MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48005	NC_009482	TGG	2	6	2073014	2073019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243479
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48116	NC_009482	GAAC	2	8	2078019	2078026	50 %	0 %	25 %	25 %	148243480
48117	NC_009482	TGG	2	6	2078036	2078041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243480
48118	NC_009482	CAG	2	6	2078050	2078055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243480
48119	NC_009482	CGG	2	6	2078097	2078102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243480
48120	NC_009482	GCCA	2	8	2078125	2078132	25 %	0 %	25 %	50 %	148243480
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48122	NC_009482	TGG	2	6	2078152	2078157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243480
48123	NC_009482	ACCG	2	8	2078182	2078189	25 %	0 %	25 %	50 %	148243480
48124	NC_009482	TCA	2	6	2078234	2078239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243480
48125	NC_009482	GCTC	2	8	2078246	2078253	0 %	25 %	25 %	50 %	148243480
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48131	NC_009482	TGG	2	6	2078430	2078435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243481
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48133	NC_009482	A	6	6	2078475	2078480	100 %	0 %	0 %	0 %	148243481
48134	NC_009482	GC	3	6	2078489	2078494	0 %	0 %	50 %	50 %	148243481
48135	NC_009482	CAAGCT	2	12	2078588	2078599	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148243481
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48140	NC_009482	CTA	2	6	2078822	2078827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243481
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48144	NC_009482	TGG	2	6	2079046	2079051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243481
48145	NC_009482	GCA	2	6	2079073	2079078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243481
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48223	NC_009482	CGT	2	6	2082367	2082372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243485
48224	NC_009482	GGC	2	6	2082377	2082382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243485
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48227	NC_009482	ACT	2	6	2082438	2082443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243485
48228	NC_009482	G	6	6	2082484	2082489	0 %	0 %	100 %	0 %	148243486
48229	NC_009482	CTGC	2	8	2082495	2082502	0 %	25 %	25 %	50 %	148243486
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48233	NC_009482	CTG	2	6	2082733	2082738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243486
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48340	NC_009482	GGC	2	6	2087388	2087393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243489
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48345	NC_009482	GC	3	6	2087663	2087668	0 %	0 %	50 %	50 %	148243489
48346	NC_009482	CG	3	6	2087721	2087726	0 %	0 %	50 %	50 %	148243489
48347	NC_009482	ATCA	2	8	2087737	2087744	50 %	25 %	0 %	25 %	148243489
48348	NC_009482	AC	3	6	2087759	2087764	50 %	0 %	0 %	50 %	148243489
48349	NC_009482	GCA	2	6	2087769	2087774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243489
48350	NC_009482	GCT	2	6	2087775	2087780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243489
48351	NC_009482	GCA	2	6	2087805	2087810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243489
48352	NC_009482	C	6	6	2087872	2087877	0 %	0 %	0 %	100 %	148243490
48353	NC_009482	TGG	2	6	2087897	2087902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243490
48354	NC_009482	CATC	2	8	2087903	2087910	25 %	25 %	0 %	50 %	148243490
48355	NC_009482	GCT	2	6	2087912	2087917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243490
48356	NC_009482	CTGG	2	8	2087922	2087929	0 %	25 %	50 %	25 %	148243490
48357	NC_009482	CAG	2	6	2087933	2087938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243490
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48359	NC_009482	GCA	2	6	2087981	2087986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243490
48360	NC_009482	GGC	2	6	2088015	2088020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243490
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48365	NC_009482	C	6	6	2088355	2088360	0 %	0 %	0 %	100 %	148243491
48366	NC_009482	CGG	2	6	2088398	2088403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243491
48367	NC_009482	TGC	2	6	2088416	2088421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243491
48368	NC_009482	GCC	2	6	2088435	2088440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243491
