MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 plasmid pSWIT02

Total Repeats: 4771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009508	ACC	3	9	186163	186171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148551021
4002	NC_009508	AGC	2	6	186352	186357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551021
4003	NC_009508	CG	3	6	186383	186388	0 %	0 %	50 %	50 %	148551021
4004	NC_009508	AAC	2	6	186391	186396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148551021
4005	NC_009508	GCA	2	6	186416	186421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551021
4006	NC_009508	CCA	2	6	186467	186472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148551021
4007	NC_009508	GCC	2	6	186531	186536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551021
4008	NC_009508	ATC	2	6	186555	186560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148551021
4009	NC_009508	CGA	2	6	186682	186687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551021
4010	NC_009508	GCGG	2	8	186726	186733	0 %	0 %	75 %	25 %	148551021
4011	NC_009508	TCG	2	6	186763	186768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551021
4012	NC_009508	GTCG	2	8	186801	186808	0 %	25 %	50 %	25 %	148551021
4013	NC_009508	TCC	2	6	186829	186834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148551021
4014	NC_009508	CCG	2	6	186836	186841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551021
4015	NC_009508	GTT	2	6	186897	186902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148551021
4016	NC_009508	CGT	2	6	186938	186943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551021
4017	NC_009508	GGCATC	2	12	186966	186977	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148551021
4018	NC_009508	GC	3	6	187025	187030	0 %	0 %	50 %	50 %	148551021
4019	NC_009508	CGC	2	6	187085	187090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551021
4020	NC_009508	CTC	2	6	187186	187191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148551021
4021	NC_009508	ACG	2	6	187290	187295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551021
4022	NC_009508	GCG	2	6	187305	187310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148551021
4023	NC_009508	CCGC	2	8	187364	187371	0 %	0 %	25 %	75 %	148551021
4024	NC_009508	GCC	2	6	187381	187386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551021
4025	NC_009508	GAAG	2	8	187468	187475	50 %	0 %	50 %	0 %	148551021
4026	NC_009508	TCGC	2	8	187483	187490	0 %	25 %	25 %	50 %	148551021
4027	NC_009508	CGC	2	6	187527	187532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551021
4028	NC_009508	ACCGGG	2	12	187537	187548	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148551021
4029	NC_009508	TGA	2	6	187582	187587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148551021
4030	NC_009508	CGA	2	6	187662	187667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_009508	CTC	2	6	187675	187680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_009508	GTT	2	6	187697	187702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_009508	CAA	2	6	187755	187760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_009508	CGC	2	6	187804	187809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_009508	CAG	2	6	187836	187841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_009508	CG	3	6	187925	187930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_009508	CGC	2	6	187982	187987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_009508	GCT	3	9	188044	188052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551022
4039	NC_009508	ACG	2	6	188077	188082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551022
4040	NC_009508	GTGCAG	2	12	188133	188144	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148551022
4041	NC_009508	ACC	2	6	188165	188170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148551022
4042	NC_009508	GCT	2	6	188243	188248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551022
4043	NC_009508	CGA	2	6	188279	188284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551022
4044	NC_009508	TCG	2	6	188297	188302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551022
4045	NC_009508	CCG	2	6	188344	188349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551022
4046	NC_009508	GAC	2	6	188397	188402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551022
4047	NC_009508	TCG	2	6	188452	188457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551022
4048	NC_009508	CGC	2	6	188477	188482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551022
4049	NC_009508	A	6	6	188549	188554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_009508	GCG	3	9	188588	188596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_009508	ACT	2	6	188610	188615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_009508	GCT	2	6	188633	188638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_009508	AGC	2	6	188757	188762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_009508	GTC	2	6	188776	188781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_009508	GCGCG	2	10	188839	188848	0 %	0 %	60 %	40 %	148551023
4056	NC_009508	CAC	2	6	188859	188864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148551023
4057	NC_009508	CG	3	6	188875	188880	0 %	0 %	50 %	50 %	148551023
4058	NC_009508	ACG	2	6	188916	188921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551023
4059	NC_009508	GTT	2	6	188925	188930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148551023
4060	NC_009508	TGA	2	6	188957	188962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148551023
4061	NC_009508	CA	3	6	188973	188978	50 %	0 %	0 %	50 %	148551023
4062	NC_009508	CGG	2	6	188996	189001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148551023
4063	NC_009508	AC	3	6	189080	189085	50 %	0 %	0 %	50 %	148551023
4064	NC_009508	C	6	6	189085	189090	0 %	0 %	0 %	100 %	148551023
