MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41503	NC_009482	GCC	2	6	1796237	1796242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243177
41504	NC_009482	GC	3	6	1796325	1796330	0 %	0 %	50 %	50 %	148243177
41505	NC_009482	GCC	2	6	1796351	1796356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243177
41506	NC_009482	CGG	2	6	1796370	1796375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243177
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41512	NC_009482	CTC	2	6	1796616	1796621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243178
41513	NC_009482	CTCA	2	8	1796676	1796683	25 %	25 %	0 %	50 %	148243178
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41516	NC_009482	GGC	2	6	1796726	1796731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243178
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41588	NC_009482	GCC	2	6	1800078	1800083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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41617	NC_009482	CCG	2	6	1801400	1801405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243184
41618	NC_009482	TGG	2	6	1801406	1801411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243184
41619	NC_009482	GCA	2	6	1801458	1801463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243184
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41621	NC_009482	TGG	2	6	1801517	1801522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243184
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41624	NC_009482	GCTG	2	8	1801614	1801621	0 %	25 %	50 %	25 %	148243184
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41626	NC_009482	TGC	2	6	1801748	1801753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243184
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41717	NC_009482	TGG	2	6	1805415	1805420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243187
41718	NC_009482	GCTGAT	2	12	1805479	1805490	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148243187
41719	NC_009482	GCA	2	6	1805548	1805553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243187
41720	NC_009482	GTG	2	6	1805697	1805702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243187
41721	NC_009482	TGG	2	6	1805733	1805738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243187
41722	NC_009482	AGCCGG	2	12	1805779	1805790	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148243187
41723	NC_009482	CCG	2	6	1805814	1805819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243187
41724	NC_009482	CAA	2	6	1805836	1805841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243187
41725	NC_009482	GCC	2	6	1805939	1805944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243188
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41727	NC_009482	GCT	2	6	1805963	1805968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243188
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41729	NC_009482	CCT	2	6	1806050	1806055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243188
41730	NC_009482	GCAGC	2	10	1806058	1806067	20 %	0 %	40 %	40 %	148243188
41731	NC_009482	TGC	2	6	1806131	1806136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243188
41732	NC_009482	AGC	2	6	1806142	1806147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243188
41733	NC_009482	GTG	2	6	1806235	1806240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243188
41734	NC_009482	AGC	2	6	1806274	1806279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243188
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41737	NC_009482	CTG	3	9	1806325	1806333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243188
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41742	NC_009482	GTGA	2	8	1806586	1806593	25 %	25 %	50 %	0 %	148243188
41743	NC_009482	CG	3	6	1806596	1806601	0 %	0 %	50 %	50 %	148243188
41744	NC_009482	GCT	2	6	1806636	1806641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243188
41745	NC_009482	CAG	2	6	1806681	1806686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243188
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41747	NC_009482	GCA	2	6	1806697	1806702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243188
41748	NC_009482	GCTG	2	8	1806705	1806712	0 %	25 %	50 %	25 %	148243188
41749	NC_009482	GCC	2	6	1806739	1806744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243188
41750	NC_009482	GC	3	6	1806797	1806802	0 %	0 %	50 %	50 %	148243188
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41752	NC_009482	GAT	2	6	1807022	1807027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243188
41753	NC_009482	GTCG	2	8	1807092	1807099	0 %	25 %	50 %	25 %	148243189
41754	NC_009482	GAAC	2	8	1807118	1807125	50 %	0 %	25 %	25 %	148243189
41755	NC_009482	TGC	2	6	1807159	1807164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243189
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41758	NC_009482	TC	3	6	1807271	1807276	0 %	50 %	0 %	50 %	148243189
41759	NC_009482	GCT	2	6	1807287	1807292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243189
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41763	NC_009482	C	6	6	1807491	1807496	0 %	0 %	0 %	100 %	148243189
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41774	NC_009482	TGGG	2	8	1807890	1807897	0 %	25 %	75 %	0 %	148243189
41775	NC_009482	CTG	2	6	1808055	1808060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243189