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48374	NC_009482	CAG	2	6	2088708	2088713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243491
48375	NC_009482	GCC	2	6	2088735	2088740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243491
48376	NC_009482	GGC	2	6	2088767	2088772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243491
48377	NC_009482	CCA	2	6	2088785	2088790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243491
48378	NC_009482	GCC	2	6	2088813	2088818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243491
48379	NC_009482	GCC	2	6	2088834	2088839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243491
48380	NC_009482	ATCAG	2	10	2088865	2088874	40 %	20 %	20 %	20 %	148243491
48381	NC_009482	CCA	2	6	2088902	2088907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243491
48382	NC_009482	GGCTG	2	10	2088942	2088951	0 %	20 %	60 %	20 %	148243491
48383	NC_009482	GCC	2	6	2089004	2089009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243491
48384	NC_009482	TCA	2	6	2089081	2089086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243491
48385	NC_009482	CGG	2	6	2089097	2089102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243491
48386	NC_009482	TCG	2	6	2089114	2089119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243491
48387	NC_009482	CCT	2	6	2089175	2089180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243491
48388	NC_009482	GGC	2	6	2089196	2089201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243491
48389	NC_009482	CCG	2	6	2089292	2089297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243491
48390	NC_009482	GTG	2	6	2089386	2089391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243491
48391	NC_009482	GCC	2	6	2089417	2089422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243491
48392	NC_009482	GCG	2	6	2089471	2089476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243491
48393	NC_009482	TGC	2	6	2089483	2089488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243491
48394	NC_009482	GCG	2	6	2089492	2089497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243491
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48397	NC_009482	GCA	2	6	2089541	2089546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243491
48398	NC_009482	GAT	2	6	2089712	2089717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243492
48399	NC_009482	GCT	2	6	2089828	2089833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243492
48400	NC_009482	TGG	2	6	2089860	2089865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243492
48401	NC_009482	TGG	2	6	2089971	2089976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243492
48402	NC_009482	GGC	2	6	2090000	2090005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243492
48403	NC_009482	CCA	2	6	2090032	2090037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243492
48404	NC_009482	CAC	2	6	2090066	2090071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243492
48405	NC_009482	GCCG	2	8	2090075	2090082	0 %	0 %	50 %	50 %	148243492
48406	NC_009482	TGG	2	6	2090090	2090095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243492
48407	NC_009482	TGC	2	6	2090112	2090117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243492
48408	NC_009482	CTG	3	9	2090204	2090212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243492
48409	NC_009482	CT	3	6	2090232	2090237	0 %	50 %	0 %	50 %	148243492
48410	NC_009482	GGCCTG	2	12	2090273	2090284	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148243492
48411	NC_009482	CTGG	2	8	2090332	2090339	0 %	25 %	50 %	25 %	148243492
48412	NC_009482	CCAC	2	8	2090349	2090356	25 %	0 %	0 %	75 %	148243492
48413	NC_009482	CCA	2	6	2090394	2090399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243492
48414	NC_009482	CTG	2	6	2090401	2090406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243492
48415	NC_009482	GTGG	2	8	2090407	2090414	0 %	25 %	75 %	0 %	148243492
48416	NC_009482	CAA	2	6	2090443	2090448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243492
48417	NC_009482	CCA	2	6	2090449	2090454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243492
48418	NC_009482	GCA	2	6	2090512	2090517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243492
48419	NC_009482	CCA	2	6	2090616	2090621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243493
48420	NC_009482	CGG	2	6	2090682	2090687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243493
48421	NC_009482	GCCA	2	8	2090704	2090711	25 %	0 %	25 %	50 %	148243493
48422	NC_009482	AGC	2	6	2090807	2090812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243493
48423	NC_009482	CAG	2	6	2090905	2090910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243493
