MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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49002	NC_009482	CGTAGC	2	12	2115717	2115728	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148243520
49003	NC_009482	GCA	2	6	2115750	2115755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243520
49004	NC_009482	GATA	2	8	2115771	2115778	50 %	25 %	25 %	0 %	148243520
49005	NC_009482	ACC	2	6	2115791	2115796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243520
49006	NC_009482	TGGGC	2	10	2115819	2115828	0 %	20 %	60 %	20 %	148243520
49007	NC_009482	CCA	2	6	2115855	2115860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243520
49008	NC_009482	CTG	4	12	2115868	2115879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243520
49009	NC_009482	TAA	2	6	2115919	2115924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49010	NC_009482	C	6	6	2115985	2115990	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49011	NC_009482	GTT	2	6	2116033	2116038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49012	NC_009482	ACAA	2	8	2116045	2116052	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49013	NC_009482	ACCT	2	8	2116061	2116068	25 %	25 %	0 %	50 %	148243521
49014	NC_009482	CTG	2	6	2116107	2116112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243521
49015	NC_009482	GCAAG	2	10	2116145	2116154	40 %	0 %	40 %	20 %	148243521
49016	NC_009482	CAGC	2	8	2116186	2116193	25 %	0 %	25 %	50 %	148243521
49017	NC_009482	ACA	2	6	2116300	2116305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243521
49018	NC_009482	A	7	7	2116318	2116324	100 %	0 %	0 %	0 %	148243521
49019	NC_009482	CG	3	6	2116373	2116378	0 %	0 %	50 %	50 %	148243521
49020	NC_009482	TCA	2	6	2116501	2116506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243521
49021	NC_009482	GTT	2	6	2116521	2116526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243521
49022	NC_009482	TCGA	2	8	2116560	2116567	25 %	25 %	25 %	25 %	148243521
49023	NC_009482	TGGG	2	8	2116796	2116803	0 %	25 %	75 %	0 %	148243521
49024	NC_009482	GCA	2	6	2116808	2116813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243521
49025	NC_009482	AAAG	2	8	2116860	2116867	75 %	0 %	25 %	0 %	148243521
49026	NC_009482	CAAA	2	8	2117002	2117009	75 %	0 %	0 %	25 %	148243521
49027	NC_009482	TAA	2	6	2117018	2117023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148243521
49028	NC_009482	AT	3	6	2117059	2117064	50 %	50 %	0 %	0 %	148243521
49029	NC_009482	A	6	6	2117096	2117101	100 %	0 %	0 %	0 %	148243521
49030	NC_009482	GGC	5	15	2117103	2117117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243521
49031	NC_009482	GTC	2	6	2117178	2117183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243521
49032	NC_009482	AGT	2	6	2117252	2117257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243521
49033	NC_009482	CAC	2	6	2117270	2117275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243521
49034	NC_009482	CGAG	2	8	2117297	2117304	25 %	0 %	50 %	25 %	148243521
49035	NC_009482	GAG	2	6	2117323	2117328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243521
49036	NC_009482	GC	3	6	2117377	2117382	0 %	0 %	50 %	50 %	148243521
49037	NC_009482	A	6	6	2117435	2117440	100 %	0 %	0 %	0 %	148243521
49038	NC_009482	GGC	2	6	2117478	2117483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243521
49039	NC_009482	GCT	2	6	2117496	2117501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243521
49040	NC_009482	AGGC	2	8	2117584	2117591	25 %	0 %	50 %	25 %	148243521
49041	NC_009482	CGG	2	6	2117594	2117599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243521
49042	NC_009482	CAGT	2	8	2117604	2117611	25 %	25 %	25 %	25 %	148243521
49043	NC_009482	TGA	2	6	2117630	2117635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243521
49044	NC_009482	GGC	2	6	2117655	2117660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243521
49045	NC_009482	A	7	7	2117672	2117678	100 %	0 %	0 %	0 %	148243521
49046	NC_009482	GGA	2	6	2117679	2117684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243521
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49049	NC_009482	AACC	2	8	2117942	2117949	50 %	0 %	0 %	50 %	148243521
49050	NC_009482	TAA	2	6	2117954	2117959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148243521
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49052	NC_009482	GA	3	6	2118164	2118169	50 %	0 %	50 %	0 %	148243521
49053	NC_009482	AGC	2	6	2118275	2118280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243521
49054	NC_009482	GTGA	2	8	2118342	2118349	25 %	25 %	50 %	0 %	148243521
49055	NC_009482	AG	5	10	2118386	2118395	50 %	0 %	50 %	0 %	148243521
49056	NC_009482	AG	3	6	2118422	2118427	50 %	0 %	50 %	0 %	148243521
49057	NC_009482	CAA	2	6	2118494	2118499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243521
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49059	NC_009482	GGCA	2	8	2118577	2118584	25 %	0 %	50 %	25 %	148243521
49060	NC_009482	CAA	2	6	2118596	2118601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243521
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49062	NC_009482	ATTCA	2	10	2118726	2118735	40 %	40 %	0 %	20 %	148243521
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49067	NC_009482	AGCA	2	8	2119054	2119061	50 %	0 %	25 %	25 %	148243521
49068	NC_009482	A	6	6	2119118	2119123	100 %	0 %	0 %	0 %	148243521
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49089	NC_009482	C	6	6	2120126	2120131	0 %	0 %	0 %	100 %	148243522
49090	NC_009482	AGC	2	6	2120143	2120148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243522
49091	NC_009482	TGCA	2	8	2120213	2120220	25 %	25 %	25 %	25 %	148243522
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49100	NC_009482	TGC	2	6	2120650	2120655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243523
49101	NC_009482	GTT	2	6	2120672	2120677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243523
49102	NC_009482	CGC	2	6	2120721	2120726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243523
49103	NC_009482	GAG	2	6	2120795	2120800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243523
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49105	NC_009482	GCGA	2	8	2120847	2120854	25 %	0 %	50 %	25 %	148243524
49106	NC_009482	TGTGC	2	10	2120961	2120970	0 %	40 %	40 %	20 %	148243524
49107	NC_009482	CCAT	2	8	2121032	2121039	25 %	25 %	0 %	50 %	148243524
