MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 plasmid pSWIT02

Total Repeats: 4771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009508	CGC	2	6	48175	48180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550892
1002	NC_009508	GACG	2	8	48221	48228	25 %	0 %	50 %	25 %	148550892
1003	NC_009508	GCA	2	6	48239	48244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550892
1004	NC_009508	CGC	2	6	48245	48250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550892
1005	NC_009508	GC	3	6	48249	48254	0 %	0 %	50 %	50 %	148550892
1006	NC_009508	TCGA	2	8	48256	48263	25 %	25 %	25 %	25 %	148550892
1007	NC_009508	TGCG	2	8	48298	48305	0 %	25 %	50 %	25 %	148550892
1008	NC_009508	GC	3	6	48357	48362	0 %	0 %	50 %	50 %	148550892
1009	NC_009508	GC	3	6	48371	48376	0 %	0 %	50 %	50 %	148550892
1010	NC_009508	GCC	2	6	48495	48500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550893
1011	NC_009508	CAT	2	6	48590	48595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550893
1012	NC_009508	GCA	2	6	48670	48675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550893
1013	NC_009508	GCC	2	6	48698	48703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550893
1014	NC_009508	GC	3	6	48704	48709	0 %	0 %	50 %	50 %	148550893
1015	NC_009508	CTT	2	6	48719	48724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550893
1016	NC_009508	CAG	2	6	48734	48739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550893
1017	NC_009508	TCGA	2	8	48753	48760	25 %	25 %	25 %	25 %	148550893
1018	NC_009508	TCG	2	6	48792	48797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550893
1019	NC_009508	AAT	2	6	48856	48861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148550893
1020	NC_009508	GCC	2	6	48915	48920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550893
1021	NC_009508	GGCGA	2	10	49037	49046	20 %	0 %	60 %	20 %	148550893
1022	NC_009508	GATCGA	2	12	49066	49077	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148550893
1023	NC_009508	ACGCG	2	10	49081	49090	20 %	0 %	40 %	40 %	148550893
1024	NC_009508	CGC	2	6	49150	49155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550893
1025	NC_009508	GTC	2	6	49221	49226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550893
1026	NC_009508	GCC	2	6	49227	49232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550893
1027	NC_009508	CGC	2	6	49274	49279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_009508	GC	4	8	49278	49285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_009508	CAT	2	6	49386	49391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550894
1030	NC_009508	TGGC	2	8	49417	49424	0 %	25 %	50 %	25 %	148550894
1031	NC_009508	CTC	2	6	49444	49449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550894
1032	NC_009508	AGGCG	2	10	49527	49536	20 %	0 %	60 %	20 %	148550894
1033	NC_009508	CG	3	6	49535	49540	0 %	0 %	50 %	50 %	148550894
1034	NC_009508	TCCTC	2	10	49629	49638	0 %	40 %	0 %	60 %	148550894
1035	NC_009508	CAT	2	6	49639	49644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550894
1036	NC_009508	CGG	2	6	49694	49699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_009508	CGG	2	6	49778	49783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550895
1038	NC_009508	GAT	2	6	49815	49820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550895
1039	NC_009508	TCA	2	6	49825	49830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550895
1040	NC_009508	ATG	2	6	49860	49865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550895
1041	NC_009508	GCC	2	6	49866	49871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550895
1042	NC_009508	CGG	2	6	49898	49903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550895
1043	NC_009508	GCC	2	6	49944	49949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550895
1044	NC_009508	CCA	2	6	49965	49970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550895
1045	NC_009508	GGC	2	6	49986	49991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550895
1046	NC_009508	CGG	2	6	49993	49998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550895
1047	NC_009508	CTC	2	6	50076	50081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_009508	AT	3	6	50116	50121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_009508	CG	3	6	50155	50160	0 %	0 %	50 %	50 %	148550896
1050	NC_009508	ATA	2	6	50213	50218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148550896
1051	NC_009508	GCA	2	6	50326	50331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550896
1052	NC_009508	TCA	2	6	50398	50403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550896
1053	NC_009508	GGCG	2	8	50455	50462	0 %	0 %	75 %	25 %	148550896
1054	NC_009508	ATG	2	6	50514	50519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550896
1055	NC_009508	CCG	2	6	50546	50551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550896
1056	NC_009508	GC	3	6	50576	50581	0 %	0 %	50 %	50 %	148550896
1057	NC_009508	CAG	2	6	50589	50594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550896
1058	NC_009508	GC	3	6	50648	50653	0 %	0 %	50 %	50 %	148550896
1059	NC_009508	CGT	2	6	50692	50697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_009508	CGG	2	6	50700	50705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_009508	TCG	2	6	50770	50775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550897
1062	NC_009508	CCG	2	6	50785	50790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550897
1063	NC_009508	GCC	2	6	50869	50874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550897
1064	NC_009508	GCG	2	6	50878	50883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550897
1065	NC_009508	CG	3	6	50915	50920	0 %	0 %	50 %	50 %	148550897
1066	NC_009508	GGGCA	2	10	50926	50935	20 %	0 %	60 %	20 %	148550897
1067	NC_009508	TAT	2	6	50991	50996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148550897
1068	NC_009508	GC	3	6	51016	51021	0 %	0 %	50 %	50 %	148550897
1069	NC_009508	CGA	2	6	51038	51043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550897
1070	NC_009508	CCG	2	6	51075	51080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550897
1071	NC_009508	CCGG	2	8	51088	51095	0 %	0 %	50 %	50 %	148550897
