MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47001	NC_009482	CTG	2	6	2029825	2029830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243432
47002	NC_009482	GGC	2	6	2029836	2029841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243432
47003	NC_009482	GCG	2	6	2029922	2029927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243432
47004	NC_009482	GCG	2	6	2030012	2030017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243432
47005	NC_009482	GCG	2	6	2030042	2030047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243432
47006	NC_009482	GCG	2	6	2030102	2030107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243432
47007	NC_009482	GCCATC	2	12	2030137	2030148	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148243432
47008	NC_009482	GCG	2	6	2030192	2030197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243432
47009	NC_009482	GCA	2	6	2030210	2030215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243432
47010	NC_009482	TCG	2	6	2030222	2030227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243432
47011	NC_009482	GAC	2	6	2030233	2030238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243432
47012	NC_009482	CCG	2	6	2030368	2030373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243433
47013	NC_009482	GCG	2	6	2030415	2030420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243433
47014	NC_009482	AGT	2	6	2030438	2030443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243433
47015	NC_009482	CTG	2	6	2030526	2030531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243433
47016	NC_009482	AACC	2	8	2030537	2030544	50 %	0 %	0 %	50 %	148243433
47017	NC_009482	CAG	2	6	2030694	2030699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243433
47018	NC_009482	CTGGCC	2	12	2030703	2030714	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148243433
47019	NC_009482	GCC	3	9	2030712	2030720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243433
47020	NC_009482	TTG	2	6	2030893	2030898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243433
47021	NC_009482	ACG	2	6	2030960	2030965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243433
47022	NC_009482	GA	3	6	2031166	2031171	50 %	0 %	50 %	0 %	148243433
47023	NC_009482	GCT	2	6	2031186	2031191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243433
47024	NC_009482	GTTGT	2	10	2031268	2031277	0 %	60 %	40 %	0 %	148243433
47025	NC_009482	TGG	2	6	2031329	2031334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243433
47026	NC_009482	TGC	2	6	2031386	2031391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243433
47027	NC_009482	CTC	3	9	2031486	2031494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243433
47028	NC_009482	AGC	2	6	2031544	2031549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243433
47029	NC_009482	CAG	3	9	2031693	2031701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243433
47030	NC_009482	GCG	2	6	2031704	2031709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243433
47031	NC_009482	CGC	2	6	2031734	2031739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243433
47032	NC_009482	TGG	2	6	2031758	2031763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243433
47033	NC_009482	GCG	2	6	2031921	2031926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243433
47034	NC_009482	GCT	2	6	2031935	2031940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243433
47035	NC_009482	CTGC	2	8	2031974	2031981	0 %	25 %	25 %	50 %	148243433
47036	NC_009482	GCTGA	2	10	2031995	2032004	20 %	20 %	40 %	20 %	148243433
47037	NC_009482	AAC	2	6	2032017	2032022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243433
47038	NC_009482	ACGATC	2	12	2032053	2032064	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148243433
47039	NC_009482	GTG	2	6	2032091	2032096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243433
47040	NC_009482	GCG	2	6	2032118	2032123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243433
47041	NC_009482	TGC	2	6	2032172	2032177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243433
47042	NC_009482	GGT	2	6	2032217	2032222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243433
47043	NC_009482	CAG	2	6	2032271	2032276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243433
47044	NC_009482	ACG	2	6	2032310	2032315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243433
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47049	NC_009482	AAAC	2	8	2032619	2032626	75 %	0 %	0 %	25 %	148243433
47050	NC_009482	G	6	6	2032788	2032793	0 %	0 %	100 %	0 %	148243433
47051	NC_009482	GCT	4	12	2032814	2032825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243433
47052	NC_009482	GCG	2	6	2032856	2032861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243433
47053	NC_009482	TGG	2	6	2032886	2032891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243433
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47055	NC_009482	ATTG	2	8	2032973	2032980	25 %	50 %	25 %	0 %	148243433
47056	NC_009482	CGCC	2	8	2033059	2033066	0 %	0 %	25 %	75 %	148243433
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47059	NC_009482	GCT	2	6	2033221	2033226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243433
47060	NC_009482	TCA	2	6	2033278	2033283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243433
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47062	NC_009482	CCGCAA	2	12	2033312	2033323	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148243433
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47064	NC_009482	TGGAGC	2	12	2033369	2033380	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148243433
47065	NC_009482	GCG	2	6	2033403	2033408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47066	NC_009482	CTC	2	6	2033437	2033442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243434
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47071	NC_009482	GCG	2	6	2033592	2033597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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47082	NC_009482	GCCA	2	8	2034126	2034133	25 %	0 %	25 %	50 %	148243435
47083	NC_009482	TGC	2	6	2034142	2034147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243435
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47087	NC_009482	GCA	3	9	2034245	2034253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243435
47088	NC_009482	GC	4	8	2034254	2034261	0 %	0 %	50 %	50 %	148243435
47089	NC_009482	GCT	2	6	2034272	2034277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243435
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47098	NC_009482	CAGC	2	8	2034578	2034585	25 %	0 %	25 %	50 %	148243435
47099	NC_009482	CTGGC	2	10	2034612	2034621	0 %	20 %	40 %	40 %	148243435
47100	NC_009482	CAG	2	6	2034641	2034646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243435
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47107	NC_009482	GCA	2	6	2034845	2034850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243435
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47110	NC_009482	AGC	2	6	2034949	2034954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243435