49108	NC_009482	AACC	2	8	2121152	2121159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49109	NC_009482	GA	3	6	2121323	2121328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49110	NC_009482	GAA	2	6	2121352	2121357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49111	NC_009482	TGC	2	6	2121379	2121384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49112	NC_009482	GCT	2	6	2121458	2121463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49113	NC_009482	ATT	2	6	2121542	2121547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49114	NC_009482	AAT	2	6	2121570	2121575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49115	NC_009482	CGG	2	6	2121687	2121692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49116	NC_009482	GA	3	6	2121750	2121755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49117	NC_009482	TGG	2	6	2121808	2121813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243525
49118	NC_009482	TGT	2	6	2121820	2121825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243525
49119	NC_009482	GCA	2	6	2121848	2121853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243525
49120	NC_009482	AC	3	6	2121921	2121926	50 %	0 %	0 %	50 %	148243525
49121	NC_009482	TCA	2	6	2121931	2121936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243525
49122	NC_009482	ACA	2	6	2122004	2122009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49123	NC_009482	TCA	2	6	2122149	2122154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243526
49124	NC_009482	CTTCT	2	10	2122209	2122218	0 %	60 %	0 %	40 %	148243526
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49126	NC_009482	GCT	2	6	2122233	2122238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243526
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49128	NC_009482	CGG	2	6	2122345	2122350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49129	NC_009482	GA	3	6	2122476	2122481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49130	NC_009482	AATC	2	8	2122493	2122500	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49131	NC_009482	GCT	3	9	2122527	2122535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243527
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49138	NC_009482	TGT	2	6	2123031	2123036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49139	NC_009482	GA	3	6	2123183	2123188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49140	NC_009482	CT	3	6	2123214	2123219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49141	NC_009482	ACA	2	6	2123223	2123228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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49144	NC_009482	AG	3	6	2123527	2123532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49145	NC_009482	GCC	3	9	2123631	2123639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243529
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49148	NC_009482	TGGT	2	8	2123736	2123743	0 %	50 %	50 %	0 %	148243529
49149	NC_009482	GCC	2	6	2123778	2123783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243529
49150	NC_009482	GGCT	2	8	2123798	2123805	0 %	25 %	50 %	25 %	148243529
49151	NC_009482	TGG	2	6	2123816	2123821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243530
49152	NC_009482	CCG	2	6	2123827	2123832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243530
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49157	NC_009482	GCTG	2	8	2123907	2123914	0 %	25 %	50 %	25 %	148243530
49158	NC_009482	CTG	3	9	2123912	2123920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243530
49159	NC_009482	CGG	2	6	2123944	2123949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243530
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49222	NC_009482	GCT	2	6	2126299	2126304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243533
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49232	NC_009482	GCC	2	6	2126681	2126686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243534
49233	NC_009482	GGT	2	6	2126803	2126808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243534
49234	NC_009482	CCA	2	6	2126826	2126831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243534
49235	NC_009482	CGG	2	6	2126869	2126874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243534
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49464	NC_009482	GCA	2	6	2136953	2136958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243544
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49466	NC_009482	CTG	2	6	2137060	2137065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243544
49467	NC_009482	CTG	2	6	2137071	2137076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243544
49468	NC_009482	GGC	2	6	2137081	2137086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243544
49469	NC_009482	GC	3	6	2137147	2137152	0 %	0 %	50 %	50 %	148243544
49470	NC_009482	CGC	2	6	2137180	2137185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243544
49471	NC_009482	GAA	2	6	2137303	2137308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243544
49472	NC_009482	CTG	2	6	2137330	2137335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243544
49473	NC_009482	TTGAG	2	10	2137342	2137351	20 %	40 %	40 %	0 %	148243544
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49475	NC_009482	CTG	2	6	2137460	2137465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243545
49476	NC_009482	GCG	2	6	2137473	2137478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243545
49477	NC_009482	AGC	2	6	2137494	2137499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243545
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49480	NC_009482	GGC	2	6	2137646	2137651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243545
49481	NC_009482	CCT	2	6	2137664	2137669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243545
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49484	NC_009482	CCA	2	6	2137708	2137713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243545
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49489	NC_009482	TGC	3	9	2137857	2137865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243545
49490	NC_009482	GCA	2	6	2137866	2137871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243545
49491	NC_009482	TGC	2	6	2137886	2137891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243545
49492	NC_009482	GCA	2	6	2137893	2137898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243545
49493	NC_009482	CTG	2	6	2137907	2137912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243545
49494	NC_009482	GGGC	2	8	2137921	2137928	0 %	0 %	75 %	25 %	148243545
49495	NC_009482	CGC	3	9	2137938	2137946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243545
49496	NC_009482	AGC	2	6	2137949	2137954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243545
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49498	NC_009482	CT	3	6	2138026	2138031	0 %	50 %	0 %	50 %	148243545
49499	NC_009482	GCT	3	9	2138050	2138058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243545
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