1072	NC_009508	CAG	2	6	51175	51180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_009508	AGG	2	6	51198	51203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_009508	ACG	2	6	51238	51243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550898
1075	NC_009508	CGG	2	6	51259	51264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550898
1076	NC_009508	CGT	2	6	51302	51307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550898
1077	NC_009508	CTCG	2	8	51420	51427	0 %	25 %	25 %	50 %	148550898
1078	NC_009508	TGA	2	6	51446	51451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550898
1079	NC_009508	CGAT	2	8	51509	51516	25 %	25 %	25 %	25 %	148550898
1080	NC_009508	ATG	2	6	51681	51686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550899
1081	NC_009508	GCGA	2	8	51708	51715	25 %	0 %	50 %	25 %	148550899
1082	NC_009508	GC	3	6	51718	51723	0 %	0 %	50 %	50 %	148550899
1083	NC_009508	GCG	2	6	51735	51740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550899
1084	NC_009508	GCA	2	6	51779	51784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550899
1085	NC_009508	CGG	2	6	51919	51924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550899
1086	NC_009508	CCT	2	6	52093	52098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550899
1087	NC_009508	GAG	2	6	52158	52163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550899
1088	NC_009508	GA	3	6	52191	52196	50 %	0 %	50 %	0 %	148550899
1089	NC_009508	ACC	2	6	52197	52202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550899
1090	NC_009508	CCGGT	2	10	52331	52340	0 %	20 %	40 %	40 %	148550900
1091	NC_009508	GCC	2	6	52350	52355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550900
1092	NC_009508	CTGATC	2	12	52425	52436	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148550900
1093	NC_009508	GCC	2	6	52538	52543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550900
1094	NC_009508	CAG	2	6	52565	52570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550900
1095	NC_009508	CAC	2	6	52580	52585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550900
1096	NC_009508	GCC	2	6	52652	52657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550900
1097	NC_009508	GTCTTG	2	12	52662	52673	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148550900
1098	NC_009508	TCA	2	6	52705	52710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550900
1099	NC_009508	CCG	2	6	52722	52727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550900
1100	NC_009508	GCA	2	6	52744	52749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550900
1101	NC_009508	CGA	2	6	52813	52818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550900
1102	NC_009508	GGTCA	2	10	52865	52874	20 %	20 %	40 %	20 %	148550900
1103	NC_009508	GGGGCG	2	12	52899	52910	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
1104	NC_009508	CCCG	2	8	52916	52923	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1105	NC_009508	TGA	2	6	52951	52956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_009508	GTC	2	6	52976	52981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_009508	CGG	2	6	53113	53118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_009508	ATC	2	6	53167	53172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_009508	GGC	2	6	53177	53182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_009508	CAT	2	6	53330	53335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550901
1111	NC_009508	TCGT	2	8	53350	53357	0 %	50 %	25 %	25 %	148550901
1112	NC_009508	CG	4	8	53374	53381	0 %	0 %	50 %	50 %	148550901
1113	NC_009508	CTGC	2	8	53424	53431	0 %	25 %	25 %	50 %	148550901
1114	NC_009508	TGA	2	6	53435	53440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550901
1115	NC_009508	GCA	2	6	53453	53458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550901
1116	NC_009508	CCG	2	6	53462	53467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550901
1117	NC_009508	GCG	2	6	53525	53530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550901
1118	NC_009508	GC	3	6	53572	53577	0 %	0 %	50 %	50 %	148550901
1119	NC_009508	CG	4	8	53697	53704	0 %	0 %	50 %	50 %	148550901
1120	NC_009508	CG	3	6	53754	53759	0 %	0 %	50 %	50 %	148550901
1121	NC_009508	ACC	2	6	53872	53877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550902
1122	NC_009508	CCGC	2	8	53907	53914	0 %	0 %	25 %	75 %	148550902
1123	NC_009508	CAGG	2	8	53930	53937	25 %	0 %	50 %	25 %	148550902
1124	NC_009508	CATCG	2	10	53948	53957	20 %	20 %	20 %	40 %	148550902
1125	NC_009508	GC	3	6	54004	54009	0 %	0 %	50 %	50 %	148550902
1126	NC_009508	AAG	2	6	54035	54040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550902
1127	NC_009508	GC	4	8	54057	54064	0 %	0 %	50 %	50 %	148550902
1128	NC_009508	GCGCC	2	10	54089	54098	0 %	0 %	40 %	60 %	148550902
1129	NC_009508	GCGCC	2	10	54162	54171	0 %	0 %	40 %	60 %	148550902
1130	NC_009508	GTC	2	6	54198	54203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550902
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1134	NC_009508	CCG	2	6	54337	54342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1247	NC_009508	CAG	2	6	58908	58913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550906
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1250	NC_009508	GCC	2	6	59075	59080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550906
1251	NC_009508	ATC	2	6	59106	59111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550906
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1254	NC_009508	CGGCG	2	10	59247	59256	0 %	0 %	60 %	40 %	148550906
1255	NC_009508	GGC	2	6	59285	59290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550906
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1257	NC_009508	GCC	3	9	59299	59307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550906
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1498	NC_009508	GC	3	6	70860	70865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1499	NC_009508	CGG	2	6	70919	70924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1500	NC_009508	AT	3	6	70928	70933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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