MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_009482	CCA	2	6	1905590	1905595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243293
44003	NC_009482	CGG	2	6	1905728	1905733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243293
44004	NC_009482	TCA	2	6	1905809	1905814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243293
44005	NC_009482	AGC	2	6	1905841	1905846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243293
44006	NC_009482	GTC	2	6	1905867	1905872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243293
44007	NC_009482	CAG	2	6	1905906	1905911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243293
44008	NC_009482	GGT	2	6	1905918	1905923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243293
44009	NC_009482	TCC	2	6	1905952	1905957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243293
44010	NC_009482	G	6	6	1905977	1905982	0 %	0 %	100 %	0 %	148243293
44011	NC_009482	CCA	2	6	1905992	1905997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243293
44012	NC_009482	GCC	2	6	1906063	1906068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243293
44013	NC_009482	CAG	2	6	1906079	1906084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243293
44014	NC_009482	CCA	2	6	1906097	1906102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243293
44015	NC_009482	GCC	2	6	1906107	1906112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243293
44016	NC_009482	TTC	2	6	1906178	1906183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44017	NC_009482	CGG	2	6	1906199	1906204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44018	NC_009482	GGC	2	6	1906225	1906230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243294
44019	NC_009482	CGG	2	6	1906300	1906305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243294
44020	NC_009482	GGTGCC	2	12	1906364	1906375	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148243294
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44022	NC_009482	CCA	2	6	1906435	1906440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243294
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44024	NC_009482	TGG	2	6	1906546	1906551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243294
44025	NC_009482	CAG	2	6	1906577	1906582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243294
44026	NC_009482	TGCT	2	8	1906584	1906591	0 %	50 %	25 %	25 %	148243294
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44032	NC_009482	TGC	2	6	1906864	1906869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243294
44033	NC_009482	GGCCA	2	10	1906904	1906913	20 %	0 %	40 %	40 %	148243294
44034	NC_009482	GTC	2	6	1906925	1906930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243294
44035	NC_009482	CGAT	3	12	1906947	1906958	25 %	25 %	25 %	25 %	148243294
44036	NC_009482	CAG	2	6	1906982	1906987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243294
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44038	NC_009482	GCA	2	6	1907026	1907031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243294
44039	NC_009482	CCG	2	6	1907083	1907088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44040	NC_009482	GC	3	6	1907152	1907157	0 %	0 %	50 %	50 %	148243295
44041	NC_009482	TGG	2	6	1907225	1907230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243295
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44043	NC_009482	TGC	2	6	1907321	1907326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243295
44044	NC_009482	TGGC	2	8	1907346	1907353	0 %	25 %	50 %	25 %	148243295
44045	NC_009482	CTG	2	6	1907392	1907397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243295
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44047	NC_009482	TGC	2	6	1907498	1907503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243296
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44050	NC_009482	AACC	2	8	1907570	1907577	50 %	0 %	0 %	50 %	148243296
44051	NC_009482	CAG	2	6	1907604	1907609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243296
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44053	NC_009482	CGG	2	6	1907693	1907698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243296
44054	NC_009482	GCG	2	6	1907700	1907705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243296
44055	NC_009482	GCA	2	6	1907720	1907725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243296
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44057	NC_009482	GCA	2	6	1907759	1907764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243296
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44065	NC_009482	CGGG	2	8	1908046	1908053	0 %	0 %	75 %	25 %	148243296
44066	NC_009482	TGGG	2	8	1908067	1908074	0 %	25 %	75 %	0 %	148243296
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44087	NC_009482	CAGGA	2	10	1909077	1909086	40 %	0 %	40 %	20 %	148243298
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44100	NC_009482	CTG	2	6	1909629	1909634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243299
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44104	NC_009482	TGT	2	6	1909720	1909725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44105	NC_009482	CGG	2	6	1910039	1910044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243300
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44110	NC_009482	CAG	2	6	1910361	1910366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44111	NC_009482	GC	3	6	1910371	1910376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44112	NC_009482	GCGAC	2	10	1910409	1910418	20 %	0 %	40 %	40 %	148243301
44113	NC_009482	GCC	2	6	1910446	1910451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243301
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44231	NC_009482	AGA	2	6	1915717	1915722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243308
44232	NC_009482	AGC	2	6	1915848	1915853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243308
44233	NC_009482	AGC	2	6	1915856	1915861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243308
44234	NC_009482	GGCA	2	8	1915912	1915919	25 %	0 %	50 %	25 %	148243308
44235	NC_009482	AACC	2	8	1915998	1916005	50 %	0 %	0 %	50 %	148243308
