MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45502	NC_009482	GGC	2	6	1968142	1968147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243362
45503	NC_009482	CT	3	6	1968161	1968166	0 %	50 %	0 %	50 %	148243362
45504	NC_009482	AGC	2	6	1968227	1968232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243362
45505	NC_009482	GCG	2	6	1968240	1968245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243362
45506	NC_009482	GCT	2	6	1968273	1968278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243362
45507	NC_009482	CCA	2	6	1968300	1968305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243362
45508	NC_009482	CTGGGG	2	12	1968316	1968327	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148243362
45509	NC_009482	CCA	2	6	1968456	1968461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243362
45510	NC_009482	GA	3	6	1968470	1968475	50 %	0 %	50 %	0 %	148243362
45511	NC_009482	CGAT	2	8	1968486	1968493	25 %	25 %	25 %	25 %	148243362
45512	NC_009482	CAC	2	6	1968534	1968539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243362
45513	NC_009482	AGCCA	2	10	1968587	1968596	40 %	0 %	20 %	40 %	148243362
45514	NC_009482	T	6	6	1968612	1968617	0 %	100 %	0 %	0 %	148243362
45515	NC_009482	CGT	2	6	1968654	1968659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243362
45516	NC_009482	GCG	2	6	1968737	1968742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243362
45517	NC_009482	GCA	2	6	1968755	1968760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243362
45518	NC_009482	GCT	2	6	1968872	1968877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243363
45519	NC_009482	GCA	2	6	1968914	1968919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243363
45520	NC_009482	CGAA	2	8	1968927	1968934	50 %	0 %	25 %	25 %	148243363
45521	NC_009482	GCA	2	6	1968937	1968942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243363
45522	NC_009482	ACA	2	6	1968973	1968978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243363
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45524	NC_009482	CGT	2	6	1968996	1969001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243363
45525	NC_009482	TCC	2	6	1969018	1969023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243363
45526	NC_009482	TGC	2	6	1969052	1969057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243363
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45529	NC_009482	GCT	2	6	1969124	1969129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243363
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45531	NC_009482	GCA	2	6	1969145	1969150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243363
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45534	NC_009482	AGCC	2	8	1969256	1969263	25 %	0 %	25 %	50 %	148243363
45535	NC_009482	ATC	2	6	1969285	1969290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243363
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45537	NC_009482	GC	3	6	1969314	1969319	0 %	0 %	50 %	50 %	148243363
45538	NC_009482	TCA	2	6	1969327	1969332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243363
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45543	NC_009482	GTC	2	6	1969434	1969439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243363
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45545	NC_009482	CA	3	6	1969484	1969489	50 %	0 %	0 %	50 %	148243363
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45551	NC_009482	GCC	2	6	1969749	1969754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243363
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45553	NC_009482	TCA	2	6	1969864	1969869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243363
45554	NC_009482	GTG	2	6	1970003	1970008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243364
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45587	NC_009482	TGG	3	9	1971074	1971082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243365
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45603	NC_009482	CA	3	6	1971721	1971726	50 %	0 %	0 %	50 %	148243366
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45615	NC_009482	GCC	2	6	1972399	1972404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243367
45616	NC_009482	C	7	7	1972409	1972415	0 %	0 %	0 %	100 %	148243367
45617	NC_009482	GGGT	2	8	1972416	1972423	0 %	25 %	75 %	0 %	148243367
45618	NC_009482	CAC	2	6	1972432	1972437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243367
45619	NC_009482	CTG	2	6	1972438	1972443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243367
45620	NC_009482	GGCAGC	2	12	1972465	1972476	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148243367
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45622	NC_009482	C	6	6	1972517	1972522	0 %	0 %	0 %	100 %	148243367
45623	NC_009482	CTG	2	6	1972613	1972618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243368
45624	NC_009482	TGC	2	6	1972644	1972649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243368
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45626	NC_009482	CCG	2	6	1972692	1972697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243368
