MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40501	NC_009482	TCA	2	6	1750141	1750146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243116
40502	NC_009482	CCA	2	6	1750154	1750159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243116
40503	NC_009482	CAG	2	6	1750167	1750172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243116
40504	NC_009482	CGC	2	6	1750205	1750210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243116
40505	NC_009482	ACG	2	6	1750244	1750249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243116
40506	NC_009482	TGC	2	6	1750276	1750281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243116
40507	NC_009482	GC	3	6	1750335	1750340	0 %	0 %	50 %	50 %	148243116
40508	NC_009482	AC	3	6	1750412	1750417	50 %	0 %	0 %	50 %	148243116
40509	NC_009482	TGG	2	6	1750437	1750442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243116
40510	NC_009482	GCC	2	6	1750479	1750484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243116
40511	NC_009482	GC	3	6	1750627	1750632	0 %	0 %	50 %	50 %	148243116
40512	NC_009482	AGC	2	6	1750692	1750697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40513	NC_009482	AGC	2	6	1750732	1750737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243117
40514	NC_009482	CAT	2	6	1750803	1750808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243117
40515	NC_009482	AGA	2	6	1750850	1750855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243117
40516	NC_009482	TGC	2	6	1750912	1750917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243117
40517	NC_009482	CTG	2	6	1751127	1751132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243117
40518	NC_009482	GTT	2	6	1751136	1751141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243117
40519	NC_009482	GCC	2	6	1751301	1751306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243117
40520	NC_009482	CCA	2	6	1751375	1751380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243117
40521	NC_009482	CCA	2	6	1751384	1751389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243117
40522	NC_009482	TGGT	2	8	1751404	1751411	0 %	50 %	50 %	0 %	148243117
40523	NC_009482	GCA	2	6	1751602	1751607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243117
40524	NC_009482	AAC	2	6	1751628	1751633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243117
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40527	NC_009482	GGT	2	6	1751730	1751735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243117
40528	NC_009482	CTCA	2	8	1751793	1751800	25 %	25 %	0 %	50 %	148243117
40529	NC_009482	CTT	2	6	1751862	1751867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243117
40530	NC_009482	GCG	2	6	1751884	1751889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243117
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40532	NC_009482	AGC	2	6	1751931	1751936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243117
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40534	NC_009482	AAC	2	6	1752033	1752038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243117
40535	NC_009482	TCT	2	6	1752062	1752067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243117
40536	NC_009482	GGCT	2	8	1752103	1752110	0 %	25 %	50 %	25 %	148243117
40537	NC_009482	GA	3	6	1752319	1752324	50 %	0 %	50 %	0 %	148243118
40538	NC_009482	GGC	2	6	1752349	1752354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243118
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40542	NC_009482	CGT	2	6	1752520	1752525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243118
40543	NC_009482	TTTCC	2	10	1752560	1752569	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
40544	NC_009482	GCG	2	6	1752631	1752636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40545	NC_009482	GTG	2	6	1752670	1752675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243119
40546	NC_009482	CT	4	8	1752677	1752684	0 %	50 %	0 %	50 %	148243119
40547	NC_009482	GCA	2	6	1752690	1752695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243119
40548	NC_009482	GCA	2	6	1752849	1752854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243119
40549	NC_009482	GCTG	2	8	1753000	1753007	0 %	25 %	50 %	25 %	148243119
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40551	NC_009482	CAACCA	2	12	1753089	1753100	50 %	0 %	0 %	50 %	148243119
40552	NC_009482	GCT	2	6	1753101	1753106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243119
40553	NC_009482	CCA	2	6	1753187	1753192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243119
40554	NC_009482	CGA	2	6	1753206	1753211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243119
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40558	NC_009482	GGCCA	2	10	1753354	1753363	20 %	0 %	40 %	40 %	148243119
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40564	NC_009482	ACG	2	6	1753604	1753609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243119
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40585	NC_009482	ACG	2	6	1754427	1754432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243121
40586	NC_009482	TGCCC	2	10	1754449	1754458	0 %	20 %	20 %	60 %	148243121
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40599	NC_009482	GCC	2	6	1755007	1755012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243122
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40603	NC_009482	GGGC	2	8	1755272	1755279	0 %	0 %	75 %	25 %	148243122
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40613	NC_009482	GGT	2	6	1755800	1755805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243123
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40615	NC_009482	CTG	2	6	1755888	1755893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243123
40616	NC_009482	CGA	2	6	1755896	1755901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243123
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40733	NC_009482	CGGG	2	8	1761479	1761486	0 %	0 %	75 %	25 %	148243129
40734	NC_009482	GAT	2	6	1761502	1761507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243129
40735	NC_009482	GA	3	6	1761513	1761518	50 %	0 %	50 %	0 %	148243129
40736	NC_009482	GCA	2	6	1761546	1761551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243130
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40739	NC_009482	TGGT	2	8	1761659	1761666	0 %	50 %	50 %	0 %	148243130
40740	NC_009482	GCA	2	6	1761753	1761758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243130
40741	NC_009482	GCT	2	6	1761786	1761791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243130
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40832	NC_009482	CGG	2	6	1765755	1765760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243135
40833	NC_009482	CGTT	2	8	1765827	1765834	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40834	NC_009482	CAA	2	6	1765852	1765857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243136
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40840	NC_009482	AG	3	6	1766071	1766076	50 %	0 %	50 %	0 %	148243136
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40844	NC_009482	CTG	2	6	1766461	1766466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243136
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40965	NC_009482	GAC	2	6	1773340	1773345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243146
40966	NC_009482	GCGAA	2	10	1773353	1773362	40 %	0 %	40 %	20 %	148243146
40967	NC_009482	GCA	2	6	1773387	1773392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243146
40968	NC_009482	CGA	2	6	1773396	1773401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243146
40969	NC_009482	G	6	6	1773415	1773420	0 %	0 %	100 %	0 %	148243146
40970	NC_009482	CAG	2	6	1773451	1773456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243146
40971	NC_009482	CGA	2	6	1773546	1773551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243146
40972	NC_009482	GCA	2	6	1773616	1773621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243146
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40975	NC_009482	TG	3	6	1773832	1773837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40976	NC_009482	CAG	2	6	1773871	1773876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40977	NC_009482	GCG	2	6	1773975	1773980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243147
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40980	NC_009482	CT	3	6	1774059	1774064	0 %	50 %	0 %	50 %	148243147
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40985	NC_009482	GCT	2	6	1774169	1774174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243147
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40991	NC_009482	CCAACA	2	12	1774359	1774370	50 %	0 %	0 %	50 %	148243147
40992	NC_009482	TC	3	6	1774475	1774480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40993	NC_009482	ACT	2	6	1774497	1774502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40998	NC_009482	GCT	3	9	1774610	1774618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243148
40999	NC_009482	GCTG	2	8	1774639	1774646	0 %	25 %	50 %	25 %	148243148
41000	NC_009482	ACG	2	6	1774653	1774658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243148

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