4065	NC_009508	CTC	2	6	189171	189176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4066	NC_009508	CCT	2	6	189202	189207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4067	NC_009508	GC	3	6	189303	189308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4068	NC_009508	ATA	2	6	189342	189347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_009508	GCC	2	6	189436	189441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4070	NC_009508	TCG	2	6	189449	189454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_009508	CGG	2	6	189499	189504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_009508	TAAA	2	8	189541	189548	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_009508	TTGG	2	8	189671	189678	0 %	50 %	50 %	0 %	148551024
4074	NC_009508	CTTC	2	8	189716	189723	0 %	50 %	0 %	50 %	148551024
4075	NC_009508	GCC	5	15	189758	189772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551024
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4077	NC_009508	GAT	2	6	189846	189851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148551024
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4081	NC_009508	CCG	4	12	189930	189941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551024
4082	NC_009508	GTT	2	6	189945	189950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148551024
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4085	NC_009508	CGA	2	6	190062	190067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551024
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4087	NC_009508	CAC	2	6	190102	190107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148551024
4088	NC_009508	GCG	2	6	190125	190130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148551024
4089	NC_009508	CGG	2	6	190142	190147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148551024
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4091	NC_009508	CGC	2	6	190156	190161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551024
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4093	NC_009508	GCG	2	6	190454	190459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148551024
4094	NC_009508	TGC	2	6	190502	190507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551024
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4097	NC_009508	GCCG	2	8	190713	190720	0 %	0 %	50 %	50 %	148551024
4098	NC_009508	GC	3	6	190721	190726	0 %	0 %	50 %	50 %	148551024
4099	NC_009508	GTCC	2	8	190730	190737	0 %	25 %	25 %	50 %	148551024
4100	NC_009508	CGG	2	6	190756	190761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148551024
4101	NC_009508	CAG	2	6	190772	190777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551024
4102	NC_009508	TCG	2	6	190810	190815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551024
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4104	NC_009508	GCC	2	6	190969	190974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551024
4105	NC_009508	GGC	2	6	190978	190983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148551024
4106	NC_009508	GCG	2	6	190990	190995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148551024
4107	NC_009508	TGC	2	6	191003	191008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551024
4108	NC_009508	GGCCA	2	10	191029	191038	20 %	0 %	40 %	40 %	148551024
4109	NC_009508	CGT	2	6	191040	191045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551024
4110	NC_009508	CG	3	6	191121	191126	0 %	0 %	50 %	50 %	148551024
4111	NC_009508	CGAT	2	8	191201	191208	25 %	25 %	25 %	25 %	148551024
4112	NC_009508	GTC	2	6	191254	191259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551024
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4117	NC_009508	GAT	2	6	191526	191531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148551024
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4119	NC_009508	CGT	2	6	191668	191673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551024
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4122	NC_009508	CA	4	8	191866	191873	50 %	0 %	0 %	50 %	148551024
4123	NC_009508	TGG	2	6	191897	191902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148551024
4124	NC_009508	CAGG	2	8	192139	192146	25 %	0 %	50 %	25 %	148551024
4125	NC_009508	ATGA	2	8	192217	192224	50 %	25 %	25 %	0 %	148551024
4126	NC_009508	GC	3	6	192264	192269	0 %	0 %	50 %	50 %	148551024
4127	NC_009508	TCA	2	6	192359	192364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148551024
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4129	NC_009508	TCA	2	6	192482	192487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148551024
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4131	NC_009508	CGT	2	6	192610	192615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_009508	CA	4	8	192720	192727	50 %	0 %	0 %	50 %	148551025
4133	NC_009508	TGG	2	6	192751	192756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148551025
4134	NC_009508	CAGG	2	8	192993	193000	25 %	0 %	50 %	25 %	148551025
4135	NC_009508	ATGA	2	8	193071	193078	50 %	25 %	25 %	0 %	148551025
4136	NC_009508	GC	3	6	193118	193123	0 %	0 %	50 %	50 %	148551025
4137	NC_009508	TCA	2	6	193213	193218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148551025
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4140	NC_009508	ATCA	2	8	193440	193447	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4141	NC_009508	CGT	2	6	193464	193469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4143	NC_009508	GGA	2	6	193608	193613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4144	NC_009508	CGA	2	6	193653	193658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551026
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4242	NC_009508	GCTC	2	8	197960	197967	0 %	25 %	25 %	50 %	148551033