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45634	NC_009482	TGC	2	6	1973179	1973184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243368
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45637	NC_009482	GCT	2	6	1973293	1973298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243368
45638	NC_009482	CGGG	2	8	1973304	1973311	0 %	0 %	75 %	25 %	148243368
45639	NC_009482	TGG	2	6	1973322	1973327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243368
45640	NC_009482	TGC	2	6	1973349	1973354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243368
45641	NC_009482	CAG	2	6	1973364	1973369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243368
45642	NC_009482	GCTGCC	2	12	1973566	1973577	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45643	NC_009482	CAC	3	9	1973588	1973596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243369
45644	NC_009482	CAG	2	6	1973641	1973646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243369
45645	NC_009482	G	6	6	1973699	1973704	0 %	0 %	100 %	0 %	148243369
45646	NC_009482	GCC	2	6	1973830	1973835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243370
45647	NC_009482	GCTG	2	8	1973907	1973914	0 %	25 %	50 %	25 %	148243370
45648	NC_009482	GCC	3	9	1973923	1973931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243370
45649	NC_009482	GCT	2	6	1973976	1973981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243370
45650	NC_009482	GGCC	2	8	1973995	1974002	0 %	0 %	50 %	50 %	148243370
45651	NC_009482	CCG	2	6	1974042	1974047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243370
45652	NC_009482	CAA	2	6	1974114	1974119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243370
45653	NC_009482	GCT	2	6	1974135	1974140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243370
45654	NC_009482	GT	3	6	1974237	1974242	0 %	50 %	50 %	0 %	148243370
45655	NC_009482	CGT	2	6	1974268	1974273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243370
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45658	NC_009482	CAG	2	6	1974490	1974495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243370
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45661	NC_009482	GTGG	2	8	1974541	1974548	0 %	25 %	75 %	0 %	148243370
45662	NC_009482	GCC	2	6	1974619	1974624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243370
45663	NC_009482	GCC	2	6	1974652	1974657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243370
45664	NC_009482	CTG	3	9	1974703	1974711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243370
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45666	NC_009482	GC	3	6	1974810	1974815	0 %	0 %	50 %	50 %	148243370
45667	NC_009482	CGC	2	6	1974822	1974827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243370
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45670	NC_009482	CAG	2	6	1975037	1975042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243370
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45672	NC_009482	CCA	2	6	1975111	1975116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243371
45673	NC_009482	CAC	2	6	1975132	1975137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243371
45674	NC_009482	CAC	2	6	1975163	1975168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243371
45675	NC_009482	CCA	2	6	1975218	1975223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243371
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45678	NC_009482	CCA	2	6	1975270	1975275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243371
45679	NC_009482	GCA	2	6	1975279	1975284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243371
45680	NC_009482	GTG	2	6	1975299	1975304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243371
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45682	NC_009482	TGGC	2	8	1975386	1975393	0 %	25 %	50 %	25 %	148243371
45683	NC_009482	GCT	2	6	1975511	1975516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243371
45684	NC_009482	GGC	2	6	1975521	1975526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243371
45685	NC_009482	GCT	3	9	1975541	1975549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243371
45686	NC_009482	CGC	2	6	1975550	1975555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243371
45687	NC_009482	TGA	2	6	1975645	1975650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243371
45688	NC_009482	TCA	2	6	1975654	1975659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243371
45689	NC_009482	GCG	2	6	1975679	1975684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243371
45690	NC_009482	GTG	2	6	1975691	1975696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243371
45691	NC_009482	CAA	2	6	1975697	1975702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243371
45692	NC_009482	ATC	2	6	1975703	1975708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243371
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45695	NC_009482	GCA	2	6	1975764	1975769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243371
45696	NC_009482	GCA	2	6	1975780	1975785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243371
45697	NC_009482	CGG	2	6	1975831	1975836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243371