44236	NC_009482	GCC	2	6	1916019	1916024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243308
44237	NC_009482	ACC	2	6	1916033	1916038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243308
44238	NC_009482	CTG	2	6	1916167	1916172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243308
44239	NC_009482	CCT	2	6	1916178	1916183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44240	NC_009482	AGCC	2	8	1916197	1916204	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44241	NC_009482	CAA	2	6	1916251	1916256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243309
44242	NC_009482	GGC	2	6	1916321	1916326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243309
44243	NC_009482	TTG	2	6	1916333	1916338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243309
44244	NC_009482	CAAA	2	8	1916361	1916368	75 %	0 %	0 %	25 %	148243309
44245	NC_009482	GCT	2	6	1916370	1916375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243309
44246	NC_009482	GGGT	2	8	1916377	1916384	0 %	25 %	75 %	0 %	148243309
44247	NC_009482	CTG	2	6	1916410	1916415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243309
44248	NC_009482	GA	3	6	1916462	1916467	50 %	0 %	50 %	0 %	148243309
44249	NC_009482	AGT	2	6	1916526	1916531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243309
44250	NC_009482	CAG	2	6	1916607	1916612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243309
44251	NC_009482	GC	3	6	1916686	1916691	0 %	0 %	50 %	50 %	148243309
44252	NC_009482	GCA	2	6	1916702	1916707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243309
44253	NC_009482	TGG	2	6	1916726	1916731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243309
44254	NC_009482	CG	3	6	1916741	1916746	0 %	0 %	50 %	50 %	148243309
44255	NC_009482	ACCA	2	8	1916782	1916789	50 %	0 %	0 %	50 %	148243309
44256	NC_009482	ATTG	2	8	1916884	1916891	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44257	NC_009482	GAC	2	6	1916981	1916986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44258	NC_009482	GCT	3	9	1917071	1917079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243310
44259	NC_009482	TGC	3	9	1917082	1917090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243310
44260	NC_009482	TGG	2	6	1917094	1917099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243310
44261	NC_009482	CGAG	2	8	1917100	1917107	25 %	0 %	50 %	25 %	148243310
44262	NC_009482	GGCCA	2	10	1917110	1917119	20 %	0 %	40 %	40 %	148243310
44263	NC_009482	GCT	2	6	1917135	1917140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243310
44264	NC_009482	GTG	2	6	1917141	1917146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243310
44265	NC_009482	CTGGTG	2	12	1917159	1917170	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148243310
44266	NC_009482	GCA	2	6	1917257	1917262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243310
44267	NC_009482	G	6	6	1917268	1917273	0 %	0 %	100 %	0 %	148243310
44268	NC_009482	CAG	3	9	1917288	1917296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243310
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44274	NC_009482	CACC	2	8	1917463	1917470	25 %	0 %	0 %	75 %	148243310
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44281	NC_009482	GCC	2	6	1917811	1917816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243310
44282	NC_009482	CAG	2	6	1917829	1917834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44283	NC_009482	GCGA	2	8	1917854	1917861	25 %	0 %	50 %	25 %	148243311
44284	NC_009482	GC	3	6	1917910	1917915	0 %	0 %	50 %	50 %	148243311
44285	NC_009482	CTGAA	2	10	1917957	1917966	40 %	20 %	20 %	20 %	148243311
44286	NC_009482	ACG	2	6	1918017	1918022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243311
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44289	NC_009482	CTGG	2	8	1918134	1918141	0 %	25 %	50 %	25 %	148243311
44290	NC_009482	TGC	2	6	1918173	1918178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243311
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44295	NC_009482	GCTG	2	8	1918441	1918448	0 %	25 %	50 %	25 %	148243311
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44299	NC_009482	AGC	3	9	1918652	1918660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243311
44300	NC_009482	GGT	2	6	1918661	1918666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243311
44301	NC_009482	TCG	2	6	1918674	1918679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243311
44302	NC_009482	CAGC	2	8	1918702	1918709	25 %	0 %	25 %	50 %	148243311
44303	NC_009482	AGCTCA	2	12	1918716	1918727	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148243311
44304	NC_009482	GCA	2	6	1918735	1918740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243311
44305	NC_009482	GCA	2	6	1918794	1918799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243311
44306	NC_009482	GGT	2	6	1918804	1918809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243311
44307	NC_009482	GGC	2	6	1918814	1918819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243311
44308	NC_009482	CAC	2	6	1918828	1918833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243311
44309	NC_009482	CA	3	6	1918856	1918861	50 %	0 %	0 %	50 %	148243311
44310	NC_009482	TGA	2	6	1918930	1918935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243311
44311	NC_009482	G	7	7	1918936	1918942	0 %	0 %	100 %	0 %	148243311
44312	NC_009482	ATC	2	6	1919006	1919011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243311
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44315	NC_009482	A	7	7	1919086	1919092	100 %	0 %	0 %	0 %	148243311
44316	NC_009482	GC	3	6	1919151	1919156	0 %	0 %	50 %	50 %	148243311
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44319	NC_009482	TGG	2	6	1919372	1919377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243311
44320	NC_009482	CGA	2	6	1919383	1919388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243311
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44322	NC_009482	CTGGG	2	10	1919482	1919491	0 %	20 %	60 %	20 %	148243311
44323	NC_009482	CGG	2	6	1919497	1919502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243311
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44328	NC_009482	TGC	2	6	1919772	1919777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243311
