272974	272979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553191
8005	NC_009511	CAG	2	6	273005	273010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553191
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8012	NC_009511	GGC	2	6	273234	273239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553191
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8017	NC_009511	TCG	3	9	273384	273392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553191
8018	NC_009511	CTG	2	6	273410	273415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553191
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8022	NC_009511	CGG	2	6	273606	273611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553191
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8056	NC_009511	GCGG	2	8	274460	274467	0 %	0 %	75 %	25 %	148553192
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8121	NC_009511	GAT	2	6	276872	276877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148553192
8122	NC_009511	CGG	3	9	276884	276892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553192
8123	NC_009511	AGC	2	6	276898	276903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553192
8124	NC_009511	CAGGAT	2	12	276945	276956	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148553192
8125	NC_009511	CGC	2	6	276984	276989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553192
8126	NC_009511	GCT	2	6	277085	277090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553192
8127	NC_009511	ATC	2	6	277201	277206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553192
8128	NC_009511	CTC	2	6	277227	277232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148553192
8129	NC_009511	CGG	2	6	277248	277253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553192
8130	NC_009511	GGCCG	2	10	277303	277312	0 %	0 %	60 %	40 %	148553192
8131	NC_009511	CGATC	2	10	277344	277353	20 %	20 %	20 %	40 %	148553192
8132	NC_009511	TCC	2	6	277399	277404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148553192
8133	NC_009511	CTG	2	6	277422	277427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553192
8134	NC_009511	AGC	2	6	277435	277440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553192
8135	NC_009511	CGT	2	6	277478	277483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553192
8136	NC_009511	CTCGGC	2	12	277548	277559	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148553192
8137	NC_009511	TCCTCG	2	12	277576	277587	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148553192
8138	NC_009511	CAG	2	6	277614	277619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553192
8139	NC_009511	TCT	2	6	277655	277660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148553192
8140	NC_009511	GCA	2	6	277673	277678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553192
8141	NC_009511	GTC	3	9	277707	277715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553192
8142	NC_009511	GCGG	2	8	277728	277735	0 %	0 %	75 %	25 %	148553192
8143	NC_009511	GGC	2	6	277772	277777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553192
8144	NC_009511	CGG	3	9	277793	277801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553192
8145	NC_009511	GCG	2	6	277825	277830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553192
8146	NC_009511	GC	3	6	277851	277856	0 %	0 %	50 %	50 %	148553192
8147	NC_009511	CAT	2	6	277899	277904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553192
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8149	NC_009511	CGA	2	6	277934	277939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553192
8150	NC_009511	AGGC	2	8	277960	277967	25 %	0 %	50 %	25 %	148553192
8151	NC_009511	GAT	2	6	277989	277994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148553192
8152	NC_009511	CGG	2	6	278044	278049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553192
8153	NC_009511	CG	3	6	278050	278055	0 %	0 %	50 %	50 %	148553192
8154	NC_009511	TGG	2	6	278164	278169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148553192
8155	NC_009511	GGT	2	6	278187	278192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148553192
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8158	NC_009511	CGC	3	9	278402	278410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553192
8159	NC_009511	GAT	2	6	278415	278420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148553192
8160	NC_009511	TCG	2	6	278443	278448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553192
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8163	NC_009511	CG	4	8	278555	278562	0 %	0 %	50 %	50 %	148553192
8164	NC_009511	GCG	3	9	278560	278568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553192
8165	NC_009511	CG	3	6	278570	278575	0 %	0 %	50 %	50 %	148553192
8166	NC_009511	GGGC	2	8	278609	278616	0 %	0 %	75 %	25 %	148553192
8167	NC_009511	CGG	2	6	278633	278638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553192
8168	NC_009511	GC	3	6	278644	278649	0 %	0 %	50 %	50 %	148553192
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8171	NC_009511	CCGCG	2	10	278714	278723	0 %	0 %	40 %	60 %	148553192
8172	NC_009511	CGC	2	6	278807	278812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553192
8173	NC_009511	TGC	2	6	278874	278879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553192
8174	NC_009511	CG	3	6	278895	278900	0 %	0 %	50 %	50 %	148553192
8175	NC_009511	GAT	2	6	278926	278931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148553192
8176	NC_009511	CCG	2	6	279016	279021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8177	NC_009511	GGA	2	6	279112	279117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8178	NC_009511	GAA	2	6	279137	279142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148553193
8179	NC_009511	GAC	2	6	279162	279167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553193
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8182	NC_009511	CG	3	6	279210	279215	0 %	0 %	50 %	50 %	148553193
8183	NC_009511	GCC	2	6	279251	279256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553193
8184	NC_009511	GCCG	2	8	279263	279270	0 %	0 %	50 %	50 %	148553193
8185	NC_009511	CGG	2	6	279281	279286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553193
8186	NC_009511	GC	3	6	279295	279300	0 %	0 %	50 %	50 %	148553193
8187	NC_009511	GAG	2	6	279312	279317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148553193
