MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46501	NC_009482	CTC	2	6	2009652	2009657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243410
46502	NC_009482	CAG	2	6	2009715	2009720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243410
46503	NC_009482	GCTGT	2	10	2009772	2009781	0 %	40 %	40 %	20 %	148243410
46504	NC_009482	GCA	2	6	2009784	2009789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243410
46505	NC_009482	G	6	6	2009813	2009818	0 %	0 %	100 %	0 %	148243410
46506	NC_009482	TCC	2	6	2009824	2009829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243410
46507	NC_009482	GC	3	6	2009835	2009840	0 %	0 %	50 %	50 %	148243410
46508	NC_009482	CGC	2	6	2009874	2009879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243410
46509	NC_009482	GCA	2	6	2009903	2009908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243410
46510	NC_009482	GCA	2	6	2009999	2010004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243410
46511	NC_009482	CAC	2	6	2010021	2010026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243410
46512	NC_009482	CGC	3	9	2010036	2010044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243410
46513	NC_009482	GTGC	2	8	2010210	2010217	0 %	25 %	50 %	25 %	148243410
46514	NC_009482	AGGG	2	8	2010257	2010264	25 %	0 %	75 %	0 %	148243410
46515	NC_009482	GCT	2	6	2010299	2010304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243410
46516	NC_009482	ACC	2	6	2010340	2010345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243410
46517	NC_009482	CG	3	6	2010353	2010358	0 %	0 %	50 %	50 %	148243410
46518	NC_009482	CCG	2	6	2010424	2010429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243410
46519	NC_009482	GCC	2	6	2010484	2010489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243410
46520	NC_009482	TGCAGA	2	12	2010508	2010519	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148243410
46521	NC_009482	TGC	2	6	2010554	2010559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243410
46522	NC_009482	CCA	2	6	2010626	2010631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243410
46523	NC_009482	G	6	6	2010638	2010643	0 %	0 %	100 %	0 %	148243410
46524	NC_009482	GT	3	6	2010670	2010675	0 %	50 %	50 %	0 %	148243410
46525	NC_009482	GCA	2	6	2010686	2010691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243410
46526	NC_009482	AGC	2	6	2010708	2010713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243410
46527	NC_009482	GCA	2	6	2010772	2010777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46528	NC_009482	GGT	2	6	2010796	2010801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243411
46529	NC_009482	TCT	2	6	2010826	2010831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243411
46530	NC_009482	TGG	2	6	2010914	2010919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243411
46531	NC_009482	GCT	2	6	2010938	2010943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243411
46532	NC_009482	CGG	2	6	2011013	2011018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243411
46533	NC_009482	GCC	2	6	2011059	2011064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243411
46534	NC_009482	TGG	2	6	2011117	2011122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243411
46535	NC_009482	TGC	3	9	2011135	2011143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243411
46536	NC_009482	CTG	2	6	2011158	2011163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243411
46537	NC_009482	CACC	2	8	2011180	2011187	25 %	0 %	0 %	75 %	148243411
46538	NC_009482	CAC	2	6	2011222	2011227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243411
46539	NC_009482	GTG	2	6	2011270	2011275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243411
46540	NC_009482	CTG	2	6	2011302	2011307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243411
46541	NC_009482	CTG	2	6	2011314	2011319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243411
46542	NC_009482	GCT	2	6	2011340	2011345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243411
46543	NC_009482	CTCAGC	2	12	2011353	2011364	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148243411
46544	NC_009482	C	7	7	2011364	2011370	0 %	0 %	0 %	100 %	148243411
46545	NC_009482	GCTG	2	8	2011385	2011392	0 %	25 %	50 %	25 %	148243411
46546	NC_009482	GCT	2	6	2011415	2011420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243411
46547	NC_009482	GCT	2	6	2011430	2011435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243411
46548	NC_009482	AC	3	6	2011454	2011459	50 %	0 %	0 %	50 %	148243411
46549	NC_009482	GGCT	2	8	2011515	2011522	0 %	25 %	50 %	25 %	148243411
46550	NC_009482	TGC	2	6	2011525	2011530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243411
46551	NC_009482	GCC	2	6	2011577	2011582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243412
46552	NC_009482	GCC	2	6	2011627	2011632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243412
46553	NC_009482	AACCC	2	10	2011665	2011674	40 %	0 %	0 %	60 %	148243412
46554	NC_009482	GGC	2	6	2011698	2011703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243412
46555	NC_009482	TCA	2	6	2011736	2011741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243412
46556	NC_009482	CAC	2	6	2011818	2011823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243412
46557	NC_009482	CACC	2	8	2011872	2011879	25 %	0 %	0 %	75 %	148243412
46558	NC_009482	GCC	2	6	2011883	2011888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243412
46559	NC_009482	GCG	3	9	2011952	2011960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243412
46560	NC_009482	CAG	2	6	2011966	2011971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243412
46561	NC_009482	GCT	2	6	2012001	2012006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243412
46562	NC_009482	GCA	3	9	2012025	2012033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243412
