MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41004	NC_009482	ACG	2	6	1774920	1774925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243148
41005	NC_009482	C	6	6	1774932	1774937	0 %	0 %	0 %	100 %	148243148
41006	NC_009482	ACA	2	6	1774968	1774973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243148
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41009	NC_009482	T	9	9	1775069	1775077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41011	NC_009482	TAA	2	6	1775101	1775106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41012	NC_009482	CTCA	2	8	1775160	1775167	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41013	NC_009482	TTG	2	6	1775211	1775216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41107	NC_009482	TGG	2	6	1779769	1779774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243153
41108	NC_009482	T	6	6	1779812	1779817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41117	NC_009482	CGA	2	6	1780634	1780639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243155
41118	NC_009482	ACT	2	6	1780667	1780672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243155
41119	NC_009482	GTT	2	6	1780689	1780694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243155
41120	NC_009482	CTG	2	6	1780735	1780740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243155
41121	NC_009482	AGC	2	6	1780776	1780781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243155
41122	NC_009482	GCT	2	6	1780854	1780859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243155
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41124	NC_009482	AGC	2	6	1780886	1780891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243155
41125	NC_009482	GCA	2	6	1780995	1781000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243155
41126	NC_009482	GCG	2	6	1781034	1781039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243155
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41128	NC_009482	TGA	2	6	1781104	1781109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243155
41129	NC_009482	GTC	2	6	1781172	1781177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243155
41130	NC_009482	TGA	2	6	1781185	1781190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243155
41131	NC_009482	GAA	2	6	1781213	1781218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243155
41132	NC_009482	A	7	7	1781310	1781316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41133	NC_009482	C	6	6	1781330	1781335	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41134	NC_009482	GA	3	6	1781366	1781371	50 %	0 %	50 %	0 %	148243156
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41143	NC_009482	CTG	2	6	1781811	1781816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243156
41144	NC_009482	CAG	3	9	1781820	1781828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243156
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41163	NC_009482	CAA	2	6	1782526	1782531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41222	NC_009482	CCCG	2	8	1785015	1785022	0 %	0 %	25 %	75 %	148243161
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41225	NC_009482	C	6	6	1785242	1785247	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41226	NC_009482	C	6	6	1785259	1785264	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41227	NC_009482	CTT	2	6	1785278	1785283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41228	NC_009482	CAA	2	6	1785418	1785423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243162
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41230	NC_009482	CAG	2	6	1785500	1785505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243162
41231	NC_009482	GGC	2	6	1785524	1785529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243162
41232	NC_009482	CGC	2	6	1785545	1785550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243162
41233	NC_009482	GCT	2	6	1785554	1785559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243162
41234	NC_009482	TGC	2	6	1785582	1785587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243162
41235	NC_009482	ACCT	2	8	1785662	1785669	25 %	25 %	0 %	50 %	148243162
41236	NC_009482	TGC	2	6	1785697	1785702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243162
41237	NC_009482	TGA	2	6	1785714	1785719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243162
41238	NC_009482	ACTGC	2	10	1785771	1785780	20 %	20 %	20 %	40 %	148243162
41239	NC_009482	GCC	2	6	1785818	1785823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243162
41240	NC_009482	GCCTGA	2	12	1785830	1785841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148243162
41241	NC_009482	C	6	6	1785885	1785890	0 %	0 %	0 %	100 %	148243163
41242	NC_009482	GCT	2	6	1785908	1785913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243163
41243	NC_009482	ACC	2	6	1786073	1786078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243163
41244	NC_009482	ACT	2	6	1786095	1786100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243163
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41246	NC_009482	CTA	2	6	1786144	1786149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243163
41247	NC_009482	GAT	2	6	1786156	1786161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243163
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41249	NC_009482	TGG	2	6	1786180	1786185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243163
41250	NC_009482	CGA	2	6	1786222	1786227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243163
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41252	NC_009482	GTG	2	6	1786305	1786310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243163
41253	NC_009482	CAC	2	6	1786368	1786373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41254	NC_009482	C	6	6	1786394	1786399	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41255	NC_009482	G	6	6	1786407	1786412	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41256	NC_009482	T	6	6	1786414	1786419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41257	NC_009482	TCC	2	6	1786455	1786460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243164
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41261	NC_009482	GCT	2	6	1786636	1786641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243164
41262	NC_009482	CAG	2	6	1786746	1786751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243165
41263	NC_009482	CGA	2	6	1786798	1786803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243165
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41270	NC_009482	TGG	2	6	1786932	1786937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243165
41271	NC_009482	TGC	2	6	1786995	1787000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243165
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41293	NC_009482	TGC	2	6	1787888	1787893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243166
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41319	NC_009482	TGC	5	15	1789010	1789024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243168
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41335	NC_009482	GTT	2	6	1789566	1789571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243168
41336	NC_009482	CTG	2	6	1789606	1789611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243168
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41346	NC_009482	TCC	3	9	1789976	1789984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243168
41347	NC_009482	GCG	2	6	1789987	1789992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243168
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41351	NC_009482	CGT	2	6	1790212	1790217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41352	NC_009482	GCA	2	6	1790230	1790235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243169
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41368	NC_009482	CAGC	2	8	1791027	1791034	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41369	NC_009482	CGA	2	6	1791055	1791060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41454	NC_009482	GCA	2	6	1794141	1794146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41461	NC_009482	G	6	6	1794416	1794421	0 %	0 %	100 %	0 %	148243175
41462	NC_009482	ACC	3	9	1794423	1794431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243175
41463	NC_009482	GGCC	2	8	1794553	1794560	0 %	0 %	50 %	50 %	148243175
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41467	NC_009482	GGC	2	6	1794756	1794761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243176
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41481	NC_009482	TGC	2	6	1795316	1795321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243177
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41492	NC_009482	GCG	2	6	1795899	1795904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243177
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41500	NC_009482	CGGCCG	2	12	1796082	1796093	0 %	0 %	50 %	50 %	148243177

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