8188	NC_009511	CG	3	6	279339	279344	0 %	0 %	50 %	50 %	148553193
8189	NC_009511	AGC	2	6	279352	279357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553193
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8192	NC_009511	GCG	3	9	279429	279437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553193
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8195	NC_009511	CGAGGC	2	12	279587	279598	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148553193
8196	NC_009511	GC	3	6	279605	279610	0 %	0 %	50 %	50 %	148553193
8197	NC_009511	GCT	2	6	279620	279625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553193
8198	NC_009511	TGA	2	6	279643	279648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148553193
8199	NC_009511	CGA	2	6	279659	279664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553193
8200	NC_009511	GATC	2	8	279667	279674	25 %	25 %	25 %	25 %	148553193
8201	NC_009511	CGG	2	6	279682	279687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553193
8202	NC_009511	GGC	2	6	279692	279697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553193
8203	NC_009511	GGCAT	2	10	279712	279721	20 %	20 %	40 %	20 %	148553193
8204	NC_009511	CCAC	2	8	279722	279729	25 %	0 %	0 %	75 %	148553193
8205	NC_009511	CGA	2	6	279748	279753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553193
8206	NC_009511	GCGG	2	8	279797	279804	0 %	0 %	75 %	25 %	148553193
8207	NC_009511	GGC	2	6	279819	279824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553193
8208	NC_009511	TCG	2	6	279841	279846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553193
8209	NC_009511	CGG	2	6	279857	279862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553193
8210	NC_009511	CGGC	3	12	279939	279950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8211	NC_009511	GGC	2	6	280030	280035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553194
8212	NC_009511	CGC	2	6	280045	280050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553194
8213	NC_009511	CGGCG	2	10	280081	280090	0 %	0 %	60 %	40 %	148553194
8214	NC_009511	TCG	2	6	280110	280115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553194
8215	NC_009511	CGG	2	6	280138	280143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553194
8216	NC_009511	CGG	2	6	280152	280157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553194
8217	NC_009511	CGG	2	6	280164	280169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553194
8218	NC_009511	TCG	2	6	280185	280190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553194
8219	NC_009511	TGC	2	6	280191	280196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553194
8220	NC_009511	GC	3	6	280206	280211	0 %	0 %	50 %	50 %	148553194
8221	NC_009511	GC	4	8	280223	280230	0 %	0 %	50 %	50 %	148553194
8222	NC_009511	TCC	2	6	280248	280253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148553194
8223	NC_009511	CGG	2	6	280260	280265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553194
8224	NC_009511	TCG	2	6	280269	280274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553194
8225	NC_009511	CGC	2	6	280337	280342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553194
8226	NC_009511	GCGA	2	8	280352	280359	25 %	0 %	50 %	25 %	148553194
8227	NC_009511	CCG	2	6	280362	280367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553194
8228	NC_009511	CTG	2	6	280379	280384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553194
8229	NC_009511	CGAGGC	2	12	280480	280491	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148553194
8230	NC_009511	CTT	2	6	280510	280515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148553194
8231	NC_009511	GGC	2	6	280534	280539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553194
8232	NC_009511	CGG	3	9	280548	280556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553194
8233	NC_009511	AGG	2	6	280575	280580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148553194
8234	NC_009511	GAG	3	9	280589	280597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148553194
8235	NC_009511	AGC	2	6	280713	280718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553194
8236	NC_009511	GC	3	6	280717	280722	0 %	0 %	50 %	50 %	148553194
8237	NC_009511	GCTCC	2	10	280735	280744	0 %	20 %	20 %	60 %	148553194
8238	NC_009511	CGAT	2	8	280760	280767	25 %	25 %	25 %	25 %	148553194
8239	NC_009511	TGG	2	6	280791	280796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148553194
8240	NC_009511	CG	4	8	280804	280811	0 %	0 %	50 %	50 %	148553194
8241	NC_009511	ATC	2	6	280817	280822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553194
8242	NC_009511	GCC	3	9	280832	280840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553194
8243	NC_009511	GCGGAG	2	12	280859	280870	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	148553194
8244	NC_009511	GCA	2	6	280878	280883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553194
8245	NC_009511	GC	3	6	280946	280951	0 %	0 %	50 %	50 %	148553194
8246	NC_009511	CAT	2	6	280966	280971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553194
8247	NC_009511	GTCG	2	8	281032	281039	0 %	25 %	50 %	25 %	148553194
8248	NC_009511	CGAGGC	2	12	281041	281052	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148553194
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8250	NC_009511	CG	3	6	281152	281157	0 %	0 %	50 %	50 %	148553194
8251	NC_009511	GGT	2	6	281221	281226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148553194
8252	NC_009511	GCGA	2	8	281312	281319	25 %	0 %	50 %	25 %	148553194
8253	NC_009511	GC	3	6	281326	281331	0 %	0 %	50 %	50 %	148553194
8254	NC_009511	CGG	2	6	281345	281350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553194
8255	NC_009511	CGC	2	6	281419	281424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553194
8256	NC_009511	GC	3	6	281442	281447	0 %	0 %	50 %	50 %	148553194
8257	NC_009511	GGCCG	2	10	281488	281497	0 %	0 %	60 %	40 %	148553194
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8261	NC_009511	GGCG	2	8	281707	281714	0 %	0 %	75 %	25 %	148553194
8262	NC_009511	TCG	2	6	281748	281753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553194
8263	NC_009511	GGC	2	6	281762	281767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553194
8264	NC_009511	CGG	3	9	281791	281799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553194