47111	NC_009482	CGA	2	6	2035040	2035045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243435
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47114	NC_009482	TGC	2	6	2035123	2035128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243435
47115	NC_009482	GCT	2	6	2035193	2035198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243435
47116	NC_009482	CAG	2	6	2035203	2035208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243435
47117	NC_009482	TCC	2	6	2035219	2035224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243435
47118	NC_009482	AGCCG	2	10	2035256	2035265	20 %	0 %	40 %	40 %	148243435
47119	NC_009482	GC	3	6	2035278	2035283	0 %	0 %	50 %	50 %	148243435
47120	NC_009482	GCC	2	6	2035291	2035296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243435
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47126	NC_009482	CCG	2	6	2035416	2035421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243435
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47128	NC_009482	GCC	2	6	2035545	2035550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243435
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47130	NC_009482	CCAAG	2	10	2035631	2035640	40 %	0 %	20 %	40 %	148243435
47131	NC_009482	GCA	2	6	2035667	2035672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243435
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47141	NC_009482	GCTG	2	8	2036101	2036108	0 %	25 %	50 %	25 %	148243435
47142	NC_009482	ACCA	2	8	2036118	2036125	50 %	0 %	0 %	50 %	148243435
47143	NC_009482	TGC	2	6	2036140	2036145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243435
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47145	NC_009482	TAC	2	6	2036197	2036202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243435
47146	NC_009482	GC	3	6	2036310	2036315	0 %	0 %	50 %	50 %	148243435
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47150	NC_009482	GGC	2	6	2036433	2036438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243435
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47152	NC_009482	GTC	2	6	2036537	2036542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243435
47153	NC_009482	ATC	2	6	2036546	2036551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243435
47154	NC_009482	ATC	2	6	2036558	2036563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243436
47155	NC_009482	GGC	2	6	2036577	2036582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243436
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47157	NC_009482	GCC	2	6	2036692	2036697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47158	NC_009482	GA	3	6	2036744	2036749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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47188	NC_009482	TGG	3	9	2037941	2037949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243440
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47199	NC_009482	CAC	2	6	2038304	2038309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243441
47200	NC_009482	TGC	2	6	2038338	2038343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243441
47201	NC_009482	CAGCT	2	10	2038388	2038397	20 %	20 %	20 %	40 %	148243441
47202	NC_009482	GCC	2	6	2038457	2038462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243441
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47213	NC_009482	TGC	2	6	2038916	2038921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243442
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47215	NC_009482	CAC	2	6	2039059	2039064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243442
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47222	NC_009482	T	6	6	2039219	2039224	0 %	100 %	0 %	0 %	148243442
47223	NC_009482	GC	3	6	2039263	2039268	0 %	0 %	50 %	50 %	148243442
47224	NC_009482	TGA	2	6	2039329	2039334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243442
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47228	NC_009482	GCG	2	6	2039464	2039469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243442
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47230	NC_009482	CAG	2	6	2039572	2039577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243442
47231	NC_009482	AGA	2	6	2039596	2039601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47232	NC_009482	TGCGCT	2	12	2039696	2039707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243443
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47456	NC_009482	GGATC	2	10	2049699	2049708	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47457	NC_009482	CAA	2	6	2049747	2049752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47464	NC_009482	GGT	2	6	2050205	2050210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243456
47465	NC_009482	CAT	2	6	2050283	2050288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243456
47466	NC_009482	CAG	2	6	2050304	2050309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243456
47467	NC_009482	CCA	2	6	2050326	2050331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243456
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47469	NC_009482	CCA	2	6	2050360	2050365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243456
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47472	NC_009482	GGT	2	6	2050460	2050465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243456
47473	NC_009482	TCG	2	6	2050527	2050532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243456
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47475	NC_009482	GAT	2	6	2050757	2050762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243457
47476	NC_009482	GCT	2	6	2050781	2050786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243457
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47479	NC_009482	TGA	2	6	2051113	2051118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243457
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47482	NC_009482	GACG	2	8	2051147	2051154	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47483	NC_009482	TGC	2	6	2051161	2051166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47484	NC_009482	GAA	2	6	2051176	2051181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47485	NC_009482	TGC	2	6	2051308	2051313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243458
47486	NC_009482	GAC	2	6	2051405	2051410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243458
47487	NC_009482	GGT	2	6	2051498	2051503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243458
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47489	NC_009482	TGC	2	6	2051545	2051550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243458
47490	NC_009482	TTC	2	6	2051615	2051620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243458
47491	NC_009482	T	6	6	2051642	2051647	0 %	100 %	0 %	0 %	148243458
47492	NC_009482	CCGC	2	8	2051713	2051720	0 %	0 %	25 %	75 %	148243458
47493	NC_009482	CTT	2	6	2051741	2051746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243458
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