46563	NC_009482	GCT	2	6	2012083	2012088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243412
46564	NC_009482	CTG	2	6	2012116	2012121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243412
46565	NC_009482	TCA	2	6	2012123	2012128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243412
46566	NC_009482	CCA	2	6	2012139	2012144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243412
46567	NC_009482	TCA	2	6	2012156	2012161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243412
46568	NC_009482	GCA	2	6	2012178	2012183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243412
46569	NC_009482	CAG	2	6	2012236	2012241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243412
46570	NC_009482	CGC	2	6	2012252	2012257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243412
46571	NC_009482	GCT	3	9	2012283	2012291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243412
46572	NC_009482	GCA	2	6	2012327	2012332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243412
46573	NC_009482	GC	3	6	2012373	2012378	0 %	0 %	50 %	50 %	148243412
46574	NC_009482	CGG	2	6	2012403	2012408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243412
46575	NC_009482	CCT	2	6	2012409	2012414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243412
46576	NC_009482	CAGC	2	8	2012425	2012432	25 %	0 %	25 %	50 %	148243412
46577	NC_009482	G	6	6	2012445	2012450	0 %	0 %	100 %	0 %	148243412
46578	NC_009482	TAA	2	6	2012452	2012457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148243412
46579	NC_009482	GCC	2	6	2012462	2012467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243412
46580	NC_009482	GCG	2	6	2012471	2012476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243412
46581	NC_009482	TGCAGC	2	12	2012519	2012530	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148243412
46582	NC_009482	AC	3	6	2012559	2012564	50 %	0 %	0 %	50 %	148243412
46583	NC_009482	CCA	2	6	2012571	2012576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243412
46584	NC_009482	GCT	2	6	2012604	2012609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243412
46585	NC_009482	GCT	2	6	2012655	2012660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46586	NC_009482	ACT	2	6	2012731	2012736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46587	NC_009482	CA	3	6	2012777	2012782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46588	NC_009482	CAG	2	6	2012820	2012825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46589	NC_009482	GTT	2	6	2012828	2012833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46590	NC_009482	AGCGCA	2	12	2013052	2013063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243413
46591	NC_009482	CGT	3	9	2013069	2013077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243413
46592	NC_009482	CCG	2	6	2013148	2013153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243413
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46598	NC_009482	CGA	2	6	2013365	2013370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243413
46599	NC_009482	GAG	2	6	2013375	2013380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243413
46600	NC_009482	GGA	2	6	2013383	2013388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243413
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46602	NC_009482	GGC	2	6	2013441	2013446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243414
46603	NC_009482	GCC	2	6	2013477	2013482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243414
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46607	NC_009482	ATGGGG	2	12	2013624	2013635	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	148243414
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46611	NC_009482	AGCC	2	8	2013737	2013744	25 %	0 %	25 %	50 %	148243414
46612	NC_009482	CAA	2	6	2013747	2013752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243414
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46710	NC_009482	CGC	2	6	2018038	2018043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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46717	NC_009482	AC	3	6	2018361	2018366	50 %	0 %	0 %	50 %	148243419
46718	NC_009482	TCG	2	6	2018393	2018398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243419
46719	NC_009482	GAT	2	6	2018437	2018442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243419
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46723	NC_009482	GGCC	2	8	2018514	2018521	0 %	0 %	50 %	50 %	148243419
46724	NC_009482	TGA	2	6	2018532	2018537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243419
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46728	NC_009482	TGT	2	6	2018727	2018732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243419
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46832	NC_009482	CG	3	6	2023250	2023255	0 %	0 %	50 %	50 %	148243425
46833	NC_009482	CAG	2	6	2023276	2023281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243425
46834	NC_009482	GC	3	6	2023306	2023311	0 %	0 %	50 %	50 %	148243425
46835	NC_009482	GCCA	3	12	2023338	2023349	25 %	0 %	25 %	50 %	148243425
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46838	NC_009482	GGC	2	6	2023579	2023584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243426
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46840	NC_009482	CGG	2	6	2023645	2023650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243426
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46842	NC_009482	TCGG	2	8	2023705	2023712	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46843	NC_009482	TC	3	6	2023820	2023825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46844	NC_009482	GC	3	6	2023829	2023834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46845	NC_009482	TCA	2	6	2023837	2023842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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