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8272	NC_009511	CAG	3	9	282045	282053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553195
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8274	NC_009511	ATC	2	6	282084	282089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553195
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8279	NC_009511	CGGC	2	8	282215	282222	0 %	0 %	50 %	50 %	148553195
8280	NC_009511	GGC	2	6	282233	282238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553195
8281	NC_009511	GC	3	6	282237	282242	0 %	0 %	50 %	50 %	148553195
8282	NC_009511	GC	3	6	282279	282284	0 %	0 %	50 %	50 %	148553195
8283	NC_009511	CAA	2	6	282323	282328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148553195
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8285	NC_009511	TGA	2	6	282388	282393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148553195
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8288	NC_009511	GATC	2	8	282485	282492	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8290	NC_009511	CTG	2	6	282524	282529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8291	NC_009511	ATG	2	6	282542	282547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8292	NC_009511	GAC	2	6	282618	282623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553196
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8322	NC_009511	ACA	2	6	283919	283924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148553196
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8327	NC_009511	CTTG	2	8	284166	284173	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8328	NC_009511	CTTG	2	8	284179	284186	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8329	NC_009511	CGG	2	6	284198	284203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8330	NC_009511	GCC	2	6	284214	284219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8331	NC_009511	CCG	2	6	284231	284236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8332	NC_009511	AGT	2	6	284273	284278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8333	NC_009511	TGC	2	6	284289	284294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8334	NC_009511	GCCG	2	8	284303	284310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8335	NC_009511	T	6	6	284318	284323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8336	NC_009511	GCC	2	6	284342	284347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8337	NC_009511	CAT	2	6	284451	284456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553197
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8340	NC_009511	TGCGC	2	10	284580	284589	0 %	20 %	40 %	40 %	148553197
8341	NC_009511	ACG	2	6	284590	284595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553197
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8343	NC_009511	CGG	2	6	284668	284673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553197
8344	NC_009511	ATC	2	6	284683	284688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553197
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8348	NC_009511	CG	3	6	284894	284899	0 %	0 %	50 %	50 %	148553197
8349	NC_009511	CGC	2	6	284912	284917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553197
8350	NC_009511	GAT	2	6	284976	284981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148553197
8351	NC_009511	GGC	2	6	284992	284997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553197
8352	NC_009511	TTC	2	6	285001	285006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148553197
8353	NC_009511	GCTCGC	2	12	285072	285083	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148553197
8354	NC_009511	CCGG	2	8	285168	285175	0 %	0 %	50 %	50 %	148553197
8355	NC_009511	CGCTTC	2	12	285193	285204	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148553197
8356	NC_009511	CCG	2	6	285255	285260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553197
8357	NC_009511	GCT	2	6	285267	285272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553197
8358	NC_009511	GCT	3	9	285276	285284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553197
8359	NC_009511	GCT	2	6	285312	285317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553197
8360	NC_009511	CGGC	2	8	285343	285350	0 %	0 %	50 %	50 %	148553197
8361	NC_009511	GGCGC	2	10	285363	285372	0 %	0 %	60 %	40 %	148553197
8362	NC_009511	CCG	2	6	285398	285403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553197
8363	NC_009511	CGATCG	2	12	285404	285415	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148553197
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8365	NC_009511	ATC	2	6	285439	285444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553197
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8485	NC_009511	GATCAG	2	12	289945	289956	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148553201
8486	NC_009511	CGT	2	6	289983	289988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553201
8487	NC_009511	CAG	2	6	290029	290034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553201
8488	NC_009511	CCA	2	6	290044	290049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148553201
8489	NC_009511	GCG	2	6	290052	290057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553201
8490	NC_009511	AGC	2	6	290102	290107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553201
8491	NC_009511	CAG	2	6	290122	290127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553201
8492	NC_009511	GCG	2	6	290151	290156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553201
8493	NC_009511	AGA	2	6	290157	290162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148553201
8494	NC_009511	CGG	2	6	290205	290210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553201
8495	NC_009511	CAT	2	6	290227	290232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553201
8496	NC_009511	CGACGC	2	12	290241	290252	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148553201
8497	NC_009511	GAT	2	6	290254	290259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148553201
8498	NC_009511	GGA	2	6	290284	290289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148553201
8499	NC_009511	CCA	2	6	290302	290307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148553201
8500	NC_009511	GAT	2	6	290323	290328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148553201

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