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44330	NC_009482	GCTG	2	8	1919932	1919939	0 %	25 %	50 %	25 %	148243311
44331	NC_009482	GCT	2	6	1919947	1919952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243311
44332	NC_009482	TGC	2	6	1919964	1919969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243311
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44334	NC_009482	GCG	2	6	1920000	1920005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243311
44335	NC_009482	CTT	2	6	1920031	1920036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243311
44336	NC_009482	GTG	2	6	1920059	1920064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243311
44337	NC_009482	TC	3	6	1920067	1920072	0 %	50 %	0 %	50 %	148243311
44338	NC_009482	CCG	3	9	1920130	1920138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243311
44339	NC_009482	CAG	2	6	1920307	1920312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243311
44340	NC_009482	GCA	2	6	1920384	1920389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243311
44341	NC_009482	GCT	2	6	1920416	1920421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243311
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44343	NC_009482	CCA	2	6	1920560	1920565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243311
44344	NC_009482	AGA	2	6	1920589	1920594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243311
44345	NC_009482	GCT	2	6	1920620	1920625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243311
44346	NC_009482	GCT	2	6	1920642	1920647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243311
44347	NC_009482	GCA	2	6	1920669	1920674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243311
44348	NC_009482	TGGGC	2	10	1920763	1920772	0 %	20 %	60 %	20 %	148243312
44349	NC_009482	GGCC	2	8	1920776	1920783	0 %	0 %	50 %	50 %	148243312
44350	NC_009482	CGG	2	6	1920797	1920802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243312
44351	NC_009482	GCA	3	9	1920818	1920826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243312
44352	NC_009482	CGG	2	6	1920827	1920832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243312
44353	NC_009482	GCA	2	6	1920854	1920859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243312
44354	NC_009482	GGTGG	2	10	1920882	1920891	0 %	20 %	80 %	0 %	148243312
44355	NC_009482	GCT	3	9	1920897	1920905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243312
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44358	NC_009482	CTTG	2	8	1921041	1921048	0 %	50 %	25 %	25 %	148243313
44359	NC_009482	CAC	2	6	1921057	1921062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243313
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44364	NC_009482	TGC	2	6	1921187	1921192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243313
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44373	NC_009482	GCA	2	6	1921614	1921619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243313
44374	NC_009482	CGC	2	6	1921662	1921667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243313
44375	NC_009482	TGC	2	6	1921701	1921706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243313
44376	NC_009482	CTCTC	2	10	1921751	1921760	0 %	40 %	0 %	60 %	148243314
44377	NC_009482	CCCT	2	8	1921763	1921770	0 %	25 %	0 %	75 %	148243314
44378	NC_009482	CGA	2	6	1921783	1921788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243314
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44382	NC_009482	CTG	2	6	1921883	1921888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243314
44383	NC_009482	GCG	4	12	1921926	1921937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243314
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44450	NC_009482	GGC	2	6	1924895	1924900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243316
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44454	NC_009482	CGAAGG	2	12	1925014	1925025	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	148243317
44455	NC_009482	GCG	2	6	1925028	1925033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243317
44456	NC_009482	AGGC	2	8	1925072	1925079	25 %	0 %	50 %	25 %	148243317
44457	NC_009482	AGC	2	6	1925087	1925092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243317
44458	NC_009482	GGC	2	6	1925106	1925111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243317
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44460	NC_009482	AGC	2	6	1925119	1925124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243317
44461	NC_009482	GCG	2	6	1925144	1925149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243317
44462	NC_009482	CCCAA	2	10	1925179	1925188	40 %	0 %	0 %	60 %	148243317
44463	NC_009482	GCA	2	6	1925353	1925358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243317
44464	NC_009482	CGCTG	2	10	1925360	1925369	0 %	20 %	40 %	40 %	148243317
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44483	NC_009482	GGC	2	6	1925986	1925991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243318
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44487	NC_009482	TGA	2	6	1926201	1926206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243318
44488	NC_009482	CGC	2	6	1926222	1926227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243318
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44490	NC_009482	GGC	2	6	1926253	1926258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243318
44491	NC_009482	CACC	2	8	1926273	1926280	25 %	0 %	0 %	75 %	148243318
44492	NC_009482	ACC	2	6	1926298	1926303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243318
44493	NC_009482	TCA	2	6	1926339	1926344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243318
44494	NC_009482	GTT	2	6	1926360	1926365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243318
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44497	NC_009482	CAGC	2	8	1926450	1926457	25 %	0 %	25 %	50 %	148243318
44498	NC_009482	GGTG	2	8	1926534	1926541	0 %	25 %	75 %	0 %	148243318
44499	NC_009482	GGCT	2	8	1926575	1926582	0 %	25 %	50 %	25 %	148243318
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