MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47503	NC_009482	CAAA	2	8	2052216	2052223	75 %	0 %	0 %	25 %	148243459
47504	NC_009482	TCC	2	6	2052259	2052264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243460
47505	NC_009482	AGC	2	6	2052307	2052312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243460
47506	NC_009482	GCA	2	6	2052344	2052349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243460
47507	NC_009482	CGC	2	6	2052352	2052357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243460
47508	NC_009482	GGGCC	2	10	2052360	2052369	0 %	0 %	60 %	40 %	148243460
47509	NC_009482	GCCA	2	8	2052397	2052404	25 %	0 %	25 %	50 %	148243460
47510	NC_009482	CAGC	2	8	2052446	2052453	25 %	0 %	25 %	50 %	148243460
47511	NC_009482	GGC	2	6	2052456	2052461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243460
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47514	NC_009482	CCGG	2	8	2052554	2052561	0 %	0 %	50 %	50 %	148243460
47515	NC_009482	GCC	2	6	2052568	2052573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243460
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47615	NC_009482	GCT	2	6	2056667	2056672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243463
47616	NC_009482	CCAAC	2	10	2056713	2056722	40 %	0 %	0 %	60 %	148243463
47617	NC_009482	CCA	2	6	2056739	2056744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243463
47618	NC_009482	GAC	2	6	2056766	2056771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243463
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47623	NC_009482	CCA	2	6	2057063	2057068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243463
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47626	NC_009482	TGA	2	6	2057291	2057296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243463
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47639	NC_009482	GCA	2	6	2057798	2057803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243463
47640	NC_009482	ACG	2	6	2058023	2058028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243463
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47642	NC_009482	TGA	2	6	2058113	2058118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243463
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47654	NC_009482	GCT	2	6	2058367	2058372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243464
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47708	NC_009482	CG	3	6	2060452	2060457	0 %	0 %	50 %	50 %	148243467
47709	NC_009482	TCA	2	6	2060460	2060465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243467
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47713	NC_009482	TGG	2	6	2060581	2060586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243467
47714	NC_009482	GCA	2	6	2060587	2060592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243467
47715	NC_009482	AGCC	2	8	2060605	2060612	25 %	0 %	25 %	50 %	148243467
47716	NC_009482	TTC	2	6	2060619	2060624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243467
47717	NC_009482	CTGGC	2	10	2060643	2060652	0 %	20 %	40 %	40 %	148243467
47718	NC_009482	GCA	2	6	2060691	2060696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243467
47719	NC_009482	CAC	2	6	2060708	2060713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243467
47720	NC_009482	ACG	2	6	2060775	2060780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243467
47721	NC_009482	CTG	2	6	2060795	2060800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243467
47722	NC_009482	AGC	2	6	2060896	2060901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47723	NC_009482	GCT	3	9	2060921	2060929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47724	NC_009482	GTC	2	6	2060950	2060955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243468
47725	NC_009482	GCT	3	9	2060976	2060984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243468
47726	NC_009482	GTT	2	6	2060997	2061002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243468
47727	NC_009482	GCG	3	9	2061016	2061024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243468
47728	NC_009482	TGG	2	6	2061045	2061050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243468
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47730	NC_009482	CAA	2	6	2061088	2061093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243468
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47964	NC_009482	CTG	2	6	2071364	2071369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243477
47965	NC_009482	CCTG	2	8	2071388	2071395	0 %	25 %	25 %	50 %	148243477
47966	NC_009482	GGA	2	6	2071538	2071543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243477
47967	NC_009482	CG	3	6	2071549	2071554	0 %	0 %	50 %	50 %	148243477
47968	NC_009482	GC	3	6	2071602	2071607	0 %	0 %	50 %	50 %	148243477
47969	NC_009482	GCT	2	6	2071634	2071639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243477
47970	NC_009482	GTTT	2	8	2071681	2071688	0 %	75 %	25 %	0 %	148243477
47971	NC_009482	AGG	2	6	2071705	2071710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243477
47972	NC_009482	GCA	2	6	2071738	2071743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243477
47973	NC_009482	CGGG	2	8	2071771	2071778	0 %	0 %	75 %	25 %	148243477
47974	NC_009482	GAA	2	6	2071884	2071889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243477
47975	NC_009482	GCA	2	6	2071937	2071942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243477
47976	NC_009482	AGC	2	6	2071987	2071992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47977	NC_009482	CGA	2	6	2072030	2072035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243478
47978	NC_009482	TGC	2	6	2072071	2072076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243478
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47980	NC_009482	TGC	2	6	2072170	2072175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243478
47981	NC_009482	CCA	2	6	2072204	2072209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243478
47982	NC_009482	CA	3	6	2072223	2072228	50 %	0 %	0 %	50 %	148243478
47983	NC_009482	GCT	2	6	2072252	2072257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243478
47984	NC_009482	GCA	2	6	2072285	2072290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243478
47985	NC_009482	GTG	2	6	2072307	2072312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243478
47986	NC_009482	AGC	2	6	2072347	2072352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243478
47987	NC_009482	TGG	3	9	2072383	2072391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243478
47988	NC_009482	GCT	2	6	2072393	2072398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243478
47989	NC_009482	GCC	2	6	2072419	2072424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243478
47990	NC_009482	GCA	2	6	2072495	2072500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243478
47991	NC_009482	GGC	2	6	2072517	2072522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243478
47992	NC_009482	CAA	2	6	2072570	2072575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243478
47993	NC_009482	TTAG	2	8	2072588	2072595	25 %	50 %	25 %	0 %	148243478
47994	NC_009482	CTG	2	6	2072607	2072612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243479
47995	NC_009482	GCC	2	6	2072650	2072655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243479
47996	NC_009482	CCG	6	18	2072692	2072709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243479
47997	NC_009482	ACC	2	6	2072761	2072766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243479
47998	NC_009482	CCA	2	6	2072783	2072788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243479
47999	NC_009482	C	6	6	2072824	2072829	0 %	0 %	0 %	100 %	148243479
48000	NC_009482	CGC	2	6	2072891	2072896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243479

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