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41783	NC_009482	GGA	2	6	1808513	1808518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243189
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41792	NC_009482	TGC	3	9	1808719	1808727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243189
41793	NC_009482	TGG	2	6	1808746	1808751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243189
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41797	NC_009482	AGG	2	6	1808896	1808901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243189
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41800	NC_009482	GTG	3	9	1809052	1809060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243189
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41807	NC_009482	CTG	2	6	1809477	1809482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243189
41808	NC_009482	GCC	2	6	1809504	1809509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243189
41809	NC_009482	GAC	2	6	1809528	1809533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243189
41810	NC_009482	AGC	2	6	1809538	1809543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243189
41811	NC_009482	CTT	2	6	1809578	1809583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243189
41812	NC_009482	TAC	2	6	1809645	1809650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243189
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41815	NC_009482	C	6	6	1809885	1809890	0 %	0 %	0 %	100 %	148243189
41816	NC_009482	ATGA	2	8	1809891	1809898	50 %	25 %	25 %	0 %	148243189
41817	NC_009482	GCT	2	6	1809938	1809943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243189
41818	NC_009482	GCA	2	6	1810003	1810008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41821	NC_009482	GCCT	2	8	1810049	1810056	0 %	25 %	25 %	50 %	148243190
41822	NC_009482	GCA	2	6	1810119	1810124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243190
41823	NC_009482	GCG	2	6	1810127	1810132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243190
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41827	NC_009482	CGA	2	6	1810284	1810289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243190
41828	NC_009482	CTG	2	6	1810306	1810311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243190
41829	NC_009482	GCA	2	6	1810364	1810369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243190
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41831	NC_009482	GCT	2	6	1810581	1810586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41832	NC_009482	GCT	2	6	1810677	1810682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41833	NC_009482	CTG	2	6	1810717	1810722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243191
41834	NC_009482	GCT	2	6	1810734	1810739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243191
41835	NC_009482	CAG	3	9	1810800	1810808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243191
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41837	NC_009482	G	6	6	1810870	1810875	0 %	0 %	100 %	0 %	148243191
41838	NC_009482	GCT	2	6	1810899	1810904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243191
41839	NC_009482	CTGAT	2	10	1810916	1810925	20 %	40 %	20 %	20 %	148243191
41840	NC_009482	CGCTG	2	10	1810931	1810940	0 %	20 %	40 %	40 %	148243191
41841	NC_009482	CGT	2	6	1811013	1811018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243191
41842	NC_009482	CAA	2	6	1811020	1811025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243191
41843	NC_009482	GCC	2	6	1811054	1811059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243191
41844	NC_009482	ACGG	2	8	1811060	1811067	25 %	0 %	50 %	25 %	148243191
41845	NC_009482	GTT	2	6	1811121	1811126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243191
41846	NC_009482	ACC	2	6	1811138	1811143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243191
41847	NC_009482	TCG	2	6	1811172	1811177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243191
41848	NC_009482	CGA	2	6	1811292	1811297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243191
41849	NC_009482	TG	3	6	1811307	1811312	0 %	50 %	50 %	0 %	148243191
41850	NC_009482	GCA	2	6	1811313	1811318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243191
41851	NC_009482	CTG	2	6	1811323	1811328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243191
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41854	NC_009482	CTG	2	6	1811407	1811412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243191
41855	NC_009482	G	7	7	1811416	1811422	0 %	0 %	100 %	0 %	148243191
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41860	NC_009482	CTG	3	9	1811578	1811586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243191
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41874	NC_009482	GCG	2	6	1811852	1811857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243192
41875	NC_009482	GTT	2	6	1811858	1811863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243192
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41877	NC_009482	TGG	2	6	1812016	1812021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243193
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41932	NC_009482	GAA	3	9	1814488	1814496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41959	NC_009482	GGC	2	6	1815528	1815533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243197
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