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45699	NC_009482	TGC	2	6	1975971	1975976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243371
45700	NC_009482	CTG	3	9	1975994	1976002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243371
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45705	NC_009482	CAC	2	6	1976195	1976200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243372
45706	NC_009482	CTG	2	6	1976246	1976251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243372
45707	NC_009482	AGC	2	6	1976288	1976293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243372
45708	NC_009482	CAGCTC	2	12	1976294	1976305	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148243372
45709	NC_009482	CTG	2	6	1976306	1976311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243372
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45714	NC_009482	TGG	2	6	1976469	1976474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243373
45715	NC_009482	TGG	2	6	1976490	1976495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243373
45716	NC_009482	GCTG	2	8	1976507	1976514	0 %	25 %	50 %	25 %	148243373
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45721	NC_009482	TGA	2	6	1976773	1976778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243373
45722	NC_009482	CTGG	2	8	1976811	1976818	0 %	25 %	50 %	25 %	148243373
45723	NC_009482	CGA	3	9	1976839	1976847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243373
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45727	NC_009482	CAA	2	6	1976954	1976959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243373
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45843	NC_009482	CTG	2	6	1981919	1981924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243378
45844	NC_009482	CTT	2	6	1981962	1981967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243378
45845	NC_009482	TGC	2	6	1982003	1982008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243378
45846	NC_009482	GAT	2	6	1982019	1982024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243378
45847	NC_009482	GTC	2	6	1982148	1982153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243379
45848	NC_009482	TGC	3	9	1982187	1982195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243379
45849	NC_009482	TGA	2	6	1982252	1982257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243379
45850	NC_009482	AGC	2	6	1982379	1982384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243379
45851	NC_009482	TTGGC	2	10	1982387	1982396	0 %	40 %	40 %	20 %	148243379
45852	NC_009482	TTG	2	6	1982401	1982406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243379
45853	NC_009482	CTG	2	6	1982452	1982457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243379
45854	NC_009482	GCG	2	6	1982485	1982490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243380
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45858	NC_009482	TGA	2	6	1982632	1982637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243380
45859	NC_009482	CTGGTG	2	12	1982651	1982662	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148243380
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45862	NC_009482	GGC	2	6	1982704	1982709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243380
45863	NC_009482	G	6	6	1982740	1982745	0 %	0 %	100 %	0 %	148243380
45864	NC_009482	TGC	2	6	1982775	1982780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243380
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45872	NC_009482	GCCG	2	8	1983171	1983178	0 %	0 %	50 %	50 %	148243380
45873	NC_009482	GTG	3	9	1983179	1983187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243380
45874	NC_009482	CGG	2	6	1983233	1983238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243380
45875	NC_009482	GCA	2	6	1983301	1983306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243380
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45881	NC_009482	GTG	2	6	1983542	1983547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243381
45882	NC_009482	GCG	2	6	1983553	1983558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243381
45883	NC_009482	CAA	2	6	1983563	1983568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243381
45884	NC_009482	CACC	2	8	1983591	1983598	25 %	0 %	0 %	75 %	148243381
45885	NC_009482	AAC	2	6	1983599	1983604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243381
45886	NC_009482	GCG	2	6	1983822	1983827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243381
45887	NC_009482	GCC	2	6	1983860	1983865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243381
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45889	NC_009482	TG	3	6	1983929	1983934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45890	NC_009482	ACC	2	6	1983966	1983971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243382
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45895	NC_009482	CGC	2	6	1984174	1984179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243383
45896	NC_009482	CCTGCT	2	12	1984195	1984206	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148243383
45897	NC_009482	GCG	2	6	1984251	1984256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243383