48424	NC_009482	CGCC	2	8	2090913	2090920	0 %	0 %	25 %	75 %	148243493
48425	NC_009482	GCT	2	6	2091000	2091005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243493
48426	NC_009482	CGC	2	6	2091015	2091020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243493
48427	NC_009482	GCCG	2	8	2091132	2091139	0 %	0 %	50 %	50 %	148243493
48428	NC_009482	CATGC	2	10	2091195	2091204	20 %	20 %	20 %	40 %	148243493
48429	NC_009482	GGC	2	6	2091214	2091219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243493
48430	NC_009482	TATTGT	2	12	2091334	2091345	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48431	NC_009482	CCAC	2	8	2091451	2091458	25 %	0 %	0 %	75 %	148243494
48432	NC_009482	GCC	2	6	2091472	2091477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243494
48433	NC_009482	TGG	2	6	2091523	2091528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243494
48434	NC_009482	GCCT	2	8	2091594	2091601	0 %	25 %	25 %	50 %	148243494
48435	NC_009482	ACC	2	6	2091619	2091624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243494
48436	NC_009482	CTT	2	6	2091671	2091676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243494
48437	NC_009482	GCG	2	6	2091685	2091690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243494
48438	NC_009482	CCA	3	9	2091737	2091745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243494
48439	NC_009482	ATC	2	6	2091769	2091774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243494
48440	NC_009482	ACA	2	6	2091775	2091780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243494
48441	NC_009482	TGG	2	6	2091795	2091800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243494
48442	NC_009482	CTA	2	6	2091881	2091886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243494
48443	NC_009482	AAC	3	9	2091897	2091905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243494
48444	NC_009482	TGC	3	9	2091910	2091918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243494
48445	NC_009482	TGGC	2	8	2091928	2091935	0 %	25 %	50 %	25 %	148243494
48446	NC_009482	CTG	2	6	2091936	2091941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243494
48447	NC_009482	CGG	2	6	2091968	2091973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243494
48448	NC_009482	CTGG	2	8	2092031	2092038	0 %	25 %	50 %	25 %	148243494
48449	NC_009482	CCAC	2	8	2092048	2092055	25 %	0 %	0 %	75 %	148243494
48450	NC_009482	CAA	2	6	2092097	2092102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243494
48451	NC_009482	GGC	2	6	2092112	2092117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243494
48452	NC_009482	CAA	2	6	2092142	2092147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243494
48453	NC_009482	CCA	2	6	2092148	2092153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243494
48454	NC_009482	GATC	2	8	2092196	2092203	25 %	25 %	25 %	25 %	148243494
48455	NC_009482	GCA	2	6	2092211	2092216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243494
48456	NC_009482	GC	3	6	2092229	2092234	0 %	0 %	50 %	50 %	148243494
48457	NC_009482	CAAG	2	8	2092247	2092254	50 %	0 %	25 %	25 %	148243494
48458	NC_009482	CGG	2	6	2092264	2092269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243494
48459	NC_009482	GTT	2	6	2092360	2092365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243495
48460	NC_009482	TCC	2	6	2092439	2092444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243495
48461	NC_009482	CAAG	2	8	2092485	2092492	50 %	0 %	25 %	25 %	148243495
48462	NC_009482	CCG	2	6	2092500	2092505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243495
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48465	NC_009482	CGA	2	6	2092611	2092616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243495
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48492	NC_009482	CGA	2	6	2093784	2093789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243496
48493	NC_009482	TGATCG	2	12	2093867	2093878	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148243496
48494	NC_009482	GGCTCC	2	12	2093899	2093910	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148243496
48495	NC_009482	GC	3	6	2093962	2093967	0 %	0 %	50 %	50 %	148243496
48496	NC_009482	GC	3	6	2094019	2094024	0 %	0 %	50 %	50 %	148243496
48497	NC_009482	TGA	3	9	2094092	2094100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243496
48498	NC_009482	TAC	2	6	2094115	2094120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243496
48499	NC_009482	GGC	2	6	2094237	2094242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243496
48500	NC_009482	TGC	2	6	2094286	2094291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243497

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