4243	NC_009508	AAG	2	6	198002	198007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148551033
4244	NC_009508	CTG	2	6	198098	198103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551033
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4246	NC_009508	CTC	2	6	198311	198316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148551033
4247	NC_009508	CTC	2	6	198328	198333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148551033
4248	NC_009508	TTC	2	6	198375	198380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148551033
4249	NC_009508	ATA	2	6	198431	198436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148551033
4250	NC_009508	ATT	2	6	198441	198446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148551033
4251	NC_009508	GCCA	2	8	198508	198515	25 %	0 %	25 %	50 %	148551034
4252	NC_009508	GCCG	2	8	198529	198536	0 %	0 %	50 %	50 %	148551034
4253	NC_009508	CTTG	2	8	198639	198646	0 %	50 %	25 %	25 %	148551034
4254	NC_009508	ACG	2	6	198719	198724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551034
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4256	NC_009508	GCAA	2	8	198814	198821	50 %	0 %	25 %	25 %	148551034
4257	NC_009508	CGA	2	6	198882	198887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551034
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4259	NC_009508	GC	3	6	199137	199142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4260	NC_009508	TCA	2	6	199191	199196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4261	NC_009508	TC	3	6	199202	199207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4262	NC_009508	ATG	2	6	199308	199313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_009508	AAT	2	6	199396	199401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_009508	GA	3	6	199442	199447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_009508	AT	3	6	199454	199459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_009508	GCC	2	6	199466	199471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4267	NC_009508	TGC	2	6	199542	199547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4268	NC_009508	ACCG	2	8	199602	199609	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4269	NC_009508	GTCT	2	8	199615	199622	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4270	NC_009508	CTC	2	6	199812	199817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148551035
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4272	NC_009508	AAC	2	6	200028	200033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148551035
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4277	NC_009508	CGTT	2	8	200332	200339	0 %	50 %	25 %	25 %	148551036
4278	NC_009508	TCG	2	6	200340	200345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551036
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4289	NC_009508	ATCG	2	8	200864	200871	25 %	25 %	25 %	25 %	148551036
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4293	NC_009508	G	7	7	201076	201082	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4294	NC_009508	AAT	2	6	201203	201208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4295	NC_009508	ACC	2	6	201211	201216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4296	NC_009508	TTAAG	2	10	201250	201259	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4297	NC_009508	TGCT	2	8	201287	201294	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4298	NC_009508	ATA	2	6	201301	201306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4299	NC_009508	ATG	2	6	201369	201374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4300	NC_009508	TC	3	6	201429	201434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4301	NC_009508	AAT	2	6	201436	201441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4302	NC_009508	CAT	2	6	201611	201616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4303	NC_009508	TTC	2	6	201678	201683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4304	NC_009508	GGC	2	6	201758	201763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4305	NC_009508	GCT	2	6	201940	201945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4307	NC_009508	GGT	2	6	202150	202155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4324	NC_009508	CTG	2	6	202952	202957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551038
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4330	NC_009508	CGGT	2	8	203337	203344	0 %	25 %	50 %	25 %	148551038
4331	NC_009508	TGG	2	6	203347	203352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148551038
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4355	NC_009508	GC	3	6	204654	204659	0 %	0 %	50 %	50 %	148551038
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4357	NC_009508	TCG	2	6	204870	204875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551038
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4363	NC_009508	TCGA	2	8	205034	205041	25 %	25 %	25 %	25 %	148551038
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4492	NC_009508	TCG	2	6	210160	210165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551045
4493	NC_009508	CTT	2	6	210194	210199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148551045
4494	NC_009508	CCG	2	6	210256	210261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551045
4495	NC_009508	CGC	3	9	210275	210283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551045
4496	NC_009508	GC	3	6	210389	210394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4497	NC_009508	CCA	2	6	210423	210428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4498	NC_009508	CAT	2	6	210457	210462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4499	NC_009508	CGT	2	6	210504	210509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4500	NC_009508	GT	3	6	210548	210553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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