45898	NC_009482	GAATGG	2	12	1984321	1984332	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148243383
45899	NC_009482	GTA	2	6	1984334	1984339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243383
45900	NC_009482	GAT	2	6	1984340	1984345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243383
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45902	NC_009482	CCG	2	6	1984636	1984641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243383
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45904	NC_009482	GCG	2	6	1984691	1984696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243383
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45907	NC_009482	CAC	2	6	1984762	1984767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243383
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45909	NC_009482	GCCG	2	8	1984840	1984847	0 %	0 %	50 %	50 %	148243383
45910	NC_009482	GAC	2	6	1984939	1984944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243383
45911	NC_009482	CAAA	2	8	1984945	1984952	75 %	0 %	0 %	25 %	148243383
45912	NC_009482	GCA	2	6	1984960	1984965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243383
45913	NC_009482	TGG	2	6	1984972	1984977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243383
45914	NC_009482	GCC	2	6	1984989	1984994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243383
45915	NC_009482	GATC	2	8	1985008	1985015	25 %	25 %	25 %	25 %	148243383
45916	NC_009482	AGGT	2	8	1985016	1985023	25 %	25 %	50 %	0 %	148243383
45917	NC_009482	A	6	6	1985087	1985092	100 %	0 %	0 %	0 %	148243383
45918	NC_009482	AGG	2	6	1985098	1985103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243383
45919	NC_009482	TGA	2	6	1985107	1985112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243383
45920	NC_009482	GCT	2	6	1985195	1985200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243383
45921	NC_009482	ACC	2	6	1985243	1985248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243383
45922	NC_009482	GTC	2	6	1985294	1985299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243383
45923	NC_009482	G	7	7	1985333	1985339	0 %	0 %	100 %	0 %	148243383
45924	NC_009482	TGC	3	9	1985405	1985413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243384
45925	NC_009482	CGG	2	6	1985419	1985424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243384
45926	NC_009482	CTGGC	2	10	1985474	1985483	0 %	20 %	40 %	40 %	148243384
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45928	NC_009482	GGC	2	6	1985566	1985571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243384
45929	NC_009482	AAC	2	6	1985576	1985581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243384
45930	NC_009482	CTG	2	6	1985590	1985595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243384
45931	NC_009482	CGCAG	2	10	1985628	1985637	20 %	0 %	40 %	40 %	148243384
45932	NC_009482	GGCT	2	8	1985748	1985755	0 %	25 %	50 %	25 %	148243384
45933	NC_009482	CGGC	2	8	1985806	1985813	0 %	0 %	50 %	50 %	148243384
45934	NC_009482	GCT	2	6	1985820	1985825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243384
45935	NC_009482	CCT	2	6	1985840	1985845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243384
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45937	NC_009482	GCA	2	6	1985889	1985894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243384
45938	NC_009482	GCT	2	6	1985992	1985997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243385
45939	NC_009482	CCGC	2	8	1985998	1986005	0 %	0 %	25 %	75 %	148243385
45940	NC_009482	CAC	3	9	1986007	1986015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243385
45941	NC_009482	CGCA	2	8	1986086	1986093	25 %	0 %	25 %	50 %	148243385
45942	NC_009482	ACG	2	6	1986099	1986104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243385
45943	NC_009482	GGT	2	6	1986112	1986117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243385
45944	NC_009482	AACC	2	8	1986119	1986126	50 %	0 %	0 %	50 %	148243385
45945	NC_009482	GATACC	2	12	1986155	1986166	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148243385
45946	NC_009482	GGT	2	6	1986280	1986285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243385
45947	NC_009482	GCC	2	6	1986376	1986381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243385
45948	NC_009482	CAAG	2	8	1986382	1986389	50 %	0 %	25 %	25 %	148243385
45949	NC_009482	GTG	2	6	1986398	1986403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243385
45950	NC_009482	CGC	2	6	1986417	1986422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243385
45951	NC_009482	CAGC	2	8	1986451	1986458	25 %	0 %	25 %	50 %	148243385
45952	NC_009482	AGC	2	6	1986471	1986476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243385
45953	NC_009482	TGC	2	6	1986480	1986485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243385
45954	NC_009482	CGC	2	6	1986492	1986497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243385
45955	NC_009482	GCGT	2	8	1986572	1986579	0 %	25 %	50 %	25 %	148243386
45956	NC_009482	GC	3	6	1986671	1986676	0 %	0 %	50 %	50 %	148243386
45957	NC_009482	ACC	2	6	1986682	1986687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243386
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